[1] Gabriel Amaral,Rodrigues的Odinal和Elena Symperl。WDV:国家数据数据数据构建编织。在Ulrike Sattles,Aidan Hogan,Maria Keet,Valentine Presutti,JoãoPauloA. Almeida。 2022。内部Springer Publishing。
近年来,发现了许多新型的反杂种防御机制。为了促进与反出现防御系统有关的机械,生态和进化方面的探索,我们于2021年发布了防御能力(Tesson等,2022)。de-Fensefinder是一项生物信息学计划,旨在系统地识别已知的反出发防御机制。Definestfinder v1.0.0的初始发布包括60个系统。在过去的三年中,纳入矿体的反义系统的数量已增长到152。越来越多的已知系统使进入该领域的挑战是一种挑剔,并使对反杂种系统的检测很难解释。此外,基于序列的结构的快速发展是新颖的分析可能性,应易于获得。为了克服这些Challenges,我们提供了防御系统上的资源枢纽,包括:1)具有Web服务搜索功能的防御能力的更新版本,2)在系统上的社区策划知识库库,以及3)预先计算的数据库,其中包括对Alphaffold产生的REDESEQ基因组和结构预测进行的注释。这些页面可以自由访问用户,作为他们更好地了解给定系统的旅程的起点。我们预计,这些资源将促进对抗系统研究中生物信息学的使用,并将为研究反戏系统的研究人员提供服务。此资源可在以下网址获得:https:// Defense -finfiffer.mdmlab.fr。
遵循维基百科的文体准则,本文包含对现有和不存在术语的交叉链接和引用。现有术语和概念用蓝色超链接表示,可将读者引导至相应维基百科页面或参考资料中的真实信息。不存在或虚构的术语(据我们所知尚未确定)用紫色标识,类似于维基百科表示应该存在但尚未存在的页面的方式。有时,本文会出于文体目的引用维基百科的引用准则,例如“[需要引用]”。这种方法增强了文章与维基百科编辑准则的联系,并使用交叉引用来增强读者的理解和获取更多信息。
自然的语言理解和产生已经取得了长足的进步,但持续的幻觉问题破坏了模型输出的可靠性。用外部知识来源(例如Wikipedia)介绍了检索提示的一代(RAG),提出了一种新颖而重要的方法来增强生成内容的事实准确性和连贯性。通过动态整合相关信息,Mistral模型表明了精度,回忆和整体响应质量的重大改进。本研究为减轻幻觉提供了一个强大的框架,为在关键应用程序中部署可靠的AI系统提供了宝贵的见解。全面的评估不足以提高抹布的潜力,以提高大语言模型的性能和可信度。
流行文化有助于塑造我们的技术观念,并强烈影响我们对它的看法:我们害怕它还是宁愿发现它令人着迷?令人惊叹的位,二进制系统,计算,与数据一起工作的世界是如此抽象,以至于其在视觉艺术中的所有形式可视化,incing电影中吸引了观众的注意。这可能也是为什么Kraftwerk乐队的僵硬而原始的音乐(其成员将电子美学与流行音乐结合在一起)如此成功的原因。今天听过的歌曲,例如家用计算机,DAS模型或计算机爱情,似乎是永恒的,也可能恰恰是因为他们在解释人类与机器之间的不清楚,仍在谈判的关系中引起了共鸣。值得纪念戒指,卡夫特夫克(Kraftwerk)于1970年开始创建,早在大数据革命之前就早在广泛可用的互联网之前就开始创建,尽管斯坦利·库布里克(Stanley Kubrick)在2001年创作了2001年之后:《太空奥德赛》(A Space Odyssey)(1968年),弗兰克·赫伯特(Frank Herbert)和弗兰克·赫伯特(Frank Herbert)撰写了Dune(1965)。
本文继承了十年前编辑维基百科的十条简单规则[1]。它介绍了维基百科的机器可读表亲:维基数据——从计算生物学的角度来看,这个项目可能更具相关性。维基数据是一个免费的协作知识库[2],为每个维基百科页面及其他页面提供结构化数据。它依赖于与维基百科相同的同行生产原则:任何人都可以做出贡献。开放的协作模式在实践中往往出人意料地高效,尽管在理论上它们似乎不太可能奏效。尽管如此,它们在学术圈仍然遭到很多抵制和怀疑[3,4]。自 2012 年上线以来,维基数据已迅速发展成为一个跨学科的开放知识库,内容涵盖从基因到细胞类型再到研究人员[2,5-7]。它具有广泛的应用,例如验证有关疾病爆发的统计信息[8]、协调人类冠状病毒资源[9]或评估生物多样性[10,11]。它可以被认为是一个巨大的网络图(图1A),其中的项目作为节点(现在超过1亿个),通过超过十亿条语句相互链接,并通过数十亿条语句进一步链接到更广泛的网络。我们将在文中用斜体字链接到示例维基数据项目和属性(图1)。在线界面使项目本身具有一定的人性化可读性(图1B),但它们的结构化特性使其能够以完全用散文编写的信息源无法实现的方式查询和组合信息。这种多功能性使其在计算生物学中的应用比仅仅依赖维基百科更加通用和灵活[12]。维基数据上的查询范围很广,从哪些基因变异可以预测结直肠癌的阳性预后,到按荷兰以其名字命名的街道数量对分类单元进行分类。我们将尝试使用与计算生物学相关的例子,但请记住,几乎所有东西都可以这样做,从苏格兰中世纪女巫处决地图到按使用人口划分的紧急电话号码,再到描绘青蛙的画作。由于它属于 CC0 版权豁免,因此 Wikidata 的结构化内容基本上已发布到公共领域以用于其他项目 [ 13 ]。您可能已经在搜索引擎结果的顶部看到了它的结构化数据,但它也在幕后使用
。CC-BY-NC 4.0 国际许可下可用(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 3 月 5 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.11.25.517950 doi:bioRxiv 预印本
简介整合数据和知识是生物医学研究中的一项艰巨挑战。尽管新的科学发现正在迅速发现,但很大一部分知识要么被锁定在数据孤岛中(不同的命名法、数据模型和许可条款阻碍了整合;Wilkinson 等人,2016 年),要么被锁定在自由文本中。缺乏集成和结构化的生物医学知识版本会阻碍对这些信息的有效查询或挖掘,从而阻碍我们充分利用积累的科学知识。最近,科学界越来越强调确保所有科学数据的公平性——可查找、可访问、可互操作和可重用——并且越来越多地就一套具体的原则达成共识以确保公平性(Wilkinson 等人,2019 年;Wilkinson 等人,2016 年)。这些原则的广泛实施将极大地
同时,这样的时期也有危险,其中最危险的是忽视生产节约,以及将改进推迟到更方便的季节。当工厂闲置或运营条件仅足以支付运营费用时,将考虑所有降低成本和增加产量的方法,并在可能的情况下付诸实践,尽管在这种时候,生产者——除非他是一个非常有远见的人,并且资金充足——倾向于推迟任何需要花钱的改进,因为他负担不起。另一方面,当时代好转,需求活跃时,就像现在一样,他更倾向于认为他现在的工厂已经足够好了,将为他赚取足够的利润。无需在几乎不需要的变革上投入更多资金即可获得利润
“被限制在钢腔中的是一个盖革柜台,该底座用少量的[放射性]铀制备,以至于在下一个小时内,很可能期望一个原子衰变与无。放大的继电器提供了第一个原子衰减会破碎一小瓶普鲁士酸[氰化物毒药]。这是残酷的 - 一只猫也被困在钢腔中。”