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IDT xGen DNA Library Prep EZ Kit 和 xGen DNA Library Prep EZ UNI Kit 方案 (RUO21-0413_002 06/24)
xGen DNA 文库制备 EZ 试剂盒简化了 NGS 样本制备，用于在 Illumina ® 平台上进行测序。该试剂盒提供快速 DNA 片段化和文库构建，以生成用于测序的文库（图 1）。提供了获取 350bp 或 200bp 平均比对插入片段的详细说明，用于直接或靶向测序。针对更大的插入片段大小（最多 550 bp），提供了协议修订版，以指导您使用 xGen 减速模块。
XGEN DNA库Prep EZ Uni套件 - Net
此协议可以自动化。在XGEN DNA库EZ套件中提供了10％的过度量试剂，以适应自动化。IDT不提供自动化的液体处理仪器或消耗品，而是与自动化解决方案提供商和客户合作，以开发优化的脚本，以便将我们的套件与液体处理平台一起使用。如果您打算与自动液体处理系统一起使用此套件，请联系您的仪器供应商或与我们联系。
IDT揭示了XGEN CFDNA和FFPE DNA库准备套件和杂交捕获解决方案的较高ngs库的复杂性和目标覆盖范围白皮书（RUO23-2238_001 08/23）
下一代测序（NGS）的数据高度取决于库的质量。XGEN CFDNA和FFPE DNA库准备套件与IDT XGEN NGS杂交捕获工作流程配对，为研究人员提供了一种行业领先的解决方案，以生成高质量的测序库。IDT与第三方研究组织合作，比较了XGEN CFDNA和FFPE DNA库Prep套件和自定义杂交捕获（HYB CAP）与两个竞争对手。IDT XGEN NGS工作流解决方案由于较高的样本转换效率和全面的XGEN自定义杂交捕获面板设计而优于竞争对手的工作流程。XGEN试剂被设计为一起使用，尽管它们在竞争对手HYB Cap Workfrows中使用时提高了库的复杂性和测序指标，但最高质量的数据来自使用完整的IDT XGEN NGS NGS Workflow解决方案。
xgen-cfdna and ffpe-dna-library-fibrary-for for for-sequencect ...
DNA，并使用贴纸确定DIN评分。使用XGEN CFDNA和FFPE DNA库Prep V2 MC Kit从DNA的25 ng输入中制备示例库，并带有UG库放大套件和自定义IDT索引引物等效于XGEN索引引物，以实现Ultima P1。在图1中，挂毯痕迹（安捷伦）显示了从低质量的FFPE样品中生成的PCR放大库。即使在DIN得分低的情况下也产生了质量库，而没有任何适配器二聚体的证据。表2显示了从UG 100序列上的12 XGEN CFDNA和FFPE库中获得的质量测序指标。图书馆的读取与参考基因组有很高的读数，并且在DIN水平不同的样品中的结果一致。数据显示较低的Indel，不匹配和嵌合体速率以及Q20高的Q20，表明在UG 100系统上生成了质量测序读数。表表示三个重复的平均值。
泛癌药物遗传学：靶向测序面板还是外显子组测序？
目的：本研究帮助临床医生和研究人员在泛癌症药物遗传学背景下在当前市售的靶向测序面板和外显子组测序面板之间做出明智的选择。材料和方法：研究了九种当代市售的靶向泛癌症面板和 xGen Exome Research Panel v2，以确定它们在多大程度上覆盖了五个现有癌症知识库中的药物遗传学变体-药物相互作用以及癌症基因组图谱中的驱动突变和融合基因。结果：xGen Exome Research Panel v2 和 True-Sight Oncology 500 分别针对现有知识库中 71.0% 和 68.9% 的药物遗传学相互作用；以及癌症基因组图谱中 93.7% 和 86.0% 的驱动突变。所有其他研究面板的目标百分比都较低。结论：在涵盖的癌症药物遗传学变异-药物相互作用和药物遗传学癌症变异方面，外显子组测序优于泛癌症靶向测序组。
IDT高通量杂交捕获术的长基因组片段的富集证明了协议（RUO23-2352_001 09/23）
图1。高通量杂交捕获量的长基因组片段工作流程。 （a）高分子量（HMW）基因组DNA需要长片段的制备和富集。 （b）使用高通量兼容的G管将HMW DNA碎片至〜10 kb。 （c）使用特殊准备的尺寸选择珠通过尺寸选择去除多余的较小片段。 （d）尺寸选定的片段被最终修复（ER）A-Tail（AT），并将适配器连接到适配器序列，并带有样品识别条形码序列。 （e）样品池与XGEN自定义HYB面板杂交，并捕获并富集。 （f）富集的目标片段通过远程PCR扩增。 （g）放大的富集片段是第二次尺寸选择的或清理以进行最佳测序读取长度。 然后，富集和条形码的样品池接受所需的第三代测序工作流程。高通量杂交捕获量的长基因组片段工作流程。（a）高分子量（HMW）基因组DNA需要长片段的制备和富集。（b）使用高通量兼容的G管将HMW DNA碎片至〜10 kb。（c）使用特殊准备的尺寸选择珠通过尺寸选择去除多余的较小片段。（d）尺寸选定的片段被最终修复（ER）A-Tail（AT），并将适配器连接到适配器序列，并带有样品识别条形码序列。（e）样品池与XGEN自定义HYB面板杂交，并捕获并富集。（f）富集的目标片段通过远程PCR扩增。（g）放大的富集片段是第二次尺寸选择的或清理以进行最佳测序读取长度。富集和条形码的样品池接受所需的第三代测序工作流程。
IDT目标测序指南（NGS-10161-AG 07/19） - Net
研究人员发现，基于RNA-Seq的方法从高病毒载荷（VL）的样品中产生了1％的总HCV序列产率。他们注意到这种方法在公正的虽然是如何代价高昂，对中端VL的样本不敏感。使用其VE-SEQ方法，该组能够生成VLS的线性检测到1000 IU/mL，比常规RNA-Seq低10倍。此外，VE-SEQ（带有XGEN探针）导致HCV总读数增加了224倍，其中包括对低至中端VL的样品的1000倍富集，而高VL样品的HCV序列含量接近100％。使用VE-SEQ，如果样品段的序列及其最接近的匹配探针≥80％相同，则可以实现接近最大的富集。研究人员实施了一种用于优化探针设计的算法，从而创建了一个全面的HCV面板，代表了当前识别的7种HCV基因型中的6种。
半F47-0706
摘要：本文详细介绍了符合半F47-0706标准的Ultimod和XGEN电源范围。简介一般而言，由于设备和过程控制的敏感性，工厂自动化设备需要非常高的电源质量。尤其是半导体处理设备可能容易受到输入线上的电压下垂。半F47-0706标准定义了半导体处理，计量和自动化测试设备的最低电压SAG免疫要求。作为本设备的组件，需要电源来满足这些最小电压SAG要求。什么是电压下垂？电压下垂（或倾斜）定义为RMS电压的降低或电流低于标称的90％的标称持续时间，直到一分钟为一分钟，但不完全中断。电压下垂可能有许多原因，例如恶劣的天气条件，公用事业设备操作或故障以及相邻的客户。我们中的许多人都会看到电压下垂的影响（例如，白炽灯的瞬间变暗），但是在生产环境中，输入电压下垂可能导致生产关闭，从而导致巨大的收入损失。为了解决此问题，1999年，半导体设备和材料研究所（SEMI）建立了与AC线SAG免疫有关的标准。