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CTCF-DNA复合物的结构，包括所有11个锌指
CCCTC结合因子（CTCF）结合了其11个串联锌（ZF）DNA结合域的哺乳动物ChR量型的增强子和启动子的数十含量。除了12-15 bp的核序列外，某些CTCF结合位点还包含上游和 /或3'下游motifs。在这里，我们分别描述了人类CTCF重叠部分的两个结构，包括ZF1 – ZF7和ZF3 – ZF11与DNA的复合体中的ZF1-ZF7和ZF3 – ZF11，它们将核心序列与3'下游或5'上游基序一起结合在一起。像常规的串联ZF阵列蛋白一样，ZF1 – ZF7 fol-DNA的右手扭曲，每个填充物均占据并识别一个在DNA Major Grove中的三个碱基对的三重态。Zf8 pla ys独特的作用，充当跨DNA或gro的间隔物，并定位ZF9 – ZF11，使其与DNA进行交叉接触。我们将ZF1 – ZF7和ZF8 – ZF11的TW O子分组之间的差异归因于每个纤维内两个位置-6和-5处的残基，而ZF1-ZF7的残基和ZF8 – ZF8 – ZF8 – ZF8-ZF8 – ZF8 – ZF8的ZF1 – ZF7的残基和较小的残基。ZF8也富含碱性氨基酸，该氨基酸使盐桥允许在较小的含量中添加到DNA磷酸盐。较高的特异性Ar ginine-鸟氨酸和谷氨酰胺 - 腺嘌呤相互作用，用于ZFS的常规碱基相互作用位置在常规的碱基相互作用位置上进行补充，也适用于ZF9 – ZF11所采用的跨链相互作用。ZF1 – ZF7和ZF8-ZF11之间的差异可以比例化结构，并且可以促进高实用性CTCF结合位点的识别。
转录因子的结构基础ZBTB7A识别DNA的识别和ZBTB7A的影响，在人类急性髓样白血病中出现的体细胞突变
ZBTB7A属于一小部分转录因素，该因子在人类中有三个成员（7a，7b和7c）。他们在氨基端具有BTB/POZ蛋白相互作用结构域，在羧基端具有一个锌 - 纤维DNA结合域。他们控制着各种基因的转录，这些基因在造血，肿瘤发生和元质体（尤其是糖酵解）中具有不同的功能。ZBTB7A结合纤维包含共识g（A / C）CCC基序，在某些情况下以CCCC序列为止。的结构和突变研究表明，DNA特异性接触ZBTB7A的四纤维串联阵列是顺序形成的，是从ZF1 - ZF2结合到G（A / C）CCC（a / c）CCC的结合，然后扩散到ZF3 – ZF4之前的ZF2 - ZF2结合，该ZF3 – ZF4与DNA Backbone和3 0 CCC的结合。在这里，我们研究了在ZBTB7A DNA结合结构域内发生的T（8; 21） - 阳性急性髓样白血病患者中发现的一些突变。我们确定这些突变通常会损害ZBTB7A DNA的结合，最严重的破坏是由ZF1和ZF2突变引起的，而ZF3中的Frameshift突变最少，导致部分错误定位。在ZBTB7A上提供的信息 - DNA相互作用可能适用于ZBTB7B/C，它们在控制主要代谢时与ZBTB7A具有重叠的功能。