在此技术说明中,使用杂种7600系统(杂种时间)质谱仪(TOFM)来测量大鼠血浆中靶向脂质介质的内源浓度。通常,使用具有多重反应监测(MRM)扫描模式的三倍四极质量光谱仪(TQM)进行此类分析。此方法非常敏感,并生成准确而精确的数据。但是,这种技术通常不适合通过MRM指导的数据依赖性采集(DDA)扫描同时进行结构表征,而在占空比中没有显着损失。高分辨率质谱器(HRMS),例如Zenotof 7600系统,在定量分析过程中生成完整的产物离子光谱,不会影响测定的占空比,准确性或精度。
该技术说明证明了用于扩展微流蛋白质组学LC-MS分析的Zenotof 7600系统的性能和鲁棒性。该系统是连续运行的28周,而没有仪器清洁或维护,除了例行调整和校准外。鲁棒性,其中使用Zeno Swath DIAS方法分析了人类K562胰蛋白酶消化标准的5 ng和50 ng载荷的复制注射,以评估定量蛋白质组学性能。评估期包括从24-28周进行的加速鲁棒性测试,包括> 1,000个注射(每次注射0.5-1 ng之间的柱载荷)和> 1,020 µg的K562摘要,并注入了系统中,以模拟高通量蛋白瘤研究。在28周内分析了超过1200 µg的蛋白质消化系统。QC结果表明,系统性能在21周的测试期间保持稳定,并且已识别和量化的蛋白质组和前体的数量与变异系数(CVS)<20%一致。这些数据表明Zenotof 7600系统是
此技术说明证明了Zenotof 7600混合时间质谱(TOFMS)系统的功能和能力,以灵敏地检测,量化和结构表征生物标本的胆汁酸含量。通过名义质量仪器(例如三肢(TQMS)系统)对胆汁酸的分析,因为在几种前体离子与基于前体的多反应监测(MRM)过渡中发现的高化学背景(MRM)在当前的现状ART分析(1-4)中都具有挑战性。高分辨率质谱(HRMS)为每个靶向胆汁酸生成完整的产物离子光谱,并用狭窄的质量到电荷(M/z)窗口提取片段离子可以减少背景化学干扰,并改善该测定的信噪比(S/N)。当前的单个胆汁酸异构体的检测取决于色谱分辨率;碰撞诱导的解离(CID)基于碎片无法区分这些异构体代谢物。电子激活解离(EAD; 5-7)是
三重四极杆质谱仪是生物分析 LC-MS/MS 的黄金标准。SCIEX 7500 系统通过关键硬件功能提供增强的正极和负极灵敏度,从而最大限度地提高离子的生成、捕获和传输。快速极性切换(5 毫秒)和高达 6 个数量级的线性动态范围 (LDR) 使 SCIEX 7500 系统成为生物分析的首选三重四极杆质谱仪。高分辨率质谱仪 (HRMS)(例如四极杆飞行时间 (QTOF) 仪器)由于其更高的选择性、更高的质量分辨率和 TOF MS/MS 数据分析的灵活性,越来越多地被用于定量生物分析。从历史上看,QTOF 平台的定量性能受到占空比问题的限制(传统 QTOF 系统的典型占空比 < 30%)。ZenoTOF 7600 系统具有 Zeno 阱,可将占空比提高到 ≥90%。采样效率的提高对于需要高灵敏度的定量工作流程非常有利,并有助于维持
为了确定T-DM1的DAR,使用Zenotof 7600系统进行了糖基化和去糖基化形式的完整质量测量。在高分辨率TOF MS光谱中观察到了两种形式的T-DM1的复杂电荷状态分布(图2A和2D)。来自生物制剂Explorer软件的完整蛋白反向溶液的结果表明,糖基化的T-DM1的复杂MS谱由不同的Glycoforms组成,这些糖基型(包括G0F,G1F和G2F)(与多达8个分子的有效载荷DM1(图2B和图2B和2B和2C)相结合。通过比较,去除N连接的糖基化导致了更简单的MS曲线(图2D – F),其中检测到携带8 dm1的脱脂化T-DM1。用<10 ppm的质量精度鉴定了两种形式的T-DM1形式,并通过Biologics Explorer软件自动集成。图3显示了T-DM1的糖基化和退化形式的DAR分布。在这两种情况下,主要的T-DM1物种的DAR值为2-4(图3)。