摘要:金属蛋白锌无处不在,具有结构和功能重要性的蛋白质锌中心,涉及与配体和底物的相互作用,并且通常具有药理意义。生物分子模拟在研究蛋白质结构,动力学,配体相互作用和催化的研究中越来越突出,但是锌构成了一个特殊的挑战,部分原因是它具有多功能,灵活的协调。生成生物锌中心配体配合物的可靠模型的计算工作流程将发现广泛的应用。在这里,我们使用(非键)分子力学(MM)和量子力学/分子力学(QM/ mm)在半词性(DFTB3)(DFTB3)和理论的密度功能理论(DFTB3)和理论水平来描述六二键式岩构成六氧化锌的锌层中心的理论水平,以评估替代处理的能力。 (单核和二核),以及相互作用组的性质(特别是锌 - 硫相互作用的存在)。mM分子动力学(MD)模拟可以过度影响八面体的几何形状,将其他水分子引入锌配位壳,但可以通过随后的半经验(DFTB3)QM/MM MM MM MD MD MD模拟来纠正。b3lyp/mm几何优化进一步提高了协调距离描述的准确性,该方法的总体有效性取决于包括锌的存在 - 硫 - 硫相互作用,而硫 - 硫相互作用的描述较少。我们描述了使用DFTB3的QM/MM MD的工作流程,然后使用DFT(例如B3Lyp)进行QM/MM几何形状优化,很好地描述了我们的锌金属酶复合物集合,并且很可能适合在结构信息的准确模型中创建锌蛋白质复合物的准确模型。
数据截止日期:2024 年 5 月 23 日。 *零假设 Z 检验的单侧 p 值 ORR ≤30%;† 由于中央审查流程,病变测量结果仅用于研究者评估 BICR,盲法独立中央审查;CI,置信区间;CR,完全缓解;DCR,疾病控制率;DoR,缓解持续时间;HER2,人表皮生长因子受体 2;NE,不可评估;NSCLC,非小细胞肺癌;ORR,客观缓解率;PD,进展性疾病;PFS,无进展生存期;PR,部分缓解;SD,疾病稳定;SLD,目标病变直径总和
摘要。这项研究评估了导致热带Zongo冰川(16°S,Bolivia)的气候条件达到17世纪后期的最大冰河时代(LIA)。我们对年度表面质量平衡进行了敏感性分析,以通过从古气候代理中获得的信息和对过去冰川质量的敏感性研究限制的物理一致的气候场景。与当前气候相比,这些情况受到1.1 K冷却的约束,年度沉淀增加了20%。使用SHU FFL ED输入数据构建了季节性降水的变化:空气温度和相对湿度,降水,风速,输入的短波辐射通量,并使用分布式能量平衡模型进行评估。如果获得接近冰川范围质量平衡平衡的条件,则认为它们是合理的。的结果表明,在1.1 K冷却和年度沉淀增加约20%上,只有两个季节性降水模式可以使LIA平衡:整个一年中均匀分布的降水事件和潮湿季节早期发作。
摘要。这项研究评估了导致热带Zongo冰川(16°S,Bolivia)的气候条件达到17世纪后期的最大冰河时代(LIA)。我们对年度表面质量平衡进行了敏感性分析,以通过从古气候代理中获得的信息和对过去冰川质量的敏感性研究限制的物理一致的气候场景。与当前气候相比,这些情况受到1.1 K冷却的约束,年度沉淀增加了20%。使用SHU FFL ED输入数据构建了季节性降水的变化:空气温度和相对湿度,降水,风速,输入的短波辐射通量,并使用分布式能量平衡模型进行评估。如果获得接近冰川范围质量平衡平衡的条件,则认为它们是合理的。的结果表明,在1.1 K冷却和年度沉淀增加约20%上,只有两个季节性降水模式可以使LIA平衡:整个一年中均匀分布的降水事件和潮湿季节早期发作。
科学发现和工程设计目前受到物理实验的时间和成本的限制,主要是通过需要深入域专业知识的反复试验和直觉选择。数值模拟是物理实验的替代方法,但由于现有数值方法的计算要求,通常对于复杂的现实世界域而言是不可行的。人工智能(AI)通过开发快速数据驱动的替代模型来提出潜在的范式转移。尤其是一个称为神经操作员的AI框架提出了一个原则上的框架,用于在连续域上定义的功能之间学习映射,例如时空过程和部分微分方程(PDE)。他们可以在训练期间看不见的新位置推断和预测解决方案,即执行零拍的超分辨率。神经操作员可以在许多应用中增强甚至替换现有的模拟器,例如计算流体动力学,天气预报和材料模型,而速度更快4-5个数量级。此外,可以将神经操作员与物理和其他领域的约束集成在一起,以获得更高的重点,以获得高保真的解决方案和良好的概括。由于神经操作员是可区分的,因此他们可以直接优化用于反设计和其他反问题的参数。我们认为,神经操作员提出了一种变革性的模拟和设计方法,从而可以快速的研发。