XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemabundance
婴儿肠道菌群中的双歧杆菌种类丰富，孟加拉国达卡与母性特征的关联
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予MedRxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
利用对尘埃特性和丰度的观察约束来改进全球尘埃循环的表征
1 加利福尼亚大学大气与海洋科学系，洛杉矶，CA 90095，美国 2 米兰比可卡大学环境与地球科学系，米兰，意大利 3 气候与环境科学实验室，CEA-CNRS-UVSQ-UPSaclay，吉夫河畔伊维特，法国 4 大气化学与动力学实验室，NASA 戈达德太空飞行中心，格林贝尔特，马里兰州 20771，美国 5 康奈尔大学地球与大气科学系，伊萨卡，纽约州 14850，美国 6 横滨地球科学研究所，JAMSTEC，横滨，神奈川县 236-0001，日本 7 巴塞罗那超级计算中心 (BSC)，08034 巴塞罗那，西班牙 8 NASA 戈达德太空研究所，纽约，纽约州 10025，美国 9 ICREA，加泰罗尼亚高等研究院，08010 巴塞罗那，西班牙 10 UMBC 物理系，美国马里兰州巴尔的摩 11 联合中心 UMBC 地球系统技术联合中心，美国马里兰州巴尔的摩 a 现地址：对流层研究系，气象和气候研究所 (IMK-TRO)，卡尔斯鲁厄理工学院 (KIT)，德国卡尔斯鲁厄 b 现地址：斯克里普斯海洋研究所，加州大学圣地亚哥分校，拉霍亚，CA 92093，美国
在Tezonapa的云森林中，墨西哥Veracruz云森林中的兰花丰度和多样性的模式
摘要目的：分析墨西哥韦拉克鲁斯Tezonapa热带山地云森林（TMCF）的海拔梯度中的兰花丰度和多样性。设计/方法论/方法：在100×20 m临时样带中采样兰花，随机分布在海拔梯度中（T1800-900，T2 901-1,000，T31,001-1,100，T4，T41,101-1,200，和T5 1,101-1,200，和T5 1,101-1,300 M）。每个标本都是地理参数，鉴定了物种，并确定了保护状态。结果：该地区的多样性达到了16个属的26种兰花。记录了204个标本的护照数据。研究局限性/含义：T3记录了最大的丰度，丰富性和多样性。此结果符合TMCF中兰花发展所需的有利温度和湿度条件。发现/结论：Stanhopea Tigrina有灭绝的危险。因此，迫切需要以下方案：体外繁殖，个人释放到环境中以及野生种群的随访，以改善遗传改善。
环境 DNA 揭示了空气中草花粉的丰度和成分与呼吸系统健康之间的联系
Francis M. Rowney，1、2、13、* Georgina L. Brennan，3、4、13、14、* Carsten A. Skjøth，5 Gareth W. Griffith，6 Rachel N. McInnes，7 Yolanda Clewlow，7 Beverley Adams-Groom，5 Adam Barber，7 Natasha de Vere，6、8 Theo Economou，7、9 Matthew Hegarty，6 Helen M. Hanlon，7 Laura Jones，8 Alexander Kurganskiy，5、10 Geoffrey M. Petch，5 Caitlin Potter，6 Abdullah M. Rafiq，3 Amena Warner，11 PollerGEN 联盟、Benedict Wheeler，1、* Nicholas J. Osborne，1、12、* 和 Simon Creer 3,* 1 埃克塞特大学欧洲环境与人类健康中心，英国特鲁罗 TR1 3HD，皇家康沃尔医院 Knowledge Spa 2 普利茅斯大学地理、地球与环境科学学院，英国普利茅斯 PL4 8AA，德雷克马戏团 3 班戈大学自然科学学院，英国班戈 LL57 2UW，Deiniol 路 4 隆德大学生物系环境与气候科学/水生生态中心，瑞典隆德 223 62 5 伍斯特大学科学与环境学院，英国伍斯特 WR2 6AJ 6 阿伯里斯特威斯大学 IBERS，英国阿伯里斯特威斯 SY23 3FL 7 气象局，英国埃克塞特 EX1 3PB，Fitzroy 路 8 威尔士国家植物园，英国 Llanarthne SA32 8HN 9数学，埃克塞特大学，North Park Road，埃克塞特 EX4 4QF，英国 10 地理系，埃克塞特大学，Penryn 校区，Treliever Road，Penryn TR10 9FE，英国 11 英国过敏协会，Edgington Way，Sidcup DA14 5BH，英国 12 昆士兰大学公共卫生学院，Herston Road，布里斯班，昆士兰州 4006，澳大利亚 13 这些作者贡献相同 14 主要联系人 *通信地址：f.rowney@exeter.ac.uk (F.M.R.)，g.l.b.doonan@gmail.com (G.L.B.)，b.w.wheeler@exeter.ac.uk (B.W.)，n.osborne@uq.edu。au（新泽西州), s.creer@bangor.ac.uk (南卡罗来纳州) https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.02.019
肠道微生物群中的大量Prevotella copri与2型糖尿病患者的健康饮食成反比
虽然已知肠道菌群受到习惯性食物的影响，但在2型糖尿病患者中很少探索这种关系。本研究旨在研究113种2型糖尿病患者（平均年龄，58岁；体重指数，29.1; Glyemogogoglobin [HBA1C]，8.1％）的饮食模式与肠道微生物物种丰度之间的关系。我们使用16S扩增子测序分析了肠道微生物群，所有患者均分为菌型型肠型（57.5％，n¼65）或prevotella entype（42.5％，n¼48），使用围绕Mediots群集的Algoriths基于最佳代表的分类，该分类属于MEDIDINIDION。与prevotella肠型相比，型菌型肠型的患者显示出更好的血糖对照，HbA1c≤7.0％的比例为2.71次（95％的置态间隔，1.02 E 7.87; p，0.034）。使用经过验证的食物频率问卷评估所有患者的饮食习惯和营养成分。观察到，所消耗的饮食纤维量次优，平均每天摄入量为16 g。此外，我们通过因素分析提取了四种饮食模式：吃外，高糖食品，菜单和发酵食品模式。与Prevotella肠型相比，患有BACTROIDES型的患者的蔬菜模式的分数更高（0.17±0.13 vess v ^ 0.23±0.09; P，0.010）。我们进一步研究了微生物群与四种饮食模式之间的关系，发现只有植物饮食模式评分与主坐标值相关。较低的模式分数与31个显着的微虫特征的累积丰度相关。在这些特征中，通过使用随机森林模型将Prevotella copri鉴定为最重要的，其接收器操作特征下的面积为0.93（95％的置态间隔，0.88 E 0.98）。为了验证这些结果，我们进行了自定义定量聚合酶链反应测定法。该测定法证实了我们队列中P. copri（灵敏度，0.96; Specii fimitivitive; Specii fimitivitive; Specii fircity，0.97）的存在，患病率为47.8％，平均相对丰度为21.0％。总而言之，患有prevotella肠型的2型糖尿病患者表现出较差的血糖控制和与健康饮食模式的偏差。作为主要促成微生物特征的大量P. copri，与饮食中的饮食小菜和蔬菜的严重程度有关。应重点放在促进健康的饮食模式和了解微生物相关性上。
全球新冠疫苗充足性、疫苗接种覆盖率和公众对政府信任度之间的联系
表 1. 所有 47 个国家的受访者特征 N = 47,656（加权）。特征（% / 平均值（标准差））性别男性 48.44 年龄 44.87（18.78）就业（任何类型就业）是 60.26 人均收入五分位数最穷的 20% 19.9 第二 20% 20.02 中间 20% 19.99 第四 20% 19.99 最富有的 20% 20.09 已婚/同居伴侣是 53.8 健康问题是 24.34 互联网接入是 83.74 出生在该国是 90.69 教育水平完成小学或以下教育。21.84
机构设计在动员气候金融中的作用
瘤胃代表一个动态的微生物生态系统，在响应饮食变化时，发酵代谢产物和微生物浓度会随着时间而变化。微生物基因组知识和动态建模的整合可以增强我们对瘤胃生态系统功能的系统级别的理解。但是，缺乏动态模型与瘤胃微生物群数据之间的这种整合。这项工作的目的是将通过16S rRNA基因扩增子测序确定的瘤胃微生物群时间序列整合到动态建模框架中，以将微生物数据与发酵过程中挥发性脂肪酸（VFA）的动态联系起来。为此，我们使用状态观察者的理论来开发一个模型，该模型从与每个VFA的特定产生相关的微生物功能代理数据中估算VFA的动力学。我们使用cowpi确定了微生物的代理，以推断瘤胃微生物群的功能潜力，并将其功能模块推断从KEGG（基因和基因组的京都百科全书）中推断出功能模块。使用来自体外rusitec实验的数据以及四头母牛的体内实验来挑战该方法。通过均方根误差（CRMSE）的变化系数评估模型性能。在体外案例研究中，乙酸盐的平均CVRMSE为9.8％，丁酸酯为14％，丙酸酯为14.5％。在体内案例研究中，乙酸盐的平均CVRMSE为16.4％，丁基率为15.8％，丙酸苯甲酸盐为19.8％。乙酸盐的VFA摩尔级分的平均CVRMSE为3.1％，丁酸酯为3.8％，丙酸酯为8.9％。我们的结果表明，与Microbiota时间序列数据集成的状态观察者有希望地应用了用于预测瘤胃微生物代谢的情况。
丁香假单胞菌和柔软腐烂的果皮细菌种群的比较丰度和多样性在整个Durance河流集水区中从其法国阿尔卑斯山到其delta
河流，小溪，溪流是在将源头与插座连接起来的土地覆盖物中发生的生物，化学和物理过程的集成商。在流域中人类和动物病原体的动态已在各种情况下进行了广泛研究，从而优化了疾病风险的降低。并行，有一种新兴的意识，即可能还可以通过地表水传播作物病原体，尤其是在用于灌溉时。但是，在整个过程中，没有关于潜在的植物病原体存在的程度 - 也没有关于其动态的程度。在这里，我们比较了假单胞菌（PSY）和软腐烂的果皮杆菌（SRP）种群的季节性动态，沿着Durance River的270公里，从上游高山河（Alpestream Alpine）到达了与Rhone河的下游农业生产区。在2016年和2017年秋季，冬季，春季和夏季在21个地点收集的168个样品中，在所有采样地点均检测到PSY菌株，在人口密度的156个样品中，在最高10 5细菌L -1的人口密度下都检测到PSY菌株。相比之下，在98个样品中检测到SRP菌株，主要来自河的南部，人口密度不超过3´10 4细菌L -1。在每个采样位点表征的生物学和化学参数中，温度是唯一解释了两个物种复合物种群大小的可变性的唯一因素。PSY密度随温度升高而降低，而SRP密度随温度升高而增加。SRP的河流种群主要由多功能胸膜杆菌和水生假子组成，它们的流行病学重要性鲜为人知。仅观察到少数几个因其流行病学影响而被称为其流行病学影响的果蝇菌株。相比之下，所有地点的PSY种群都是由从其他研究中以广泛宿主范围及其地理和栖息地无处不在的遗传谱系为主的。我们的观察结果表明，可以利用对SRP的河水进行监视来发出诊断和管理反应，以避免疾病爆发。相反，由于这组细菌，由于没有规则和广泛的疾病暴发，整个集水区的持续存在表明，监视应集中在土地使用，河水条件和农艺学实践的未来变化上，这些实践可能会破坏当前在检查中持Psy暴发的机制。
肠道菌群丰度与宫颈癌的发病机理之间的因果关系：双向孟德尔随机研究
Results: In primary outcomes, we found that a higher abundance of class Clostridia, family Family XI, genus Alloprevotella, genus Ruminiclostridium 9, and order Clostridiales predicted higher risk of CC, and a higher abundance of class Lentisphaeria, family Acidaminococcaceae, genus Christensenellaceae R7 group, genus Marvinbryantia, order维多利亚菌，肌动杆菌和小扁豆门预测CC的风险较低。在可验证的结果中，我们发现甲甲基类，家族放线菌科，家族甲状腺杆菌科，lachnospiraceae ucg属010，甲苯基菌科属，甲苯基逆葡萄菌属，命令放线菌和甲基甲基甲基菌属越高的风险和cccccund ccccccc，链球菌科，属媒介物和细菌植物属预测CC的风险较低，反之亦然。
在德国奥格斯堡的两个不同高度的生物多样性，丰度，季节性和昼夜的花粉分布模式
机载花粉是全球最重要的空气过敏剂。由于气候变化，花粉季节性和丰度正在发生重大改变，这引起了基本问题：花粉暴露何时和多少增加？为了回答这个问题，我们采用了多分辨率的研究设计，从大约每年到年度规模，研究了空中花粉的多样性，丰度和时间出现。使用7天记录的Hirst型体积陷阱，在2015年至2017年期间进行了空气传播的花粉浓度。监控是在地面上进行的，我们主要是上下班和居住的地方，在“金标准”屋顶级别（地面高12 m），分辨率：a）每天bi-hourly，b）。评估了所有分类单元的生物多样性和相对丰度，并开发了第一个花粉季节日历以及昼夜节律日历，用于德国奥格斯堡。确定了40多种花粉类型，其中13种是最丰富的（每个相对丰度> 0.5％，总计91.8％）。生物多样性在高度之间没有任何明显的差异，尿布科，槟榔和豆豆的花粉代表了始终超过一半的区域大气生物多样性。在屋顶级别的花粉丰度通常看起来更高，尤其是对于betula，picea和quercus。主要的花粉季节从3月至10月延长，最高峰将于4月至5月。在屋顶级别，大多数分类单元的花粉季节都早些时候，整个季节更长。时花粉在一天中，在中午至下午观察到较高的花粉浓度（荨麻教，肺科，plantago，大多数是地面上的分类单元）或傍晚到清晨，经常使用多模式的昼夜模式（betula，fraxinus，fraxinus，fraxinus，大多数是屋顶级别的分类）。我们的发现表明，应深入重新考虑地面和“金标准”屋顶级花粉测量之间的丰度和时间分布模式的概括。