XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemabundances
基于弱缩放指数和对神经科学中MEG录音的应用多型分析
背景：多环芳烃（PAHS）具有环境和公共卫生的关注，并导致皮肤不良属性，例如过早的皮肤老化和色素疾病。但是，关于慢性城市PAH污染物在皮肤微生物群中的潜在作用的信息很少。鉴于皮肤微生物群在健康和不良的皮肤表型以及PAH和皮肤特性之间的关系中具有作用，我们假设PAH的暴露可能与皮肤微生物群的变化有关。在这项研究中，来自中国两个城市的200多个中国人的皮肤菌群具有不同的PAH曝光水平，其特征是细菌和真菌扩增子和shot弹枪宏基因组学测序。结果：皮肤遗址和城市是改变微生物群落及其组装过程的强大参数。降低细菌 - 真菌微生物网络结构完整性和稳定性与皮肤条件（痤疮和头皮屑）有关。多变量分析揭示了丙酸杆菌和马拉西亚的丰富性与宿主特性和污染物暴露水平之间的关联。香农多样性的增加与剂量依赖性的PAH的暴露水平相关。shot弹枪元基因组学分析样品（n = 32）的PAH的个体的样本（n = 32）进一步强调了量化的PAH和减少皮肤分子的丰富性与口腔细菌的增加之间的关联。功能分析确定了PAH的水平与代谢和其他途径的微生物基因之间的关联，具有潜在的重要性在宿主 - 微生物相互作用以及芳香族化合物的降解中。结论：这项研究的结果证明了与PAH的长期暴露水平相关的皮肤微生物群的组成和功能能力的变化。这项研究的发现将有助于制定利用微生物群保护皮肤免受污染物的策略。
人类代谢组学
收到：29-01-2025 /接受了修订：02-02-2025 /发布：07-02-2025摘要：代谢组学是对涉及代谢物，小分子底物，中间体和细胞代谢产物的化学过程的科学研究。具体而言，代谢组学是“对特定细胞过程所留下的独特化学指纹的系统研究”，对它们的小分子代谢物概况的研究。代谢组代表了在生物细胞，组织，组织或生物体中的最终产物，是蜂窝化过程的最终产物，是基因rna（mmess rna）（MRNA）（MRNA），MRNA，MRNA，MRNA，MRNA（MRNA），代表了完整的代谢物。在细胞中产生的一组基因产物，代表细胞功能的一个方面。Conversely, metabolic profiling can give an instantaneous snapshot of the physiology of that cell,and thus, metabolomics provides a direct "functional readout of the physiological state" of an organism.There are indeed quantifiable correlations between the metabolome and the other cellular ensembles (genome, transcriptome, proteome, and lipidome), which can be used to predict metabolite abundances in biological来自mRNA丰度的样本。系统生物学的最终挑战之一是将代谢组学与所有其他 - 组信息整合在一起，以更好地了解细胞生物学。生物学的中心原理显示了从DNA到表型的信息流。与每个阶段相关的是相应的系统生物学工具，从基因组学到代谢组学。[图1]
柞蚕丝素肽在缓解高血糖过程中的抗氧化、抗炎症及微生物组成优化作用
结果表明，TSFP能显著降低糖尿病小鼠的空腹血糖（FBG）水平并抑制糖代谢基因的mRNA表达。此外，TSFP可以改善脂质代谢紊乱并提高抗氧化能力。此外，TSFP可以减轻糖尿病小鼠的病理损伤并阻碍炎症过程。此外，补充TSFP通过丰富有益细菌和抑制病原微生物表现出更强的塑造和优化肠道微生物组成的能力。相关性分析还显示，TSFP治疗组的功能性细菌丰度与血清参数表现出更好的相关性，这对血糖调节和炎症缓解具有积极意义。
TMC-1中CH3NC的检测和建模
a b s t r a c t在冷的，深色的星际云条件下研究了两个密切相关的氰化物CH 3 [CN/NC]和H 2 C [CN/NC]的密切相关的异构体对。与空间中甲基氰化物（CH 3 CN）的不同检测相反，以前仅在温暖和热的恒星形成区域中观察到甲基异氰化物（CH 3 NC）。我们使用绿色银行望远镜的检测显着性约为13.4σ，报告了冷前核金牛座分子云（TMC-1）中CH 3 NC的检测。在H 2 CCN中的过度过渡和Ch 3 Cn和Ch 3 Nc中的四极相互作用与绿色库望远镜观测到的光谱线相匹配：狩猎芳香族分子的绿色储物望远镜上的大型项目捕食大型项目，导致了与1的含量相对于1的水。92 + 0。13-0。07×10 - 9对于氰基甲基自由基（H 2 CCN），5。02 + 3。08-2。06×10 - 10- 10-3 CN和2。 97 + 2。 10 - 1。 37×10-11 ch 3 nc。 在TMC-1条件下，在CH 3 CN和CH 3 NC的TMC-1条件下，将这些分子与三相气体密码Nautilus建模的努力，尽管在这些物种的观察值和模型之间，约5.9％的比率是一致的。 这可能指出模型中缺少破坏路线。 模型捕获了H 2 CCN的较大丰度。 解离重组被认为是这些分子的主要生产途径，并且发现具有丰富离子的反应是主要破坏途径。06×10 - 10- 10-3 CN和2。97 + 2。 10 - 1。 37×10-11 ch 3 nc。 在TMC-1条件下，在CH 3 CN和CH 3 NC的TMC-1条件下，将这些分子与三相气体密码Nautilus建模的努力，尽管在这些物种的观察值和模型之间，约5.9％的比率是一致的。 这可能指出模型中缺少破坏路线。 模型捕获了H 2 CCN的较大丰度。 解离重组被认为是这些分子的主要生产途径，并且发现具有丰富离子的反应是主要破坏途径。97 + 2。10 - 1。37×10-11 ch 3 nc。 在TMC-1条件下，在CH 3 CN和CH 3 NC的TMC-1条件下，将这些分子与三相气体密码Nautilus建模的努力，尽管在这些物种的观察值和模型之间，约5.9％的比率是一致的。 这可能指出模型中缺少破坏路线。 模型捕获了H 2 CCN的较大丰度。 解离重组被认为是这些分子的主要生产途径，并且发现具有丰富离子的反应是主要破坏途径。37×10-11 ch 3 nc。在TMC-1条件下，在CH 3 CN和CH 3 NC的TMC-1条件下，将这些分子与三相气体密码Nautilus建模的努力，尽管在这些物种的观察值和模型之间，约5.9％的比率是一致的。这可能指出模型中缺少破坏路线。模型捕获了H 2 CCN的较大丰度。解离重组被认为是这些分子的主要生产途径，并且发现具有丰富离子的反应是主要破坏途径。H + CH 3 NC以过渡状态理论为潜在的破坏途径进行了研究，但发现在冷云条件下太慢，无法解释CH 3 NC的建模和观察到的差异。
粪便DNA元法编码显示可靠的短期猎物检测，并解释了两个北极熊亚群的肠道微生物组的变化
摘要：这项研究开发并评估了DNA元法编码，以鉴定East Greenland（EG）（EG）和Southern Beaufort Sea（SB）Polars Polars Maritimus在2015年春季采样的pinniped和Cetacean Prey DNA的存在。在所有样品的一半（49/92）中检测到猎物DNA，并且在检测到响起的密封pusa hispida是主要的猎物，在Eg的100％（22/22）中鉴定出Eg的100％（22/22），SB北极熊样品的81％（22/27）鉴定出具有猎物DNA的SB北极熊样品。胡须的密封barbatus dna，检测到猎物DNA。猎物DNA检测频率和相对可怕的频率与SB北极熊子集的定量脂肪酸签名分析（QFASA）的估计进行了比较。环形密封和胡须密封是两种方法都确定的主要猎物，但Qfasa还鉴定出了猎物DNA未发现的2个鲸类猎物。DNA元法编码与QFASA结果的差异可能与每种方法捕获的不同饮食时间尺度有关，即短期与长期饮食。 猎物DNA检测，性别/年龄类别和亚群显着解释了北极熊肠道细菌相位的变化。 检测到的具有猎物DNA的北极熊样品与细菌类梭状芽胞杆菌和杆菌的丰富性较高以及否定性较低的含量有关。 因此，粪便DNA metabarcoding可用于识别北极熊的近期猎物，补充定量和可能的长期QFASA估计，并可能有助于了解北极熊肠肠肠微生物组的变化。短期与长期饮食。猎物DNA检测，性别/年龄类别和亚群显着解释了北极熊肠道细菌相位的变化。检测到的具有猎物DNA的北极熊样品与细菌类梭状芽胞杆菌和杆菌的丰富性较高以及否定性较低的含量有关。粪便DNA metabarcoding可用于识别北极熊的近期猎物，补充定量和可能的长期QFASA估计，并可能有助于了解北极熊肠肠肠微生物组的变化。关键词：饮食组成·DNA元法量·QFASA·脂肪酸特征·海洋哺乳动物·基因组学·北极海洋生态
肠道微生物组的改变与表观遗传年龄的加速和身体健康有关
fi g u r e 2肠道微生物组和表观遗传老化时钟的关联。（a，b）在物种，（s），属（g），家庭（F），（O），（C），Phylum（p）和王国（K）和年龄，年龄，年龄，加速及年龄的物种水平上，微生物组的多样性（通过相对丰度的香农熵测量）之间的相关性。（c，d）类似于类似的相对丰度的相似相关分析。（e，f）肠道微生物组丰富物种的相似相关分析。门也显示在括号中，由门的前四个字母缩写。（g，h）肠道微生物组中最丰富的细菌途径的相似相关分析（SPWY。，SuperPathway； Bios。，生物合成）。
补充材料
图S3。 三元地块描述了细菌和真菌DNA的基于真菌和真菌DNA或基于RNA的OTU在植物土壤实验结束时土壤处理之间的分布（灰色圆圈），表明基于DNA的或基于RNA的基于DNA或基于RNA的富集或激活的OTU，或者是由T.绿色圆圈或通过T. eestivum（blue cirdie）（或蓝色圆形），或在blue coundere（blue cirdiean），或者在blue counder coundere coundere coundere counce，或者在blue councered counder counder counder（blue cirdie），或depleta。或通过T. aestivum（浅蓝色），两种植物（橙色）富集或激活的Otus以及两种植物（黄色）耗尽或抑制的OTU。 对总细菌和真菌的丰度（基因拷贝数）进行了此分析。 每个圆圈描绘了一个单独的OTU，其位置取决于指示的方式对丰度的贡献。 圆的大小反映了OTU的相对丰度。图S3。三元地块描述了细菌和真菌DNA的基于真菌和真菌DNA或基于RNA的OTU在植物土壤实验结束时土壤处理之间的分布（灰色圆圈），表明基于DNA的或基于RNA的基于DNA或基于RNA的富集或激活的OTU，或者是由T.绿色圆圈或通过T. eestivum（blue cirdie）（或蓝色圆形），或在blue coundere（blue cirdiean），或者在blue counder coundere coundere coundere counce，或者在blue councered counder counder counder（blue cirdie），或depleta。或通过T. aestivum（浅蓝色），两种植物（橙色）富集或激活的Otus以及两种植物（黄色）耗尽或抑制的OTU。对总细菌和真菌的丰度（基因拷贝数）进行了此分析。每个圆圈描绘了一个单独的OTU，其位置取决于指示的方式对丰度的贡献。圆的大小反映了OTU的相对丰度。
culicidae）在珀斯，西方
蚊子传播的疾病是一个重大的公共卫生问题，在澳大利亚，罗斯河病毒（RRV）是最报告的。这项研究结合了两个蚊子媒介的蚊子发育机械模型。 Vigilax和Aedes Camptorhynchus的艾德斯（Aedes vigilax）和艾德斯（Aedes camptorhynchus），来自三种代表性浓度途径（RCP）的三个气候模型的气候预测，以检查西澳大利亚州珀斯的气候变化和海平面上升对温带潮汐盐沼地栖息地的可能影响。这些预测是在没有积聚和积聚场景下运行的，它是使用已知的蚊子栖息地作为案例研究的。这改善了我们对西南澳大利亚西南部温带潮汐区域类似栖息地的海平面上升，积聚和气候变化的可能影响的理解。该模型的输出表明一年的射流比例是积极的增加。两种埃德斯物种的人口丰度显着增加。蚊子种群丰度变化的主要驱动因素是潮汐湿地淹没的频率和面积淹没的大小，最低水温升高，并且随着由于海平面的变化而增加的每日温度的降低，尤其是在模型下，每天的温度升高，每日温度的波动降低。与RCP 4.5相比，RCP 8.5对蚊子种群的影响更为明显，但在三个气候变化模型中是一致的。结果表明AE。Vigilax可能是2030年和2050年最丰富的物种，但是到2070年，Camptorhynchus可能会变成更丰富的物种。这种增加将对现有的蚊子控制计划造成巨大压力，并增加蚊子传播疾病的风险和刺激当地社区的刺激，并计划减轻这些潜在的影响现在应该构成。
Matteo Vismara2，医学博士； Kenneth J. O’Riordan3，博士；约翰……
摘要 37 强迫症 (OCD) 和重度抑郁症 (MDD) 经常同时发生，抑郁症状会影响 OCD 进展，反之亦然。识别生物标记物 39 对于改善诊断和治疗至关重要。虽然肠道微生物群在精神疾病中的作用已得到充分研究，但本研究重点关注口腔微生物群的变化及其与 BDNF（脑源性神经营养因子）DNA 甲基化的关系，并与健康对照组进行比较。我们的研究结果揭示了微生物群 43 组成的显著变化，强迫症患者的放线菌门和厚壁菌门丰度 44 增加（p<0.05；CTRL=n.24，OCD=n.21），而 MDD 患者的放线菌门和厚壁菌门丰度增加，拟杆菌门和变形菌门丰度减少（p<0.05；CTRL=n.24，46 MDD=n.16）。这些变化（包括潜在的链球菌感染后自身免疫）凸显了微生物群在强迫症和 MDD 病理生理学中的作用。在两种疾病中，外显子 I 和 IV 的 CpG 位点均观察到 BDNF DNA 48 甲基化的选择性变化，在 OCD 和 MDD 中显著减少（p<0.05；CTRL=n.24，OCD=n.23，MDD=n.16），并且 miRNome 分析 50 显示 BDNF 靶向微小 RNA 的表达发生改变，其中 miR-16-5p 和 miR-29a-3p 51 在 OCD 中上调（p<0.05；CTRL=n.24，OCD=n.17），而 miR-29a-3p 上调而 miR-191- 52 5p 下调（p<0.05；CTRL=n.24，MDD=n.16）。这些发现表明了疾病特异性的微生物群和表观遗传特征，将唾液定位为一种非侵入性生物标志物识别工具。这项研究促进了对强迫症 55 和抑郁症中微生物表观遗传相互作用的理解，可能指导早期诊断和针对性治疗。56
Zachary Beller，Darryl Wesener，Timothy Seebeck，Janaki Guruge，Alexandra Byrne等。
学习人类肠道细菌如何竞争并合作代谢营养是开发更多营养食品并促进更健康的肠道微生物群落的重要一步。人类肠道细菌是复杂的饮食多糖的主要消费者。在这里，我们描述了一种遗传体系，用于故意诱导肠道群落中目标生物的丰度减少。gnotobiotic小鼠被喂食人类饮食，并用定义的培养，基因组测序的，人类肠道细菌（包括多种菌囊科种类）定植。在既定社区中的不同菌孢子的“敲低”导致了其他生物体的特定增加，并揭示了它们如何动态地改变其优先级，以利用可用的多糖，同时保留了社区代谢碳水化合物的总体能力。