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深度学习 - 深海底栖大型社区中的生物多样性评估：在聚合金属结节挖掘的背景下进行的案例研究
简介：技术发展促进了从孤立的深海生态系统（例如深渊结节场）中收集大量图像的收集。将图像作为监测工具在这些感兴趣的领域进行深海开发非常有价值。但是，为了收集大量的物种观测值，需要分析数千个图像，尤其是如果在深渊结节场中，高度多样性与低丰度相结合时，则需要进行分析。作为大量图像的视觉解释和定量信息的手动提取是耗时且容易出错的，计算检测工具可能会起关键作用，以减轻这种负担。然而，使用深度学习 - 基于深度学习的计算机视觉系统来实现动物群检测和分类的任务，仍然没有建立的工作流量来进行有效的海洋图像分析。
肥胖症中的眼表面菌群改变：病例对照研究
结果：在将肥胖症患者与健康对照组进行比较时，α多样性在眼表面菌群的丰富度或均匀度没有明显差异（香农指数，p = 0.1003）。但是，β多样性突出了这两组的微生物群组成中的显着方差（Anosim，p = 0.005）。lefse分析表明，肥胖症患者的delftia，cutibacterium，cutibacterium，cutibacterium，culobacterium，caulobacteraceae，caulobacteraceae未分类，comamonas和卟啉症显着增加（p <0.05）。使用PICRUST2的预测分析强调了肥胖症患者的某些代谢途径的显着增强，特别是通过细胞色素P450（CYP450），脂质代谢和脂质代谢的代谢，尤其是异种疗法，脂质代谢和类似的受体信号途径（NOD） - 样型（NOD） - 样型（NOD）。
在微生物组指导的食物中，生物活性糖
有证据表明，肠道微生物组的产后发育有助于儿童营养不良1-4。在这里，我们分析了来自微生物组指导的互补食品（MDCF-2）的随机对照试验的生物测量，该试验与在12-18个月大的班加拉德岛（12-18个月大的邦格拉德郡儿童中）相比，与热量更密集的常规辅助食品相比，其体重增加率较高。We reconstructed 1,000 bacterial genomes (metagenome-assembled genomes (MAGs)) from the faecal microbiomes of trial participants, identified 75 MAGs of which the abundances were positively associated with ponderal growth (change in weight-for-length Z score (WLZ)), characterized changes in MAG gene expression as a function of treatment type and WLZ response, and quantified carbohydrate MDCF-2和粪便中的结构。结果表明，与WLZ正相关的两个Prevotella copri mag是MDCF-2诱导的代谢途径表达的主要贡献者，该代谢途径涉及使用MDCF-2的成分聚糖。The predicted specificities of carbohydrate-active enzymes expressed by their polysaccharide- utilization loci are correlated with (1) the in vitro growth of Bangladeshi P. copri strains, possessing varying degrees of polysaccharide-utilization loci and genomic conservation with these MAGs, in defined medium containing different purified glycans representative of those in MDCF-2, and （2）试验参与者中粪便碳水化合物结构的水平。这些关联表明，通过与生长相关的细菌分类群代谢的MDCF中鉴定生物活性聚糖结构将有助于指导有关其在急性营养不良儿童中使用的建议，并能够开发出其他配方。
跨空间和时间的重复组进化：揭示植物属 Erythrostemon Klotzsch（豆科）的重复动态
图 4 影响红胸木重复组组成的因素。(a) 红胸木物种中每个 TE 谱系丰度所选最佳模型的估计值。Y 轴为 TE 进化枝；重复名称的颜色基于其超家族或类别。X 轴为 WorldClim 变量：Bio2—平均日温差，Bio3 等温性 (Bio2/Bio7) ( × 100)，Bio5—最热月份最高温度，Bio6—最冷月份最低温度，Bio13—最湿月份降水量，Bio14—最干旱月份降水量，Bio19—最冷季度降水量和 Elev—海拔数据。(b) 获得的偏差分割分析的维恩图，用于评估 Erythrostemon 物种内所有 TE 丰度中的环境（绿色）变量和系统发育（灰色）的相对重要性。
20K08242 研究成果报告书
研究成果概要（中文）：首席研究员此前已证明，怀孕小鼠肠道细菌的紊乱会影响出生后的大脑发育，从而导致后代的行为变化（Tochitani，2016：紊乱的母体肠道菌群模型）。在本研究中，我们利用这种紊乱的母体肠道菌群模型，研究了紊乱的母体肠道菌群如何影响出生后早期后代肠道菌群的建立。结果表明，后代的肠道菌群紧密继承了母体肠道菌群紊乱的特征。然而，我们还发现，一些在紊乱的母体肠道菌群中表现出高相对丰度的细菌属在后代中生长受到抑制。这表明肠道菌群从母亲到后代的传递取决于细菌分类。
行星大气的激光边缘探测方法......
Haris Riris 1，James B. Abshire 1，Michael Mumma 1，Geromino Villanueva 1，Thomas Hanisco 1，1 Grogdard太空飞行中心，8800 Greenebelt Rd。 简介：我们描述了一种效率和敏感方式来绘制行星气氛中痕量气体丰度的方法。 该方法使用一对在圆形极性轨道形成中飞行的小卫星。 每个卫星都带有几个可调的单频率二极管激光器和一个灵敏的光学检测器。 每个卫星的激光束都通过行星气氛的肢体指向，以照亮另一个卫星。 通过痕量吸收线调整二极管激光的波长，可以在另一个卫星接收器处测量的路径中的气体刺激。Haris Riris 1，James B. Abshire 1，Michael Mumma 1，Geromino Villanueva 1，Thomas Hanisco 1，1 Grogdard太空飞行中心，8800 Greenebelt Rd。简介：我们描述了一种效率和敏感方式来绘制行星气氛中痕量气体丰度的方法。该方法使用一对在圆形极性轨道形成中飞行的小卫星。每个卫星都带有几个可调的单频率二极管激光器和一个灵敏的光学检测器。每个卫星的激光束都通过行星气氛的肢体指向，以照亮另一个卫星。通过痕量吸收线调整二极管激光的波长，可以在另一个卫星接收器处测量的路径中的气体刺激。
探索银河系最近的目的地
由于时间通常是此类问题中唯一的独立变量，我们必须制定策略来发现适宜居住的地方并利用地外能源。这一目的回顾了太空探索在第二代生物燃料、聚变、生物特征、技术特征、原子丰度曲线、核合成（即燃烧 H、He、C、Ne、O、Si、Fe）等领域的研究问题。从氢进行氦、氧和氖的核合成，以及从捕获过剩的大气碳和甲烷进行铁的核合成，可以为太空探索提供宝贵的物质资源并促进技术科学知识。无论如何，聚变与其他有效手段相结合，是星际旅行的一个有前途的技术项目，而从这个角度来看，控制核扩散的伦理问题也必须得到解决。因此，功利主义应该得到责任和组合学的帮助。
使用贝叶斯模型和机器学习的银河系中的系外行星
已经知道了几个相关年龄相关的过程。例如，许多系外行星可能在恒星辐射的影响下可能遭受近乎完全的大气损失（Fulton等人。2017，van Eylen等。 2018），无论是在其生命的头亿年（例如Owen＆Wu 2013）还是在数十亿年（Gupta＆Schlichting 2019）。 即使气氛幸存下来，它们的性质也会随着数十亿年的时间表的冷却而变化（Lopez＆Fortney 2014）。 同时，系外行星的岩心是由Fe，Mg和Si等元素制成的。 随着星系的发展，这些元素的相对丰度发生了变化，最近显示出恒星的丰度和小行星的密度是连接的（Adibekekyan等人。 2021），观察到岩石行星组成与恒星年龄之间的直接联系（Weeks等人 2024）。2017，van Eylen等。2018），无论是在其生命的头亿年（例如Owen＆Wu 2013）还是在数十亿年（Gupta＆Schlichting 2019）。即使气氛幸存下来，它们的性质也会随着数十亿年的时间表的冷却而变化（Lopez＆Fortney 2014）。同时，系外行星的岩心是由Fe，Mg和Si等元素制成的。随着星系的发展，这些元素的相对丰度发生了变化，最近显示出恒星的丰度和小行星的密度是连接的（Adibekekyan等人。2021），观察到岩石行星组成与恒星年龄之间的直接联系（Weeks等人2024）。
怀孕期间接触金属的关联...
摘要：已建议对肠道微生物组的改变和在怀孕期间接触金属的变化会影响炎症性肠病。尽管如此，产前接触金属的暴露最终如何对肠道微生物组产生长期影响，从而导致亚临床肠道炎症，尤其是在儿童晚期，尚未研究。也未知这种互动效应是否将特定的儿童亚组驱动到对肠道炎症的敏感性提高。我们将机器学习技术与基于回归的框架进行了合并，以探索是否具有不同肠道微生物组的儿童以及怀孕期间某些暴露于金属的模式（金属 - 微生物群）具有较高的肠道炎症的可能性，基于粪便Calprotectin（FC）（fc）（fc）。我们从墨西哥市的墨西哥城（n = 108）中获得了良好的纵向出生队列的样品。在妊娠的第二和第三种三物种中，全血中测量了11种金属。肠道微生物的丰度和FC在9-11岁儿童的粪便样品中测量。升高的FC定义为FC高于100μg/g的凳子。我们确定了微生物和金属 - 微生物集团特征的儿童亚组（错误发现率（FDR）<0.05）。这项探索性研究表明，在怀孕期间，患有特定肠道微生物的儿童和对金属的特定暴露模式可能在儿童晚期可能具有较高的粪便钙蛋白钙蛋白酶水平，表示肠道炎症的风险升高。，我们发现了两个金属 - 微生物簇的特征与FC的升高显着相关：（1）在三个月的较低剖宫产（CS）和铜（CU）和腹膜的相对丰度较低（或[95％CI]：10.27 [3.57,52]，第三个trim和fdr <0.001），以及（fdr <0.001），以及（2），以及（2）和（2）。 Roseburia Inulinivorans和Ruminococcus Torques的丰度（或[95％CI]：7.21 [1.81,28.77]，FDR <0.05）。关键字：杂物组，金属，机器学习，微生物组，环境流行病学，肠道炎症■简介
肠道微生物群和与HIV暴露于未感染的婴儿T细胞调节有关的其他因素
结果：出生时，包括原型CD4+FOXP3+和CD4+FOXP3+CD25+的3个Treg子集的频率高于117 Huus的频率，而3个子集的频率更高。在28和62周龄时，huus中有5个TREG/TICI子集的比例高。出生时Heus和Huus之间发散的Treg/ TICI子集的频率与母体肠道微生物组中细菌分类群的差异相对丰度相关。随后访问时具有显着不同频率的Treg/TICI子集与婴儿肠道微生物组的并发组成相关。在体外，用细菌分类群（PBMC）处理HUU外周血单单核细胞（PBMC）在heus中最丰富的细菌分类群扩展了huus的treg/tiCi亚群，其经频率高于Huus，从而概括了体内相关性。相反，对HEU PBMC的体外治疗不会增加Treg/TICI频率。与Treg/TICI频率增加相关的其他因素