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河流的间歇性影响空间量表的生物多样性 - 稳定关系：对不确定的未来的影响
fi g u r e 1这个框中的概念图描述了在不同空间尺度上运行的metAcmunity稳定性的不同机制。在所有情况下，具有不同颜色的实线表明了不同物种的丰富性，而面板中的虚线B和C表示元社区中所有物种的汇总丰度。在面板A中，场景（a）说明了一个情况，其中一个物种随着时间的流逝而在丰度或生物量中差异很大。在A面板中，方案（b）与方案（a）相比，由于当地社区中的物种异步，本地社区的稳定性有所提高。在面板A中，场景（C）由于存在高度稳定的物种而实现了本地社区的稳定性。面板B表示从（a）到（c）的每个本地社区由不同物种（即高β多样性）组成的情况。在这种情况下，高β多样性可以增强由于不同当地社区不同物种之间的空间异步而引起的元社区稳定性。在面板C中，可以说明一种情况，在这种情况下，由于平均物种稳定性（方案[A]）或局部物种异步，所有当地社区都稳定。在这种情况下，由于每个当地社区的稳定性高，可以实现区域稳定。
产前金属暴露和儿童肠道微生物特征与儿童晚期有关抑郁评分
背景：儿童抑郁症是全球主要的公共卫生问题。先前的研究将产前金属暴露和肠道微生物组与儿童的抑郁症联系起来。但是，很少有（如果有的话）研究了它们在儿童特定亚组中的相互作用。目标：使用可解释的机器学习方法，这项研究调查了产前金属和儿童微生物特征（金属或金属和Mi Crobes组）的SPE CIFIC组合的儿童是否更可能在9至11岁时具有较高的抑郁症分数。方法：我们从墨西哥城及其微生物组的典型小儿纵向出生队列中利用数据（n = 112）。在妊娠的第二和第三种三物种中，在母体全血样品中测量了11种金属暴露。使用shot弹枪元基因组测序在9 - 11岁的孩子下测量肠道微生物的丰度。使用儿童抑郁指数（CDI）T得分在9 - 11岁时评估抑郁症状。我们使用了微生物和化学暴露分析（MICXA），该分析将可解释的机器学习结合到回归框架中，以识别和估计特定亚组中金属微生物集团的联合关联。分析。
人类肠道中古细菌与细菌之间的好坏处置：元基因组调查和共发生分析的新见解
古细菌是人类微生物组的研究成分。在这项研究中，通过全基因组shot弹枪测序分析了来自不同地区的60名健康成年人的肠道考古组和BAC TERIOME。古细菌无处不在，在广泛的丰度中发现了高达7.2％。主要的古细菌门是甲烷杆菌，特别是家族甲烷科，涵盖了50个样本中超过50％的古细菌。先前被低估的热质量，主要由甲基菌科菌科组成，主要由10名受试者（> 50％）组成，并且在其他所有受试者中都存在。hal ubacteriota，唯一的其他古细胞门，以微不足道的浓度发生，除了两个样品（4.6 - 4.8％）。这一发现证实了人类的肠道考古体主要由甲烷生物体组成，在已知的甲烷生成途径中：i）Co 2的氢化含量减少是前主要的，是甲苯基抗逆性杆菌属，物种甲烷基revibacter smithii是主要的smithii smithii，这是样品中主要的甲苯胺史密斯。 ii）涉及甲烷二菌的第二个途径是甲基化合物的氢养分还原。 iii）似乎不存在乙酸盐或甲基化合物的声誉。共发生的分析允许在古细菌和细菌之间揭示塑造微生物群落的整体结构的相关性，从而可以描绘出人类肠道古学的更清晰图片。
使用非人类灵长类动物模型
抽象的wependinnon-human灵长类动物（NHP），地中海消费术使乳房和乳房中乳酸杆菌的比例丰度转移了。此数据突出了有关肠乳腺微生物组互连的潜在联系。为了解决这个问题，我们比较了NHP研究中匹配的乳房和粪便样品中发现的细菌种群。饮食模式在两个地区同时改变了两个物种； lutetiensis链球菌和Ruminococcus Torques。当我们观察到乳房和肠道中乳酸杆菌丰度的类似趋势时，每个区域中鉴定出的物种都会有所不同。地中海饮食增加了乳房中乳酸杆菌的未指定物种，但在肠道中调节了动物乳杆菌和L. reuteri。我们还研究了肠道渗透性对乳房微生物组的影响。无论饮食模式如何，表现出肠道通透性的生理测量的受试者（血浆脂多糖升高，绒毛长度降低和杯状细胞减少）显示出明显不同的乳腺微生物组。肠道屏障功能障碍与乳腺组织中α多样性增加和显着不同的β多样性有关。一起，我们的数据支持乳房微生物组的存在受饮食影响，而饮食很大程度上与肠道微生物组的种群不同，但对肠道渗透性敏感。
从印度移民和印度 - 加拿大人中的非西方化向西方化肠道微生物组的过渡与饮食适应性有关
alpha多样性 - 使用16S扩增子序列，向前消失，反向读数在251个基础上被截断。框表示第一四分位数和第三四分位数之间的四分位间范围（IQR），水平线表示中位数，晶须是IQR的1.5倍以内的上和下值。alpha多样性。（a）Pielou的均匀度显示出显着差异（H = 85.7，P = 1.07E-17）。成对比较表明，印第安人的均匀均高于欧洲加拿大人（H = 56.2，Q = 6.51E-13），欧洲移民（H = 17.0，Q = 7.32e-05）和印度 - 加拿大人（H = 10.8，Q = 10.69e-03）。欧洲 - 加拿大的控制也比印度移民（H = 41.4，Q = 6.09e-10）和印度加拿大人（H = 21.7，Q = 8.10E-06）高得多。（b）香农的多样性显示出显着差异（H = 79.8，p = 1.89e-16）。成对比较表明，印第安人的多样性明显低于欧洲加拿大人（H = 56.7，Q = 3.91e-12），欧洲移民（H = 32.9，Q = 4.94E-08），印度 - 加拿大人，H = 14.3，Q = 14.3，Q = 2.59e-04）和Indo-Indo-Indo-Mignmants（H = 6. H = 17）6.66，6.66。欧洲 - 加拿大对照组的得分也明显高于印度移民（h = 20.0，q = 2.62e-05）和印度 - 加拿大人（h = 14.4，q = 2.59e-04）。beta多样性 - 使用shot弹枪序列，向前的反复读取和反向读数以10个碱基对修剪，固定最大长度为120个碱基对。使用Bray Curtis差异和加权Unifrac探索了Beta多样性，并使用成对的置换式多元方差分析（PermanOva）来测试组之间的差异。（c）Bray Curtis原理坐标分析（PCOA）图显示，在前两个轴上捕获了45.3％的变异。与Bonferroni校正的成对比较显示，大多数群体之间存在显着差异，印第安人和西方同类群的印第安人和印度移民的明显聚类。（d）加权unifrac PCOA图显示，在前两个轴上捕获了61.8％的变化，还检测到显着差异。成对比较结果可以在附录E中找到。印度的肠道表现出了杆菌和蛋白质细菌的占主导地位，欧洲加拿大人表现出很高的富公司。印度移民的消失（挥发性和/或与人类工业化社会有效）相关的大量分类单元，包括Eubacterium和Erysipelotrichaceae。印度 - 加拿大人拥有诸如Collinsella等消失的分类单元，以及Blossum（Bloom或在城市化/现代化社会中被选中）的大量丰富，例如Anaerostipes和Blautia。
免疫磁捕获粪便杆菌的prausnitzii有选择地修饰粪便菌群及其免疫调节型
抽象的粪便裂门代表着健康成年人人类肠道菌群中最丰富的细菌群之一，可以占细菌总人群的10％以上，这是粪便核酸杆菌prausnitzii是唯一的收获物种。人类肠道中F. prausnitzii的丰度减少与几种人类疾病有关，例如克罗恩病。在这项研究中，我们制定了一种策略，以修改粪便中的F. prausnitzii在粪便中的相对丰度，以评估其对肠道微生物群对使用外外血单核细胞（PBMC）模型的肠道微生物群对免疫调节作用的贡献。，我们使用对F. prausnitzii M21表面的多克隆抗体，使用免疫分化技术从合成和人类粪便菌群中捕获细菌。作为一项原理研究，在PBMC模型中评估了以上提到的免疫分化技术的相对丰度，具有不同的prausnitzii相对丰度的菌群（HDS）施加的免疫调节水平。为此，将PBMC与经过修改的菌群或F. prausnitzii的纯培养物共培养，然后将Crohn供体的微生物群添加到合文中。确定了细胞因子浓度，表明我们的经验模型支持该细菌的抗炎性作用。
通过Mavlink协议确保GCS与无人机之间的安全通信
摘要人类呼吸的分析是一个非常活跃的研究领域，这是由在护理点上快速，容易且无创的工具进行医学诊断的愿景的驱动。毫米波频谱（MMWGS）是一种适合此应用的新型技术，因为它具有高灵敏度，特异性和选择性。最重要的是，它提供了适用于医生办公室或医院的紧凑型低成本系统的视角。在这项工作中，我们证明了使用MMWGS在医疗环境中获得的呼吸样品分析，并评估该方法的有效性，可靠性以及局限性和观点。为此，我们研究了来自慢性阻塞性肺病患者的28个重复样品，并将结果与气相色谱 - 质谱法（GC-MS）进行了比较。使用无校准拟合模型进行了数据的量化，该模型精确地描述了数据并提供了绝对数量。对于乙醇，丙酮和乙腈，结果与GC-MS测量非常吻合，并且与GC-MS一样可靠。重复样本偏离平均值仅6％至18％。MMWG的检测极限在很大程度上取决于分子物种。 例如，通过MMWGS系统可以将乙腈追溯到1.8×10 - 12 mol，这与GC-MS系统相当。 我们观察到甲醛和乙醛之间以及乙腈和乙醛之间的丰富性相关性，这证明了MMWGS在呼吸研究中的潜力。MMWG的检测极限在很大程度上取决于分子物种。例如，通过MMWGS系统可以将乙腈追溯到1.8×10 - 12 mol，这与GC-MS系统相当。我们观察到甲醛和乙醛之间以及乙腈和乙醛之间的丰富性相关性，这证明了MMWGS在呼吸研究中的潜力。
生物电化学反应器中对比浅海热液环境中电营养微生物的富集
结果：在碱性样品中，在 Prony 热液条件下（pH 10，30–75 °C）运行 6 天的 15 个反应器中均未观察到电流增加。相比之下，在 Panarea 热液条件下（pH 4.5–7，75 °C）运行的反应器中平均观察到 6 倍的增加。多因素分析显示，这些反应器的整体生物电化学性能使它们有别于所有其他 Panarea 和 Prony 条件，这不仅是因为它们具有更高的电流产量，还因为它们具有古细菌丰度（通过 qPCR 测量）。大多数反应器产生有机酸（6 天内高达 2.9 mM）。尽管如此，库仑效率表明这可能是由于培养基中微量酵母提取物的（电）发酵而不是 CO 2 固定。最后，通过 16S 宏条形码和排序方法描述了微生物群落，并确定了潜在的电营养类群。在帕纳雷亚反应堆中，较高的生长与一些细菌属有关，主要是芽孢杆菌和假交替单胞菌，其中前者在较高温度下（55°C 和 75°C）生长。在重现普罗尼湾热液条件的反应堆中，已知的兼性甲基营养菌，如鞘氨醇单胞菌和甲基杆菌占主导地位，似乎消耗甲酸盐（作为碳源），但不消耗来自阴极的电子。
盐胁迫对水稻根际土壤细菌群落的影响
盐分是限制沿海滩涂土地利用的首要因素，根际微生物在增强作物抗逆性方面发挥着至关重要的作用，对环境变化高度敏感。水稻（Oryza sativa L.）是盐渍土改良的首选作物。本研究通过高通量测序技术，对不同盐胁迫处理下水稻根际土壤微生物群落进行了研究。研究发现，盐胁迫改变了水稻根际土壤细菌群落多样性、结构和功能。盐胁迫显著降低了水稻根际土壤细菌群落的丰富度和多样性。盐胁迫下，细菌群落中绿弯菌门、变形菌门和放线菌门丰度较高，厚壁菌门、酸杆菌门和粘球菌门相对丰度降低，拟杆菌门和蓝藻门相对丰度增加。水稻根际土壤细菌群落功能主要有化学异养、好氧_化学异养、光能营养等，其中化学异养和好氧_化学异养NS3（基土中添加3‰NaCl溶液）处理显著高于NS6（基土中添加6‰NaCl溶液）处理。本研究为开发水稻专用耐盐微生物菌剂提供了理论基础，为利用有益微生物改善滨海盐渍土土壤环境提供了可行的策略。
应用定量PCR调查
摘要：众所周知，海洋恐龙植物属的种类会产生各种有效的生物毒素，并会形成有害的花朵，从而引起鱼和壳的质量。迄今为止，韩国已经报道了K. Mikimotoi物种的有害花朵，但K. papilionacea最近在韩国南部海岸记录了。在这里，我们开发了一种定量的实时PCR（QRT-PCR）测定法，并具有特定的引物对，以精确检测和量化这两个外观外观相似的未武装物种K. Mikimotoi和K. papilionacea，并研究了其在韩国沿海水域的分布和动态。总体而言，K。papilionacea不仅具有更大的分布，而且比在地表水中的K. mikimotoi（3–122细胞L -1）的细胞丰度更高（15–2553细胞L -1）。在18个采样地点中，发现两个karenia物种在两个地点共存。在固定站（S5）进行监测期间，K。Papilionacea通常比K. Mikimotoi占主导地位。但是，这两个物种表现出相似的动力学，偶尔同时发生。两种karenia物种均对温度和盐度的生理反应相似，需要相似的最佳生长条件。这些结果表明，这两个物种的开花可能会同时发生并引起对海洋环境的协同不利影响。