描述:重组人全长ADAR1(腺苷脱氨酶,RNA特异性1)转录本1,包含氨基酸2-1226(END)。该蛋白质包含感兴趣的突变E1008Q。此构造包含一个N末端标记标签。重组蛋白具有亲和力纯化。背景:ADAR1(腺苷脱氨酶,RNA特异性1)对RNA中的腺苷进行腺苷进行腺苷,尤其是针对位于特定茎环基序结构中的腺苷。有人提出,ADAR进化为为转录组提供额外的多样性,而大多数ADAR编辑事件发生在非编码RNA中,但其中一些(包括规范GLUA2编辑位点)改变了编码蛋白的氨基酸序列。adar1通过缓解干扰素信号传导在先天免疫中起作用。ADAR1功能障碍会导致自身免疫性疾病,并影响癌细胞的生长和增殖以及对免疫疗法的肿瘤反应。由于ADAR识别双链RNA,因此抑制或修饰RNA病毒的功能也起作用。因此,它与病毒进化和病毒变体(例如SARS-COV-2变体)的出现有关。已经提出了ADAR1的E1008Q突变体比其野生型具有更高的编辑活性,其突变存在于蛋白质的脱氨酶结构域中的高度保守的谷氨酸盐中。物种:人类结构:ADAR1(E1008Q)(FLAG-2-1226(END))浓度:0.39 mg/ml表达系统:HEK293纯度:80%格式:水缓冲液溶液。MW:137 KDA GenBank登录:NM_001111稳定性:-80°C至少6个月。以:50 mM Tris-HCl,pH 8.0、750 mm NaCl,0.01%Triton X-100、10%甘油和100μg/ml的FLAG肽。存储:-80°C使用的说明:在冰上解冻,并在使用前轻轻混合。不要涡旋。在打开前进行快速旋转。等分的小容量,然后闪烁冻结以进行长期存储。避免多个冻结/解冻周期。测定条件:根据ADAR1:RNA TR-FRET分析套件(#82252)进行测定,具有不同量的ADAR1(E1008Q),FLAG-TAG重组(#102535)。应用程序:
作用于 RNA ADAR1 的腺苷脱氨酶促进双链和结构化 RNA 中的 A 到 I 转换。ADAR1 有两种异构体,它们从不同的启动子转录:细胞质 ADAR1p150 是干扰素诱导的,而 ADAR1p110 是组成性表达的,主要位于细胞核中。ADAR1 突变会导致艾卡迪-戈蒂埃综合征 (AGS),这是一种与异常 IFN 产生相关的严重自身炎症疾病。在小鼠中,ADAR1 或 p150 异构体的缺失会导致胚胎死亡,这是由干扰素刺激基因的过度表达引起的。这种表型通过删除细胞质 dsRNA 传感器 MDA5 得到挽救,表明 p150 同工型是不可或缺的,不能被 ADAR1p110 挽救。尽管如此,ADAR1p150 唯一针对的编辑位点仍然难以捉摸。在这里,通过将 ADAR1 同工型转染到无 ADAR 的小鼠细胞中,我们检测到了同工型特异性的编辑模式。使用突变的 ADAR 变体,我们测试了细胞内定位和 Z-DNA 结合域的存在如何影响编辑偏好。这些数据表明 ZBD 对 p150 编辑特异性的贡献很小,而同工型特异性编辑主要由 ADAR1 同工型的细胞内定位指导。我们的研究通过对异位表达标记 ADAR1 同工型的人类细胞的 RIP-seq 进行补充。两个数据集均表明 ADAR1p110 富集了内含子编辑和结合,而 ADAR1p150 优先结合和编辑 3'UTR。
根据法庭文件和庭审中提供的证据,奥斯汀 51 岁的 Sekhar Rao 医生是 ADAR Group LLC 的医疗总监。Rao 授权为 TRI CARE 受益人进行毒理学和基因检测,包括癌症基因检测,但并未见过、与患者交谈或以其他方式治疗患者,也未将检测结果纳入正在进行的治疗。在某些情况下,患者不知道他们接受的检测是什么。TRI CARE 受益人被诱骗提供尿液或唾液样本以换取 50 美元的礼品卡。庭审证据表明,Rao 收受了报酬,以换取签署医学上不必要的重复性毒理学和基因检测。
斯蒂芬·A·伯恩利 指挥士官长 美国陆军安全援助司令部 指挥士官长 (CSM) 斯蒂芬·A·伯恩利于 2022 年 12 月 16 日担任美国陆军安全援助司令部高级士兵顾问。CSM 伯恩利来自弗吉尼亚州亚历山大市,于 1993 年 2 月加入美国陆军。他在俄克拉荷马州西尔堡接受基本训练,在德克萨斯州布利斯堡接受高级个人训练,以 14S 复仇者机组成员的身份毕业。在他的职业生涯中,他曾在空降和防空炮兵部队担任过各种职务,从毒刺炮手到指挥士官长。他之前的工作包括:德克萨斯州布利斯堡 CSM 32D 陆军防空反导司令部;德国凯泽斯劳滕第 10 陆军防空反导司令部 CSM;德国莱茵军械兵营第 7 防空炮兵第 5 营 CSM;作战士官长,第 3 防空炮兵团第 4 营,俄克拉荷马州西尔堡;高级士兵顾问,伊拉克陆军第 8 师军事过渡小组(47433),MNF-S;一等军士,总部和总部炮兵连,第 108 防空炮兵旅(空降);一等军士,第 1 太空营、第 1 太空旅、日本沙里基、太空与导弹防御司令部第 1 太空营、第 3 支队;一等军士,阿尔法炮兵连,第 82 空降师,第 4 防空炮兵团(ADAR)第 3 营(空降),第 4 ADAR 第 3 营(空降)排长;军官基础课程教官,第 6 防空炮兵团第 4 营,德克萨斯州布利斯堡;路易斯安那州波尔克堡联合战备训练中心(空降)作战中士和观察员控制员;北卡罗来纳州布拉格堡第 82 空降师第 4 ADAR 第 3 营(空降)三角洲炮台毒刺科中士和小队队长;韩国斯坦顿营第 5 防空炮兵第 5 营复仇者机组成员。CSM Burnley 完成了许多军事学校和课程,包括济州岛绳降和登山、丛林作战、跳伞长、格斗、联合火力、战斗参谋、陆军部队管理、高级士兵联合专业军事教育和高级军事过渡团队课程。他完成了士官教育系统各级的课程,并且毕业于美国陆军士官长学院第 61 班(驻地)和执行领导课程。他拥有理学学士学位。他获得的奖章和勋章包括功绩勋章、铜星勋章、功绩服务勋章(1 枚银勋章和 2 枚橡树叶勋章)、陆军嘉奖勋章(1OLC)、陆军成就勋章(4OLC)、联合功绩单位奖、陆军上级单位奖(1OLC)、陆军优良品行勋章(第 8 次颁发)、国防服务勋章(带铜星)、韩国国防服务勋章、伊拉克战役勋章、全球反恐战争服务勋章、人道主义服务勋章、海外服役勋章(带数字 5)、军事杰出志愿服务奖章、跳伞大师徽章、英国皇家跳伞员徽章,并且是圣芭芭拉古代教团的成员。他已婚,有两个孩子。
本科生研究,奖学金和创意活动会议非常感谢教师的赞助商和其他人的指导为我们的演示者提供的研究做出了贡献。我们还要感谢许多在加州大学戴维斯分校慷慨支持和鼓励本科研究和创意活动的计划。包括:贝克曼学者计划;加利福尼亚州少数民族参与联盟(CAMP);教育丰富的外展计划(BUSP,BUSP-HONORS,BSHARP-MARC,CURE,ADAR);食品与健康创新研究所(IIFH)实习与职业中心;麦克奈尔学者计划;人文,艺术,文化研究和社会科学方面的导师计划;农业,信件和科学的本科研究指导(壁画);体育和数学科学(MURPPS)的本科研究参与者的指导;教务长的本科奖学金;大学荣誉计划;加州大学戴维斯加州大学华盛顿大学计划; UC通过高级学位(UC Leads)和垂直整合项目(VIP)卓越领导力卓越。
抽象的RNA编辑是在正常生理过程中观察到的最普遍,最丰富的转录后RNA修饰形式之一,在包括癌症在内的疾病中通常异常。RNA编辑会改变mRNA的序列,使其与源DNA序列不同。编辑的mRNA可以产生与相应基因组编码的蛋白质同工型功能不同的编辑蛋白质同工型。哺乳动物中的主要类型RNA编辑是通过在双链RNA(DSRNA)中或前mRNA转录本中的双链RNA(DSRNA)或发夹中酶脱氨酸对腺苷(A-to-I)的酶促脱氨酸的。催化这些过程的酶属于作用于RNA(ADAR)家族的腺苷脱氨酶。 使用体外癌细胞培养模型获得了与人类疾病相关的RNA编辑景观的绝大多数知识。 但是,这种体外模型的局限性是,获得的结果的生理或疾病相关性不一定是显而易见的。 在这篇综述中,我们专注于讨论在人类癌组织中使用手术切除或从患者临床检索的样品中发现的RNA编辑事件。 我们讨论体内肿瘤中发生的RNA编辑事件如何识别与人类癌症生理学相关的病理信号传导机制,这与癌症进展的不同阶段有关,包括起始,促进,生存,生存,增殖,免疫逃生和转移。催化这些过程的酶属于作用于RNA(ADAR)家族的腺苷脱氨酶。使用体外癌细胞培养模型获得了与人类疾病相关的RNA编辑景观的绝大多数知识。但是,这种体外模型的局限性是,获得的结果的生理或疾病相关性不一定是显而易见的。在这篇综述中,我们专注于讨论在人类癌组织中使用手术切除或从患者临床检索的样品中发现的RNA编辑事件。我们讨论体内肿瘤中发生的RNA编辑事件如何识别与人类癌症生理学相关的病理信号传导机制,这与癌症进展的不同阶段有关,包括起始,促进,生存,生存,增殖,免疫逃生和转移。
遗传性视网膜疾病 (IRD) 是一组异质性罕见眼病,通常由单基因突变引起,被认为是基因治疗的热门靶点。在 RPE65 突变导致的莱伯氏先天性黑蒙的 IRD 基因替代疗法获批后,国际上展开了密集的研究,以确定一系列 IRD 的最佳基因治疗方法,目前许多方法正在进行临床试验。在本综述中,我们探讨了 IRD 带来的治疗挑战,并回顾了可能适用于不同 IRD 突变子集的当前和未来方法。重点放在五种不同的基因治疗方法上,这些方法有可能治疗全谱 IRD:1)使用腺相关病毒(AAV)和非病毒递送载体进行基因替换,2)通过 CRISPR/Cas9 系统进行基因组编辑,3)通过内源性和外源性 ADAR 进行 RNA 编辑,4)使用反义寡核苷酸进行 mRNA 靶向以进行基因敲除和剪接修饰,以及 5)光遗传学方法,旨在通过设计其他视网膜细胞类型使其具有光转导能力来取代天然视网膜光感受器的功能。
合成生物学的目标之一是能够设计具有可编程输入和输出的任意分子电路。此类电路将电子电路和自然电路的特性结合起来,以可预测的方式在活细胞内处理信息。基因组编辑是合成分子电路的潜在强大组成部分,无论是用于调节目标基因的表达还是用于将信息稳定地记录到基因组 DNA 中。然而,将蛋白质-蛋白质相互作用或诱导接近等分子事件编程为基因组编辑的触发因素仍然具有挑战性。在这里,我们展示了一种称为“P3 编辑”的策略,它将蛋白质-蛋白质接近与功能性 CRISPR-Cas9 双组分向导 RNA 的形成联系起来。通过设计 crRNA:tracrRNA 相互作用,我们证明了各种已知的蛋白质-蛋白质相互作用以及化学诱导的蛋白质结构域二聚化可用于激活人类细胞中的原始编辑或碱基编辑。此外,我们还探索了 P3 编辑如何整合基于 ADAR 的 RNA 传感器的输出,从而可能允许特定 RNA 在更大的电路中诱导特定的基因组编辑。我们的策略增强了基于 CRISPR 的基因组编辑的可控性,有利于其在活细胞中部署的合成分子回路中的应用。
RNA 疗法对医学产生了巨大影响,最近迅速开发和部署用于抗击 COVID-19 大流行的 mRNA 疫苗就是一个例证。此外,通过选择性 mRNA 敲低或调节前 mRNA 剪接,已经开发出针对 RNA 靶向药物,用于治疗具有重大未满足医疗需求的疾病。最近,RNA 编辑,特别是反义 RNA 引导的腺苷脱氨酶作用于 RNA (ADAR) 的可编程 A-to-I 编辑,已成为操纵 RNA 的有力工具,可以纠正致病突变并调节基因表达和蛋白质功能。除了纠正致病突变外,该技术特别适合需要短暂药效学作用的治疗应用,例如治疗急性疼痛、肥胖、病毒感染和炎症,在这些情况下,不希望对基因组造成永久性改变。此外,蛋白质功能的瞬时调节,例如改变酶的活性位点或蛋白质-蛋白质相互作用的界面,为从再生医学到肿瘤学等各种治疗途径打开了大门。这些新兴的基于 RNA 编辑的工具集有望广泛影响生物技术和治疗应用。在这里,我们回顾了治疗性 RNA 编辑的新兴领域,重点介绍了最近的实验室进展,并讨论了临床开发道路上的关键挑战。
RNA 疗法对医学产生了巨大影响,最近迅速开发和部署用于抗击 COVID-19 大流行的 mRNA 疫苗就是一个例证。此外,通过选择性 mRNA 敲低或调节前 mRNA 剪接,已经开发出针对 RNA 靶向药物,用于治疗具有重大未满足医疗需求的疾病。最近,RNA 编辑,特别是反义 RNA 引导的腺苷脱氨酶作用于 RNA (ADAR) 的可编程 A-to-I 编辑,已成为操纵 RNA 的有力工具,可以纠正致病突变并调节基因表达和蛋白质功能。除了纠正致病突变外,该技术特别适合需要短暂药效学作用的治疗应用,例如治疗急性疼痛、肥胖、病毒感染和炎症,在这些情况下,不希望对基因组造成永久性改变。此外,蛋白质功能的瞬时调节,例如改变酶的活性位点或蛋白质-蛋白质相互作用的界面,为从再生医学到肿瘤学等各种治疗途径打开了大门。这些新兴的基于 RNA 编辑的工具集有望广泛影响生物技术和治疗应用。在这里,我们回顾了治疗性 RNA 编辑的新兴领域,重点介绍了最近的实验室进展,并讨论了临床开发道路上的关键挑战。