1。嘌呤碱基组(嘌呤)为太极时(胸腺素; T)和胞嘧啶; c)2。pyimidine碱基组包括腺嘌呤; A)和鸟嘌呤(G)。 Dee Syboss和磷酸盐中包括这种硝基 - 中心贝司化合物。这是由低音鲍兰与基础pyimidine(A-T,G-C)结合的一对线(图1)。所有4个核苷酸电缆的扩展都可用于分离生物可以不同的生物,使每个生物体中的遗传多样性和特异性。 div>
到编辑脂质纳米颗粒(LNP)已被广泛批准,并在全球范围内用于传递mRNA。lnps可以包装并传递mRNA编码的基因编辑器,包括腺嘌呤碱基编辑器,它们将T碱基对转换为无需双重DNA断裂或供体DNA的G C C碱基对(Gaudelli等,2017)。腺嘌呤基本编辑器是一种潜在的治疗方法,用于遗传性疾病营养不良的表皮溶液Bullosa(DEB)。deb是由COL7A1的致病变异引起的,导致功能障碍或不存在VII型胶原蛋白(C7),这是固定纤维的主要组成部分,它们粘附了皮肤E表皮连接,从而使皮肤稳定性(Bardhan等,2020)。目前无法治愈DEB;然而,W 90%的Col7a1变体是单核苷酸变体,c> t单核苷酸变体可用于W 60%的变体(Clinvar数据库; 2023年8月访问)。这些变体是由腺嘌呤碱基编辑器定位的;我们的小组和其他人已经证明了腺嘌呤基本编辑器在恢复病原变体和恢复C7表达方面的实用性(Osborn等,2020; Sheriff等,2022)。在这项研究中,我们首先探讨了新型LNP的使用,以mRNA格式传递ABE8E(Richter等,2020),其单一指定RNA(SGRNA)针对致病性C.5047 c> t col7aa1 col7a1 col7a1变体在患者锻造的纸张中
图 1. 开发腺嘌呤碱基编辑来纠正 SMN2 外显子 7 C6T。a、未受影响个体和脊髓性肌萎缩症 (SMA) 患者的 SMN1 和 SMN2 示意图。SMN1 中的突变会导致 SMA,因为 SMN 蛋白会消耗,而这可以通过编辑 SMN2 来恢复。b、与 SMN1 相比,SMN2 外显子 7 C 到 T (C6T) 多态性的示意图,其中有碱基编辑器 gRNA 靶位及其估计的编辑窗口。cd、当使用由腺嘌呤脱氨酶结构域 ABEmax 33,38、ABE8.20m 35 和 ABE8e 36 与野生型 SpCas9(面板 c)或 SpRY 37(面板 d)融合的 ABE 时,对 SMN2 C6T 靶向腺嘌呤和其他旁观者碱基进行 A-to-G 编辑,通过靶向测序进行评估。 e,使用 SpRY 或其他宽松 SpCas9 PAM 变体 43 对 SMN2 外显子 7 中的腺嘌呤进行 A 到 G 编辑,通过靶向测序进行评估。图 ce 中的数据来自 HEK 293T 细胞中的实验;n = 3 个独立生物学重复的平均值、sem 和单个数据点。
尽管DNA骨架的负电荷,但酸性残基(ASP/GLU)通常参与基础读数,对胞嘧啶的偏爱很偏爱。实际上,在已解决的DNA/蛋白质结构中,几乎完全通过ASP/GLU通过直接的氢键识别胞嘧啶,而与此同时,腺嘌呤,无论其氨基群如何,都没有显示出ASP/GLU的倾向。在这里,我们分析了ASP/GLU使用所选转录因子的经典和缩写模拟对序列特异性DNA结合的贡献,并发现它受骨链磷酸盐的排斥与有吸引力的相互作用与胞质相互作用之间的细分平衡。特别是,ASP/Glu降低了非循环位点的属性,因此充当了防止脱靶结合的负选择器。在含胞嘧啶的位点,有利的贡献不仅依赖于单个H键的形成,而且通常需要由多个细胞穿刺产生的阳性势能,而靶位点中观察到的过量的胞嘧啶在靶位点中始终如一。最后,我们表明,ASP/GLU对胞嘧啶而不是腺嘌呤的偏好是腺嘌呤咪唑环的排斥以及嘌呤 - 嘌呤二核苷酸采用BII构象的趋势。
在中央轴周围是反平行扭曲的两个多核苷酸链,形成右手双螺旋,沿顺时针方向向下旋转。这两个链通过氮碱的配对将其连接在一起。嘌呤碱(A&G)与嘧啶(T&C)碱基对。腺嘌呤对胸腺嘧啶和细胞氨酸对鸟嘌呤。 在A&T之间存在两个氢键,而C&G之间存在三个氢键。一个链中的腺嘌呤碱基数等于另一链中的胸腺胺碱数量,一个链中的细胞质碱基数等于另一链中的鸟嘌呤碱基数量。腺嘌呤对胸腺嘧啶和细胞氨酸对鸟嘌呤。在A&T之间存在两个氢键,而C&G之间存在三个氢键。一个链中的腺嘌呤碱基数等于另一链中的胸腺胺碱数量,一个链中的细胞质碱基数等于另一链中的鸟嘌呤碱基数量。
2. 蛋白质的生成量。重要的是,mRNA 还包含一种机制,以确保我们的细胞不会被过多的蛋白质所淹没。想想《我爱露西》中的场景,露西和埃塞尔无法跟上糖果包装线。我们的细胞也是如此。如果 mRNA 片段永远留在细胞中,细胞将继续产生该蛋白质并很快被它淹没。出于这个原因,mRNA 链具有限制“蓝图”在 mRNA 被破坏之前可以使用的次数的机制。发生这种情况的主要方式之一是 mRNA 链末端存在“poly(A) 尾巴”。“A”代表腺嘌呤,是 mRNA 的组成部分之一。一系列腺嘌呤分子排列在 mRNA 链的末端——就像一条尾巴。每次使用 mRNA 蓝图制造蛋白质时,都会移除一个腺嘌呤分子。最终,尾巴变得太短,mRNA 无法继续使用,并被细胞破坏。疫苗中传递的 mRNA 也会发生同样的过程。因此,疫苗传递的 mRNA 在接种几天后就会消失,而一旦 mRNA 蓝图消失,刺突蛋白就无法再制造。
非标准缩写和首字母缩写2-DG,2-脱氧葡萄糖; kg,α-ketoglutarate; ADP,腺苷二磷酸; AMP,单磷酸腺苷; ATP,三磷酸腺苷; Angii,血管紧张素II; Cr,肌酸; DHAP,二羟基丙酮磷酸盐;粮农组织,脂肪酸氧化; FBP,果糖双磷酸酯; G6P,6-磷酸葡萄糖; GSD,糖原储存疾病; KD,生酮饮食; Kegg,基因和基因组的京都百科全书; LF,低脂; MPC,线粒体丙酮酸载体; NAD+和NADH,氧化和还原烟酰胺腺嘌呤二核苷酸; NADP+和NADPH,氧化和减少烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸盐; PCR,磷酸盐; PEP,磷酸烯醇丙酮酸; P/M,丙酮酸/苹果酸; R5p,5磷酸核糖; RT-QPCR,逆转录定量PCR,SEDO7P,SEDOHEPTULOSE 7-磷酸盐; UDP,尿苷二磷酸盐; UHPLC,超高性能液相色谱
糖原储存疾病IA型(GSDIA)是由G6PC基因突变引起的常染色体隐性疾病,它破坏了葡萄糖稳态中的关键酶G6Pase 1。GSDIA患者患有低血糖,肝脏和肾脏的糖原和脂肪的积累,导致肝肿大和肾肿大。无法治愈。急性致命的低血糖,但肾脏疾病和肝细胞癌的长期并发症并未解决。与GSDIA相关的两个最普遍的G6PC突变是R83C和Q347X,均包含单个G> A的过渡突变。腺嘌呤碱基编辑器(ABES)可以使用基因组DNA中A•T到G•C的编程转换,并且原理可以用来精确纠正这些突变。在这里,我们设计了新颖的腺嘌呤基础编辑器(ABE)变体,以验证GSD1A的临床模型。
A019抑制烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的产生是一种有效的治疗策略,可使癌细胞中的同源重组失活。 Sadaf Valeh Sheida,加拿大魁北克魁北克市HDQ Pavilion的Chu deQuébec研究中心,加拿大魁北克市。A019抑制烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的产生是一种有效的治疗策略,可使癌细胞中的同源重组失活。Sadaf Valeh Sheida,加拿大魁北克魁北克市HDQ Pavilion的Chu deQuébec研究中心,加拿大魁北克市。
脱氧核糖核酸或DNA是一种双螺旋化合物,大多数人体都包含在细胞核的所有染色体中。DNA是遗传密码,该DNA的某些部分称为基因,这些基因传递了用于制造蛋白质的信息,这就是构成您的性状的原因。现在,核糖核酸(RNA)基本上是单链DNA,并且有3种不同类型的DNA都用于读取DNA。它从RNA聚合酶开始,该聚合酶沿着DNA的链移动,并使用核中剩余的游离核苷酸创建信使RNA,这是转录中的这一过程。在DNA核苷酸中成对称为碱基对;腺嘌呤与胸腺嘧啶,鸟嘌呤与胞嘧啶。当RNA聚合酶读取DNA时,它将其分为一半(打破碱基对),并添加新的,相应的核苷酸,对于胞嘧啶,它会添加鸟嘌呤,对于鸟嘌呤,它会添加胞嘧啶,为胸腺氨酸添加腺嘌呤,添加腺嘌呤,最后添加腺嘌呤,以添加Uracine。uracil是一种新化合物,用于构建RNA,但是DNA不包括它,就像RNA不包含胸腺素一样,换句话说,它们相互替代。所有这些后,使信使RNA准备转变为蛋白质,它必须从细胞中的细胞核和核糖体扫描它的细胞质中传播。在核糖体中,有称为转移RNA分子的分子,一旦读取了信使RNA,一次3个核苷酸,这些分子以链的形式释放氨基酸。这条氨基酸形成了复杂的形状,形成蛋白质,从而使其具有某些生物特征。