肿瘤切除术中神经活动的监测、神经外科手术[6–8]中慢性植入物中癫痫病灶的识别[9–11]以及神经假体。[12–17]为了在保留大量任务相关信息的同时尽量减少侵入性,人们对皮层电图 (ECoG) 和微皮层电图 (μ ECoG) 技术进行了广泛的研究。[18–22]对于皮层内微电极,由于与信号源的距离增加,ECoG 和 μ ECoG 都表现出一些固有的局限性。[23]此外,由于电极小型化和随之而来的阻抗增加,μ ECoG 会受到噪声增强的影响。[24,25]在这种情况下,脑记录将从原位第一级信号放大策略中受益匪浅。在克服这些限制的各种策略中,半导体技术已用于神经生理学应用。无机场效应晶体管已成功证明可作为体外生物电活动传感器,[26–28] 但它们在体内的应用受到无机半导体的化学和机械特性的限制,尤其是暴露于水环境时。[29] 这使得无机晶体管沦为微电极集成多路复用器的角色。[30]
(crRNA)或单个诱导RNA(SGRNA)将CAS ector蛋白引导至用于加工的特定核酸序列,例如,结合和/或裂解。在CRISPR - CAS技术之前,其他核酸结合蛋白,例如锌nger核酸酶(ZFN),6个转录激活剂核酸蛋白酶(tal-ens),7和8个转录激活蛋白,8个,8个,8次,工程为与特定c c and c cy c c c c c c c demomic cynomic cytemic cytemic contimic contimic cypeci c necy。9,10麦尿素,例如laglidadg归核核酸内切酶,特定识别14至40个碱基对的双链DNA序列,并启用DNA序列的修改和缺失。8个ZFN要求将多个锌nger基序连接起来,每个基序都针对一个核苷酸三重态。10 Talens需要一个DNA结合结构域,其中每个氨基酸与四种类型的核苷酸之一的特异性结合。10这些系统需要针对不同目标位点的工程不同的融合蛋白,因此并不广泛适用。CRISPR - CAS技术克服了这个问题。可以通过使用设计用于识别基因序列的cRRNA来实现不同的基因序列。CRRNA介导的CRISPR指导的可编程特征尤其有利。因此,CRISPR - CAS
au:PleaseconfirnheadinglevelsarerePresentedCorrecty:高通量测序(HTS)彻底改变了微生物学,但是在自然环境中,许多微生物在其自然环境中存在较低的丰度,并且在实验室中很难(如果不是不可能)进行文化。这使得使用HTS研究许多重要的微生物和病原体的基因组具有挑战性。在这篇综述中,我们讨论了选择性整个基因组扩增(SWGA)的开发和应用,以使整个或部分基因组直接从复杂的生物学样本中对低丰度微生物进行测序。我们重点介绍了SWGA生成的基因组数据已被用来阐明重要人类病原体的种群动态并监测抗菌素耐药性的发展以及潜在暴发的出现。我们还描述了这种方法的局限性,并提出了一些潜在的创新,这些创新可用于提高SWGA的质量,并降低在更广泛的传染病范围内使用该方法的障碍。
摘要 背景 E3 泛素连接酶鼠双微体 2 (MDM2) 结合 p53 转录激活结构域并作为 TP53 通路的强效抑制剂,TP53 通路是尿路上皮癌 (UC) 中三种最关键的致癌通路之一。然而,MDM2 扩增在 UC 中的临床意义及其对肿瘤免疫背景的影响仍不清楚。 方法 本研究分析了来自两个当地队列(ZSHS 队列和 FUSCC 队列)的 240 名具有匹配临床注释的 UC 患者。我们通过免疫组织化学分析和靶向测序评估了 MDM2 状态与临床结果、治疗效果和免疫学特征之间的相关性。此外,来自五个独立外部队列的 2264 个 UC 样本(包含基因组、转录组和临床数据)用于验证。结果 MDM2 扩增 (MDM2 Amp) 或蛋白质过表达 (MDM2 OE) 与 UC 患者总体生存率较低 (ZSHS 队列,Log-rank p<0.001;FUSCC 队列,Log-rank p=0.030) 和对铂类化疗 (ZSHS 队列,Log-rank p<0.001) 以及抗 PD-1/PD-L1 免疫疗法 (FUSCC 队列,Log-rank p=0.016) 的反应降低有关,无论 TP53/p53 状态如何。MDM2 扩增或过表达进一步与具有去分化形态的高级别 UC 肿瘤相关。此外,MDM2 扩增或过表达的 UC 与免疫逃避结构相关,其特征是三级淋巴结构浸润比例较低、CD8 + T 细胞、IFN-γ + 细胞、GZMB + 细胞丰度较低,以及免疫检查点分子表达降低,包括程序性死亡配体 1 (PD-L1)、程序性死亡-1 (PD-1) 和细胞毒性 T 淋巴细胞相关蛋白 4 (CTLA-4)。结论 MDM2 扩增或过表达定义了一组致命的 UC 患者,无论 TP53 /p53 状态如何,其预后较差,并且对铂类化疗和免疫疗法均有耐药性。这些肿瘤的特点是去分化形态和免疫抑制微环境。准确
3.对于可能损害正常功能的状况,鼓励评估功能能力以确定在生理需求条件下的健康状况。这包括完整的心脏评估,包括压力成像(当有冠状动脉疾病时)或官方功能能力检查(FCE)(针对骨科问题)。评估提供者应特别注意可能对个人或他人造成危险和/或妨碍在部署环境中执行功能要求的任何情况。此外,必须将剧院环境中药物的类型、数量、适用性和可用性视为潜在限制。部署前处理中心的医疗检查/筛查程序可能有所不同;个人应联系各自的动员地点以获取处理清单。
简介:微生物在牙髓疾病的发病机制中起着重要作用。在提高牙髓样本中微生物检测、鉴定和计数的灵敏度方面取得了重大进展。本研究的目的是比较培养和全基因组扩增(WGA)随后进行 PCR 检测在根管化学机械制备(CMP)之前和之后的细菌检测中的效果。方法:分析了 10 颗患有原发性牙髓感染的单根牙。在 CMP 之前和之后用纸尖收集微生物样本,将其分成两组:(i)将培养测定样本接种到含有 5% 脱纤维羊血、甲萘醌和血红素的布鲁氏菌琼脂上,并在 36°C 下厌氧孵育 14 天; (ii) 从分子测定样本中提取 DNA,并用 Phi29 DNA 聚合酶通过等温链置换进行 WGA,然后进行 PCR 以确定细菌的存在。结果:在两种测定中,CMP 之前的样本都显示所有 10 颗牙齿中都存在细菌。然而,在 CMP 之后,在进行的测定中细菌检测有所不同(p = 0.0198)。通过 WGA 随后的 PCR 在 70%(10 个中的 7 个)的样本中检测到细菌的存在,而只有 10%(10 个中的 1 个)在培养方法中显示细菌生长。结论:在使用 NaOCl 作为 CMP 冲洗剂进行根管治疗后,WGA 随后的 PCR 相结合增加了从根管样本中检测到的微生物。因此,这种技术组合可以成为一种重要的工具,以提高根管研究中的微生物检测率。
为了评估MET扩增与NSCLC免疫疗法的疗效之间的相关性,收集并处理了两个NSCLC临床队列中IC-治疗患者的数据,如图S1所示。Rizvi等人的第一个ICI处理的队列。主要由240个NSCLC样品(n = 240)组成,具有CNA,体细胞突变和临床数据(19)。Rizvi等人的样品。 队列(n = 240)使用纪念sloan kettering综合的突变分析(MSK-IMPACT)面板进行了测序。 作为Samstein等人的ICI处理的队列。 (20)仅由四名MET扩增患者组成,我们收集了CNA,肿瘤突变负担(TMB)以及来自南部医科大学,广州胸部医院和第一人民医院的另一位ICI治疗队列的临床数据。 共有10例患者接受ICI(抗PD-1单一疗法,≥3个治疗线),以研究MET扩增对NSCLC免疫疗法预后的影响。 在https://cdn.amegroups.cn/static/public/atm-21-4543-1.docx中列出了MET扩增患者的详细临床特征。 这项研究是根据赫尔辛基宣言(2013年修订)进行的,并得到了南科尔大学朱吉安格医院的伦理委员会的批准。Rizvi等人的样品。队列(n = 240)使用纪念sloan kettering综合的突变分析(MSK-IMPACT)面板进行了测序。作为Samstein等人的ICI处理的队列。(20)仅由四名MET扩增患者组成,我们收集了CNA,肿瘤突变负担(TMB)以及来自南部医科大学,广州胸部医院和第一人民医院的另一位ICI治疗队列的临床数据。共有10例患者接受ICI(抗PD-1单一疗法,≥3个治疗线),以研究MET扩增对NSCLC免疫疗法预后的影响。在https://cdn.amegroups.cn/static/public/atm-21-4543-1.docx中列出了MET扩增患者的详细临床特征。这项研究是根据赫尔辛基宣言(2013年修订)进行的,并得到了南科尔大学朱吉安格医院的伦理委员会的批准。
简介:发生的犯罪行为行为具有多种模式和动机。此外,罪犯总是试图在犯罪现场隐藏或消除证据。在大多数情况下,警察或法医专家经常在犯罪现场发现DNA。这些物品之一是戒指,这是人类经常穿的物品。方法:本研究使用了24个已戴8小时并在室温下孵育的环样本。然后将所有这24个样品区分为4组,其中每组由6个样品组成,并在0、1、3和7天孵育。DNA鉴定。Results: The mean result of DNA quantification on day 0 (control) was 1020,833 ± 0.28903 ng/μL, day 1 was 546 ± 0.093569 ng/μL, day 3 was 1066.333 ± 0.117372 ng/μL, and day 7 was 1054.083 ± 0.070733 ng/μL.PCR工艺使用了带有基因座VWA,FGA和TH01的STR引物,并且可视化使用了硝酸银方法。结论:最终结果表明,所有样品都可以使用3个str基因座,即VWA,FGA和TH01进行扩增。马来西亚医学与健康科学杂志(2023)19(5):97-101。 doi:10.47836/mjmhs19.5.14马来西亚医学与健康科学杂志(2023)19(5):97-101。 doi:10.47836/mjmhs19.5.14
基于免疫的抗体发现平台需要稳健有效的方案来从大量 B 细胞中扩增、克隆、表达和筛选抗体,以便有效捕获经验丰富的免疫球蛋白库的多样性。多重 PCR 使用一系列正向和反向引物来从一系列不同的种系序列中回收抗体,这很有挑战性,因为引物设计需要回收全长抗体序列、低起始模板浓度,并且需要所有引物在相同的 PCR 条件下发挥作用。在这里,我们展示了将 RNase H2 依赖性 PCR (rh-PCR) 整合到高通量抗体发现平台中的几个优势。首先,rh-PCR 将引物二聚体的合成消除到可检测水平以下,从而消除了具有假阳性抗体滴度的克隆。其次,通过提高 PCR 的特异性,rh-PCR 引物增加了从单个 B 细胞中回收同源抗体可变区以及下游重组抗体滴度。最后,我们证明,在基于下一代测序的方法中,rh-PCR 引物可提供更均质的样本池和更高的序列质量,从而从大量克隆的抗体同源对中获取 DNA 序列信息。此外,rh-PCR 引物的更高特异性使天然抗体种系序列与从单个 B 细胞扩增的 VL/VH 片段之间能够更好地匹配。
摘要 结核病 (TB) 的表型药物敏感性测试 (DST) 需要数周才能产生结果。虽然分子测试可以快速检测出耐药相关突变 (DRM),但它们无法扩展到覆盖整个基因组和可以预测耐药性的许多 DRM。全基因组测序 (WGS) 方法是可扩展的,但如果直接在痰液上进行,通常需要目标富集步骤,例如核酸扩增。我们开发了一种靶向等温扩增-纳米孔测序工作流程,用于快速预测结核病分离株的耐药性。我们使用重组酶聚合酶扩增 (RPA) 对结核分枝杆菌基因组内的三个区域进行靶向等温扩增(37°C,90 分钟),然后在 MinION 上进行纳米孔测序。我们检测了 29 种耐药性 (DR) 结核病患者的分枝杆菌基因组 DNA 提取物,并将我们的结果与 Illumina 的 WGS 和表型 DST 的结果进行比较,以评估对利福平和异烟肼耐药性的预测准确性。RPA 扩增的保真度与高保真度 PCR 相当(100% 一致)。纳米孔测序产生的 DRM 预测与 WGS 相同,测序运行时间明显更快,只需几分钟而不是几天。我们工作流程对利福平耐药性预测的灵敏度和特异性分别为 96.3%(95% 置信区间 [CI],81.0 至 99.9%)和 100.0%(95% CI,15.8 至 100.0%)。对于异烟肼耐药性预测,敏感性和特异性分别为 100.0%(95% CI,86.3 至 100.0%)和 100.0%(95% CI,39.8 至 100.0%)。每个样本的工作流程耗材成本不到 100 英镑。我们快速且低成本的药物耐药性基因分型工作流程可准确预测利福平和异烟肼耐药性,适合在资源有限的环境中使用。