XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemanalyses
孟德尔随机化和横断面分析
与 DSST 性能名义上相关（p < 0.05）的蛋白质（N = 184）富含脑表达蛋白质，最显著的是海马表达的蛋白质（FDR 校正 p = 0.0154 补充表 4）。更好的 DSST 性能名义上与 90 种蛋白质的较低水平相关。这些蛋白质映射到以下免疫途径“白细胞介素-10 信号传导”、“肾小球肾炎”、“粒细胞趋化性的调节”、“白细胞趋化性的正调节”、“白细胞迁移的正调节”和“炎症”（FDR 校正 p ≤ 0.0337；补充表 5）。
原子模拟，中等尺度的分析和对普通波特兰水泥和地球聚合物糊的热性质的实验验证
普通波特兰水泥（OPC） - 由于其出色的TES能力，良好的机械性能和低成本，因此已广泛用于热量储能（TES）应用。在这项尝试中，这项工作提出了一种升级程序，以对两种由OPC和杂化水泥制成的水合糊的特性进行建模（即一种替代的H污染物粘合剂），后者用于基于Geopolymer的复合材料（GEO）。首先，采用基于能量最小化和分子动力学的原子方法来建模CSH（硅酸盐水合钙）和NASH（铝硅硅酸盐水合物）阶段的热行为和热储存能力，这是基于OPC的Paste和Geo的主要阶段。然后，提出了提出的上缩放优化程序和中尺度的FEM均质化技术，以将基于OPC的糊和GEO的原子主要阶段的TES参数与均质的Meso/Macro量表值联系起来。为此，在OPC和GEO糊剂上的实验程序的结果都被视为校准/验证数值工具的基准。在几个尺度上进行的有希望的模拟和上刻度程序的模拟在均质化的温度依赖性热容量和热扩散率方面证明了与分析混合物的实验数据良好的一致性。2023作者。由Elsevier Ltd.这是CC下的开放式访问文章（http：//creativecommons.org/licenses/4.0/）。
研究文章Linguaphylo：一种可再现的系统发育分析的概率模型规范语言
系统发育模型已经变得越来越复杂，系统发育数据集在规模和丰富度方面都扩大了。但是，当前的推理工具缺乏模型指定语言，可以简单地描述完整的系统发育分析，同时独立于实施细节。我们引入了一种新的轻巧和简洁的模型规范语言“ lphy”，该语言被设计为人类和机器可读性。图形用户界面伴随“ lphy”，允许用户构建模型，模拟数据并创建描述模型的自然语言叙述。这些叙述可以作为手稿方法部分的基础。此外，我们提出了一个命令行界面，用于将LPHY指定模型转换为与BEAST2软件平台兼容的分析规范文件（XML格式）。总的来说，这些工具旨在增强植物研究中描述的清晰度和概率模型的报告，最终促进结果的可重复性。
实时分析和连接主义建模
在不到100毫秒的时间里，人类可以准确地解释从未经历过的物体和场景的图像，这些对象和场景从未经历过或被广泛降级或从新颖的方向看待。最近的研究与理论（Biederman，1987a，b，c）表明，这一成就可能基于一个将复杂的视觉实体分解为简单组件的过程，通常在匹配的凹陷区域。当任意加入形状时，几乎总是会产生这种凹陷（Hoffman＆Richards，1985）。所得组件激活了一组凸的凸面或单一基于边缘的体积元素（称为geons）的最接近拟合成员，它们在视点和视觉噪声的变化下是不变的，并允许对象表示具有相同的不变性。GEON仅需要分类边缘特性（例如，直弯与弯曲；并行与非平行；顶点类型），而不是精确的度量规范（例如，边缘的曲率度或长度）。人类以足够的速度或准确性来制定后一种判断，以作为实时人类物体识别的控制过程。
基因分析确定了与高血压相关的认知障碍相关的大脑结构
1 波兰克拉科夫雅盖隆大学医学院内科系，ul. Skarbowa 1, 31-121；2 英国爱丁堡大学女王医学研究所心血管科学中心，47 Little France Crescent, Edinburgh EH16 4TJ，英国；3 波兰克拉科夫雅盖隆大学医学院 OMICRON 医学基因组学中心，ul. Kopernika 7c, 31-034；4 意大利波齐利 IRCCS INM Neuromed 心血管神经病学和转化医学系，Via Atinense, 18, 86077；5 英国曼彻斯特大学生物、医学和健康学院医学院心血管科学系，46 Grafton Street, Manchester M13 9NT，英国； 6 罗马大学分子医学系，Viale Regina Elena, 291 - 00161 Roma，意大利；7 伦敦帝国理工学院公共卫生学院流行病学与生物统计学系，南肯辛顿校区，伦敦 SW7 2AZ，英国；8 约阿尼纳大学医学院卫生与流行病学系，约阿尼纳大学校园，邮政信箱：1186，451 10，约阿尼纳，希腊；9 生物医学研究系，分子生物学与生物技术研究所，希腊研究与技术基金会，大学校园 GR -451 15，约阿尼纳，希腊；10 威廉哈维研究所，NIHR 生物医学研究中心，伦敦玛丽女王大学，Charterhouse Square，伦敦 EC1M 6BQ，英国； 11 格拉斯哥大学感染与免疫学院、医学、兽医学和生命科学学院，英国格拉斯哥大学大道，邮编 G12 8QQ；12 那不勒斯费德里科二世大学医学和外科学院药学系，邮编 Via Domenico Montesano 49，邮编 80131 那不勒斯，意大利；13 英国爱丁堡大学英国痴呆症研究所临床脑科学中心，邮编 49 Little France Crescent，邮编 EH16 4SB；14 莱斯特大学心血管科学系，邮编 University Road，邮编 Leicester LE1 7RH，英国；15 NIHR 莱斯特生物医学研究中心，邮编 Glenfield 医院，邮编 Groby Road，邮编 Leicester LE3 9QP，英国；16 曼彻斯特大学 NHS 基金会曼彻斯特学术健康科学中心医学部，邮编 Oxford Road，邮编 Manchester M13 9WL，英国； 17 布里斯托医学院，布里斯托大学人口健康科学系，布里斯托皇后路，邮编 BS8 1QU，英国；18 布里斯托大学医学研究委员会综合流行病学部，布里斯托皇后路，邮编 BS8 1QU，英国
原子模拟，中等尺度的分析和对普通波特兰水泥和地球聚合物糊的热性质的实验验证
普通波特兰水泥（OPC） - 由于其出色的TES能力，良好的机械性能和低成本，因此已广泛用于热量储能（TES）应用。在这项尝试中，这项工作提出了一种升级程序，以对两种由OPC和杂化水泥制成的水合糊的特性进行建模（即一种替代的H污染物粘合剂），后者用于基于Geopolymer的复合材料（GEO）。首先，采用基于能量最小化和分子动力学的原子方法来建模CSH（硅酸盐水合钙）和NASH（铝硅硅酸盐水合物）阶段的热行为和热储存能力，这是基于OPC的Paste和Geo的主要阶段。然后，提出了提出的上缩放优化程序和中尺度的FEM均质化技术，以将基于OPC的糊和GEO的原子主要阶段的TES参数与均质的Meso/Macro量表值联系起来。为此，在OPC和GEO糊剂上的实验程序的结果都被视为校准/验证数值工具的基准。在几个尺度上进行的有希望的模拟和上刻度程序的模拟在均质化的温度依赖性热容量和热扩散率方面证明了与分析混合物的实验数据良好的一致性。2023 Elsevier Ltd.保留所有权利。
SPOVG与RNA之间相互作用的定量分析
先前已发现伯氏毛毛毛虫SPOVG蛋白是DNA和RNA结合蛋白。测量并进行了比较，以帮助阐明配体基序，众多RNA，SSDNA和DSDNA的影响。研究中使用的基因座是SPOVG，GLPFKD，ERPAB，BB0242，AB和OSPAB，特别关注mRNA的未翻译5 0部分。执行结合和竞争测定结果表明，SPOVG mRNA的5 0端具有最高的属性，而观察到的最低限度是to ab mRNA的5'端。对SPOVG RNA和ssDNA序列的诱变研究表明，Spovg-核酸复合物的形成并不完全取决于序列或结构。此外，在SSDNA中换尿氨酸不影响蛋白质核酸复合物的形成。©2023作者。由Elsevier Inc.出版这是CC BY-NC许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/）下的开放访问文章。
外显着关联分析
的发现：分析揭示了各种基因与每个并发症类别的关联：1）糖尿病性视网膜病与基因座22q13.33（SNP RS9616915; P = 5.18 X10 -4）中的Shank3基因有关基因座中的DCP1B基因12p13.33（SNP RS715146，RS1044950，RS113147414，RS34730825; P = 7.62 x10 -4）; 2）糖尿病神经病与基因座4Q23（SNP RS4148883; P = 1.23 X10 -4），基因座2q35中的SLC11A1基因（SNP RS17235409; P = 1.85 x10 -4）和Locus 20q12（SNP 20q12） p = 2.68 x10 -4）; 3）糖尿病性肾病与基因座7q31.1（SNP RS1799999; P = 1.91 X10 -4），Znf136基因中的PPP1R3A基因有关RS6076550; p = 2.86 x10 -4）;和4）心血管并发症与基因座21q22.3（SNPS RS7279204，RS6518289，RS2839227，RS2839223; p = 2.18 x10 -4，3.04，3.04 x10 -4，4.51 x10 -4，5.2 x10 -4，5.22 x10 -4，5.22 x10 -4，5.22 x10 -4，5.22 x10 -4，5.22 x10 -4
evo lu tio na ry b i olo gy bat基因组的比较分析确定了旧世界中的免疫力的明显演变
蝙蝠已被确定为几种人畜共患病毒的天然储层宿主，促使他们具有独特的免疫适应性。在蝙蝠中，旧世界的水果蝙蝠（pteropodidae）与多个溢出有关。为了测试这些蝙蝠中谱系特异性的分子适应性，我们开发了一种新的组装管道来生成果实蝙蝠cynopterus sphinx的参考质量基因组，并将其用于对12个蝙蝠物种的比较分析，包括6个pteropopodids。我们的结果表明，与其他蝙蝠相比，与免疫相关的基因的进化率更高。在MyD88中，在包括NLRP1的丧失，PGLYRP1和C5AR2的重复以及氨基酸替代品之间共享了几种谱系特异性遗传变化。我们将含有pteropidae特异性残基的MyD88转基因引入了BAT和人类细胞系中，并发现了炎症反应抑制的证据。通过揭示不同的免疫适应性，我们的结果可以帮助解释为什么经常将孢子形杀死为病毒宿主。
通过生物信息学分析鉴定 2 型糖尿病和多囊卵巢综合征的关键基因和分子通路
摘要。– 目的：2 型糖尿病 (T2DM) 和多囊卵巢综合征 (PCOS) 是常见的内分泌系统疾病。然而，在转录组水平上对 T2DM 和 PCOS 的分子机制研究仍然很少。因此，我们旨在通过生物信息学分析揭示 T2DM 和 PCOS 之间潜在的共同遗传和分子途径。材料与方法：我们从美国国家生物技术信息中心的基因表达综合 (GEO) 数据库下载了 T2DM 和 PCOS 的 GSE10946 和 GSE18732 数据集。对这些数据集进行综合差异和加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 以筛选共同基因。随后进行功能富集和疾病基因关联分析，构建转录因子 (TF)-基因和TF-miRNA-基因调控网络，最终确定相关的靶向药物。结果：我们鉴定了T2DM和PCOS的共同基因（BIRC3，DEPTOR，TNNL3，ADRA2A）。通路富集分析显示共同基因在平滑肌收缩，通道抑制剂活性，细胞凋亡和肿瘤坏死因子 (TNF) 信号通路中富集。SP7，KLF8，HCFC1，IRF1和MLLT1等TF在TF调控网络中起关键作用。奥利司他被指出是一种重要的基因靶向药物。