1 法国里昂克劳德伯纳德大学 Léon Bérard 中心肿瘤医学系;2 美国俄亥俄州哥伦布俄亥俄州立大学詹姆斯综合癌症中心妇科肿瘤科;3 西班牙巴塞罗那 Vall d'Hebron 肿瘤研究所肿瘤医学服务部;4 美国纽约州纽约大学朗格尼医学中心 Laura & Isaac Perlmutter 癌症中心妇科肿瘤科;5 意大利米兰圣皮奥十世人道主义医院和米兰罗扎诺人道主义大学妇科肿瘤科;6 美国加利福尼亚州圣地亚哥加利福尼亚大学丽贝卡和约翰摩尔斯综合癌症中心妇产科和生殖科学系妇科肿瘤科; 7 美国德克萨斯州休斯顿德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心妇科肿瘤学和生殖医学系;8 美国密歇根州大急流城中西部 START;9 美国犹他州西瓦利城 START 山区犹他州癌症专家;10 日本东京国立癌症中心医院实验治疗学系;11 日本癌症研究基金会癌症研究所医院高级医学开发系;12 韩国京畿道国立癌症中心肿瘤免疫学分部;13 法国图卢兹图卢兹大学癌症研究所 (IUCT) - Oncopole 肿瘤医学和临床研究系;14 西班牙瓦伦西亚瓦伦西亚大学医院肿瘤医学系; 15 意大利米兰 IRCCS 欧洲肿瘤研究所和意大利米兰大学;16 法国圣埃尔布兰 René Gauducheau 西部癌症研究所肿瘤内科部;17 美国印第安纳州印第安纳波利斯礼来公司;18 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心
结核分枝杆菌是结核病 (TB) 的病原体,仍然是全球健康负担。虽然结核分枝杆菌主要是一种呼吸道病原体,但它可以扩散到其他器官,包括大脑和脑膜,导致结核性脑膜炎 (TBM)。然而,人们对导致跨器官差异疾病的免疫机制知之甚少。人们的注意力集中在控制肺部结核分枝杆菌的 T 细胞反应差异上,但新出现的数据指出抗体作为疾病控制的生物标志物和抗菌分子发挥着作用。鉴于人们对血脑屏障跨区室抗体反应的认识日益加深,我们在此表征了 TBM 中血液和脑区室的抗体谱,并确定肺部结核分枝杆菌感染 (肺结核) 和 TBM 之间结核分枝杆菌特异性体液免疫反应是否不同。采用高通量系统血清学方法,我们深入分析了 HIV 阴性成人肺结核 ( n = 10) 和 TBM ( n = 60) 患者针对 10 种不同结核分枝杆菌抗原(包括脂阿拉伯甘露聚糖 (LAM) 和纯化蛋白衍生物 (PPD))的抗体反应。抗体研究包括免疫球蛋白同种型 (IgG、IgM、IgA) 和亚类水平 (IgG1–4) 的分析以及结核分枝杆菌特异性抗体结合 Fc 受体或 C1q 并激活先天免疫效应功能(补体和自然杀伤细胞活化;单核细胞或中性粒细胞吞噬作用)的能力。机器学习方法被用于表征 TBM 中的血清和 CSF 反应,确定与疾病严重程度相关的预后因素,并确定区分 TBM 和肺结核的关键抗体特征。在患有 TBM 的个体中,我们发现脑脊液特异性抗体谱标志着针对结核分枝杆菌的独特且区室化的体液反应,其特征是结核分枝杆菌特异性抗体的富集,这些抗体能够强效激活补体并驱动单核细胞和中性粒细胞的吞噬作用,所有这些都与表现时的 TBM 严重程度较低有关。此外,与患有肺结核的个体相比,患有 TBM 的个体血清中存在结核分枝杆菌特异性抗体,激活单核细胞吞噬作用的能力增强,尽管 IgG 滴度和 Fc γ 受体结合能力较低。总的来说,这些数据表明体液反应在功能上有所不同,具体取决于感染部位(即肺部与大脑),并表明 TBM 中脑脊液内存在高度区室化的结核分枝杆菌特异性抗体反应。此外,我们的结果表明,吞噬作用和补体介导的抗体可能促进神经病理学减弱和 TBM 疾病减轻。
抗体是最大的生物治疗剂,预计到2025年的市场规模为3000亿美元(Lu等,2020)。它们用于治疗癌症,自身免疫性和感染性疾病(Lu等,2020; Weiner等,2010; Chan and Carter,2010),因为它们旨在识别高特异性较高的抗原和结合后的任何抗原。抗体发现。尽管建立了良好的成本,但由于实验挑战,这些方法仍然昂贵,耗时且容易失败。引入下一代测序(NGS)用于抗体筛选代替随机菌落拾取,使得能够覆盖更大的序列多样性,更宽的结合依次范围和靶向靶向独特表位的隔离序列(Spoendlin等,2023)。简短的读取测序仅限于单个链,即重(VH)和轻链(VL),而长读数可以获取这两个链的配对信息,从而增加了我们对链间残留依赖性的理解(Burbach和Briney,2024)。Recently, Arti fi cial Intelligence (AI) has experienced accelerated progress, particularly in the fi elds of Deep Learning (DL) and Natural Language Processing (NLP), and biology has been greatly bene fi ted from it ( Khakzad et al., 2023 ; Graves et al., 2020 ; Nam Kim et al., 2024 ; Bender and Cortés-Ciriano, 2021 ; Bender and Cortes-Ciriano,2021年; Kim等人,2023年)。嵌入为一个显着的例子是结构生物学的模型Alphafold2(Jumper等,2021),它带来了基于序列的蛋白质结构预测,接近实验精度。NLP中变压器体系结构(Vaswani等,2023)的成功导致了大型语言模型(LLM)的创建,对大量文本培训的统计模型,以捕获大量的文本相似性,以捕获矢量表现形式的语义相似性,以嵌入式嵌入,而无需依靠昂贵和昂贵的标签。
蛋白质环的特征是它们的多功能结构具有不同的尺寸和形状,可以承认具有较高规格和亲和力的广泛范围。由于其有效的TAR-获得有效的TAR-获得识别能力,因此对抗纤维互补性确定区域(CDR)的可变回路对于免疫反应和治疗应用特别重要。这些抗体环的精确结构前词对于在治疗或工业用途的目标结合抗体的有效设计中至关重要。但是,由于缺乏来自相关蛋白质的进化信息,预测抗体环结构具有挑战性。因此,无需结构模板或相关序列运行的成功从头算结构的词典方法对于有效设计抗体环介导的介导的相互作用至关重要。这项研究表明,高度准确的抗体环结构预测可以实现目标结合抗体的效率零射击设计
例如NMDA,LGI-1对免疫调节的反应很好,大多数患者无癫痫发作,不需要长期的抗性药物。这些癫痫发作可以被认为是自身免疫性脑炎继发的急性症状性癫痫发作。Peltola等。研究了药物抗局灶性癫痫患者的抗GAD65滴度,并得出结论,针对GAD65抗原产生的抗体可能是癫痫病的根本原因[4]。GAD65抗体相关癫痫主要是自身免疫性条件,而没有基本的恶性肿瘤[5]。高GAD65抗体血清水平是中枢神经系统参与的特异性[6]。靶向神经元抗原导致炎症的自身免疫性,会导致神经递质的免疫调节剂改变,用于控制自身免疫性炎症,抗癫痫和抗气症和其他姑息治疗(例如靶向神经元抗原导致炎症的自身免疫性,会导致神经递质的免疫调节剂改变,用于控制自身免疫性炎症,抗癫痫和抗气症和其他姑息治疗(例如vns)干预措施用于消除癫痫发作。许多患者对抗癫痫药有反应,尽管需要免疫治疗来改善认知功能障碍。对钠通道阻滞剂的功效的解释可能是这些药物的免疫调节特征[7]。抗体滴度不能反映癫痫的持续时间,频率或严重程度[8],尽管在临床反应较差的患者中可以持续很高[8]。一线免疫抑制作用可以有效[9,10],但是患者经常需要二线免疫抑制剂,例如利妥昔单抗和/或环磷酰胺[11]。
Gang Xu,1,6 Wei Liu,1,6 Ying Wang,1,6 Xiaoli Wei,2 Furong Liu,3 Yanyun He,1 Libo Zhang,1 Qin Song,1 Qin Song,1 Zhiyao li,4 Changyu Wang,1 Changyu Wang,1 Ruihua Xu,1 Ruihua Xu,2,5, *和Bo Chen 1,7, *和Bo Chen 1,7, * 1,1,1,1,1.中国平民610219,中国2号医学肿瘤学系,中国南部肿瘤学国家关键实验室,南广东510060,广东510060的癌症癌症创新中心中国广东510060大学,大学4个生物科学学院,Nanyang Technological University 60 Nanyang Drive,Nanyang Drive,新加坡637551,新加坡5,新加坡5研究单位,胃肠癌的精确诊断和治疗单位,中国医学科学院,医学科学院,Guangzhou,Guanggandong 510060,贡献 * xurh@sysucc.org.cn(R.X.),knybochen@keymedbio.com(B.C.)https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101710
蛋白质还原似乎在我们观察到HER2指导的ADC耐药细胞系中HER2表达降低的过程中起作用。确认降低HER2蛋白水平是否是对T-DXD抗性的原因,我们在T-DXD耐药的BC细胞系中过表达HER2,并测量了T-DXD的抗增殖作用。HER2的过表达不会诱导T-DXD的抗增殖作用(sup。 图4A)。 表明,HER2定向ADC抗性细胞系中HER2的表达降低足以进行ADCHER2的过表达不会诱导T-DXD的抗增殖作用(sup。图4A)。 表明,HER2定向ADC抗性细胞系中HER2的表达降低足以进行ADC图4A)。表明,HER2定向ADC抗性细胞系中HER2的表达降低足以进行ADC
自身免疫性疾病的复杂全景中的抽象目标,参与疾病进展的促进自身抗体的关键表征仍然具有挑战性。这项研究旨在采用全球抗体分析策略来识别新型抗体并研究其与系统性硬化症(SSC)的关联。方法,我们使用源自细胞裂解液的抗原池在与SSC或健康供体患者的珠子消化后进行免疫沉淀(IP)进行了免疫沉淀(IP)。使用质谱(MS)的定量蛋白质组学(MS)进行了富集的抗原抗体复合物,并通过生物信息学分析过度代表。然后,在两个独立的SSC患者组中对候选抗体进行正交验证。用靶抗原对小鼠进行免疫,随后通过组织学检查和RNA测序评估。结果IP-MS分析,然后在SSC患者中进行验证,显示SSC患者的抗PRMT5抗体显着升高。这些抗体在区分SSC和健康对照和其他自身免疫性疾病(包括全身性红斑狼疮和Sjögren综合征)方面表现出强大的诊断精度,曲线下的区域范围为0.900至0.988。使用其他方法,微阵列在随后的独立组中验证了抗PRMT5抗体的升高。值得注意的是,SSC患者中有31.11%的抗PRMT5抗体表现出血清阳性。此外,抗PRMT5抗体的滴度与SSC中的进程或回归轨迹有着相关性。PRMT5免疫在小鼠的皮肤和肺中均显示出明显的炎症和纤维化。这与多种促炎和纤维化途径的上调同时,从而强调了抗PRMT5抗体在SSC中的潜在关键作用。结论本研究将抗PRMT5抗体确定为SSC的新生物标志物。
背景信息MTH1,也称为NUDT1或8-oxo-DGTPase,是一种重要的修复酶,可通过水解诱变的8-oxo-DGTP来防止氧化应激诱导的DNA损伤进入8-oxo-DGMP。mth1在有丝分裂后神经元和增殖组织中表达,并且在线粒体和核中都定位。mTH1可能是氧化应激的有用标记,其水平在氧化应激下增加。在各种癌症组织和神经退行性疾病中也发现了MTH1的表达增加。
背景信息PHF10,也称为BRG1相关因子45a,是498个氨基酸蛋白,该氨基酸蛋白位于核中,属于Sayp家族。PHF10通过染色质重塑参与转录活性调节。它属于神经祖细胞特异性染色质重塑复合物(NPBAF复合物),是神经祖细胞增殖所必需的。在神经发育过程中,随着神经元退出细胞周期并致力于其成人状态,从茎/祖细胞转换为有丝分裂后染色质重塑机制。从增殖神经茎/祖细胞到有丝分裂后神经元的过渡需要NPBAF和NBAF复合物的亚基组成。作为神经祖细胞出口有丝分裂并分化为神经元,含有ACTL6A/BAF53A和PHF10/BAF45A的NPBAF复合物被交换为同源替代ACTL6B/BAF53B和DPF1/BAF45B和DPF3/BAF3/BAF45C SUBUNICECIFICICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICIFICAIFICACTICACTL6B/BAF53B和DPF1/BAF45B和DPF1/BAF45B。NPBAF复合物对于多能神经干细胞的自我更新/增殖能力至关重要。NBAF复合物与波峰一起起着调节基因对树突生长必不可少的活性的作用。PHF10作为几种同工型存在,每个同工型的分子量为42 kDa,37 kDa,51 kDa和56 kDa。