摘要 通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征(单链断裂)III,IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究,已通过E coli dna Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA coletidylyclase ind of DNA)的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端,而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。 该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA,而核酸内切酶VI也是如此,而核酸内切酶III具有不同的切口机制。 t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性,该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA,对聚合酶的启动活性低。 通过与核酸内切酶VI的额外孵育,可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性,并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。 这些结果表明,核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶(分别作用于撤离和放射性的DNA)产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕,并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5' 然而,核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。 这些结果表明,在DNA中肾上腺素/III,IV和VI的连核III,IV和VI的作用。通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征(单链断裂)III,IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究,已通过E coli dna Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA coletidylyclase ind of DNA)的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端,而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。 该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA,而核酸内切酶VI也是如此,而核酸内切酶III具有不同的切口机制。 t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性,该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA,对聚合酶的启动活性低。 通过与核酸内切酶VI的额外孵育,可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性,并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。 这些结果表明,核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶(分别作用于撤离和放射性的DNA)产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕,并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5' 然而,核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。 这些结果表明,在DNA中肾上腺素/III,IV和VI的连核III,IV和VI的作用。通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征(单链断裂)III,IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究,已通过E coli dna Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA coletidylyclase ind of DNA)的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端,而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。 该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA,而核酸内切酶VI也是如此,而核酸内切酶III具有不同的切口机制。 t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性,该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA,对聚合酶的启动活性低。 通过与核酸内切酶VI的额外孵育,可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性,并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。 这些结果表明,核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶(分别作用于撤离和放射性的DNA)产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕,并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5' 然而,核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。 这些结果表明,在DNA中肾上腺素/III,IV和VI的连核III,IV和VI的作用。通过大肠杆菌内核的损坏DNA的特征(单链断裂)III,IV和VI以及通过噬菌体T4 UV鼻核ASE进行了研究,已通过E coli dna Polymerase I(DNA Polymerase I(DNA coletidylyclase ind of DNA)的dna-nicks Incriv dna-dna-dna in nicks dna complose se a聚合酶的末端,而核酸内切酶III或通过T4紫外线溶液引入脱固定的DNA的痕迹却没有。该结果表明核酸内切酶IV尼古克在源自核酸位点的5'侧降低了DNA,而核酸内切酶VI也是如此,而核酸内切酶III具有不同的切口机制。t4紫外核酸内切酶还具有apur- inic核酸内切酶活性,该活性在聚合酶的脱尿中产生了脱尿的DNA,对聚合酶的启动活性低。通过与核酸内切酶VI的额外孵育,可以增强用核酸内切酶III或T4 UV内核酸酶划分的DNA的启动活性,并在较小程度上与核酸内切酶IV孵育。这些结果表明,核酸内切酶III和T4 UV核酸内切酶(分别作用于撤离和放射性的DNA)产生含有3末端的载膜/阿哌丁汀位点的划痕,并且这些位点并未通过DNA Polymase I. divne divne的3' -5'活性来[' -5' - 5' - 5'然而,核酸内切酶IV或VI显然可以去除未经零件位点的5'侧的末端肾上腺素/apyrimidinic位点以及裂解。这些结果表明,在DNA中肾上腺素/III,IV和VI的连核III,IV和VI的作用。我们使用T4 UV核酸内切酶的结果表明,T4紫外核酸内切酶对辐照DNA的切口涉及在嘧啶二聚体的5'一半处的糖基键的裂解,又涉及磷酸二二聚体的裂解,又是磷酸二酯键的裂解,最初连接了两个核位核位核苷酸的两个核苷酸。他们还暗示糖基键在磷酸酯键之前切割。
缩写:AAD,衰老相关疾病;年龄,晚期糖基终产物; ap,apurinic/apyrimidinic; APE1/REF-1,apurinic/apyrimidin inononononononononononocleplease1/redox fastor-1; CM,心肌细胞; CO,一氧化碳; Copp,钴原源性; CP-312,心脏保护剂-312; CPC,心脏祖细胞; CSC,心脏干/祖细胞; CVD,心血管疾病; DHA,二十六烯酸; EC,内皮细胞; ECFC,内皮菌落形成细胞; eNOS,内皮一氧化氮合酶; EPA,二糖酸; EPC,内皮祖细胞; ESC,胚胎干细胞; Foxo,叉子盒; GPX,谷胱甘肽过氧化物酶; GRX,谷毒素; GWAS,全基因组协会研究; H 2 O 2,过氧化氢; H 2 S,硫化氢; HGPS,Hutchinson – Gilford progeria综合征; HIF-1α,缺氧诱导因子-1α; HO-1,血红素氧酶-1; I/R,缺血/再灌注; IPSC,诱导多能干细胞;线粒体电子传输链; MEF,小鼠胚胎成纤维细胞; Mi,心肌梗塞; MPTP,线粒体通透性过渡孔; NAC,N-乙酰L-半胱氨酸; NLRP3,点头样受体蛋白3;不,一氧化氮; NOX,NADPH氧化酶; NRF2,核因子红细胞2相关因子2; NRP1,Neuropilin 1; PM 2.5,颗粒物; PRX,过氧蛋白; PUFA,多不饱和脂肪酸; ROS,活性氧; SASP,与衰老相关的分泌表型; SDF-1,基质细胞衍生的因子1; SMPC,平滑肌样祖细胞;草皮,超氧化物歧化酶; SRF,血清反应因子; T-BHQ,Tert-丁基氢喹酮; TRX,TXN,硫氧还蛋白; TRXR,硫氧还蛋白还原酶; VEGF,血管内皮生长因子; VSMC,血管平滑肌细胞。
apurinic/apyrimidinic(AP)核酸内切酶 - 还原/氧化因子1(APE1/Ref-1,也称为APE1)是一种多功能酶,在DNA修复和还原/还原/氧化(REDOX)信号中具有至关重要的作用。APE1最初被描述为基础切除修复(BER)途径中的内切酶。进一步的研究表明,它是调节关键转录因子(TFS)的氧化还原信号枢纽。尽管已大量的重点放在APE1在癌症中的作用,但最近的发现支持APE1作为其他指示的目标,包括眼部疾病,包括眼部疾病[糖尿病性视网膜病变(DR),糖尿病黄斑水肿(DME)(DME),以及年龄相关的黄斑变性(AMD),炎症性肠道疾病(IBD)和其他对这些疾病的影响(IBD),以及这些crce at ape1 and ape1 and ape1 cracial and acce acce acce acce ccrem ccr二胰胰and and。疾病。APE1在DNA修复和氧化还原信号传导中的核心责任使其成为癌症和其他疾病的有吸引力的治疗靶标。
无嘌呤/无嘧啶 (AP) 核酸内切酶-还原/氧化因子 1 (APE1/Ref-1,也称为 APE1) 是一种多功能酶,在 DNA 修复和还原/氧化 (氧化还原) 信号传导中起着至关重要的作用。APE1 最初被描述为碱基切除修复 (BER) 通路中的核酸内切酶。进一步的研究表明,它是调节关键转录因子 (TF) 的氧化还原信号转导中心。尽管人们将大量注意力集中在 APE1 在癌症中的作用上,但最近的研究结果支持将 APE1 作为其他适应症的靶点,包括眼部疾病 [糖尿病视网膜病变 (DR)、糖尿病性黄斑水肿 (DME) 和年龄相关性黄斑变性 (AMD)]、炎症性肠病 (IBD) 等,其中 APE1 对关键 TF 的调节会影响这些疾病中的重要通路。APE1 在 DNA 修复和氧化还原信号转导中的核心作用使其成为癌症和其他疾病的有吸引力的治疗靶点。
背景信息APEX1(也称为APE,APE1,HAP1和REF-1)属于DNA修复酶AP/EXOA家族。这是一种多功能蛋白,在细胞对氧化应激的反应中起着核心作用。APEX1的两个主要活动是在DNA修复和转录因子的氧化还原调节中。APEX核酸酶是一种具有apurinic/apyrimidinic(AP)核酸内切酶,3- prime,5-Prime-脱核酸酶,DNA 3-Prime Repair二酯酶和DNA 3-Prime-phosprime-磷酸酶活性的DNA修复酶。另一方面,APEX1还发挥可逆的核氧化还原活性来调节DNA结合亲和力和转录因子的转录活性,通过控制其DNA结合结构域的氧化还原状态,例如暴露于IR后的FOS/JUN AP-1复合物。APEX1通过与负钙反应元件(NCARES)结合来参与甲状旁腺激素(PTH)表达的钙依赖性下调。当在Lys-6和Lys-7处进行乙酰化时,APEX1刺激YBX1介导的MDR1启动子活性,从而导致耐药性。它也充当了一种控制单链RNA代谢的内核酸酶。它通过优先在MYC编码区域决定因素(CRD)的UA和CA二核苷酸之间切割来调节MYC mRNA更新。与NMD1相关,APEX1在细胞周期进程过程中在RRNA质量控制过程中起作用。
肾上腺素/阿哌丁素核酸内切酶1/氧化还原因子-1(APE1/REF-1)是作用于细胞信号通路的多功能蛋白,包括DNA修复和氧化还原活性。APE1/REF-1已成为癌症治疗的靶标,其在乳腺癌模型中的作用将揭示癌症治疗的新策略。APX2009是一种特定的APE1/REF-1氧化还原抑制剂,其抗癌特性尚未在乳腺癌细胞中描述。在这里,我们研究了APX2009治疗在乳腺癌细胞系MDA-MB-231和MCF-7中的影响。乳腺癌细胞系,并进行WST1和菌落形成测定以评估细胞增殖。进行膜联蛋白V-FITC/7-AAD和LDH-GLO T测定法以评估细胞死亡。APX2009治疗后,进行了伤口愈合测定法和Matrigel Transwell分析,分别评估了细胞迁移和侵袭过程。我们的发现表明APX2009治疗降低了乳腺癌细胞增殖,迁移和侵入性特性。此外,它诱导了两种细胞系的凋亡。我们的研究是第一个显示APX2009治疗对乳腺癌细胞凋亡的影响。因此,这项研究表明APX2009治疗是乳腺癌的有希望的抗癌分子。
摘要:有人提出,在无氧环境中,最后一个普遍的共同祖先(LUCA)在高温19次下进化,类似于深海通风口和火山斜坡上的环境。20因此,自发性DNA衰变(例如碱基损失和胞嘧啶脱氨酸)是影响卢卡基因组完整性的主要因素21。宇宙辐射是由于弱地球磁场和烷基化的22种代谢自由基所引起的,添加了这些威胁。在这里,我们提出,古代生活形式只有两种不同的23种修复机制:多功能的肾上腺素/肾上腺素(AP)核酸内核酸内核酸内核酸酶,以应对AP位点和24个脱氨基残基,以及酶催化紫外线和烷基化损害的直接逆转。在某些古细菌中,尿素-DNA N-糖基酶的缺失以及AP核酸内切酶的存在,即26可以切割含尿嘧啶的DNA,这表明AP内核酸内核酸酶引起的核苷酸切口修复27(NIR)途径27(NIR)途径从分别从Glycosylase介导的碱基降低层独立于Glycosypiend介导的碱基上的远程摄取。nir可能是28个遗物,出现在早期的嗜热祖先中,以抵消自发的DNA损伤。我们 - 29提出,地球大气中的氧气水平升高〜2 ga触发了狭窄的AP核酸内切酶和DNA糖基酶的狭窄狭窄,以有效地应对氧化量扩大的氧化31碱基损伤和复杂的DNA病变。32
抽象背景蛛网膜下腔出血(SAH)可能导致高度不利的预后。近年来,对SAH的研究集中在早期脑损伤(EBI)上,这是一个至关重要的进步,导致预后不良。SAH会导致各种并发症,包括线粒体功能障碍和DNA损伤。apurinic/ apyrimidinic核酸内切酶1(APE1)是一种必需的蛋白质,具有多方面的功能性,与DNA修复和氧化还原信号传导不可或缺。但是,APE1在SAH后线粒体DNA损伤修复中的作用尚不清楚。方法我们的研究涉及大鼠体内内血管内穿孔模型和体外神经元氧降解。然后,通过蛋白质印迹,免疫荧光,定量实时PCR,线粒体生物能测量和Neurobehavioural实验分析APE1对线粒体DNA损伤修复的影响。结果我们发现,在SAH大鼠模型中,线粒体DNA损伤和神经元死亡的水平下降。APE1的过表达改善了SAH后大鼠的短期和长期行为障碍。在体外,在暴露于氧蛋白的原发性神经元之后,APE1表达随着线粒体DNA损伤的增加而显着降低,呼吸链复合物水平的亚基降低以及随后的呼吸链功能障碍。APE1的过表达可解除神经元线粒体中的能量代谢疾病,并减少了神经元凋亡。ape1可能在SAH之后的EBI阶段起着至关重要的作用,使其成为治疗的关键目标。结论结论,SAH后EBI参与了APE1,通过通过线粒体呼吸链影响线粒体细胞凋亡。
癌症将直接影响超过三分之一人口的生活。DNA损伤反应 (DDR) 是一个复杂的系统,涉及损伤识别、细胞周期调控、DNA 修复以及最终的细胞命运决定,在癌症病因和治疗中发挥着核心作用。涉及 DDR 靶向的两种主要治疗方法包括:采用抗癌基因毒性剂的组合疗法;以及合成致死,利用散发性 DDR 缺陷作为癌症特异性治疗的机制。尽管许多 DDR 蛋白已被证明“无法用药”,但基于片段和结构的药物发现 (FBDD、SBDD) 已推进了治疗剂的鉴定和开发。FBDD 已促成 4 种药物(另有约 50 种药物处于临床前和临床开发阶段),而据估计,SBDD 已促成 200 多种 FDA 批准药物的开发。基于蛋白质 X 射线晶体学的片段库筛选,特别是针对难以捉摸或“无法用药”的靶标,可以同时生成命中结果以及蛋白质-配体相互作用和结合位点(正构或变构)的详细信息,从而为化学可处理性、下游生物学和知识产权提供信息。使用一种新型的高通量基于晶体学的片段库筛选平台,我们筛选了五种不同的蛋白质,命中率约为 2 e 8%,晶体结构约为 1.8 至 3.2 Å。我们考虑了当前的 FBDD/SBDD 方法和一些设计针对 DDR 核酸酶减数分裂重组 11(MRE11,又名 MRE11A)、无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶 1(APE1,又名 APEX1)和 flap 核酸内切酶 1(FEN1)的抑制剂的示例性结果。© 2020 作者。由 Elsevier Ltd. 出版。这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议 ( http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ ) 开放获取的文章。