摘要。本文研究了在水产养殖条件下饲养的年轻和成人carlias gariepinus的肠道微生物组。基因组DNA是从大肠的大肠中分离出来的。该研究是使用16S宏基因组学方案进行的,并在Illumina Miseq上测序了库池。微生物群的特征是一组多种有氧和厌氧菌,其定性和定量组成对每个人来说都是个性化的。年轻cat鱼的微生物群主要由机会性革兰氏阴性细菌和革兰氏阴性厌氧菌细菌组成。在成年cat鱼中,较高的生物多样性和链球菌属的机会性革兰氏阳性细菌的出现被揭示出来。痤疮丙酸丙酸杆菌的物种也很常见。研究结果表明,随着时间的推移,carlias clarias gariepinus的肠道微生物组的多样性会增加。
全球水产养殖可持续发展的最大挑战之一是传染病的威胁。需要减少抗生素使用的预防性策略,以确保鱼类健康,最大程度地减少传染病和随后的药物干预措施。最近的策略涉及促进健康的饲料SUP成熟,例如锦葵和益生菌细菌。astaxanthin是一种广泛使用的类胡萝卜素,具有颜色和抗氧化特性,可在受病原体挑战时改善鱼类生长和鱼类的生存。益生菌可以为鱼类提供一系列健康益处,包括增强的饲料消化,维生素的合成,先天免疫反应的增强以及对潜在病原体的主动防御。在这项研究中,我们测试了是否可以将新型益生菌混合物(枯草芽孢杆菌和/或芽孢杆菌含量)用作替代健康和/或化学补充剂,用于在两个塞浦路斯物种,镜片腕(Cyprinus carpio)和红彗星(Carassius auratus auratus auratus)中为astaxanthin superations。使用实验饲料试验和16S rRNA mi焦虫分析,评估了益生菌对远端胃肠道中鱼类生长和微生物群落的影响。此外,在镜鲤鱼中,对血液样本进行了免疫学和血液学参数的测试,而在金鱼中,则分析了皮肤的颜色。胶质鲤鱼食用的astaxanthin显示出显着增加的生长,而B. septilis /b.Indicus柔软的意识对生长绩效的影响无显着影响。在镜鲤鱼,astax anthin和益生菌混合物中会引起肠道微生物群落的显着转变。我们的结果提供了第一个见解,即补充脂肪素的补充如何改变Cyprinid物种中的微生物组成。镜面鲤鱼喂食B. dementilis/b。Indicus显示了潜在的微生物和健康益处的几个指数,例如增加了DI疗法,丰富了潜在的有益细菌以及增强吞噬性活性并创造了无性血液水平。然而,在两个密切相关的塞浦路斯物种中,在金鱼中没有发现对益生菌反应的大量物种特异性差异,对颜色,生长或微生物群落没有影响。进一步研究了补充细菌在鱼类胃睾丸睾丸中的疗效和定殖位点,并且需要在宿主微生物群中观察到的变化的机制,以完全理解对益生菌补充物的物种特异性反应。
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公共卫生领域。教学和学习课程将每周开会两个小时。水生环境的详细课程内容性质。供水的微生物学,表面和地下水的微生物菌群。水处理,供水和公共卫生。常规和先进的水处理以及在农业灌溉,鱼类文化,工业和市政目的中使用废水;污水和污水处理;水管理的微生物方面;富营养化和生物修复。海洋环境的进化,生态和多样性;海洋中生命的起源以及海洋化石床建议的进化模式;在每个环境中的动植物的多样性及其适应性的不同条件。课程内容测序周第一周水生环境的性质。供水的微生物学,表面和地下水的微生物菌群。第2-3周的水处理,供水和公共卫生。常规和先进的水处理以及在农业灌溉,鱼类文化,工业和市政目的中使用废水;第4周连续评估1周5污水和污水处理;水管理的微生物方面
妊娠按蚊疟疾媒介依靠化学和物理(包括微生物)线索来选择优选的产卵栖息地。这项研究的重点是评估细菌组成和栖息地代谢物对灌溉和非灌溉潜在幼虫源中疟疾媒介幼虫可用性的影响。从霍马湾县灌溉和非灌溉地区的幼虫阳性和阴性栖息地采集水样。对从水样中培养的细菌进行基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 以进行物种鉴定。从菌落中提取 DNA,并进行聚合酶链式反应 (PCR) 和测序。最后,确定幼虫阳性和阴性栖息地的代谢物组成。MALDI-TOF MS 结果显示,芽孢杆菌是从非灌溉区幼虫源中鉴定出的唯一属。在灌溉区,志贺氏菌为优势属(47%),大肠杆菌为丰富种(13/51)。在测序的分离株中,65% 为芽孢杆菌。分离出杀幼虫分离株短芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌和深小芽孢杆菌,并将其与莫哈文芽孢杆菌、特基勒芽孢杆菌、粪类芽孢杆菌和农业短芽孢杆菌归为一类。有幼虫的灌溉区与无幼虫的灌溉区相比,粗脂肪(0.01%)和蛋白质含量(0.13%)降低。在灌溉区和非灌溉区,总叶绿素含量高的栖息地(1.12 μ g/g vs 0.81 μ g/g 和 3.37 μ g/g vs 0.82)都有幼虫存在。灌溉和非灌溉地区有幼虫的水生栖息地的糖浓度高于没有幼虫的栖息地;然而,相比之下,有幼虫的非灌溉地区的糖浓度高于灌溉地区的类似栖息地。此外,在灌溉和非灌溉地区含有幼虫的水生栖息地中发现了大量锰、钙和铜的浓度。这些结果允许对潜在的杀幼虫剂或杀虫剂进行前瞻性检查。
未来,常规 eDNA 研究和监测将转向无 PCR 方法。如需全面了解环境 DNA 研究的各个方面,包括方法、挑战和应用,请参阅 Taberlet 等人 (2018) 的文章。可以说,近几十年来,很少有领域像 eDNA 一样对生态学产生如此迅速而深远的影响。如今,eDNA 作为一种生态工具已在全球范围内广受欢迎,涵盖了从微生物到大型动物群的所有生物多样性水平,以及所有陆地和水生生物群落。其应用范围广泛,从检测入侵物种(Dougherty 等人,2016 年)、饮食研究(Shehzad 等人,2012 年),到通过吸血无脊椎动物(如水蛭)中的 DNA 间接检测哺乳动物的非侵入性方法(Schnell 等人,2015 年),再到水生生态系统的监测和评估(Chariton 等人,2015 年;Laroche 等人,2016 年)。水生生态学家是最早采用基于 eDNA 的方法的先驱和人士之一(Ficetola 等人,2008 年;Deagle 等人,2009 年;Chariton 等人,2010 年;Hajibabaei 等人,2011 年)。如今,基于 eDNA 的方法正在世界各地得到常规应用(Cordier 等人,2021 年),欧盟的 DNAquaNet 就是明证,该项目旨在开发和应用基于 eDNA 的方法来监测欧洲的水生系统(Leese 等人,2016 年)。eDNA 研究最令人兴奋的方面之一是能够从同一样本中获取大量生态信息。例如,一位研究人员可能会检查水样中的微生物成分;其他人可以对同一样本进行分析以检测鱼类或获取浮游植物组成。尽管需要考虑初始研究的实验设计及其对后续解释的影响( Zinger 等人,2019 年),但从相同样本中“重新获取”生态数据的能力不仅凸显了基于 eDNA 方法的独特属性之一,而且还强调了生物银行( Jarman 等人,2018 年)和共享 eDNA 样本的必要性,在大多数情况下,这些样本都是使用公共资金收集的。鼓励这些方法不仅可以使研究人员能够重新使用样本进行回顾性分析,这对于监测人类活动对地球生物群落的影响至关重要,而且还为利用样本探索与最初收集目的完全无关的问题提供了机会。
介绍在2019年,政府启动了水产养殖战略,为年度水产养殖收入提供了可持续的增长途径。该战略朝着可持续,富有成效,韧性和包容性水产养殖行业的四个成果建立,并在五年内将政府机构授予36项行动以提供这些成果。本实施计划报告了2022年的进度,并规定了2023年将采取哪些代理商来实施该策略。2022比过去两年更稳定,并且从Covid-19的影响中继续恢复。尽管如此,市场,货运和行业仍在继续导航的货物和劳动力方面仍存在一些挑战。劳动力的可用性一直是Aotearoa和全球水产养殖和其他行业的特殊挑战。新西兰水产养殖的代表组织已制定了一项行动计划,以解决当前的劳动力短缺,并在战略上考虑未来的劳动力需求。我们将在2023年整个新西兰支持新西兰,以实施其劳动力行动计划。近年来已经证实,海洋热浪将对该行业持持持续的风险,贻贝和鲑鱼业务在2022年受到影响。我们在2023年的工作将加深我们对气候变化为水产养殖带来的威胁的理解,我们将与该行业一起工作,以确定适应这些挑战的实际方法。这项工作将在2023年继续。•渔业新西兰发布了第一份关于水产养殖环境表现的年度报告。已经取得了进步,以确定实现水产养殖战略目标所需的关键投资,并通过加速水产养殖战略投资治理小组,使行业和研究提供商与这些目标保持一致。从2022年开始,要反思的一些主要积极进展是:•在库克海峡获得新西兰第一个开放式鲑鱼农场的同意(指出该同意正在上诉)。•Te Moana-a-toi的皇冠宪报空间提供和解,并通过了2022年《毛利人商业水产养殖修正案》,以进一步交付官方的和解义务。•渔业新西兰更新了马尔伯勒声音中鲑鱼农场的底栖最佳管理实践指南,并完成了开放海洋水产养殖的选址和管理指南,涵盖了底栖和水质效果。•持续进展取得了一种全面的水产养殖生物安全方法。•初级产业部的可持续食品和光纤期货基金投资于一个项目开发原型的陆基流通鲑鱼农场,包括对Sockeye Salmon Farming的试验。•机构提供了有关如何在资源管理系统改革中解决水产养殖的建议,并在2022年11月将其纳入了自然和建筑环境法案和空间规划法案中。
图 1 繁殖种群由繁殖季节产卵的亲鱼组成,这些亲鱼会生成数个(数百个)全同胞和半同胞家族,并在不同的水箱中饲养。当这些个体长到足够大以进行物理标记时,它们会进行单独识别,以在整个周期内保持谱系可追溯性。一些带标记的动物会作为选择候选者留在繁殖核心中,直到它们达到商业重量为止。其他带标记的动物组(选择候选者的全同胞和半同胞)代表繁殖核心中的所有家族,它们会被送去进行环境基因型、产品质量和抗病性测试,以评估具有表型的训练基因型(即成为训练种群)。所有带物理标记的动物都会进行采样并使用 SNP 面板进行基因分型。通过基因组评估方法(例如 GBLUP)联合分析来自训练种群和选择候选种群的谱系、表型和基因型信息,以预测 GEBV,进而用于做出下一繁殖季节的选择决策,并通过繁殖加速将优良基因转移到商业农场
药物已被确定为对环境的重要威胁。它们不断进入水生生态系统意味着生物会长期暴露。迄今为止,已经有大量科学论文评估了药物对不同分类学群体的单个生物的影响。但是,药物对环境的影响可能比在毒性测试中对单个生物的毒性测试所确定的影响要广泛得多。这些化合物会破坏整个社区。在这种情况下,应特别关注微生物社区,该社区规范了许多基于水生食物网和生态系统服务的基本过程。本文回顾了与药物对微生物的影响有关的当前发展,特别关注新鲜和盐水中的全社区研究。我们还总结了与原位和实验室研究相关的机会,并突出了重要的知识差距。
结合人类对人类的接触,通过气溶胶和粪便传播SARS-COV-2病毒的潜力提高了有效治疗医院废水(HWW)的紧迫性,这已被认为是传播到水生环境中的致病微生物的重要来源。但是,很少有评论讨论医院废水矩阵中病原体的存在和去除。本综述总结了医院废水中存在的细菌,真菌,病毒和寄生虫在内的致病微生物,相关疾病和治疗过程。此外,还审查了医院废水处理过程中病原体的去除,包括初步过程,次要过程和第三过程。由于人们对当前全球大流行对医院废水处理过程的影响的影响越来越大,因此需要进一步的研究来研究医院废水中病原体的实际命运并优化消毒过程。