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抗肿瘤坏死因子治疗的纵向单细胞图中炎症性肠病
免疫介导的炎症性疾病（IMID）中的精确药物需要对治疗反应有细胞的理解。我们描述了克罗恩氏病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）的治疗曲线（抗肿瘤坏死因子（抗TNF）治疗）。我们产生了约100万个单细胞转录组，分为109个细胞状态，来自216个肠道活检（41名受试者），揭示了疾病特异性的差异。系统生物学空间分析确定了CD和干扰素（IFN）反应特征中的肉芽肿特征，该特征位于T细胞聚集体和CD和UC中的上皮损伤。上皮和髓样室的预处理差异与两种疾病的缓解结果有关。纵向比较表明非排放中的疾病进展：CD中的髓样和T细胞扰动，UC中的多细胞IFN信号增加。IFN信号传导在类风湿关节炎（RA）滑膜中也观察到了淋巴样病变。我们的治疗图集是多种炎症性疾病中最常见的生物治疗，抗TNF的扰动最大的细胞普查。
二甲双胍调节骨髓基质细胞在糖尿病小鼠中加速骨骼愈合
抽象映射神经递质身份对神经元是理解神经系统中信息流的关键。它还为研究神经元身份特征的发展和可塑性提供了宝贵的入口点。在秀丽隐杆线虫神经系统中，神经纤维 - 米特的身份在很大程度上是通过编码神经递质生物合成酶或转运蛋白的神经递质途径基因的表达模式分析来分配的。但是，其中许多作业都依赖于可能缺乏相关顺式调节信息的多拷贝记者转基因，因此可能无法提供神经递质使用情况的准确图片。我们分析了秀丽隐杆线虫中所有主要类型的神经递质（谷氨酸，乙酰胆碱，GABA，5-羟色胺，多巴胺，多巴胺，酪胺和章鱼胺）中所有主要类型的神经递质的16个CRIS/CAS9工程敲入报告菌株的表达模式。我们的分析揭示了这些神经递质系统在神经元和神经胶质中以及非神经细胞中的新颖位点，最著名的是在性腺细胞中。所得表达的地图集定义了可能仅是神经肽的神经元，它基本上扩展了能够共同传播多个神经递质的神经元的曲目，并鉴定了单胺能神经植物的新颖位点。此外，我们还观察到单胺能合成途径基因的异常共表达模式，这表明存在新型单胺能发射器。我们的分析导致迄今为止，神经递质使用量最广泛的全动物范围图构成了最广泛的全动物范围图，为更好地理解秀丽隐杆线虫中神经元通信和神经元身份规范铺平了道路。
下一代人类大脑组织学图谱及其在自动脑部 MRI 分割中的应用
图 1：组织学图谱中的 NextBrain，具有优点（）、缺点（）和中立点。（）。（A）打印的图谱 [1]，其中包含一组稀疏的手动追踪切片 [1]。（BG）覆盖范围有限的特定 ROI 的组织学图谱：（B）手动追踪的基底神经节切片 [8]；（C）确定性丘脑图谱的 3D 渲染 [11]；（DF）追踪的 MRI 切片、组织学切片和海马图谱的 3D 渲染 [12]；（G）我们的丘脑概率图谱切片 [14]。（HN）整个人脑的组织学图谱：（H）BigBrain 的 3D 重建切片 [13]；（I）MNI 模板上的 Julich-Brain 标签切片； (J) 标记的 Allen 参考脑组织学切片 [7]；(K) 使用受 (J) 启发的协议标记 MNI 模板；(LN) AHEAD 脑的 MRI、组织学和 3D 渲染 [22]。(OS) 我们的新图谱 NextBrain 包括五个标本的密集 3D 组织学 (OP) 和全面的手动标记 (Q)，从而可以构建概率图谱 (R)，该图谱可与贝叶斯技术相结合，自动标记体内 MRI 扫描中的 333 个 ROI (S)。
线粒体呼吸图集揭示了性别范围的线粒体功能的不同变化
。cc-by-nc 4.0国际许可证未获得同行评审的认证）是作者/筹款人，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（该版本发布于2024年7月24日。; https：//doi.org/10.1101/2024.03.26.586781 doi：biorxiv Preprint
小麦抗锈病基因座全基因组图谱
摘要 锈病，包括叶锈病、条锈病/黄锈病和秆锈病，严重影响小麦 (Triticum aestivum L.) 的产量，每年造成巨大的经济损失。培育和推广具有遗传抗性的品种是控制这些疾病最有效和可持续的方法。小麦育种者用于选择抗锈病的遗传工具包已迅速扩展，利用最新的基因组学、作图和克隆策略鉴定了大量基因位点。本综述的目的是建立一个小麦基因组图谱，全面总结已报道的与抗锈病相关的基因位点。我们的图谱总结了过去二十年 170 篇出版物中针对三种锈病绘制的数量性状基因位点 (QTL) 和特征基因。根据最新的小麦参考基因组 (IWGSC RefSeq v2.1)，总共有 920 个 QTL 或抗性基因被定位在小麦的 21 条染色体上。有趣的是，26 个基因组区域包含多个锈病基因座，表明它们可能对两种或多种锈病具有多效性。我们讨论了一系列利用这些丰富的遗传信息来有效利用抗性来源的策略，包括利用基因组信息来堆叠理想的和多个 QTL，以开发具有增强的抗锈病小麦品种。
在发育中的小鼠视觉皮层中，感觉依赖性基因表达的单细胞转录图
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年6月26日。 https://doi.org/10.1101/2024.06.25.600673 doi：Biorxiv Preprint
电池Atlas 2024电池Atlas 2024
最初的位置直到最近，欧洲还没有作为电池电池的生产地点发挥重要作用，但是技术创新以及稳定和促进政治框架条件的稳定性使欧洲越来越有吸引力，作为电池生产的新市场。由于电池沿电动汽车的过程链和欧盟绳索的OEM密度的重要性，欧洲将成为下一个热点。为了满足仅汽车部门对电池电池不断增长的需求，到2030年可能需要900吉瓦小时（GWH）。因此，正在计划或已经在建设中进行了大约40个电池生产事实。计划的活动遍布欧洲。在与欧洲制造商有关的情况下，来自亚洲和美国的生产商也希望帮助塑造欧洲的电池界。与主要专注于细胞生产的亚洲细胞制造公司相比，欧洲市场看到了大型汽车制造商和细胞生产商之间的许多合作和合资企业。此外，还有来自欧洲的新初创企业。来自亚洲，主要是在家中建立的细胞制造商进入欧洲市场。那些新计划的电池生产工厂的目标是减少进一步的生产
心脏发展中发展的人类流出道及其成人衍生物
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2024年6月5日。 https://doi.org/10.1101/2023.04.05.535627 doi：Biorxiv Preprint
土壤病毒的全球地图集揭示了未开发的生物多样性和潜在的生物地球化学1
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证未通过同行评审获得证明）是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（本版本发布于2024年5月1日。; https：//doi.org/10.1101/2023.11.02.565391 doi：biorxiv Preprint
胎儿脑部 MRI 图谱和数据集：综述
胎儿大脑发育是一个复杂的过程，涉及不同的生长和组织阶段，这对于大脑回路和神经连接的发育至关重要。胎儿脑图谱和标记数据集是研究产前大脑发育的有前途的工具。它们支持识别非典型大脑模式，为临床状况的潜在早期迹象提供见解。简而言之，通过现代工具进行产前大脑成像和后期处理是一个前沿领域，将极大地促进我们对胎儿发育的理解。在这项工作中，我们首先对特定术语（即“大脑模板”和“大脑图谱”）进行术语澄清，强调与文献中术语使用不一致相关的潜在误导性解释。我们讨论了胎儿大脑个体发育的主要结构和神经发育里程碑。我们的主要贡献是对 18 个产前大脑图谱和 3 个数据集进行系统回顾。我们还顺便关注产前神经影像学的临床、研究和伦理影响。