1 Respucation of ResjudmentBioMédicen Red de Enfermedes Raras(Ciberer),西班牙巴塞罗那; 2大学庞贝·法布拉大学(UPF),西班牙巴塞罗那; 3西班牙巴塞罗那科学技术研究所(Bisti)基因组调节中心(CNAG-CRG)的Centro NacionaldeAnálisisGenómica(CNAG-CRG); 4 Isglobal,西班牙巴塞罗那; 5西班牙巴塞罗那巴塞罗那科学技术学院基因组监管中心(CRG); 6 CiberEpidemiologíay SaludPública(Ciberesp),西班牙巴塞罗那; 7医学基因组学集团,圣地亚哥大学,西班牙圣地亚哥·德·孔波斯特拉; 8英国布拉德福德的布拉德福德教学医院NHS基金会信托基金Bradford健康研究所; 9大学格勒诺布尔(Grenoble Alpes),Inserm,CNRS,环境流行病学团队,用于繁殖和呼吸遗产,法国格勒诺布尔; 10日环境科学系,立陶宛Kaunas Vytautas Magnus University; 11挪威挪威公共卫生学院环境卫生部;挪威; 12社会医学系,克里特岛克里特大学,希腊克里特岛; 13美国南加州大学凯克医学院预防医学系,美国洛杉矶,美国; 14 Medicine Genomics Group,Ciberer,Santiago de Compostela大学,西班牙圣地亚哥De Costela; 15加利西亚州基因组医学基金会,西班牙圣地亚哥·德·波多拉(Santiago de Costela); 16定量基因组医学实验室(QGENOMICS),西班牙巴塞罗那的埃斯普尔·德尔·洛布雷加; 17 Departoment de Biomedicine,DeNeurociències,巴塞罗那大学,巴塞罗那大学,西班牙
此预印本版的版权持有人于2025年2月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.25321773 doi:medrxiv preprint
授予/奖励号:U19AG032438;国家老化研究所;阿尔茨海默氏症协会,赠款/奖励号:SG-20-690363-DIAN LATAM;德国神经退行性疾病中心;劳尔·卡雷(Raul Carrea)神经研究所;痴呆症的研发赠款;日本医学研发机构;韩国痴呆研究中心,赠款/奖励号:HU21C0066;西班牙卫生研究院卡洛斯三世;加拿大卫生研究所;加拿大神经退行性和衰老联盟,大脑加拿大基金会; BMBF-德国研究和教育部,赠款/奖励号:(FKZ,FKZ161L0214B,FKZ161L0214CCLINSPECT-M);德国研究基金会在慕尼黑系统神经病学框架内的德国卓越策略(Synergy),赠款/奖励号:exc2145Synergy -ID390857198
授予/奖励号:U19AG032438;国家老化研究所;阿尔茨海默氏症协会,赠款/奖励号:SG-20-690363-DIAN LATAM;德国神经退行性疾病中心;劳尔·卡雷(Raul Carrea)神经研究所;痴呆症的研发赠款;日本医学研发机构;韩国痴呆研究中心,赠款/奖励号:HU21C0066;西班牙卫生研究院卡洛斯三世;加拿大卫生研究所;加拿大神经退行性和衰老联盟,大脑加拿大基金会; BMBF-德国研究和教育部,赠款/奖励号:(FKZ,FKZ161L0214B,FKZ161L0214CCLINSPECT-M);德国研究基金会在慕尼黑系统神经病学框架内的德国卓越策略(Synergy),赠款/奖励号:exc2145Synergy -ID390857198
淀粉样蛋白β沉积是散发性阿尔茨海默氏病和常染色体主导的阿尔茨海默氏病的标志性病变之一,后者是由淀粉样蛋白β处理中涉及的基因突变引起的。尽管淀粉样蛋白β沉积是散发性阿尔茨海默氏病和常染色体主导的阿尔茨海默氏病的核心,但这些阿尔茨海默氏病亚型的某些差异在与淀粉样ambeta的空间模式方面存在观察到。Previous work has shown that the spatial pattern of amyloid-beta in individuals spanning the sporadic Alzheimer ' s disease spectrum can be reproduced with high ac- curacy using an epidemic spreading model which simulates the diffusion of amyloid-beta across neuronal connections and is constrained by individual rates of amyloid-beta production and clearance.然而,尚未研究是否可以以相同的方式对稀有的常染色体式阿尔茨海默氏病中的淀粉样蛋白-Beta沉积进行建模,如果是这样,如果是这样,淀粉样蛋白贝塔(Alzheimer)的淀粉样蛋白β的传播模式多么一致。我们利用流行病扩散模型作为数据驱动的方法,用于探测淀粉样蛋白β的传播模式在三个不同的大型成像数据集中的淀粉样蛋白β传播模式(2种散发性阿尔茨海默氏病,1个常染色体典型的阿尔茨海默氏病)。我们分别评估了每个数据集中的个体和个体内模型性能,并进一步识别了淀粉样蛋白β扩散的最可能受试者特异性的表述。我们将流行病扩散模型分别应用于阿尔茨海默氏病神经影像学计划(n = 737),开放式成像研究系列(n = 510)和主要遗传的阿尔茨海默氏症网络(n = 249),其中后两个使用相同的管道处理。使用在零星阿尔茨海默氏病的先前作品中定义的epcentres,流行病扩散模型对所有三个数据集中的淀粉样蛋白β沉积的区域模式进行了适度的预测。我们进一步发现,虽然大多数淀粉样蛋白β的最有可能的中心 - 积极对象与默认模式网络重叠,但常染色体占主导地位的13%
染色体是生物体的遗传信息的载体,可以分为两种主要类型:同种异体体和常染色体。同种体,也称为性染色体,在性别决定和调节与性别相关的特征中起着至关重要的作用。尽管多样性相当多,但它们具有标准特征和基因含量和配对系统的差异。了解性染色体对于农业和疾病控制工作至关重要,在这种工作中,利用性别特异性特征的遗传方法表现出希望。但是,识别同种异体,尤其是在非模型生物中,带来了挑战。在这里,我们探索了监督的机器学习模型的使用,包括逻辑回归,随机森林,支持向量机和K-Nearest邻居,将基于全基因组测序数据基于全基因组测序数据的常染色体或同体分类。评估了覆盖,杂合性和GC含量等特征的预测能力。结果强调了特征组合和模型选择以进行准确分类的重要性。
。CC-BY 4.0 国际许可 它是根据作者/资助者提供的,他已授予 medRxiv 永久展示预印本的许可。(未经同行评审认证)
(1)马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州波士顿的马萨诸塞州妇女医院(2)华盛顿大学,位于美国密苏里州圣路易斯,美国密苏里州圣路易斯医学院,(3)美国梅奥诊所,放射学,美国明尼苏达州罗切斯特,美国明尼苏达州,印第安纳州阿尔茨海姆研究中心,印第安纳州印第安纳州纽约市,德国神经退行性疾病中心(DZNE)的临床脑研究,Tübingen,D-72076Tübingen,德国Tübingen,(6)埃默里大学医学院,乔治亚州亚特兰大,乔治亚州亚特兰大,(7)Neuroscience Research Australia,澳大利亚,澳大利亚,澳大利亚,澳大利亚,澳大利亚,澳大利亚;和新南威尔士大学的生物医学科学学院,澳大利亚新南威尔士州悉尼,(8)布朗大学布朗大学阿尔普特医学院,美国普罗维登斯,美国,(9)(9)Ludwig-Maximilians-universitätmunchen神经病学系,穆尼奇(Munich),Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich,Munich clister,Munich clister,Munich clister,Munich clister,Munich emich of Munich of Munich of Munich of Munichians-Universitätmuniversität阿根廷布宜诺斯艾利斯的Fleni神经学研究所(11)英国痴呆症研究所,UCL,伦敦,英国,英国,(12)梅奥诊所,美国佛罗里达州杰克逊维尔,美国密歇根大学,密歇根大学,密歇根州安阿伯,密歇根州安阿伯,美国密歇根州,
通讯作者:Yakeel T. Quiroz,博士,哈佛医学院副教授,精神病学和神经病学系,马萨诸塞州综合医院,第39号大街,套房101,马萨诸塞州查尔斯敦,马萨诸塞州02129,电话:(617)643-5944; yquiroz@mgh.harvard.edu。Disclosures HZ has served at scientific advisory boards and/or as a consultant for Abbvie, Alector, Annexon, Artery Therapeutics, AZTherapies, CogRx, Denali, Eisai, Nervgen, Novo Nordisk, Pinteon Therapeutics, Red Abbey Labs, Passage Bio, Roche, Samumed, Siemens Healthineers, Triplet Therapeutics, and Wave, has鉴于由Cellectricon,Fujirebio,Alzecure,Biogen和Roche赞助的研讨会讲座,并且是Gothenburg AB(BBS)的脑生物标志物溶液的共同创始人,这是GU Ventures Cubator Program的一部分(外部提交的工作)。JD是Eli Lilly的专利或专利申请的发明者,以及与这项工作中使用的物质的测定,方法,试剂和 /或组成有关的公司。JD曾担任Karuna Therapeutics的顾问,并获得了ADX Neurosciences,Roche Diagnostics和Eli Lilly and Company的研究支持。OH已从ADX,AVID放射性药物,Biogen,Eli Lilly,Eisai,Fujirebio,GE Healthcare,Pfizer和Roche获得了研究支持(用于机构)。在过去的两年中,他从Amylyx,Alzpath,Bioarctic,Biogen,Cerveau,Cerveau,Fujirebio,Genentech,Novartis,Roche,Roche和Siemens获得了咨询/发言人费用。EMR报告收到个人费用作为Roche Diagnostics的科学顾问(仅旅行费用),MAGQ,AVID放射线药物,并且是Alzpath的共享共同创始人,在提交的工作之外。此外,他是颁发给Banner Health的专利的发明者,该专利涉及在高危人士中使用生物标志物终点,以加快对阿尔茨海默氏病预防疗法的评估,并且不在提交的工作之外。PT reports personal fees from Abbvie, AC Immune, Acadia, Auspex, Boehringer Ingelheim, Eisai, Genentech, GliaCure, Merck, Novo Nordisk, T3D Therapeutics, grants and AstraZeneca, grants and personal fees from Biogen, Roche, grants from Genentech, Novartis, and Arizona Department of Health Services, outside the submitted work.此外,PT具有专利的美国专利#11/632,747,“神经退行性疾病的生物标志物”。 KB曾担任ABCAM,Axon Neuroscience,Biioentic,Biogen,Lilly,Lilly,Magqu,Novartis,Roche Diagnostics的顾问或咨询委员会,并且是Gothenburg AB的Brain Biomarker Solutions的联合创始人,Gothenburg AB,Gothenburg AB,Gothenburg gu Venture的平台公司。YTQ曾担任Biogen的顾问。其他合着者宣布没有竞争利益。
注意:在非携带者,无症状突变携带者和有症状的突变载体中,使用线性混合效应模型(用于连续结果)和具有逻辑链接的广义线性混合效应模型来计算特征差异的重要性。所有混合模型均包含随机的家庭效应,以说明同一家族参与者之间的结果指标的关联。连续措施表示为中值(IQR)。缩写:Adad,常染色体显性阿尔茨海默氏病; cdr-sob,临床痴呆评级盒子的总和; CSF,脑脊液); Eyo,估计症状发作的年; FDG,18 F-氟脱氧葡萄糖; GFAP,神经胶质原纤维酸性蛋白; IQR,四分位数范围; MMSE,小型国会考试; n,参与者的总数(分别有突变非载体,无症状突变携带者和有症状的突变载体的数量);宠物,正电子发射断层扫描; PIB,11 C-pittsburgh化合物B; SUVR,标准化的吸收值比。
