空中真菌和细菌已被研究人员进行了广泛的研究。我们概述了空气中的致病微生物的分布和来源,以及对这些微生物在室外和室内环境中对人类健康造成的有害影响的详细描述。通过分析该领域发表的大量文献,我们就空降微生物如何影响我们的幸福感提供了宝贵的见解。这些发现突出了与各种自然和人介导的环境中暴露于空中真菌和细菌有关的有害后果。某些人群群体,包括儿童和老年人,免疫功能低下的个体以及各种类型的工人特别暴露,并且容易受到对空气微生物污染健康影响的有害影响。在各种室内和室外环境中,许多研究始终始终确定为替代性的替代品,cladosporium,cladosporium,penicillium,曲霉和镰刀菌作为主要的真菌属。在细菌,芽孢杆菌,链球菌,微球菌,肠球菌和假单胞菌中,从许多环境中收集的空气样品中出现了主要属。所有这些发现有助于扩大我们对空中微生物分布的了解,强调对进一步研究的关键需求并提高公众意识。总体而言,面对机载微生物污染物带来的风险,这些努力可能在保护人类健康方面起着至关重要的作用。
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摘要:细菌基因组编辑包括一系列繁琐且多步骤的方法,例如自杀质粒。成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)-Cas 技术的发现和应用因其简单性和可编程性而彻底改变了真核生物的基因组编辑。然而,该系统在细菌基因组编辑中并没有得到广泛的青睐。在这篇综述中,我们总结了 CRISPR-Cas 介导的细菌基因组编辑的主要方法和困难,并提出了一些规避这些问题的替代方法,包括 CRISPR 切口酶、Cas12a、碱基编辑器、CRISPR 相关转座酶、引物编辑、内源性 CRISPR 系统以及使用预制的 Cas 蛋白和向导 RNA 的核糖核蛋白复合物。最后,我们还讨论了基于荧光蛋白的方法来评估基于 CRISPR 的系统对细菌基因组编辑的有效性。CRISPR-Cas 仍然有望成为细菌中的通用基因组编辑工具,并且正在进一步优化以扩大在这些生物体中的应用。这篇综述提供了罕见的基因组编辑综合视角。它还旨在让微生物学界熟悉不断增长的细菌基因组编辑工具箱。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2020 年 2 月 22 日发布。;https://doi.org/10.1101/2020.02.21.958983 doi:bioRxiv 预印本
我们构建了一组质粒,可用于在某些革兰氏阴性细菌中表达重新组合功能,从而促进体内遗传操作。这些质粒包括复制的起源和噬菌体λ基因组的片段,该基因组在其天然控制下包含红色基因(EXO,BET和GAM)。这些构建体不需要通常需要的抗终止事件才能进行红色表达,从而使它们在不同物种中的应用更可能。一些质粒具有温度敏感的复制子来简化固化。在创建这些向量时,我们开发了两个有用的重组应用程序。仅使用质粒起源和靶同源性,可以通过GAP-REPAIR检索任何与药物标记相关的基因。复制的质粒起源可以通过靶向替换来更改为不同的来源,从而有可能更改其拷贝数和主机范围。这两种技术都将被证明可用于操纵体内质粒。大多数红色质粒构造在大肠杆菌中催化有效的重组,其背景重组水平较低。这些红色质粒已在沙门氏菌中成功进行了测试,我们预计它们将在其他相关的革兰氏阴性细菌中提供有效的重组。由Elsevier B.V.
Bacteria Spirit Creek Augusta,佐治亚州执行摘要第303(d)条《联邦清洁水法》(CWA)要求开发305(b)/303(d)水域清单。佐治亚州环境保护部(GA EPD)根据40 CFR第130.7(b)(4)部分和美国环境保护署(美国EPA)提供的指导,为佐治亚州河流和溪流开发此列表。2022第303(d)列表在里士满县确定了精神溪,因为违反了地表水质细菌标准,因此不支持指定用途。从SR56到萨凡纳河的岩石溪的下部七英里部分被列为粪便大肠菌群(FC)细菌损伤,原因是由于非点源和城市径流。Spirit Creek损坏的细分市场列表基于GA EPD在2018年收集的第2级数据。只收集了四个样本;一个在三月,八月,十月和十一月。在四个收集的样品中,只有一个样本,八月收集,超过了单个样品阈值值,并被用来将7英里的Spirit Creek覆盖在受损的水域清单上。在我们的专业意见中,该覆盖范围应该在第3类(评估待定)中放置在收集其他数据之前。诸如评估参数以及其他数据的结果(包括现场历史数据)的结果等因素。Augusta MS4排放量受到GA EPD采样位置附近的限制,并且可能有很高的其他因素导致2018年8月29日收集的样品。历史数据摘要作为图表A(第9/9页)。以前列出了同一细分市场,佐治亚州奥古斯塔(Augusta)收集了足够的几何均值数据,以在2006年至2010年间将该细分市场提升。本工作计划的目的是遵守奥古斯塔(GA)地区广泛的国家污染物消除系统(NPDES),市政独立的雨水系统下水道系统(MS4)许可证以及一般实施的集成管理控制措施,以管理最大程度上可行的涉及的已确定污染物(MEP)。简介奥古斯塔(Augusta)位于佐治亚州中部的萨凡纳河附近。它受哥伦比亚县北部和西北的边界;麦克杜菲县和杰斐逊县西南;南部的伯克县;以及东部的萨凡纳河和南卡罗来纳州(图1)。奥古斯塔(Augusta)位于佐治亚州亚特兰大以东约150英里处,南卡罗来纳州哥伦比亚西南约68英里。该县涵盖了约324平方英里,其中近75%由奥古斯塔服务。大多数奥古斯塔位于上沿海平原生理省内。然而,包括洛克克里克(Rock Creek)和雷克里克(Rae's Creek)在内的一个小北部位于皮埃蒙特(Piedmont)物理学省。沿海平原通过分层且未固定的海洋沉积岩的底层。Spirit Creek朝着萨凡纳河朝着东方的方向流动。小溪流经艾森豪威尔堡和赫菲尔赛巴社区。流域描述Spirit Creek流域位于里士满县的中部。流域中的土地利用主要是住宅,大量小溪排水口约41,210英亩(64.41平方英里),包括戈登堡的一部分和赫菲尔西巴市。
摘要。我们使用低成本,紧凑的拉曼光谱仪报告快速鉴定单个细菌。我们证明了60 s的程序足以在600至3300 cm-1的范围内获取全面的拉曼光谱。这次包括将小细菌聚集体的定位,单个个体的比对以及自发的拉曼散射信号收集。小细菌聚集体的快速定位,通常由小于十二个个体组成,是通过在24 mm 2的大型视野上进行镜头成像来实现的。无镜头图像还允许单个细菌与探测束的精确比对,而无需标准显微镜。在532 nm处的34兆瓦连续激光器的拉曼散射光被喂入定制光谱仪(原型龙卷风光谱系统)。由于该光谱仪的高光吞吐量,可接受的积分时间低至10 s。我们在七个细菌物种上总共记录了1200个光谱。使用此数据库和优化的预处理,获得了约90%的分类速率。我们的拉曼光谱仪的速度和敏感性为高通量和无损的实时细菌鉴定测定法铺平了道路。这种紧凑和低成本的技术可以使生物医学,临床诊断和环境应用受益。©2014光学仪器工程师协会(SPIE)[doi:10.1117/1.jbo.19.11.111610]
摘要:药用植物拥有各种具有巨大经济价值的内生微生物。因此,本研究的重点是分离和鉴定来自阿拉什(埃及)干旱地区的药用植物的细菌内生菌,及其作为增强番茄植物生长的生物调节剂的潜在作用。在这项研究中,八个内生细菌分离株显示了对测试真菌的直接广泛拮抗作用。根据拮抗活性,研究了这些分离株,以根据其16S rRNA基因序列进行识别,例如lysinibacillus fusiformis,pumilus pumilus,siamensis,siamensis,paenibacillus peoriae,paenib,paenib。polymyxa,铜绿假单胞菌A,Brevundimonas diminuta和Providencia vermicola。筛选菌株的各种植物生长促进(PGP)属性,包括吲哚-3-乙酸(IAA),氨,铁载体,磷酸酶,水解酶产生和磷酸盐溶解。孤立的细菌菌株具有可变的植物生长促进活性。评估了两种选择的内生细菌菌株,其生物控制潜力针对由氧气孢子菌和溶孢菌引起的番茄真菌根腐病疾病,以进一步评估其在温室条件下的PGP能力。在温室下,B。bumilusnaw4和铜绿假单胞菌A NAW6被证明有效地赋予在压力下以及在正常生长条件下的西红柿上带来积极的好处。
最近的许多研究强调了植物生长促进(Rhizo)细菌(PGPR)在支持植物发育中的重要性,尤其是在生物和非生物胁迫下。最关注植物生长 - 促进所选菌株的性状以及后者对植物生物量,根建筑,叶片区域和特定代谢物积累的影响。关于能量平衡,植物的生长是投入(光合作用)和几个输出(即呼吸,渗出,脱落和草食)的结果,在PGPR植入植物相互作用的古典研究中经常被忽略。在这里,我们讨论了PGPR及其代谢物在植物生态生理学上触发的修饰的主要证据。我们建议使用叶子气体交换检测PGPR诱导的光合作用活动的变化,并建议根据实验的特定目标设置正确的时间来监视植物响应。这项研究确定了挑战,并试图向从事PGPR植物相互作用的科学家提供未来的方向,以利用微生物在改善植物价值方面的应用。
17。Walkiewicz K.等。“酶功能的微小变化会导致抗生素耐药性的自适应发展过程中出奇的适应性效应”。美国国家科学学院的会议记录109(2012):21408-21413。
