细胞运动普遍依赖于连接底物与细胞电机的局灶性粘附复合物(FAS)的空间调节。在细菌FAS中,冒险的滑行运动机制(AGL-GLT)在相互滑动运动蛋白(MGLA) - 瓜氨酰5'三磷酸(GTP)梯度沿细胞轴沿细胞轴沿铅杆组装。在这里,我们表明GLTJ是一种机械膜蛋白,包含胞质序列的结合MGLA-GTP和AGLZ,并募集MREB细胞骨架以启动向滞后细胞极运动。此外,MGLA-GTP结合触发相邻的GLTJ锌指域中的构象转移,从而促进了滞后极附近的MGLB募集。这提示了MGLA的GTP水解,从而导致复杂的拆卸。因此,GLTJ开关用作MGLA-GTP梯度的传感器,在空间上控制FA活性。
使用人尿作为农作物肥料,由于其潜在的好处引起了兴趣,但其应用对尿液如何影响土壤功能和微生物群落有所了解。本研究旨在阐明土壤细菌群落对用人尿液施肥的反应。为此,菠菜作物被2种不同剂量的分离和储存的人类尿液(170 kg n ha-1 + 8.5 kg p ha-1和510 kg n ha-1 + 25.5 kg p ha-1),并与合成受肥(170 kg n ha-h ha-8.5 ka + p ha-5 k p ha-5 k p ha-1)相比根据随机块方案,在温室条件下在四个土壤罐中进行了实验。我们在开始时和土壤和植物特性的开始时评估了尿液和土壤细菌组成的地位,以了解细菌组成变化中的驱动因素。储存12个月后,尿液具有耗尽的微生物组,但仍然含有很少的尿液或粪便菌株。总体而言,土壤细菌群落对尿液施肥有抵抗力,只有3%的分类单元受到影响。然而,与合成肥料相比,尿液受精的硝化和反硝化基团的相对丰度,这意味着在用尿液施肥时可能会发出更多的n 2 o,而无需发出。尿液的高盐浓度对BAC群落几乎没有明显的影响。在更广泛的背景下,该实验提供了证据表明,一年储存的尿液可以应用于植物土壤系统,而不会在短期内对土壤细菌群落产生负面影响。
抽象的拉曼光谱学对细菌物种提供了非破坏性和高度敏感的分子见解,使其成为检测,识别和抗生素易感性测试的宝贵工具。然而,由于批量信号的优势和不可控制的分析物的异质性,实现临床相关的准确性,定量数据和可重复性仍然具有挑战性。在这项研究中,我们介绍了一种创新的诊断工具:质子纤维纤维旋转器(P -FS),该工具掺入了与金属特征集成的硝酸纤维素膜,该膜被称为纳米质体 - 增强矩阵,设计用于同时的细菌局限型和检测。我们开发了一种使用光刻造影的等离子阵列图案化硝化膜的方法,然后将其与自定义的纤维旋转器集成。用各种细菌物种(E. Coli 25922,S。金黄色葡萄球菌25923,大肠杆菌MG1655,Brevis和S. Mutans 3065)测试P -FS装置(E. Coli 25922,S。Aureus 25923,E。coli Mg1655),这表明基于其独特的Ramanefingerprints,证明了成功的识别。与等离子体阵列内的区域的细菌界面,在P -FS上,电磁场最浓缩的是最强烈的浓缩(称为纳米质热点)显着提高了敏感性,从而提高了更精确的检测。SERS强度映射使用基于阈值的方法转化为数字信号,以识别和量化细菌分布。鉴于P -FS在日常条件下增强振动签名及其可扩展的制造能力,我们预计纳米质增强的拉曼光谱 - 利用由金属制成的纳米结构(特定的金色和银色)沉积在硝基纤维膜上散布的含量散布的含量,并将其散布在偏心上 - 各种分析物,包括对人类健康至关重要的分析物,其从实验室研究过渡到临床应用的强大潜力。
摘要简介细菌性阴道病(BV)的病因(一种与生物膜相关的阴道感染)仍然未知。流行病学数据表明它是性传播的。BV的特征是乳酸产生乳酸杆菌的丧失以及兼性和严格的厌氧菌细菌的增加。Gardnerella spp以95% - 100%的病例存在;在体外,已发现阴道加德纳(Gardnerella daginal)比其他与BV相关的细菌(BVAB)更具毒性。然而,阴道菌在正常的阴道微生物群中发现了G. g。g。g。g。g。定植不足以进行BV发育。我们假设Gardnerella spp启动BV生物膜形成,但是入射的BV(IBV)需要将其他关键的BVAB(IE,Prevotella bivia,Fannehessea daginae)掺入将多因素群体转录组改变的生物膜中。这项研究将研究IBV之前的微生物事件的序列。方法和分析本研究将在阿拉巴马州伯明翰的一家性健康研究诊所中招募150名18-45岁阴道菌群的女性,没有性传播感染。女性每天每天两次自我收集,最多60天。16S rRNA基因测序,用于Gardnerella spp,P。bivia和F. f. f。f。f。f。divcr以及范围16S rRNA基因QPCR的QPCR将在每天的两次阴道标本中进行,来自IBV女性的阴道女性两次(至少连续2个日子)和对照组的差异(至少是连续2个)和竞赛,并具有可比性的年龄,并且对竞赛的差异,并在竞赛中进行了差异,并在竞赛中进行了反对,并且竞赛,竞赛,竞赛,竞赛,竞赛,竞赛,竞赛,竞赛,竞赛,并在竞赛中,并且竞赛,竞赛和竞赛,竞赛,并在竞赛中,竞赛,竞赛,并竞争。 Microbiota研究IBV女性随着时间的流逝,阴道菌群的变化。参与者将每天对包括性活动在内的多种因素完成日记。道德和传播该协议得到了阿拉巴马大学伯明翰机构审查委员会(IRB-300004547)的批准,并将获得所有参与者的书面知情同意。调查结果将在科学会议上提出,并在同行评审的期刊上发表,并将其传播给感兴趣的社区的提供者和患者。
AurélienMaillet,AgnèsBouju-Albert,Steven Roblin,PaulineVaissié,SébastienLeuillet等。dna提取方法和采样方法对细菌群落的采样方法和采样方法,受16s rdna Metabarcoding在冷salmokeped salmon and Processing salmon and Processing surfaces中监测的细菌群落。食品微生物学,2021,95,pp.1-10。10.1016/j.fm.2020.103705。hal-03492706
研究小组利用 RNA 测序发现癌细胞在细胞和分子水平上对细菌的反应。他们提出了一个假设,即癌细胞的哪些分子通路有助于细胞对细菌疗法产生耐药性。为了验证他们的假设,研究人员用目前的抗癌药物阻断了这些通路,并表明将药物与细菌毒素相结合可以更有效地消除肺癌细胞。他们在肺癌小鼠模型中验证了细菌疗法与 AKT 抑制剂的结合作为一个例子。
牙菌菌生物膜内链球菌与白色链球菌之间的生态相互作用是驱动龋齿发病机理的重要因素。这项研究旨在调查s。mutans c。白色疾病的生长和通过细胞外膜囊泡(EMV)和泛素化调节(一种关键蛋白转化后修饰)的调节。我们建立了一个Transwell共培养模型,以实现s之间的“联系 - 独立”相互作用。mutans and c。白色唱片。s。mutans eMV与c直接关联。白色念珠菌细胞并促进生物膜的形成和生长。Quantertative泛素化分析显示了s。Mutans极大地改变了c。白色唱片。我们确定了整个c的10,661个泛素化位点。白色唱片蛋白质组及其在与翻译,代谢和应激适应性相关的途径中的富集。与s共同培养。突变导致对糖分解代谢和减少功率产生的398种蛋白质上的泛素化上调。s。mutans上调了c的超氧化物歧化酶3。白色念珠菌,诱导其降解和高度增强的活性氧水平,并同时刺激c。白色唱片的生长。我们的发现阐明了EMV和泛素化调制,作为控制s的关键机制。mutans-c。白色唱片相互作用,并为促进性口服生物膜环境提供新的见解。这项研究显着提高了对牙齿斑块营养不良和龋齿发病机理基础的复杂分子相互作用的理解。
Marchi, A., Bonaldo, A., Scicchitano, D., Candela, M., De Marco, A., Falciglia, S., 等人 (2023)。通过增加膳食细菌单细胞蛋白水平喂养金头鲷:对生长、血浆生物化学、肠道组织学和肠道微生物群的影响。水产养殖,565,1-11 [10.1016/j.aquaculture.2022.739132]。
1 加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系;美国加利福尼亚州伯克利市;2 加州大学创新基因组学研究所;3 加州大学伯克利分校加州定量生物科学研究所 (QB3);4 加州大学伯克利分校霍华德休斯医学研究所;美国加利福尼亚州伯克利市;5 加州大学伯克利分校地球与行星科学系;6 加州大学洛杉矶分校分子、细胞和发育生物学系;7 加州大学伯克利分校计算生物学中心;8 加州大学洛杉矶分校霍华德休斯医学研究所;9 格拉德斯通研究所;美国加利福尼亚州旧金山市;10 格拉德斯通-加州大学旧金山分校基因组免疫学研究所; 11 劳伦斯伯克利国家实验室分子生物物理和综合生物成像部;美国加利福尼亚州伯克利市;12 加利福尼亚大学伯克利分校化学系;美国加利福尼亚州伯克利市;
致病细菌造成许多医疗保健和安全问题,包括传染病(He等,2023),食物中毒(Hussain,2016年)和水污染(Some等,2021)。由于其感染性和快速增殖,需要快速,准确的细菌检测和鉴定方法,以减少决策的时间段,从而最大程度地减少医疗保健风险,生态系统影响以及与微生物病原体相关的经济损失。基于琼脂平板上细菌细胞培养的病原体检测和鉴定已经存在不同的方法(Van Belkum和Dunne,2013年),免疫学检测(例如,酶联免疫吸附测定法) ),DNA微阵列(Colle等,2003),生物传感器(Boehm等,2007; Ahmed等,2014),或使用特定试剂敏感的使用,例如,细菌代谢(Ghatole et al。,2020; Hsieh等人,2018年)或lie of eDeNos of AdeNose(Et) ),等(Chen等,2018; Dietvorst等,2020)。然而,由于其简单性,低成本,稳健性和可靠性,传统的板块培养方法仍然是病原体检测和识别的金标准(Rohde等,2017),是细菌污染评估法规中的一种(Word Health Organisation,2017年)。实际上,板培养涉及琼脂平板的细菌生长,直到可以观察到单克隆菌落的形成为止。因此,板块培养在某种程度上容易受到人类错误的影响。菌落在形态,颜色,光泽和不透明度上等等,在仔细观察之后,有时在显微镜下,专家可以区分专家。除此之外,这项技术的主要限制是其持续时间。通常,直到菌落形成的细菌增殖需要超过18小时,对于缓慢增殖的细菌而言,必须超过3 - 4天(Franco-Duarte等,2023; Rajapaksha等,2019; Lee等,2020)。一种极端情况是军团菌,它需要非标准治疗和第二盘培养以进行适当的诊断,从而将细菌识别延迟到几周内(Tronel和Hartemann,2009; McDade,2009)。减少测量时间和加速决策的一种可能性是实施能够检测菌落并在形成的早期阶段识别的先进成像系统(Wang等,2020)。从这个意义上讲,高光谱成像是有利的,因为它以3D数据矩阵或超立方体格式提供了高分辨率图像,其中二维对应于空间信息(x,y坐标),而第三个维度对每个单独的像素(λ坐标)的光谱数据(Gowen等,2015,2015,2015; arrigoni; arrigoni et al arrigoni; arrigoni et al and arrigoni; arrigoni et al and arrigoni et al and arrigoni et al and arrigoni et al and arrigy and and and and。通常使用化学计量学来处理大量信息,以识别数据集中的模式,这些模式在裸眼中并不明显,并创建了能够对新数据进行分类的预测模型(Huang,2022)。然后可以使用这些PC进行基于PCA的判别分析(PCA-DA)(UDDIN主成分分析(PCA)通常与高光谱成像结合使用,以将光谱图像数据集减少为称为主成分(PCS)的代表变量(Abdi和Williams,2010年)。