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用于高通量筛选的数字条形码
摘要：高通量筛选是药物研发、癌症治疗和疾病诊断中不可或缺的技术，可以大大减少时间成本、试剂消耗和人工费用。本文详细介绍了四种灵敏度高、可及性的高通量筛选方法。荧光、DNA、重金属和非金属同位素条形码通常标记抗体、蛋白质和糖类以识别细胞，分别通过流式细胞术、第二代 DNA 测序、质谱流式细胞术和第二离子质谱法进行检测。将二进制信息编码在条形码中、用条形码标记单个细胞、一起进行细胞表征以及通过条形码识别属于单个细胞的结果是高通量筛选的主要步骤。详细介绍了四种数字条形码在体外和体内高通量筛选中的应用，并总结了它们的优缺点。高通量筛选为多学科研究提供了强大的平台，极大地促进了药物研发、疾病诊断、癌症治疗等的进程。关键词：高通量筛选，荧光条形码，DNA条形码，重金属条形码，非金属同位素条形码■引言
硅藻 DNA 条形码的鉴定
硅藻序列的总体多样性比使用显微镜通过物理特征识别的硅藻物种的多样性高出约三分之一。这可能是因为每种物理类型都有多个条形码序列，例如隐藏的多样性或物种内的差异。元条形码非常敏感（Keck 等人，2017 年），甚至可以比使用显微镜的传统方法更好地发现稀有生物。池塘测深仪样本中有十一 (11) 种硅藻非常丰富。对于这些硅藻，条形码序列的确定性很高（表 1），但样本的整体多样性很高，很难将低丰度硅藻物种与其条形码清楚地匹配。
使用DNA条形码的水生生物研究
自成立以来，它是一种雄心勃勃的全球生物识别系统[1]，DNA条形码（使用标准化的基因片段作为物种识别的内部标签）已将自己确立为生物多样性科学中的重要方法，并发表了12,000多篇论文（Web of Science搜索“ DNA” DNA“ DNA”和“ Barodod*6月2021年）。Hebert和合作者的最初建议推荐了动物的线粒体细胞色素C氧化酶I（COI）标记。然而，对于植物和真菌，已经提出了其他更有效的标记物，例如Maturasek（MATK）和核糖二磷酸羧化酶大亚基（RBCL）胆固醇成形剂标记物用于流量的植物[2] [2]。已建议使用几种标记为硅藻的DNA条形码，例如，从5.8S + ITS-2 [3]到RBCL [4]，但对这些分类单元的研究受到限制。对于真菌，它已被广泛接受[5]；但是，它的实施也有几个问题，特别是在某些水生物种中[6]，尽管它很重要，但我们发现了六篇DNA条形码水生真菌的论文。DNA条形码已被反复证明是一种生物多样性测量方法的方法，显示了与传统分类法的高度率，例如，薄荷和鸟类和鸟类[7-10] [7-10]，而其作为生物差异科学的预测工具的能力也很快就变得显而易见，刺激了新的框架框架。在这里，已经观察到了一些引人注目的多样性示例[14，15]，并且在众多水生生态系统中已经描述了类似的趋势。目前，DNA条形码可以加速生物多样性库存，并帮助许多国家 /地区的分类学家数量减少。很早就确认了数据共享和协作研究潜力的重要性，从而创建了生命数据系统的条形码（BOLD）[16]。序列数据可以与详细的标本元数据和照片相关联，支持痕量文件，最重要的是博物馆收藏中的保证标本[16]。
barcodingr：使用DNA条形码
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利用 DNA 条形码识别和分类生物
分类学是一门根据共同特征对生物进行分类的科学，它一直是人类社会的一部分。卡尔·林奈用他的二名法系统正式确立了生物分类，该系统为每个生物分配了一个属名和种名。随着我们监测全球气候变化的生物效应，并在栖息地不断遭到破坏的情况下试图保护物种多样性，识别生物的重要性日益增加。我们对地球上许多独特生态系统中动植物的多样性知之甚少，更不用说微生物了。在估计的 500 万至 5000 万种动植物中，只有不到 200 万种已被识别。科学家们一致认为，每年的灭绝率已从每百万种约一种增加到每百万种 100 至 1,000 种。这意味着每年有数以千计的动植物消失。其中大多数尚未被识别。在生物多样性消失之前对其进行分类的这场竞赛中，传统分类学显得力不从心。必须仔细收集和处理标本，以保存其
使用DNA条形码识别侵入性外星物种
针对政策关注的生物和组织（BOPCO）的条形码设施（BOPCO）提供了一个专业知识论坛，以促进比利时和欧洲识别政策关注的生物学样本。Bopco由比利时科学政策办公室（BELSPO）资助。被引入欧洲的非本地物种，无论是偶然的还是故意的，都可能引起政策关注，因为其中一些可以在新的领土上迅速繁殖和散布，建立可行的人群，甚至是胜过本地物种。由于它们的存在，自然和托管的生态系统可能会受到破坏，庄稼和牲畜影响，并且可能引入媒介传播的疾病或寄生虫，从而影响人类健康和社会经济活动。引起这种不良反应的非本地物种称为侵入性外星物种（IAS）。为了保护本地生物多样性和生态系统，并减轻对人类健康和社会经济活动的潜在影响，欧盟第1143/2014/2014号欧洲议会和理事会解决了IAS问题。IAS法规规定了在所有成员国中采取的一系列措施。定期更新工会关注的侵入性外星物种清单。但是，要实施拟议的动作，遇到可疑的生物材料时需要进行准确的物种识别方法。因为基于形态的物种鉴定并不总是可能的（例如结果将结果显示为使用公开可用的DNA序列数据和从各种来源汇总的信息编制的情况表（一个）。[1]。隐秘的物种，痕量物质，早期生命阶段），本工作的目的是调查和评估DNA序列数据的有用性，以识别欧盟调节中包含的每一个IAS。每个事实表都由两个主要部分组成：（i）对特定IAS的简短介绍，并提供有关其分类法和当前发生/分布在欧洲的信息，（ii）对公开可用的DNA序列的有用性进行调查，以确定该IAS的实用性，以确定DNA barcods在EUU列表中列出的分类级别。有关应用方法背后的推理以及有关材料和方法的详细信息的更多信息，请参见下文和Smitz等。有关Bopco的更多信息，请访问https://bopco.be或通过bopco@naturalsciences.be与我们联系。有关http://ec.europa.eu/environment/nature/invasivealien/index_en.htm的欧盟法规的更多信息。
通过CRISPR获取基于逆转录的遗传条形码
1 Gladstone数据科学与生物技术研究所，美国加利福尼亚州旧金山2号，美国2个神经生物学系，杜克大学医学中心，美国北卡罗来纳州杜克大学医学中心，美国3号遗传学系，哈佛医学院，马萨诸塞州波士顿，美国4 Wyss Institute fiologaligy Institute fiologaligy启发工程，哈佛大学，波斯顿，沃尔斯顿，美国5.美国6美国加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学加利福尼亚大学生物工程和治疗科学系
药品供应链安全法案和二维疫苗条码
《药品供应链安全法案》（DSCSA）于 2013 年 11 月 27 日签署成为法律，旨在通过识别和清除美国药品供应链中的假冒和危险药品/产品来增强 FDA 保护消费者的能力。DSCSA 规定，到 2023 年，美国将拥有一个电子的、可互操作的系统，该系统将能够监控处方药从制造到分发的整个过程。为了实现这一目标，DSCSA 要求制造商以人类可读的形式在他们打算引入供应链的产品的每个包装和箱子上印上产品标识符。此外，产品标识符必须包括国家药品代码、序列号、批号和有效期，这些都编码在二维条形码中。
设计，测序和识别随机DNA条形码
抽象随机DNA条形码是用于跟踪细胞谱系的多功能工具，其应用从发育到癌症到进化。在这里，我们审查并进行了批判性评估条形码设计以及条形码测序和条形码数据的初始处理方法。我们首先演示各种条形码设计决策如何影响数据质量，并提出一种平衡我们当前知道的所有考虑因素的新设计。然后，我们讨论准备条形码测序文库的各种选择，包括内联指数和唯一的分子标识符（UMIS）。最后，我们测试了几种已建立和新的生物信息学管道的表现，以从原始测序读取和误差校正中提取条形码。我们发现，对齐和基于正则表达式的方法都适合条形码提取，并且专门针对条形码数据设计的错误校正管道优于通用数据。总的来说，这项审查将帮助研究人员以故意和系统的方式进行条形码实验。
条形码和射频识别在供应链管理中的优缺点
摘要 摘要 自 20 世纪 80 年代以来，条形码已成为供应链管理 (SCM) 的支柱。最近，政府和企业部门的组织越来越重视进一步简化 SCM 以节省成本。这导致许多领先的组织要求其供应商实施射频识别 (RFID) 技术。许多组织不确定哪种技术（条形码或 RFID）能为他们带来最佳回报。本论文将帮助利益相关者了解 SCM 应用中每种技术的优缺点。此外，该研究将探讨电子产品代码 (EPC) 等 RFID 全球标准的重要性，并深入了解条形码和 RFID 的共存。该研究将采用全面的文档审查以及对每种技术用户的多次采访。