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将果皮水蛙（Pelophylax）的条形码拼图散发出关于两栖动物生物地理学和全球入侵的灯光
fi g u r e 1系统发育关系和pelophax Mitroups在西改变（WP）中的分布。分类名称将在可用时给出（表S1）。地图结合了来自六个基因的条形码信息；阴影区域：大概是本地分布（一些东部范围可能反映了旧的介绍； Kuzmin，1999）；箭头：引入人群的基因分型。插图映射在巴尔干半岛（左上），坎奇特卡半岛（右上角）和亚速尔群岛（左下）。pelophylax ridibundus中的Mitroup分布如图2所述。树显示了对全部和部分有丝分裂组的贝叶斯分析（〜16.8 kb）；有关末端分支，请参见图S1和最大样品分析；节点圆说明分支支持；灰色线（树的底部）表明基于核系统基因组的撒哈拉s b（Doniol-Valcroze等，2021；另见图4）。天然范围是根据GBIF（www。Gbif。Org）和MNHN（https：//inpn。mnhn。fr）的出现数据修改的IUCN红色列表（2023）。
基于 rbc L、mat K 和 ITS 序列对菲律宾 11 种特有万代兰进行 DNA 条形码编码
DNA 条形码因其在植物种类识别、鉴别和分类以及揭示近缘物种间的系统发育关系方面的潜力而备受关注。使用 BLASTn、遗传距离相似性和基于树的方法评估了三种条形码标记（rbc L、mat K 和 ITS）及其组合对菲律宾 11 种特有万代兰的有效性。使用通用引物成功扩增并测序了代表 11 种万代兰的 40 个种质的每个条形码区域。比对序列中可变位点的数量在 ITS 区域最多（30%），其次是组合区域（3%）、mat K（2%）和 rbc L（2%）。BLASTn 结果显示，基于 NCBI 数据库中可用的 rbc L、mat K 和 ITS 序列，大多数样本都被正确识别到属的水平。在 NCBI 数据库中，仅两个物种（Vanda sanderiana 和 Vanda luzonica）根据 mat K 和 ITS 序列在物种水平上被正确识别。从三个区域的组合计算出的遗传距离范围为 0.0000–0.01528。Vanda aurantiaca 和 Vanda lamellata var remediosa 之间的遗传距离最大（0.01528），这表明它们之间的遗传相似性较低。使用最大简约法和 1000 次引导重复测试为每个基因序列构建系统发育树。在从 rbc L、mat K 和 ITS 区域序列生成的系统发育树中，从 ITS 序列生成的系统发育树根据其当前基于形态学的分区分类完全区分了 11 个 Vanda 物种。基于这三个区域的组合序列构建的系统发育树与基于 ITS 区域构建的系统发育树相似，只是 MP 分析对聚类的支持更强。MP 树中呈现的分子数据支持 Vanda 的现有形态部分。单条形码 ITS 是菲律宾 Vanda 物种的合适条形码。因此，ITS 应与植物核心条形码、rbc L 和 mat K 结合使用，以区分和分类菲律宾特有的 Vanda 物种。本研究提供了菲律宾 Vanda 物种的条形码数据库，可能对保护兰科中这一宝贵属做出重大贡献。
使用非侵入性粪便DNA样品对麻风病的DNA微型 - 巴甲构造及其监测入侵物种的重要性
Adams，J。R.，Goldberg，C。S.，Bosworth，W。R.，Rachlow，J。L.，＆Waits，L。P.（2011）。 从粪便颗粒DNA的侏儒兔（Brachylagus idahoensis）的快速物种鉴定。 分子生态资源，11（5），808–812。 https：//doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03020.x Auricchio，P。，＆Olmos，F。（1999）。 欧洲野兔Lepus Europaeus Pallas 1778（Lagomorpha-Leporidae）的北向范围扩展。 publicaçõesactulsas do Brasil Instituto Pau Brasil，2，1-5。 Bellard，C。，Cassey，P。和Blackburn，T。M.（2016）。 外星物种是最近灭绝的驱动力。 生物学来信，12（2），20150623。https：// doi。 org/10.1098/rsbl.2015.0623 Benson，D.A.，Clark，K. GenBank。 核酸研究，41（D1），D36– D42。 https：//doi.org/10.1093/nar/gkt1030 Berry，O.，Sarre，S。D.，Farrington，L。，＆Aitken，N。（2007）。 粪便DNA检测入侵物种：塔斯马尼亚州的野狐。 野生动植物研究，34（1），1-7。 https：//doi.org/10.1071/wr06082 Blackwell，G。L.（2005）。 另一个世界：新西兰引入的哺乳动物动物区系的构成和结构。 澳大利亚动物学杂志，33（1），108-118。 https：//doi.org/10.7882/ az.2005.008 Bonino，N.，Cossíos，D。，＆Menegheti，J. （2010）。 欧洲野兔，南美洲的Lepus Europaeus散布。 Folia Zoologica，59（1），9-15。 Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。 保护遗传学，8，249–260。Adams，J。R.，Goldberg，C。S.，Bosworth，W。R.，Rachlow，J。L.，＆Waits，L。P.（2011）。从粪便颗粒DNA的侏儒兔（Brachylagus idahoensis）的快速物种鉴定。分子生态资源，11（5），808–812。https：//doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03020.x Auricchio，P。，＆Olmos，F。（1999）。欧洲野兔Lepus Europaeus Pallas 1778（Lagomorpha-Leporidae）的北向范围扩展。publicaçõesactulsas do Brasil Instituto Pau Brasil，2，1-5。Bellard，C。，Cassey，P。和Blackburn，T。M.（2016）。 外星物种是最近灭绝的驱动力。 生物学来信，12（2），20150623。https：// doi。 org/10.1098/rsbl.2015.0623 Benson，D.A.，Clark，K. GenBank。 核酸研究，41（D1），D36– D42。 https：//doi.org/10.1093/nar/gkt1030 Berry，O.，Sarre，S。D.，Farrington，L。，＆Aitken，N。（2007）。 粪便DNA检测入侵物种：塔斯马尼亚州的野狐。 野生动植物研究，34（1），1-7。 https：//doi.org/10.1071/wr06082 Blackwell，G。L.（2005）。 另一个世界：新西兰引入的哺乳动物动物区系的构成和结构。 澳大利亚动物学杂志，33（1），108-118。 https：//doi.org/10.7882/ az.2005.008 Bonino，N.，Cossíos，D。，＆Menegheti，J. （2010）。 欧洲野兔，南美洲的Lepus Europaeus散布。 Folia Zoologica，59（1），9-15。 Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。 保护遗传学，8，249–260。Bellard，C。，Cassey，P。和Blackburn，T。M.（2016）。外星物种是最近灭绝的驱动力。生物学来信，12（2），20150623。https：// doi。org/10.1098/rsbl.2015.0623 Benson，D.A.，Clark，K.GenBank。核酸研究，41（D1），D36– D42。https：//doi.org/10.1093/nar/gkt1030 Berry，O.，Sarre，S。D.，Farrington，L。，＆Aitken，N。（2007）。粪便DNA检测入侵物种：塔斯马尼亚州的野狐。野生动植物研究，34（1），1-7。https：//doi.org/10.1071/wr06082 Blackwell，G。L.（2005）。另一个世界：新西兰引入的哺乳动物动物区系的构成和结构。澳大利亚动物学杂志，33（1），108-118。https：//doi.org/10.7882/ az.2005.008 Bonino，N.，Cossíos，D。，＆Menegheti，J.（2010）。欧洲野兔，南美洲的Lepus Europaeus散布。Folia Zoologica，59（1），9-15。 Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。 保护遗传学，8，249–260。Folia Zoologica，59（1），9-15。Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。保护遗传学，8，249–260。非侵入性人口范围：样本源，饮食，碎片长度和微卫星基序对扩增成功和基因分型错误率的影响。https：//doi.org/10.1007/ S10592-006-9146-5 Chaves，P.B.，Graeff，V.G.，Lion，M.B.，Oliveira，L.R。，＆Eizirik，E.（2012）。DNA条形码符合分子粪便学：用于食肉动物非属性样品的标准化物种分配的短mtDNA术。分子生态资源，12（1），18-35。https：// doi。org/10.1111/j.1755-0998.2011.03056.x Clout，M.N。，＆Russell，J.C。（2008）。哺乳动物的入侵生态：一种全球视角。欧洲野生动物研究杂志，35（3），180-184。https：//doi.org/10.1071/wr07091 Cuervo，P。F.，Di Cataldo，S.，Fantozzi，M。C.肝氟（fasciola hepatica）自然感染了北巴塔哥尼亚北部引入了欧洲棕色野兔（Lepus Euro-Paeus）：表型，患病率和潜在风险。Acta Parasitologica，60（3），536–543。https：//doi.org/10.1515/ AP-2015-0076 Da Rosa，C.A.，de Almeida Curi，N.H.巴西的外星陆地哺乳动物：当前状态和管理。生物学入侵，19（7），2101–2123。https：//doi.org/10.1007/ S10530-017-1423-3 Davison，A.，Birks，J.D.，Brookes，R.C.，Braithwaite，T.C。关于粪便的起源：用于测量其少量食肉动物的形态学与分子方法。动物学杂志，257（2），141–143。哺乳动物，80（5），497–505。https：//doi.org/10.1017/s0952 83690 2000730 de Faria，G。M. M.欧洲野兔（Lepus Europaeus）在巴西的地理分布以及塞拉多和大西洋森林生物群落的新记录。de Sousa E SilvaJúnior，J.，Oliveira，J。A.，Dias，P。A.和Gomes de Oliveira，T。（2005）。更新巴西亚马逊的Tapiti（Sylvilagus Brasiliensis：Lagomorpha，Leporidae）的地理分布和栖息地。哺乳动物，69，245–250。DeMay，S.M.，Becker，P.A.，Eidson，C.A.，Rachlow，J.L.，Johnson，T.R。，＆Waits，L.P。（2013年）。 评估濒危侏儒兔的粪便中的DNA降解速率。 分子生态资源，13（4），654–662。 https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12104DeMay，S.M.，Becker，P.A.，Eidson，C.A.，Rachlow，J.L.，Johnson，T.R。，＆Waits，L.P。（2013年）。评估濒危侏儒兔的粪便中的DNA降解速率。分子生态资源，13（4），654–662。https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12104
通过在史密森尼国家自然历史博物馆收集陆地节肢动物来增强DNA条形码参考库黑暗分类墙中的另一个裂缝：富含物种和普通的eurytomidae（膜翅目，chalcidoidea）的定制DNA条形码方案
DNA条形码是加速物种鉴定和补充物种划界的绝佳工具。此外，DNA条形码参考文献是生物多样性监测，保护或生态学中任何元法编码研究的决定性主链特征。但是，在某些分类单元中，DNA条形码不能以令人满意的成功率产生，因此这些群体将在任何基于条形码的物种清单中都在很大程度上缺少。在这里，我们为eurytomidae（膜翅目，沙尔西多德亚）提供了定制的DNA条形码向前底漆，将高质量DNA条形码的成功率从33％提高到88％。eurytomidae是一种严重研究的，分类学上具有挑战性的，物种丰富的群，主要是寄生的黄蜂。较高的物种数量，多样化的生态作用以及广泛和共同存在确定Eurytomidae是陆地生态系统中众多关键家庭之一。现在可以在研究和监测陆地动物区系时包括eurytomidae，强调基于条形码的方法将需要定期使用不同的引物来避免其数据和推论中的偏见。新的DNA条形码方案也是我们对小组的综合分类研究的先决条件，旨在划界和表征Central
使用 nrITS 和叶绿体 rbcL 基因序列对印度叶下珠进行 DNA 条形码编码和系统发育分析，以进行分子鉴定
叶下珠属植物因其生态和治疗意义而闻名。准确识别这些物种对于保护和研究目的至关重要。由于植物的表型可塑性以及在检测植物产品中的替代品或掺假物方面存在挑战，传统的分类学鉴定往往不够完善。因此，通过 DNA 条形码进行分子鉴定已成为草药产品质量控制和国际草药贸易的新标准。本研究使用 DNA 条形码工具来识别印度叶下珠属物种，重点关注 nr 内部转录间隔区 2 (ITS2) 和叶绿体 rbcL 基因。系统发育分析显示高度的遗传相似性和很强的系统发育关系。这些发现证实了与全球同类的遗传亲缘关系，突出了进化模式。ITS2 区域的结构使用最小自由能计算来验证物种鉴定。这项研究展示了如何将 rbcL 基因分析与基于 ITS2 的 DNA 条形码相结合来准确识别印度叶下珠属物种，这种方法增强了这些宝贵植物资源的可持续利用，确保了产品质量，最大限度地减少了掺假，并支持生物多样性保护。
不完整的谱系分类解释了在四种西欧蚱hoppers（Orthoptera：acrididae：chorthippus）的辐射中DNA条形码低的性能
Benoit Nabholz。不完整的谱系分类解释了四种西欧蚱hoppers的辐射中DNA条形码的低性能（Orthoptera：Acrididae：Chorthippus）。林尼社会生物学杂志，2023年，10.1093/biolinnean/blad106。hal-04192161
DNA条形码揭示了心脏脑头sp的发生。 （Digenea：strigeidae）感染大毛骨曲局碳（L. 1758）
抽象的cormorant（Pelecaniformes）在全球范围内广泛分布，是内陆水域和海洋环境中的沿海鸟类，并且与某些水生寄生虫的传播有关。因此，本工作的目的是研究心脏脑头核苷（Digenea：Strigeidae）的发生和形态变化，这是伟大的cormorant phalacrocorax carbo的寄生虫。从维多利亚湖从Mwanza Gulf收集的大cormorant的肠道中获得了用于分子分析（DNA条形码（COX 1）区域）的心脏脑标本（COX 1）区域。心脏脑头像标本的形态检查表明，属于心脏脑脑属的四个形态摩托克可能存在。然而，对COX 1序列，系统发育和单倍型的分析表明，所有四个形态摩托物都属于心脏脑脑的单个未知物种。本文提供了有关较棒的毛叠曲局碳纤维碳纤维的第一份报告，该报告是淡水系统中心脏脑的确定宿主。调查结果还表明，非洲心脏脑的多样性比以前报道的要高。此外，它强调了在坦桑尼亚进行更多研究的必要性，以泄露蜗牛和与水生环境中鸟类和其他脊椎动物的生命周期有关的蜗牛物种。关键字：digenean trematodes;斯特里吉德; Phalacrocorax Carbo;心脑头；考克斯1。简介
超越粗体：使用DNA条形码来识别加拿大艾伯塔省南部的普鲁士鲤鱼（Carassius Gibelio Bloch，1782年）
Carassius Gibelio（普鲁士鲤鱼）是加拿大新鲜水域的最新入侵者，有报道称其在艾伯塔省和萨斯喀彻温省。与引入的Auratus（金鱼）和推出的（但可能被误认为）C。Carassius（Crucian Carp）的形态相似性使得在没有仔细检查的情况下很难区分这些物种。线粒体细胞色素C氧化酶I（COI）基因的DNA条形码是一种潜在的工具，可以识别Carassius个体，但公开序列的不正确注释可能会混淆物种鉴定的尝试。在这里，我们使用形态和DNA条形码来识别从艾伯塔省的两个地点收集的假定的C. gibelio标本，这些标本构成了该省的新记录。在形态上，标本与C. gibelio一致，但在C. gibelio和C. auratus的范围内。从遗传上讲，我们的样品无法鉴定为物种水平，与多种卡拉西修斯物种相匹配。单倍型网络与统计分析一致，支持艾伯塔鲤鱼为C. gibelio的识别。此外，艾伯塔省的单倍型与海鲜贸易报道的一条鱼有分享，这可能是进入艾伯塔省的可能来源。因此，尽管大胆的算法表明COI基因不是对Carassius物种物种水平鉴定的有力候选者，但单倍型网络方法和对单倍型之间可变性的统计检查可以用于对物种认同做出合理的推论。由于其在加拿大的生态影响预计，对卡拉西乌斯物种的早期发现和管理至关重要； DNA条形码是物种识别的重要工具，尤其是当标本在预期的多种物种的表型范围内时。
通过DNA条形码Beivy J. Kolondam
摘要。DNA条形码已用于识别鱼类，尤其是用于认证渔业产品。在加工金枪鱼产品的身份验证过程中，DNA条形码的准确性和该过程所需的少量组织样品需要进行DNA条形码。作为标准基因标记，COI基因在区分几种鱼类中存在缺点。这项研究旨在检查DNA条形码测定金枪鱼物种的线粒体NADH脱氢酶2（ND2）基因标记物的能力。在13种金枪鱼组（蓝鳍金枪鱼，黄鳍金枪鱼和其他金枪鱼组）中，ND2基因的1,042 bp基因内的变异表现出比标记基因更好的性能（COI基因，CyB基因和16S rRNA基因），用于DNA条形码。有296个观察到的种间变异点，其中49点能够区分Thunnus属的成员和其他金枪鱼属。没有所有比较物种的相同序列。最终结果提供了通过DNA条形码和实际方法发展ND2基因物种鉴定金枪鱼的前景（例如pcr-rflp）用于金枪鱼产品的身份验证。关键词：蓝鳍金枪鱼，DNA条形码，ND2基因，金枪鱼，黄鳍金枪鱼。简介。DNA条形码的使用在鱼类和渔业的身份验证中表现出重要作用（Rasmussen＆Morrissey 2008）。许多加工的鱼类产品都标有与所使用的鱼成分不匹配的标签（Xiong et al 2019）。通常，形态学特征用于识别多种金枪鱼，但这需要高技能的人力资源。如今，这种方法很难用于识别已经以菲力和鱼类罐头鱼类形式的产品（Bottero等，2007）。另一方面，消费者有权被告知购买的原始和加工金枪鱼所购买的商品的身份，因此继续进行适当的识别方法很重要（Aranishi等人，2005年）。使用DNA条形码技术的前景为精确物种识别打开了机会，即使仅来自少数组织标本（Dudu等，2016年）。专门针对金枪鱼，仍然使用了来自线粒体DNA的几个基因的测序，因为它可以可靠地区分这些鱼类（Wulansari et al，2015）。
摄影清单，DNA条形码以及来自Faafu Atoll的新型海sl和蜗牛的新物种，马尔代夫（Astropoda：heterobranchia和vetigastropoda）2279
摘要：基线生物多样性数据是生态和进化研究的关键，并且与印度洋的马尔代夫群岛等地区特别相关，印度洋可以充当分布广泛的海洋物种的垫脚石。我们通过浮潜和水肺潜水调查了Faafu和Malé环礁的岛屿和礁石，收集了两个腹足类亚类，Heterobranchia和Vetigastropoda。我们的库存包括104种活着拍摄的物种，以创建标识指南。我们还为大多数物种提供COI条形码，并为马尔代夫Malacofauna添加了新的序列数据。我们一半的物种代表了马尔代夫的新记录，强调要发现多少多样性。物种分布反映生态稀有性，仅在一个地点发现了近60％的分类单元。我们还根据文献记录编制了马尔代夫的异源和vetigastropods的全面清单，导致了320种，这些物种与条形码数据一起表明了印度 - 普基菌中的几种潜在的隐性物种。描述了六种新物种，裸叶兰德拉·埃文尼（Limenandra evanescenti n）。sp。，Eubranchus putnami n。sp。，Sakuraeolis Marhe n。sp。，Moridilla Maldivensis n。sp。，tergiposacacca perspicua n。sp。和sacoglossan costasiella fridae n。 sp。