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节能预处理会影响上层sargassum组成和DNA metabarcoding揭示了与甲烷产量有关的微生物群落
sargassum spp。淹没了加勒比海的海岸线，造成了当地经济和环境的破坏。厌氧消化（AD）被认为是将大量藻类转向宝贵资源的有吸引力的选择。sargassum spp。具有复杂的组成，会影响AD中涉及的微生物组成，从而产生低甲烷产量。这项研究旨在使用不同的节能预处理，并鉴定与甲烷生产相关的微生物群落，以提高上层sargassum的甲烷产量。我们对藻类生物量进行了不同的节能预处理，并使用生物甲烷电位（BMP）测试评估了甲烷产量。通过高吞吐量测序分析了与表现最佳和最差的甲烷作原系统相关的微生物群落。结果表明，预处理修改了与BMP具有很强的正相关性的Inorganic化合物，纤维和C：N比的含量。洗水预处理导致最佳甲烷产量，增加了38％。DNA元法编码分析表明，细菌属属属属属，dmer64，treponema和wirogenispora，以及古老的甲植物学，rumen_m2，rumen_m2，rumen_m2，bathyarchaeia和bathyaNAnaChaeia和hathananaMassieliicocus，并以高hide基屈服。这项研究是第一个证明Sargassum spp AD涉及的微生物群落结构的研究。这项研究中预处理可以帮助克服与甲烷产量相关的局限性。
通过DNA条形码Beivy J. Kolondam
摘要。DNA条形码已用于识别鱼类，尤其是用于认证渔业产品。在加工金枪鱼产品的身份验证过程中，DNA条形码的准确性和该过程所需的少量组织样品需要进行DNA条形码。作为标准基因标记，COI基因在区分几种鱼类中存在缺点。这项研究旨在检查DNA条形码测定金枪鱼物种的线粒体NADH脱氢酶2（ND2）基因标记物的能力。在13种金枪鱼组（蓝鳍金枪鱼，黄鳍金枪鱼和其他金枪鱼组）中，ND2基因的1,042 bp基因内的变异表现出比标记基因更好的性能（COI基因，CyB基因和16S rRNA基因），用于DNA条形码。有296个观察到的种间变异点，其中49点能够区分Thunnus属的成员和其他金枪鱼属。没有所有比较物种的相同序列。最终结果提供了通过DNA条形码和实际方法发展ND2基因物种鉴定金枪鱼的前景（例如pcr-rflp）用于金枪鱼产品的身份验证。关键词：蓝鳍金枪鱼，DNA条形码，ND2基因，金枪鱼，黄鳍金枪鱼。简介。DNA条形码的使用在鱼类和渔业的身份验证中表现出重要作用（Rasmussen＆Morrissey 2008）。许多加工的鱼类产品都标有与所使用的鱼成分不匹配的标签（Xiong et al 2019）。通常，形态学特征用于识别多种金枪鱼，但这需要高技能的人力资源。如今，这种方法很难用于识别已经以菲力和鱼类罐头鱼类形式的产品（Bottero等，2007）。另一方面，消费者有权被告知购买的原始和加工金枪鱼所购买的商品的身份，因此继续进行适当的识别方法很重要（Aranishi等人，2005年）。使用DNA条形码技术的前景为精确物种识别打开了机会，即使仅来自少数组织标本（Dudu等，2016年）。专门针对金枪鱼，仍然使用了来自线粒体DNA的几个基因的测序，因为它可以可靠地区分这些鱼类（Wulansari et al，2015）。
模拟群落的 DNA 条形码突显了评估新热带鱼类多样性时的潜在偏差
图 1 研究框架 (a) 和所分析模拟群落的描述，包括不同物种组成和 DNA 输入、评估的标记和用于生物多样性评估的代理 (b)。所有模拟群落均使用来自圣弗朗西斯科河流域 (SFRB) 和热基蒂尼奥尼亚河流域 (JQRB) 的物种构建。 (1) 标准化圣弗朗西斯科河模拟群落 (SFmc) 包含来自 SFRB 的 23 个物种，具有相同的 DNA 浓度 (10 ng/ μ L) 和 (2) 使用不同 DNA 浓度偏斜的 SFmc。 (3) 圣弗朗西斯科和热基蒂尼奥尼亚河组合模拟群落 (SFJQmc) 使用来自标准化热基蒂尼奥尼亚河模拟群落 (JQmc) JQmc 和 SFmc 的 38 个独特物种构建。 (4) 标准化热基蒂尼奥尼亚河模拟群落 (JQmc) 由来自 JQRB 的 23 个物种组成，使用相同浓度的 DNA 构建。 （5）JQmc skewed：由来自 JQRB 的 23 个物种组成的模拟群落，采用 DNA 浓度倾斜构建。
印度尼西亚的黑蝇（Diptera：simuliidae）的DNA条形码
©作者2023。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
DNA元法估计的丰度估计 微生物中的作用在动物入侵中：范围评论 一个具有零排放的新过程，用于真正的生物降解... 一个具有零排放的新过程，用于真正的生物降解... 评估环境DNA的五个引物对...
作者格式，未经同行评审的文件发布于2023年7月7日。doi：https：//doi.org/10.3897/arphapreprints.e109709
的创新方法，以准确评估基于杀害的疗法对抗文化遗产纪念碑的生物临时性的有效性
1-维维戈大学，生物学教师，实验科学爱德华州，B块，工厂2，实验室39（GEA Group），E -36310，西班牙Vigo，西班牙2 -CIBIO，INBIO实验室，InbioVairão葡萄牙4-加利福尼亚州伯克利分校的环境科学，政策和管理系，美国加利福尼亚州94720，5-加利福尼亚大学伯克利分校脊椎动物动物学博物馆，美国66720- 1100意大利VITERBO，8-保加利亚科学学院生物多样性与生态系统研究所圭尔夫大学，圭尔夫大学，安大略省，N1G，N1G，N1G，N1G，N1G，N1G 1，加拿大11-生物多样性和进化生物学系，国家天然科学博物馆（MNCN -CSIC），C/JoséGutiérrezAbascal，2，28006006 MADRID，SPAIN *cottreting，电子邮件：guillermo.velo@uvigo.es; inigomsolano@mnnn.csic.es orcid ID：velo-antón：0000-0002-9483-5695;钱伯斯：0000-0002-7369-0108; Poyarkov Jr。：0000-0002-7576-2283; Canestrelli：0000-0001-9351-4972; Bisconti：0000-0002-0600-7436; Naumov：0000-0003-2146-208X; Benéitez：0000-0003-3797-4805; Borisenko：0000-0002-3061-3057; Martínez-Solano：0000-0002-2260-226X
一项3年浮游生物DNA Metabarcoding调查揭示了澳大利亚沿海水域的海洋生物多样性模式
fi g u r e 4通过大量浮游物样品的DNA分析检测到的浮游组合中的空间模式。从16S通用（a）和软体动物（b）测定的非金属多维缩放图显示了采样位点和摩ri座北部和南部的OTU组合（分别为k = 0.11＆0.10）之间的OTU组合，均分别为k = 3＆p≤.001）。样品与抽样时的平均海面温度的关系由温度梯度指示。簇表示每个位置的样品，彩色线的连接表示每个位置的质心。
印度尼西亚林博托湖芒格拜鱼 (Glossogobius aureus) 的 DNA 条形码、系统发育树和遗传距离
摘要 .芒格拜鱼（Glossogobius aureus）是林博托湖的一种具有经济价值的本地鱼类。随着湖泊生态系统的破坏，当地鱼类面临的压力也越来越大。芒格拜鱼种群的减少说明了这一点。总体而言，当地社区将芒格拜鱼视为特有鱼类。芒格拜鱼的保护工作需要从 DNA 角度进行分析。本研究旨在探索芒格拜鱼物种的身份，分析遗传距离并构建系统发育树。从林博托湖采集鱼样并运送到哥伦打洛州立大学渔业与海洋科学学院的实验室进行形态学和计数分析。对组织取样用 PCR 进行 DNA 条形码分析。DNA 测序基于 PCR。分析表明，从林博托湖采集的所有芒格拜鱼样本都属于同一个物种，即 G. aureus。 DNA 条形码结果得到了与参考序列 99-100% 的相似性测试、单个 manggabai 样本的系统发育树序列以及显示亲缘关系的单个参考鱼序列的支持。关键词：DNA 条形码、鱼类物种身份、林博托湖、相似性指数。简介。林博托湖是位于印度尼西亚哥伦打洛省的生态系统资源，覆盖哥伦打洛县和哥伦打洛市地区。从地理上看，林博托湖位于低地，周围环绕着石灰岩山丘，有 23 条支流作为入口，1 条支流作为出口。林博托湖对该地区至关重要，因为它具有多种生态、社会和经济功能。因此，政府已将林博托湖列为国家战略区。
通过在史密森尼国家自然历史博物馆收集陆地节肢动物来增强DNA条形码参考库黑暗分类墙中的另一个裂缝：富含物种和普通的eurytomidae（膜翅目，chalcidoidea）的定制DNA条形码方案
DNA条形码是加速物种鉴定和补充物种划界的绝佳工具。此外，DNA条形码参考文献是生物多样性监测，保护或生态学中任何元法编码研究的决定性主链特征。但是，在某些分类单元中，DNA条形码不能以令人满意的成功率产生，因此这些群体将在任何基于条形码的物种清单中都在很大程度上缺少。在这里，我们为eurytomidae（膜翅目，沙尔西多德亚）提供了定制的DNA条形码向前底漆，将高质量DNA条形码的成功率从33％提高到88％。eurytomidae是一种严重研究的，分类学上具有挑战性的，物种丰富的群，主要是寄生的黄蜂。较高的物种数量，多样化的生态作用以及广泛和共同存在确定Eurytomidae是陆地生态系统中众多关键家庭之一。现在可以在研究和监测陆地动物区系时包括eurytomidae，强调基于条形码的方法将需要定期使用不同的引物来避免其数据和推论中的偏见。新的DNA条形码方案也是我们对小组的综合分类研究的先决条件，旨在划界和表征Central
非洲商业木材品种的遗传特征：从基因组学到条形码
在过去的几十年里，非法砍伐对热带非洲森林生态系统的完整性和生物多样性保护构成了严重威胁。尽管已经实施了减少非法砍伐的国际条约和监管计划，但大部分木材都是从热带非洲森林地区非法砍伐和交易的。因此，开发和应用分析工具来提高木材和相关产品的可追溯性和识别性对于执行国际法规至关重要。在现有技术中，DNA 条形码是一种很有前途的植物物种分子鉴定方法。然而，虽然它已成功用于区分动物物种，但还没有一套可用于普遍识别植物物种的遗传标记。在这项工作中，我们首先使用基因组略读方法表征了 17 种非洲高价值木材物种的遗传多样性，这些物种来自五个属（Afzelia、Guibourtia、Leplea、Milicia、Tieghemella），分布在西非和中非的范围内，以便重建它们的叶绿体基因组和核糖体 DNA。接下来，我们确定了单核苷酸多态性 (SNP)，以区分近亲物种。通过这种方式，我们成功开发并测试了用于物种识别的新型物种特异性遗传条形码。