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土壤环境DNA的元编码估计全球植物多样性
瑞典乌普萨拉学会，纳比亚大学纳米比亚大学4个学院4学院，7058），墨西哥，墨西哥大学汽车大学，11个iLlow椅子。爱沙尼亚大学14号的爱沙尼亚，爱沙尼亚塔尔图17号
使用Edna metabarcoding建立河流恢复后淡水鱼组成的靶标
需要为鱼类社区组成建立现实的目标来评估河流修复项目的有效性。，我们使用了与米里什底漆的环境DNA（EDNA）元法编码，以获取估计位于日本Ehime ehime Prefecture的Shigenobu River System的上游，下游和恢复缓解项目区域（Kaihotsu - Kasumi）的17个地点（Kaihotsu - Kasumi）的估计。我们评估了使用Edna快速，敏感和广泛收集数据的好处，以在恢复区建立现有的鱼类群落组成，以及物种组合的潜在的短期，中期和长期目标，这些物种组合可能在分散到来自上游和下游群体的项目区域后现实地出现。我们将Edna Metabarcodod的结果与从同时捕获调查和历史信息获得的物种列表进行了比较。从埃德纳（Edna Surveys）获得的社区组成的非衡量多维标度图显示，Kaihotsu - Kasumi恢复区和周围的河流及其河流分为三个簇：上游，中层和下游及河口和河口。Kaihotsu - Kasumi恢复区位点包含在恢复区附近的流入和流出河流的中间和下到达的组中。我们在这一组中检测到了总共26种，二十一种本地物种和五个非本地物种。因此，这些本地物种被认为是短期目标物种，其散布到Kaihotsu - Kasumi恢复区域。相比之下，基于捕获调查和历史文献，只有14种被选为目标物种。增加了我们埃德纳调查的分辨率的一个因素是我们确定存在a anguillicaudatus（进化枝A和B）的种内谱系的能力，这些谱系被捕获调查遗漏了。这些结果表明，与捕获调查相比，EDNA Metabarcoding方法可以提供更全面和现实的短期目标物种估计，并通过种内谱系检测提供更高的分辨率监测。
在评估北冰洋微真核生物的多样性及其对环境变量的响应方面，RNA 优于基于 DNA 的宏条形码
北冰洋（AO）环境恶劣，温度低、冰盖大、海冰周期性冻结和融化，为微生物提供了多样化的栖息地。前期研究主要基于环境DNA对北冰洋上层水体或海冰中的微真核生物群落进行研究，而对北冰洋多样化环境中活跃微真核生物的组成成分则知之甚少。本研究通过对共提取的DNA和RNA进行高通量测序，对北冰洋从雪冰到1670 m深度海水范围内的微真核生物群落进行了垂直评估。与DNA提取物相比，RNA提取物能更准确地描述微真核生物群落结构和类群间相关性，对环境条件的反应也更为敏感。使用RNA：DNA比率作为主要分类群相对活性的代表，确定了主要微真核生物群落沿深度方向的代谢活性。共现网络分析表明，深海中的 Syndiniales 和甲藻/纤毛虫之间的寄生关系可能很重要。这项研究增加了我们对活跃微真核生物群落多样性的认识，并强调了使用基于 RNA 的测序而非基于 DNA 的测序来研究微真核生物群落与微真核生物对 AO 环境变量的反应之间的关系的重要性。
环境DNA（EDNA）在东南亚红树林恢复中的前景和挑战
1诺丁汉大学马来西亚大学环境和地理科学学院海洋生物学的高级研究，印度波托纳诺沃海洋科学学院，马来西亚马来西亚科学学院4个生物科学学院，马来西亚科学院4个生物科学研究所Sumatera utara，梅德岛，印度尼西亚，6大学渔业与水产养殖研究所，塞里克·安塔（Cheikh Anta Dip），达卡（Dakar），塞内加尔（Dept），第7部。渔业生物学和遗传学，渔业学院，水产养殖与海洋科学，Sher-e-e-bangla农业大学，达卡，孟加拉国，孟加拉国8伊奥莫特站，8伊奥米特站，瑞哈拉大学，Uehara，UEHARA，UEHARA，UEHARA，UEHARA，UEHARA，UEHARA，UEHARA Taketomi，Yayama，冲绳，日本，
使用非侵入性粪便DNA样品对麻风病的DNA微型 - 巴甲构造及其监测入侵物种的重要性
Adams，J。R.，Goldberg，C。S.，Bosworth，W。R.，Rachlow，J。L.，＆Waits，L。P.（2011）。 从粪便颗粒DNA的侏儒兔（Brachylagus idahoensis）的快速物种鉴定。 分子生态资源，11（5），808–812。 https：//doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03020.x Auricchio，P。，＆Olmos，F。（1999）。 欧洲野兔Lepus Europaeus Pallas 1778（Lagomorpha-Leporidae）的北向范围扩展。 publicaçõesactulsas do Brasil Instituto Pau Brasil，2，1-5。 Bellard，C。，Cassey，P。和Blackburn，T。M.（2016）。 外星物种是最近灭绝的驱动力。 生物学来信，12（2），20150623。https：// doi。 org/10.1098/rsbl.2015.0623 Benson，D.A.，Clark，K. GenBank。 核酸研究，41（D1），D36– D42。 https：//doi.org/10.1093/nar/gkt1030 Berry，O.，Sarre，S。D.，Farrington，L。，＆Aitken，N。（2007）。 粪便DNA检测入侵物种：塔斯马尼亚州的野狐。 野生动植物研究，34（1），1-7。 https：//doi.org/10.1071/wr06082 Blackwell，G。L.（2005）。 另一个世界：新西兰引入的哺乳动物动物区系的构成和结构。 澳大利亚动物学杂志，33（1），108-118。 https：//doi.org/10.7882/ az.2005.008 Bonino，N.，Cossíos，D。，＆Menegheti，J. （2010）。 欧洲野兔，南美洲的Lepus Europaeus散布。 Folia Zoologica，59（1），9-15。 Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。 保护遗传学，8，249–260。Adams，J。R.，Goldberg，C。S.，Bosworth，W。R.，Rachlow，J。L.，＆Waits，L。P.（2011）。从粪便颗粒DNA的侏儒兔（Brachylagus idahoensis）的快速物种鉴定。分子生态资源，11（5），808–812。https：//doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03020.x Auricchio，P。，＆Olmos，F。（1999）。欧洲野兔Lepus Europaeus Pallas 1778（Lagomorpha-Leporidae）的北向范围扩展。publicaçõesactulsas do Brasil Instituto Pau Brasil，2，1-5。Bellard，C。，Cassey，P。和Blackburn，T。M.（2016）。 外星物种是最近灭绝的驱动力。 生物学来信，12（2），20150623。https：// doi。 org/10.1098/rsbl.2015.0623 Benson，D.A.，Clark，K. GenBank。 核酸研究，41（D1），D36– D42。 https：//doi.org/10.1093/nar/gkt1030 Berry，O.，Sarre，S。D.，Farrington，L。，＆Aitken，N。（2007）。 粪便DNA检测入侵物种：塔斯马尼亚州的野狐。 野生动植物研究，34（1），1-7。 https：//doi.org/10.1071/wr06082 Blackwell，G。L.（2005）。 另一个世界：新西兰引入的哺乳动物动物区系的构成和结构。 澳大利亚动物学杂志，33（1），108-118。 https：//doi.org/10.7882/ az.2005.008 Bonino，N.，Cossíos，D。，＆Menegheti，J. （2010）。 欧洲野兔，南美洲的Lepus Europaeus散布。 Folia Zoologica，59（1），9-15。 Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。 保护遗传学，8，249–260。Bellard，C。，Cassey，P。和Blackburn，T。M.（2016）。外星物种是最近灭绝的驱动力。生物学来信，12（2），20150623。https：// doi。org/10.1098/rsbl.2015.0623 Benson，D.A.，Clark，K.GenBank。核酸研究，41（D1），D36– D42。https：//doi.org/10.1093/nar/gkt1030 Berry，O.，Sarre，S。D.，Farrington，L。，＆Aitken，N。（2007）。粪便DNA检测入侵物种：塔斯马尼亚州的野狐。野生动植物研究，34（1），1-7。https：//doi.org/10.1071/wr06082 Blackwell，G。L.（2005）。另一个世界：新西兰引入的哺乳动物动物区系的构成和结构。澳大利亚动物学杂志，33（1），108-118。https：//doi.org/10.7882/ az.2005.008 Bonino，N.，Cossíos，D。，＆Menegheti，J.（2010）。欧洲野兔，南美洲的Lepus Europaeus散布。Folia Zoologica，59（1），9-15。 Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。 保护遗传学，8，249–260。Folia Zoologica，59（1），9-15。Broquet，T.，Ménard，N。，＆Petit，E。（2007）。保护遗传学，8，249–260。非侵入性人口范围：样本源，饮食，碎片长度和微卫星基序对扩增成功和基因分型错误率的影响。https：//doi.org/10.1007/ S10592-006-9146-5 Chaves，P.B.，Graeff，V.G.，Lion，M.B.，Oliveira，L.R。，＆Eizirik，E.（2012）。DNA条形码符合分子粪便学：用于食肉动物非属性样品的标准化物种分配的短mtDNA术。分子生态资源，12（1），18-35。https：// doi。org/10.1111/j.1755-0998.2011.03056.x Clout，M.N。，＆Russell，J.C。（2008）。哺乳动物的入侵生态：一种全球视角。欧洲野生动物研究杂志，35（3），180-184。https：//doi.org/10.1071/wr07091 Cuervo，P。F.，Di Cataldo，S.，Fantozzi，M。C.肝氟（fasciola hepatica）自然感染了北巴塔哥尼亚北部引入了欧洲棕色野兔（Lepus Euro-Paeus）：表型，患病率和潜在风险。Acta Parasitologica，60（3），536–543。https：//doi.org/10.1515/ AP-2015-0076 Da Rosa，C.A.，de Almeida Curi，N.H.巴西的外星陆地哺乳动物：当前状态和管理。生物学入侵，19（7），2101–2123。https：//doi.org/10.1007/ S10530-017-1423-3 Davison，A.，Birks，J.D.，Brookes，R.C.，Braithwaite，T.C。关于粪便的起源：用于测量其少量食肉动物的形态学与分子方法。动物学杂志，257（2），141–143。哺乳动物，80（5），497–505。https：//doi.org/10.1017/s0952 83690 2000730 de Faria，G。M. M.欧洲野兔（Lepus Europaeus）在巴西的地理分布以及塞拉多和大西洋森林生物群落的新记录。de Sousa E SilvaJúnior，J.，Oliveira，J。A.，Dias，P。A.和Gomes de Oliveira，T。（2005）。更新巴西亚马逊的Tapiti（Sylvilagus Brasiliensis：Lagomorpha，Leporidae）的地理分布和栖息地。哺乳动物，69，245–250。DeMay，S.M.，Becker，P.A.，Eidson，C.A.，Rachlow，J.L.，Johnson，T.R。，＆Waits，L.P。（2013年）。 评估濒危侏儒兔的粪便中的DNA降解速率。 分子生态资源，13（4），654–662。 https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12104DeMay，S.M.，Becker，P.A.，Eidson，C.A.，Rachlow，J.L.，Johnson，T.R。，＆Waits，L.P。（2013年）。评估濒危侏儒兔的粪便中的DNA降解速率。分子生态资源，13（4），654–662。https：//doi.org/10.1111/1755-0998.12104