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充分利用Foodmicrobionet 5.0
fmbn专业（食物细菌和真菌生物群落，251项研究，14,035个带有细菌数据的样本和1,114个带有真菌数据的样品），对食物进行了优化的样品元数据结构，可以以几种形式出口数据，以便以几种形式出口数据，以准备进一步分析；可以结合来自不同研究的数据；连接到其他几个数据库（NCBI SRA，LPSN，NCBI分类法，Omnicrobe）
AM2684 Ambion™RNase抑制剂（克隆）
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可富集的微生物共生菌群落降解了 Kyphosus 鱼中的大型藻类多糖
摘要 沿海食草鱼类以大型藻类为食，这些藻类随后被其消化道中的微生物降解。然而，关于进行这种降解的微生物群的基因组信息很少。本研究通过计算机模拟研究碳水化合物活性酶和硫酸酯酶序列，探索了 Kyphosus 胃肠道微生物共生体协同降解和发酵红、绿和棕色大型藻类中的多糖的潜力。从先前描述的 Kyphosus 肠道宏基因组和新测序的生物反应器富集物中回收宏基因组组装基因组 (MAG) 揭示了 Kyphosus 肠道中主要微生物类群之间的酶活性差异。回收的 MAG 中用途最广泛的是来自拟杆菌门，其 MAG 中含有能够分解各种藻类多糖的酶集合。 Bacillota（Vallitalea 属）和 Verrucomi crobiota（Kiritimatiellales 目）基因组的独特酶和预测降解能力凸显了多个门的代谢贡献对拓宽多糖降解能力的重要性。很少有基因组含有单独完全降解任何复杂硫酸化藻类多糖所需的酶。来自不同分类群的 MAG 之间合适酶的分布，以及在候选酶中广泛检测到信号肽，与这些碳水化合物的协同细胞外降解相一致。这项研究利用基因组证据揭示了 Kyphosus 共生体在酶和菌株水平上尚未开发的多样性及其对大型藻类分解的贡献。生物反应器富集为降解和发酵过程提供了基因组基础，对于将从该系统获得的知识转化为水产养殖和生物能源领域至关重要。
阐明微生物组操作对栖息地形成海洋全生物的直接和间接影响
© 2024 作者，更正出版物 2024。开放获取。本文根据知识共享署名 4.0 国际许可获得许可，允许以任何媒体或格式使用、共享、改编、分发和复制，只要您给予原作者和来源适当的信任，提供知识共享许可的链接，并指明是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的知识共享许可中，除非在材料的致谢中另有说明。如果材料未包含在文章的知识共享许可中，并且您的预期用途不被法定法规允许或超出允许用途，则您需要直接从版权所有者处获得许可。要查看此许可证的副本，请访问 http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/。
16个ixodes的深度测序ricinus ticks揭示了他们与内共生体的相互作用的见解
背景：ixodes ricinus tick是众多病原体的媒介，这些病原体呈现出严重的健康威胁。此外，它们具有垂直传播的共生体，其中一些与疾病有关。隔离和培养这些共生体的困难阻碍了我们对它们的生物学作用，引起疾病的潜力和传播方式的理解。为了扩展我们对与人类疾病有关的tick共生二氯乙醇中心核的理解，并在人类中与疾病有关，我们使用了16个成年女性tick虫进行了深入的测序。其中，八个是从沿海沙丘环境中收集的，另外八个是从荷兰的森林地区获得的。结果：通过采用下一代和第三代测序技术的组合，我们成功地重建了来自11个个体的线粒体M. M. helvetica的完整基因组，来自八个个体的Helvetica和来自所有tick的线粒体基因组。此外，我们可视化了Helvetica在tick器官和两个共生体的构造基因组代谢模型（GEM）中的位置，以研究其与生长相关的环境依赖性。我们的分析表明，线粒体和线粒体基因组之间存在很强的辅助性，表明频繁的母体传播。相比之下，helvetica和线粒体基因组之间不存在Cophyly，并在雌性的ini ricinus internis seminis中的存在，提高了helvetica的父亲传播的可能性。值得注意的是，除了rick a毒力基因外，发现Helvetica的遗传多样性非常低，在该基因中，在33nt-long重复的插入中的存在导致了显着的差异。但是，这种变化无法解释荷兰八个不同位置观察到的感染率的差异。结论：通过采用深层测序，可以直接从其宿主生物体中提取共生体的完整基因组和遗传数据变得可行。这种方法是一种强大的方法，可以使他们对其相互作用的新见解。我们的观察结果表明，R. helvetica的父亲传播是一种相对尚未开发的壁虱传播方式，需要通过实验研究进行验证。rick中鉴定出的遗传变异r。
真菌Holobionts作为合成内共生系统的蓝图
真菌是高度多样的，并且在生态系统中执行许多关键任务，从有机物的分解到营养物质通过菌丝的易位以及土壤中遥远的壁cor的联系。但是，真菌不孤立地生活；取而代之的是，它们与植物和动物建立了密切的关联，作为其复杂的微生物群的一部分。真菌以其对大多数血管植物的基本菌根共生体的作用而闻名，以及与藻类或蓝细菌的地衣共生的作用；鲜为人知的是它们与细菌和RNA病毒的微生物共生关系[1，2]。在1970年通过显微镜观察到了真菌中的细菌性内膜[3]，最近的发现表明，这些内共生细菌可以是某些真菌中突出的特征[1，4]。相比之下，大多数在1962年正式描述[5]最初对其宿主的影响（尽管有些可以减少真菌的生长和毒力）的大多数分枝病毒。根瘤菌是一个真菌的一个充分的例子，可以携带细菌和病毒内共生菌，被称为真菌霍洛比恩（图1）。根茎物种用于生产发酵食品，酶和代谢产物。仍然，它们也可能是农作物（包括草莓，地瓜和大米）的致病性，并在免疫验证的人类中引起致命感染。在其著名的特征中，有能力产生霉菌毒素，包括根茎毒素，根茎及其衍生物。另一个引人注目的分解是R的菌株。孢子形成仅随着真菌 - 细菌共生的重建而恢复[7]。有趣的是，关于根瘤菌毒素产生和非生产菌株的研究表明，参与根蛋白毒素产生的生物合成基因并不是真菌的起源。相反，所有产生根茎毒素的菌株均由细菌共生体定植，这些菌株含有能够产生根蛋白毒素的多酮化合物生物合成基因[6]。缺乏细菌共生体的微孢子不再无性繁殖并形成孢子囊和孢子囊孢子[7]。的确，细菌共生体是在孢子孢子中遗传的（图1），以确保它们向后代的传播[7]。r。Microsporus需要2个兼容伴侣（一种构成类型的阳性（MT+）和一种负型负菌株（MT-）菌株），并与Trisporic Acid（一种性激素）的协作产生，用于形成Zygospores的性激素（图1）。非常明显，
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厄瓜多尔亚马逊的黄色皮塔哈亚已成为该地区最重要的经济作物之一。然而，土壤中的害虫（线虫）影响了农作物生长阶段的100％。面对这个问题，种植者使用了各种化学壁甲虫剂，以最大程度地减少这种影响，但会导致污染问题。出于这个原因，研究的目的是评估微生物在温室水平控制或减少Pitahaya作物中Meloidogyne Incognita的种群。设计是DBCA，使用线性混合模型和Fisher的测试（5％）使用统计包Infostat 2017进行统计分析。结果表明，在线虫注射后施用丁香杆菌 + T.芦荟时，根结节减小（261）。此外，在线虫接种后应用微生物时，获得了最低的结节（251）（251个淋巴结）。仍然，当使用微生物时，即使在根系中存在线虫时，也会刺激空中生物量生长（384.17 g）。
Ori Bionature（M）SDN BHD 201401002514（1078588-D）Ori Bionature（M）SDN BHD 201401002514（1078588-D）
An ancient plant grown in the Tibetan Plateau Contains a unique combination of polyphenols, proanthocyanidins, and bioflavonoids, that provide extensive health benefits It offers a dual mechanism to help slow down the aging process by protect and repair mechanism The proanthocyanidins from sea buckthorn protect cells from oxidative damages that causes aging It triggers stem cell release and increases the number of circulating stem cells in the blood circulation These stem cells have the potential to transform into other more specialized cells, helping to repair damaged tissues and organs in our body Enhances collagen production, promotes collagen cross-linking and protects the skin from sunburn and photoaging Provides cardiovascular benefits lowers LDL, serum Triglyceride, increases HDL and promotes vascular repairing 5 times在保护眼睛免受可见光引起的视网膜变性
一种工程的细菌共生体允许蜜蜂肠道环境的非侵入性生物传感
蜂蜜蜜蜂是探测宿主的强大模型系统 - 近距离菌群相互作用，也是自然生态系统和农业的重要传粉媒介物种。虽然细菌生物传感器可以对宿主与其相关的菌群之间发生的复杂相互作用提供批判性的见解，但缺乏非侵入性的肠道含量进行采样的方法，以及对工程师Symbionts的有限遗传工具，到目前为止，它们在蜜蜂中的发展促成了它们的发展。在这里，我们构建了一个多功能分子工具套件，以基因修改共生体，并在蜜蜂中首次报告了一种用于采样其粪便的技术。我们将天然的蜜蜂肠道细菌snodgrassella alvi作为IPTG的生物传感器，其工程细胞通过表达荧光蛋白的表达来稳定地定居于蜜蜂蜜蜂的肠道，并以剂量依赖性的方式暴露于骨骼。我们表明可以在肠道组织中测量荧光读数或在粪便中无创测量。这些工具和技术将使工程细菌的快速建立能够回答宿主 - 近距离微生物群研究中的基本问题。