化学库对于促进药物发现过程至关重要。人们普遍认为,化学库的质量取决于其可用性和化学多样性等因素,这有助于提高找到良好匹配项的机会。在这方面,我们的小组开发了一种有用的化学品来源,称为药物和生物化学 (MBC) 库。它源于我们研究小组 30 多年的药物设计和发现经验,并成功地为神经系统、神经退行性疾病和传染病提供了有效的匹配项。此外,在过去几年中,欧洲化学生物学研究基础设施 EU-OPENSCREEN 生成了欧洲化学生物学库 (ECBL),用作药物发现的匹配项来源。在这里,我们介绍并讨论了 MBC 库的更新版本 (MBC v.2022),它富含新的支架,包含 2,500 多种化合物以及收集约 100,000 个小分子的 ECBL。为了正确处理新版 MBC 库在药物发现方面的改进潜力,我们计算了多达 44 种物理化学和药物特性,并将其与其他知名的公开库进行了比较。为了进行比较,我们使用了 ZINC20、DrugBank、ChEMBL 库、ECBL 和 NuBBE 以及已批准的药物库。最终结果证实了 MBC v.2022 和 ECBL 所涵盖的竞争性化学空间以及合适的类药物特性。总之,我们可以肯定这两个库代表了药物发现新发现的有趣来源。
对于每个样本,从步骤 4b.15 中取出 2 µL PCR 扩增文库进行定量分析:接下来必须按照“Onso TM 文库的 qPCR 定量分析”程序使用 Onso Library 定量试剂盒 (PacBio 102-431-800) 通过 qPCR 准确评估文库数量。这将确保在簇生成期间能够实现最佳簇密度。注意:步骤 4b.17 可以与步骤 4b.16 同时进行。
1美国贝勒医学院病理与免疫学系的药物发现中心,美国德克萨斯州休斯敦77030,美国。2 Verna和Marrs McLean生物化学与分子药理学系,贝勒医学院,德克萨斯州休斯敦77030,美国。3,明尼苏达州明尼阿波利斯,明尼苏达州,明尼苏达州,分子生物学和生物物理学系,分子生物学和生物物理学,美国明尼苏达州55455,美国。4美国贝勒医学院国家热带医学院儿科系,美国德克萨斯州休斯敦77030。 5美国德克萨斯州贝茨街1102号,德克萨斯州休斯敦市贝茨街1102号疫苗开发中心,美国德克萨斯州77030,美国。 6伯克利结构生物学中心分子生物物理学和综合生物成像,劳伦斯·伯克利国家实验室,美国加利福尼亚州伯克利94720,美国。 7,德克萨斯大学圣安东尼奥大学生物化学与结构生物学系,德克萨斯州圣安东尼奥市,美国78229,美国。 8霍华德·休斯医学院,德克萨斯大学健康圣安东尼奥分校,圣安东尼奥,德克萨斯州78229,美国。 9这些作者同样贡献:Ravikumar Jimmidi,Srinivas Chamakuri,Shuo Lu。 10这些作者共同监督这项工作:Srinivas Chamakuri,Timothy Palzkill,Damian W. Young。 ✉电子邮件:srinivas.chamakuri@bcm.edu; timothyp@bcm.edu; damian.young@bcm.edu4美国贝勒医学院国家热带医学院儿科系,美国德克萨斯州休斯敦77030。5美国德克萨斯州贝茨街1102号,德克萨斯州休斯敦市贝茨街1102号疫苗开发中心,美国德克萨斯州77030,美国。 6伯克利结构生物学中心分子生物物理学和综合生物成像,劳伦斯·伯克利国家实验室,美国加利福尼亚州伯克利94720,美国。 7,德克萨斯大学圣安东尼奥大学生物化学与结构生物学系,德克萨斯州圣安东尼奥市,美国78229,美国。 8霍华德·休斯医学院,德克萨斯大学健康圣安东尼奥分校,圣安东尼奥,德克萨斯州78229,美国。 9这些作者同样贡献:Ravikumar Jimmidi,Srinivas Chamakuri,Shuo Lu。 10这些作者共同监督这项工作:Srinivas Chamakuri,Timothy Palzkill,Damian W. Young。 ✉电子邮件:srinivas.chamakuri@bcm.edu; timothyp@bcm.edu; damian.young@bcm.edu5美国德克萨斯州贝茨街1102号,德克萨斯州休斯敦市贝茨街1102号疫苗开发中心,美国德克萨斯州77030,美国。6伯克利结构生物学中心分子生物物理学和综合生物成像,劳伦斯·伯克利国家实验室,美国加利福尼亚州伯克利94720,美国。7,德克萨斯大学圣安东尼奥大学生物化学与结构生物学系,德克萨斯州圣安东尼奥市,美国78229,美国。8霍华德·休斯医学院,德克萨斯大学健康圣安东尼奥分校,圣安东尼奥,德克萨斯州78229,美国。 9这些作者同样贡献:Ravikumar Jimmidi,Srinivas Chamakuri,Shuo Lu。 10这些作者共同监督这项工作:Srinivas Chamakuri,Timothy Palzkill,Damian W. Young。 ✉电子邮件:srinivas.chamakuri@bcm.edu; timothyp@bcm.edu; damian.young@bcm.edu8霍华德·休斯医学院,德克萨斯大学健康圣安东尼奥分校,圣安东尼奥,德克萨斯州78229,美国。9这些作者同样贡献:Ravikumar Jimmidi,Srinivas Chamakuri,Shuo Lu。10这些作者共同监督这项工作:Srinivas Chamakuri,Timothy Palzkill,Damian W. Young。✉电子邮件:srinivas.chamakuri@bcm.edu; timothyp@bcm.edu; damian.young@bcm.edu
摘要 本文对人工智能在图书馆中的应用及其对图书馆运营的影响进行了文献综述。本研究旨在让研究人员全面了解图书馆环境中的人工智能。研究方法包括利用 Scopus 数据库并确定 66 篇与人工智能相关的文章。在删除重复项并应用过滤器后,对所有 65 篇文章进行了审查,并在本文中介绍了它们的主要发现和摘要。本文提供的信息将成为有兴趣探索人工智能在图书馆中使用的研究人员的宝贵资源。 关键词:人工智能、图书馆中的人工智能、应用中的人工智能、图书馆服务中的人工智能、人工智能聊天机器人、人工智能评论、图书馆机器人、智能图书馆、智慧图书馆 介绍 人工智能 (AI) 的快速发展彻底改变了各个领域,图书馆也不例外。本文旨在全面回顾人工智能在图书馆中的应用及其对图书馆运营的影响。通过分析 Scopus 数据库中的一系列相关文章,本研究为研究人员提供了在图书馆环境中集成人工智能技术的宝贵见解。
Chhetri, Parbat,“分析人工智能在图书馆的优势、劣势、机遇和威胁”(2023 年)。图书馆哲学与实践(电子期刊)。7808。https://digitalcommons.unl.edu/libphilprac/7808
图 1. APPEAL 克隆。A、从载体 pYJA5 中去除氨苄青霉素抗性基因 (AmpR)。sgRNA1-4 和甲氧苄啶抗性基因 (TmpR) 与三个不同的 PCR 扩增子融合。所有元件均经过 Gibson 组装以形成 4sgRNA-pYJA5 质粒,并用甲氧苄啶筛选转化子。描绘了 4sgRNA-pYJA5 全质粒和 4sgRNA 盒的详细结构。LTR,长末端重复;Ψ,包装信号序列;PB,piggyBac 转座子元件;PuroR,嘌呤霉素抗性元件;hU6、mU6、hH1 和 h7SK 是普遍表达的 RNA 聚合酶 III 启动子;sg,sgRNA。 B、转化大肠杆菌并进行甲氧苄啶筛选后,代表性 pYJA5 限制性片段、3 片段 PCR 和 APPEAL 克隆产物的单菌落 PCR。Bbs I 消化 pYJA5 产生约 1 千碱基 (kb) 的 AmpR 元件条带和约 7.6 kb 的线性化载体条带(左)。使用相应的 sgRNA 引物进行 PCR 后,三个扩增子在琼脂糖凝胶上分别显示预期的 761、360 和 422 bp 大小(中)。使用转化细菌平板中 APPEAL 克隆产物 4sgRNA 盒两侧的引物进行单菌落 PCR 始终产生预期大小(2.2 kb,右)。 C ,8 个具有不同 4sgRNA 序列的独立 APPEAL 实验中正确、重组和突变 4sgRNA 质粒的百分比(每个实验测试 ≥22 个菌落)。D ,四个 APPEAL 实验中正确、重组和突变 4sgRNA 质粒的百分比。每个点代表一个由八个菌落组成的独立生物复制品(n=24;平均值 ± SEM)。E ,高通量格式的 APPEAL 克隆时间线(h:小时;d:天)。
人工智能 (AI) 和机器学习 (ML) 在图书馆和信息中心的应用越来越普遍,有望改善服务交付和效率。然而,这些技术的使用也带来了重大的道德挑战和风险,包括偏见和歧视、隐私和安全、自动化和工作流失以及服务交付中缺乏人际互动。这篇概念论文概述了与图书馆和信息中心使用人工智能和机器学习相关的关键道德框架和原则,并分析了如何将这些框架应用于这一特定环境。本文还讨论了这些技术的潜在好处和风险,并提供了减轻使用这些技术所带来的道德风险的最佳实践和策略。最后,本文强调了这些发现对图书馆和信息中心的影响,并建议未来在该领域开展研究和实践,包括持续评估和监测人工智能和机器学习的道德影响。总体而言,本文强调了在图书馆和信息中心使用人工智能和机器学习时采取积极主动和道德的态度的重要性,以确保这些技术的使用方式符合其使命和价值观,并符合其用户和整个社会的最佳利益。
法格贝米罗,阿约德勒·奥拉博德;阿基诺拉,阿约德勒 O.;以及 Ogunkeyede、Anna Nkechi 女士,《尼日利亚学术图书馆的创客空间现实》(2023 年)。图书馆哲学与实践(电子期刊)。 7729. https://digitalcommons.unl.edu/libphilprac/7729
基因组库:基因组库也称为克隆银行或基因库。它是来自单个生物体的DNA的集合,尽管不一定一定包含其整个基因组DNA序列。来自感兴趣的源生物的DNA分为多个片段,并包装在克隆载体中,使每个片段都带有一部分。由于以下原因,可以将矢量DNA插入由λ噬菌体载体而不是质粒矢量制成的宿主生物。整个人类基因组的长度约为3 x 109 bp,而质粒或λ噬菌体载体可能带有多达20 kb的碎片。这将需要1.5 x 105重组质粒或λ噬菌体。将大肠杆菌菌落镀在3英寸的培养皿上时,允许单个菌落隔离的最大数量约为每盘菌落。因此,构建人类基因组文库需要至少700种培养皿。相比之下,可以在典型的培养皿上筛选多达5 x104λ噬菌体鼠疫。这仅需要30培养皿来构建人类基因组文库。λ噬菌体载体的另一个优点是其转化效率比质粒载体高约1000倍。互补DNA(cDNA):cDNA是mRNA的逆转录酶产物,代表mRNA分离时所有转录基因的编码序列