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靶向纳米孔测序技术检测支气管肺泡灌洗液标本中结核分枝杆菌的初步评估
结核病（TB）是由结核分枝杆菌（M.tb）引起的传染病，对人类健康构成重大威胁。根据世界卫生组织（WHO）2021年全球结核病年度报告，中国估计有结核病病例约78万，估计结核病发病率约为每10万人55例，在30个结核病高负担国家中，中国估计结核病发病率位居第三位，低于印度尼西亚和印度。中国结核病病原体阳性率仅为58%（World Health O，2022）。因此，快速、准确的临床诊断方法对提高结核病诊断水平、治疗结核病患者、防止结核病传播至关重要。目前，在结核分枝杆菌（M.tb）的通用检测临床诊断方法中，AFB涂片具有检测方法快捷、简便、费用低廉的优势，但病原体阳性率低，M.tb.结核分枝杆菌培养时间长，无法满足临床快速诊断的要求。基于结核分枝杆菌培养的表型药敏试验（DST）受到生物安全、培养时间长及使用抗结核药物后培养率下降的影响。结核分枝杆菌生长缓慢的特点使得该方法耗时长、且由于培养不良或微生物污染等原因导致结果不确定，不能满足临床快速诊断的要求。快速准确地检测结核分枝杆菌样本和快速诊断耐药结核病是有效控制耐药结核病流行的关键。结核分枝杆菌的耐药表型主要通过多个基因的染色体突变来确认（Gygli et al.，2017）。例如，编码RNA聚合酶b亚基的rpoB基因突变导致的利福平耐药是结核分枝杆菌中最常见的基因突变。Xpert MTB/RIF检测采用半嵌套PCR直接从痰中检测结核分枝杆菌和rpoB基因突变。Xpert MTB/RIF最初于2010年被WHO推荐用于结核病诊断，但对于细菌载量较低的样本，Xpert MTB/RIF的检测结果灵敏度较低。此外，该检测只能检测利福平耐药突变，而不能报告突变类型。随着近年来新一代测序（NGS）的快速发展，WHO推荐使用NGS检测结核分枝杆菌复合群（MTBC）的耐药相关突变，并有针对性地采用高通量测序
在下呼吸道微生物群中检测甲烷摩托杆菌史密斯和甲烷摩布杆菌口腔
摘要：甲烷的甲烷产生甲烷的甲烷，是人类厌氧微生物群中常见的古细菌。甲烷植物作为与营养不良相关的机会病原体的出现，并且在厌氧脓肿中也被检测和培养。他们在呼吸道中的存在尚不清楚。是对908个呼吸道样品的前瞻性研究，使用多重指导方法结合了PCR测序，实时PCR，原位杂交（FISH）和甲烷植物培养。在21 /527（3.9％）痰样品中检测到甲烷摩托杆菌史密斯和甲烷素的口腔DNA序列，2/188（1.06％）支气管肺泡灌洗，也没有193个Tracheo-Bronchial ChialChialChialChial Chial Chial Chial Chial Chipations。此外，在三个痰液中检测到的荧光原位杂交检测到了用棍子形态的样品研究的标本，暗示了M. oralis，而在另一种支气管肺泡灌洗样本中，研究了次生斑的形态，提示Smithii M. Smithii。这些观察结果将已知的甲烷植物领土扩展到呼吸道，并在任何以后从支气管肺泡灌洗和肺部隔离的情况下进一步解释其检测为病原体。
十三价肺炎球菌结合疫苗诱导的血清免疫球蛋白 G (IgG) 反应与肺中的血清型特异性 IgG 相关
肺炎球菌结合疫苗 (PCV) 对非侵袭性肺炎的效力低于侵袭性疾病。在这项研究中，参与者接种了 13 价 PCV (PCV13) 或甲型肝炎疫苗（对照）。接种疫苗后 2 至 6 个月采集支气管肺泡灌洗样本，4 至 7 周采集血清样本。在肺部，除 3 型和 6B 型血清型外，PCV13 组的抗荚膜免疫球蛋白 G (IgG) 水平均高于对照组。从系统上讲，除 3 型血清型外，4 周时 PCV13 组所有血清型的 IgG 水平均升高。几乎所有血清型的支气管肺泡灌洗液和血清中的 IgG 均呈正相关。PCV13 对 3 型血清型的免疫原性较差，这意味着缺乏保护作用。临床试验注册。 ISRCTN 45340436。关键词。肺炎球菌；PCV13；抗荚膜 IgG；BAL。
2% 利多卡因雾化对健康马呼吸道微生物群没有可检测到的影响
糖皮质激素仍然是治疗马哮喘最常见的药物方法，但可能会产生严重的副作用，包括呼吸道微生物群改变。该研究的目的是评估 2% 利多卡因雾化（一种预计的马哮喘替代治疗方法）对健康马呼吸道微生物群的影响。进行了一项前瞻性、随机、对照、盲法、双向交叉研究，以评估 1 mg/kg 2% 利多卡因（4 天内 7 次治疗）对马呼吸道微生物群的影响，并与对照马（盐水和未治疗）进行比较。在每个样本采集时间点都获得了临床评估和呼吸道样本，包括鼻冲洗液、内窥镜气管抽吸物和支气管肺泡灌洗液。使用 16S 扩增子测序评估呼吸道细菌微生物群的概况，并使用相关样本分析比较临床数据（基于数据正态性）。治疗不会影响临床数据，也不会改变健康马的气管和鼻腔微生物群。然而，时间可以解释样本间 12.6% 的微生物群变化。在鼻腔和气管样本中观察到细菌组成的显著差异，其中放线菌和厚壁菌门的相对丰度最高。尽管尝试了多种 DNA 提取方法和 PCR 方案，并排除 PCR 抑制后，来自支气管肺泡灌洗液的细菌 DNA 并没有通过针对原核核糖体 RNA 基因小亚基核糖体 RNA 基因 V4 可变区的通用引物进行扩增。这一观察结果表明，健康马的支气管肺泡灌洗液的细菌负荷较低。
结核病管理协议的临床手册2024
Acid-Fast Bacillus Acquired immunodeficiency syndrome Antiretroviral treatment Bronchoalveolar Lavage Bacillus Calmette-Guérin Bedaquiline, Pretomanid and Linezolid Bedaquiline, Pretomanid, Linezolid and Moxifloxacin Computer-Aided Detection United States Centers for Disease Control and Prevention Central Nervous System Cerebrospinal Fluid Chest X-Ray Directly Observed Treatment Drug Susceptible Drug susceptibility testing Extrapulmonary Fixed-dose combination Fine Needle Aspiration Fine Needle Aspiration Cytology Guideline Development Group Global TB Programme Germicidal Ultraviolet High-Efficiency Particulate Air Human immunodeficiency virus Isoniazid and Rifampicin Isoniazid, and Rifampicin, with Ethambutol Isoniazid, Rifampicin, Pyrazinamide, and Ethambutol Internally Displaced人们感染的预防和控制异念珠菌
使用奴才序列对SARS-COV-2分析
我们将要使用的数据是武汉海鲜市场肺炎爆发的元文字小奴才数据集[Chan等，2020]。对疾病的病毒进行采样涉及从患者那里获得痰，喉咙或鼻咽拭子或支气管肺泡灌洗液（BALF）样品。因此，样品将包含来自非病毒源的RNA。该数据集是使用独立于序列的单播放扩增（SISPA）方案来制备的，以进行其他病毒序列富集。
协议
10/03/2021增加了有关支气管镜检查和EBUS出血风险的段落，以“ 1.1程序相关的出血风险”；在“ 1.5患者 /客户组”节下添加了“支气管镜和支气管内超声（EBUS）”；在“ 1.6定义”下添加了“ BAL - 支气管肺泡灌洗”和“ Ebus - Ebus - Ebus -Endobronchial Ultrasound”；在2.4图2和2.6中添加了“高风险程序”下的“支气管镜”和“ EBUS”。添加了对“ 4个证据基础”的新参考；在以下区域上更改为“>”：2.2、2.6图4和2.9.1。华法林，在“否”途径下；在2.6中发现的“ 4”之后省略了“天”单词。图4 DOAC途径
虹膜毒理学评论六价铬[Cr（vi ...
ADAF age-dependent adjustment factors ADME absorption, distribution, metabolism, and excretion AIC Akaike's information criterion ALT alanine aminotransferase ALP alkaline phosphatase Asc ascorbate AST aspartate aminotransferase ATSDR Agency for Toxic Substances and Disease Registry BAL bronchoalveolar lavage BALF bronchoalveolar lavage fluid BMD benchmark dose BMDL benchmark dose lower confidence limit BMDS Benchmark Dose Software BMI body mass index BMR benchmark response BMDC bone marrow-derived stem cell BW body weight CA chromosomal aberration CASRN Chemical Abstracts Service Registry Number CHO Chinese hamster ovary (cell line cells) CPHEA Center for Public Health and Environmental Assessment CL confidence limit CNS central nervous system Cr(III)三价铬Cr（IV）四价铬Cr（V）载体CR（VI）六价铬铬DAF daf剂量调节因子DLCO碳一氧化碳DNA DNA脱氧核糖核酸氧化脱氧核糖核酸酸E EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA ISPAIRE EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA EPA FEF 1 FEF 1 FEL. FVC强迫生命能力GD妊娠日GGTγ-谷氨酸转移酶GI胃肠道GLP良好实验室实践GSD几何标准标准偏差GSH谷胱甘肽GST谷胱甘肽GST谷胱甘肽-S-转移酶-S-转移酶HAWC健康评估工作区HEC HEC HEC HEC HEC HEC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEAC HEC VICERENT
杭州圣庭医疗科技有限公司TBSeq测试
杭州盛廷医疗科技有限公司拥有一款基于靶向二代测序（NGS）的试剂盒，用于同时识别分枝杆菌种类并预测结核分枝杆菌复合群（MTBC）菌株的耐药性。该试剂盒 TBseq® 可直接应用于痰液、支气管肺泡灌洗液、胸腔积液或分枝杆菌阳性培养物等临床标本。它依赖于引物多重扩增混合物的深度测序，针对与一线和二线抗结核（抗 TB）药物（利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、对氨基水杨酸、环丝氨酸、乙硫异烟胺/丙硫异烟胺、贝达喹啉、氯法齐明和利奈唑胺）耐药相关的 21 种主要 MTBC 基因。分枝杆菌种属鉴定是通过针对 16S 和 hsp65 基因区域进行的。
«精英 InGenius® SP 1000»
«ELITe InGenius ® SP 1000» 是一种即用型试剂盒，内含用于从单个样本中提取和纯化核酸 (NA) 的试剂。«ELITe InGenius ® SP 1000» (ELITechGroup SpA，编号 INT033SP1000) 与 «ELITe InGenius ® » (ELITechGroup SpA，编号 INT030) 和 « ELITe BeGenius ® » (ELITechGroup SpA，编号 INT040) 仪器配合使用，并与 ELITechGroup 实时 PCR 检测一起构成 «ELITe InGenius ® » 和 «ELITe BeGenius ® » 系统，即全自动分子诊断系统，可执行核酸提取、纯化、扩增、检测和结果解释。核酸（NA）分离协议基于磁珠，用于从人类血清、EDTA 或柠檬酸中收集的血浆、呼吸道样本（支气管肺泡灌洗（BAL）/支气管抽吸物（BA））中自动制备高纯度 DNA（人类、细菌、病毒和真菌）和病毒 RNA。