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World File Search SystemcDNA
Biochip技术解释
通过核酸（DNA/RNA）分析检测病原体可提供病毒，细菌和原生动物病原体的快速，敏感，多重检测。在从各种样本类型（痰，尿液，拭子等）中提取核酸后，目标DNA/cDNA在单个反应中得到扩增，然后杂交到包含23个病原体特异性探针的生物芯片阵列。这个快速，高度敏感和特定的过程可以同时识别初级和共同感染，通常在无症状的患者中，并且具有许多病原体面板的能力。
CRISPR/Cas9 基因敲除及随后的野生型和突变型基因拯救的改进策略
将荧光标记 mOrange 插入到流行的 pLentiCrispr-V2 中，以创建包含嘌呤霉素选择和荧光标记的 pLentiCrispr-V2-mOrange (V2mO)，使病毒产生和靶标转导可见。用该质粒和适当的向导 RNA (gRNA) 包装的慢病毒成功敲除了人胃癌细胞系中的 RhoA、Gli1 和 Gal3 基因。Cas9-gRNA 编辑效率可以直接从 Cas9-gRNA 转导细胞中 gRNA 区域周围的短聚合酶链反应产物的 Sanger 电泳图来估计。必须对转导的靶细胞池进行单克隆以建立稳定的敲除克隆。仅当 gRNA 结合的 cDNA 被三个核苷酸修饰而氨基酸序列保持不变时，才能成功将野生型（RhoA 和 Gal3）和突变型（RhoA.Y42C）基因拯救到敲除细胞中。在 Gal3 基因中观察到严格的靶向 CRISPR/Cas9 编辑，但在 RhoA 基因中未观察到，因为 RhoA.Y42C 已经在 gRNA5 结合位点出现核苷酸变化。总之，我们改进的策略增加了这些优势：在流行的慢病毒系统中添加可视化标记、监测慢病毒的生产和转导效率、通过荧光激活细胞分选在靶细胞中分选 Cas9+ 细胞、通过 gRNA 结合位点周围的短 PCR 电泳图直接估计靶细胞池的基因编辑效率、以及在敲除细胞中成功拯救野生型和突变型基因，通过修饰 cDNA 克服 Cas9 编辑。
课程描述植物学
基因组学分类，原核基因组的结构和组织。细菌基因的转录调节剂。细菌基因组中的可转座遗传元素。细菌操纵子和操纵片化的演变。岛屿和致病性和抗性的片段。真核基因组的结构和组织。重复和转座元素及其对基因组的影响。染色体中的端粒和亚电体区域。CpG甲基化和基因沉默。 酵母 - 两种杂交系统。 cDNA微阵列。 线粒体基因组的进化和结构。 基因组测序：整个shot弹枪基因组测序。 测序技术：Sanger毛细血管测序，Roche 454（焦磷酸测序），Illumina/Solexa，固体系统。 测序技术的优缺点。 Maxam-Gilbert测序。 ORF和启动子预测。 内含子和外显子预测。 基因注释。 主要基因组数据库。CpG甲基化和基因沉默。酵母 - 两种杂交系统。cDNA微阵列。线粒体基因组的进化和结构。基因组测序：整个shot弹枪基因组测序。测序技术：Sanger毛细血管测序，Roche 454（焦磷酸测序），Illumina/Solexa，固体系统。测序技术的优缺点。Maxam-Gilbert测序。ORF和启动子预测。 内含子和外显子预测。 基因注释。 主要基因组数据库。ORF和启动子预测。内含子和外显子预测。基因注释。主要基因组数据库。
Ribosafe RNase抑制剂
核糖核酸酶（RNase）无处不在，可以在许多方面引入实验：例如，在RNA隔离期间的共纯化，裸手和移液器尖端的持久性。这种RNase污染通常不会引起人们的注意。核糖防护RNase抑制剂非常适合对RNA敏感的应用，例如RT-QPCR，因为即使少量RNase也可能不利于最终的实验结果。核糖防护酶抑制剂是一种高效的抑制剂（图1）一系列真核RNass，没有抑制聚合酶或逆转录酶活性（图2），因此可以用于cDNA合成或一步RT-QPCR反应中。
AXV-101，一种新的密码子优化的BBS1 AAV9向量，停止...
Bardet-Biedl综合征（BBS）是一种与原发性纤毛功能障碍相关的常染色体隐性疾病，表现出视网膜营养不良和进行性视觉丧失，以及其他临床特征。bbs1是在BBS中发现的最常见的突变基因，而错义BBS1 M390R突变是最常见的等位基因。我们先前已经证明，在调节的Remodopsin激酶（AAV8-RK-BBS1）和巨细胞病毒（AAV8-CMV-BBS1）下表达野生型BBS1 cDNA的不同AAV8载体是安全且能够停止BBS1 Missense Youse BBBS Mode bbs1鼠标BBS1 MISSONSE BBS1 MORTENS MISSENSE MOLTENS MISTENS MORTANE DENINALION的促进剂（AAV8-CMV-BBS1）的启动子（M390R）（Freitas等人）。我们还介绍了BBS1的密码子优化版本的开发如何增加蛋白BBS1表达（De Castro等人）。在这项研究中，我们通过AXV-101（在CAG启动子（AAV9-CAG-HCOBB1）调节下表达人类密码子优化的BBS1 cDNA序列（HCOBBS1）（AAV9-CAGBB1），我们提高了AXV-101的视网膜下递送的功效和安全概况。在这里，我们单方面用单一的泡沫给了新生儿P7-9 M390R和野生型（WT）动物的5种不同的队列（n = 5-12）；用AXV-101配方缓冲液和磷酸盐缓冲盐水（PBS）和3个队列的两个对照组，以及增加剂量的AXV-101（1x10 9，5x10 9和1x10 10 10总病毒基因组（VG））。对侧眼被用作内部对照。我们使用光学相干断层扫描（OCT）和用电子图（ERG）的功能救援测量了6个月内的安全性和功效。
理学学士微生物学第三学期和第四学期...
第一单元 遗传工程简介。DNA、RNA 和蛋白质分析方法：琼脂糖凝胶电泳、Southern 和 Northern 印迹技术、点印迹、SDS-PAGE 和 Western 印迹。DNA 修饰酶及其应用：限制酶、DNA 聚合酶。末端脱氧核苷酸转移酶、激酶和磷酸酶以及 DNA 连接酶。第二单元 聚合酶链式反应。C-DNA 合成和克隆：mRNA 富集、逆转录、接头、衔接子、平端连接、同聚物加尾。基因组和 cDNA 文库：制备和用途、基因组测序。DNA 测序：传统和自动测序。
RNase抑制剂 - 重组
描述：RNase抑制剂是一种重组蛋白，它完全抑制了包括RNase A，B和C在内的广泛的真核RNase，它通过以1：1的比率与高亲和力（4 x 10 -14 m）抑制RNase。它不抑制RNase I，T1，T2，H，U1，U2和CL3。此外，RNase抑制剂没有对聚合酶或逆转录酶活性的抑制作用，因此可用于cDNA合成和一步性RT-PCR反应。RNase抑制剂的鼠版本缺乏在人类版本中鉴定出的一对半胱氨酸，因此它显着提高了对氧化的耐药性。
DNA聚合酶I（大肠杆菌）-ABO
DNA聚合酶I（大肠杆菌）是一种固有的3´→5´（校对）和5´→3´核酸酶活性的不可用疗法的DNA聚合酶，此外还具有较低和非特异性核糖核酸酶H活性。5´→3´外核酸酶Acɵvity在生长的DNA链之前去除核驱动器，从而可以进行划痕 - 翻译。因此，DNA聚合酶I（大肠杆菌）不显示链脱位活性，可用于通过尼克翻译来标记DNA，并与DNase I或第二链cDNA合成，或与RNase H. DNA聚合酶I（E. coli）接受Modified nitified nucified Nucified Nucified Nicified Nicified Nicified Nicified 生物素 - ，二氧素蛋白，荧光标记的核苷酸）作为DNA合成的底物。生物素 - ，二氧素蛋白，荧光标记的核苷酸）作为DNA合成的底物。
欢迎新年！多样性，公平和包容
我们正在应用功能性基因组和遗传研究来填补有关卵巢癌可起作突变的临床知识的空白。我们应用了基于CRISPR/CAS9的基因组规模筛选，以鉴定卵巢癌对PAPR抑制剂敏感性的遗传决定因素。我们还从耐药性的患者中产生了肿瘤衍生的cDNA表达文库，并且我们正在应用功能性遗传筛选来识别促进癌症进展和治疗耐药性的驱动基因。我们还生成了几个TP53诱变文库，以表征对TP53靶向疗法有反应的突变体。该项目最近由国防部卵巢癌研究计划资助。