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基因组知识的圈养育种可以减少近亲抑郁症和动物园种群的遗传负荷
fi g u r e 1从单个粉红色鸽子的原始阅读中，粉红色依赖性耗竭（PPCADD）分数的每单核苷酸多态性（SNP）粉红色鸽子的产生管道。Snakemake（Mölder等，2021）管道用作输入主体个体的测序读数，受试者物种参考基因组以及CADD分数和参考基因组（即鸡肉，Chcadd分数（Groß，Bortoluzzi等，2020）和Galgal6参考基因组（Warren等，2017））。管道分为六个部分，对应于管道的部分（https：//github。com/saspe ak/loadlift）。（1）（黄色）使用Phyluce从参考基因组中提取UCE。（2）（深蓝色）映射个体的测序读取到参考基因组，以指示10×Chromium读取数据（本文中使用）和Illumina读取数据的两种平行方法。（3）（浅蓝色）变体呼叫UCES中的SNP。（4）（浅灰色）创建链文件，用于从鸡基因组转化注释。（5）（深灰色）Chcadd得分转换为粉红色鸽子（主题物种）注释。（6）（绿色）床文件和UCE站点的交集到每个站点PPCADD（主题物种）分数（红色）。
定量确定来自泰米尔纳德邦南部热带地区南部热带地区的成年圈养亚洲大象（Elephas Maximus）中25-羟基维生素D
ISSN印刷：2617-4693 ISSN在线：2617-4707 IJABR 2024; SP-8（5）：406-408 www.biochemjournal.com收到：16-02-2024接受：23-04-2024 Anisha J Perumbilly兽医临床综合综合体田纳图斯系，泰米尔纳德邦，泰米尔纳德邦，印度泰米尔纳德邦，印度M balaganganganganthalagaragaragaragaragarathalagaragaragaragarathalagaragaragaragarathalagaragaragaragarathalagarathalagaragar and vernical tir tir tir tir tir tir tir tir tir tir tir tir tir tir。 Tamil Nadu, India M Kalaivanan Assistant Professor, Department of Veterinary Clinical Complex, VCRI, Theni, Tanuvas, Tamil Nadu, India Vishnurahav RB Assistant Professor, Department of Veterinary Clinical Complex Professor, Department of Veterinary Clinical Complex, VCRI, Tirunelveli, Tanuvas, Tamil Nadu, India Corresponding Author: Anisha J Perumbilly Assistant Professor Tirunelveli，Tanuvas，Tamil Nadu，印度
高通量 DNA 条形码技术用于测定禁食期间圈养极度濒危马来虎 (Panthera tigris jacksoni) 的肠道微生物组
马来虎 ( Panthera tigris jacksoni ) 是马来西亚半岛的极度濒危物种。为了模拟老虎不每天捕猎的野外环境，许多野生动物保护区并不每天喂食老虎。然而，禁食对圈养马来虎肠道菌群的影响仍然未知。这项研究旨在通过比较禁食和正常喂养条件下圈养马来虎的微生物群落来表征其肠道菌群。这项研究是在马来西亚半岛的马六甲动物园进行的，马来虎每周一禁食。总共收集了 10 个马来虎粪便样本、2 个孟加拉虎（外群）和 4 个狮子（外群）的粪便样本，并进行了针对 16S rRNA V3-V4 区域的宏条形码分析。总的来说，我们在马来虎样本中确定了 14 个门、87 个科、167 个属和 53 种肠道微生物组。本研究发现的潜在有害细菌属包括梭杆菌、拟杆菌、狭义梭菌 1、
圈养领狐猴（Varecia spp.）的线粒体 DNA 多样性：对保护的意义
摘要 领狐猴（ Varecia variegata 和 Varecia rubra ）在 IUCN 红色名录中被列为极度濒危物种，需要开展遗传学研究来评估圈养种群的保护价值。利用 线粒体 DNA (mtDNA) D-loop 序列，我们研究了马达加斯加、欧洲和北美圈养领狐猴的遗传多样性和结构。我们发现 10 个新的单倍型：一个来自欧洲圈养的 V. rubra 种群，三个来自圈养的 V. variegata sub-cincta（一个来自欧洲，两个来自马达加斯加），六个来自马达加斯加其他圈养的 V. variegata。我们发现欧洲和北美圈养的 V. variegata 种群的线粒体 DNA 遗传多样性较低。几个创始个体共享相同的线粒体 DNA 单倍型，因此在提出繁殖建议时不应假设它们是无关的创始个体。马达加斯加的圈养种群具有很高的遗传多样性，包括尚未在野生种群中发现的单倍型。我们通过与之前的研究进行比较，确定了圈养种群创始个体的可能地理来源；圈养领狐猴的所有报告单倍型都与位于马达加斯加芒戈罗河以北的野生种群的单倍型相同或聚集在一起。有效