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与生长和免疫相关的基因表达模式
摘要。多刺龙虾，Panulirus homarus，是水产养殖中具有重要经济价值的一种物种。这项研究研究了生长相关（生长激素/GH和甲壳类高血糖激素/CHH）和免疫系统相关（凝集素和苯酚氧化酶作为无活跃的促酶/蛋白酶/propo）基因的表达模式。了解这些模式对于提高水产养殖的生产力至关重要。基因表达在NAUPLISOMA阶段（0.003±0.0002 CHH，0.0084±0.0002 GH，0.003±0.001凝集素，0.0033±0.0009 Propo），在5 cm种子龙虾中最高（1.25±0.11 CHH，2.14 l. 0.14±0.533，0.14±0.533±0.14±0.8±，0.11 chH，0.14±0.14±0.8±， 1.62±0.24 propo）。这些发现表明，在定时免疫刺激施用方面的潜在应用以增强免疫力，以及制定与饲料补充剂，疾病管理和影响CHH和GH表达的环境因素有关的策略。这项研究提供了对homarus假单胞菌的生长和免疫发展的关键见解，为改善水产养殖实践铺平了道路。关键词：生产力，水产养殖，Nauplisoma，环境，发展。简介。多刺龙虾Panulirus homarus广泛分布在整个印度太平洋地区，在东非和印度尼西亚，人口密集（Berry 1974； Pollock 1993）。这是一种具有重要经济价值的物种，尤其是在越南和印度尼西亚，在那里进行了广泛的培养（Jones 2010）。P. homarus的水产养殖依赖于自然发生的大型后pueruli的收集，然后将其升至海洋笼中可销售的大小（Do Huu＆Jones 2014）。然而，当前的文化实践是次优的，诸如营养不良和人满为患的问题导致了养殖种群的健康问题和严重死亡（Behringer等人，2012年）。甲壳类高血糖激素（CHH）在甲壳类动物的生命周期中起着至关重要的作用，从而显着影响其生长。它参与了碳水化合物的代谢，并抑制摩擦，生殖活性和渗透调节过程（Fanjul-Moles 2006； Lacombe等，1999）。chh诱导血淋巴中的高血糖和高脂血症，提供必要的葡萄糖和脂质，以满足龙虾器官和组织的能量需求（Kummer＆Keller 1993）。
商业责任和可持续性报告
1。列表实体的公司身份编号（CIN）-L34102MH1999PLC123296 2。列出的实体耐力技术有限公司的名称3。成立年份1999 4.注册的办公室地址E-92，MIDC工业区，Waluj，Chh。Sambhajinagar -431 136，马哈拉施特拉邦5。公司地址E-92，MIDC工业区，Waluj，Chh。Sambhajinagar -431 136，马哈拉施特拉邦6。电子邮件investors@endurance.co.in 7。电话 +91-240-2569600 8。网站www.endurancegroup.com 9。为完成报告的财政年度2023-24 10。证券交易所的名称，该股票列为BSE Limited（BSE），国家证券交易所有限公司（NSE）11。付费资本J 1,406,628,480 12。姓名和联系方式（电话，电子邮件地址），如果BRSR报告中的任何查询，可能会联系的人
epiGBS 与 WGBS 结果比较
DNA 胞嘧啶甲基化是一种表观遗传机制，参与调节植物对生物和非生物胁迫的反应，其改变能力随胞嘧啶出现的序列环境（CpG、CHG、CHH，其中 H = 腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶）而变化。模型植物物种中的 DNA 甲基化定量通常通过全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）进行，这需要高质量的参考基因组。精简代表性亚硫酸盐测序 (RRBS) 是一种经济有效的潜在替代方案，适用于基因组资源有限且实验设计规模大的生态研究。在本研究中，我们首次全面比较了 RRBS 和 WGBS 的输出，以表征 DNA 甲基化对给定环境因素的反应变化。具体而言，我们使用 epiGBS（最近优化的 RRBS）和 WGBS 来评估 Populus nigra cv. 无性系中昆虫和人工食草后的整体和序列特异性差异甲基化。 'italica'。我们发现，在两种食草处理中的任何一种之后，CHH 中的全局甲基化百分比都会增加，并且只有 epiGBS 检测到这种转变具有统计学意义。至于食草引起的位点特异性差异甲基化（epiGBS 中的胞嘧啶和 WGBS 中的区域），两种技术都表明昆虫和人工食草引起的反应具有特异性，并且 CpG 中的低甲基化和 CHH 中的高甲基化频率更高。当存在于 CpG 和 CHG 中时，甲基化变化主要发现在基因体和基因间区域，而在 CHH 环境中则发现在转座因子和基因间区域。因此，epiGBS 成功地表征了伦巴第杨对食草反应的全局全基因组甲基化变化。我们的研究结果支持 epiGBS 在旨在探索非模型植物物种对多种环境因素反应的表观遗传变化的大型实验设计中特别有用。
新英格兰Biolabs分析证书
通过构建由基因组DNA和DNA对照组成的Nebnext®EM-SEQ库（CPG甲基化的PUC19和未甲基化的Lambda），通过构建Nebnext®EM-SEQ库进行了功能测试，并与前面的批次进行了测试。NEBNEXT®EM-SEQ KIT的最小值和最大DNA输入要求用于制作在同一Illumina®流动池上测序的库。库评估基于指标，包括库产量，库大小，GC偏置，插入大小以及在基因组DNA和内部对照中检测到的CpG，CHG，CHH环境的5MC/5HMC百分比。
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CHH米高梅大学生物技术米高梅大学。 Sambhaji Nager 431001，印度。 摘要：PGPR植物生长促进根瘤菌是最有益的细菌菌株，可通过直接和间接机制增强植物的生长和生物控制。 PGPR被确定为有效的微生物作为植物生长的生物肥料。 因此，进行了本研究以分离并表征从根际土壤中的PGPR。 从土壤样品中分离出总数十个分离株，并通过不同的表征技术来表征。 在本研究中，十个分离物中的两个10 -5 F1和10 -5 F3显示了IAA高产生，显示了Pikovskaya琼脂中磷酸盐溶解活性，几乎所有分离株在过氧化氢酶测试中均为阳性，并显示出针对曲霉菌物种的抗真菌活性。 索引项 - 根瘤菌，磷酸盐溶解，抗真菌活性。CHH米高梅大学生物技术米高梅大学。Sambhaji Nager 431001，印度。摘要：PGPR植物生长促进根瘤菌是最有益的细菌菌株，可通过直接和间接机制增强植物的生长和生物控制。PGPR被确定为有效的微生物作为植物生长的生物肥料。因此，进行了本研究以分离并表征从根际土壤中的PGPR。从土壤样品中分离出总数十个分离株，并通过不同的表征技术来表征。在本研究中，十个分离物中的两个10 -5 F1和10 -5 F3显示了IAA高产生，显示了Pikovskaya琼脂中磷酸盐溶解活性，几乎所有分离株在过氧化氢酶测试中均为阳性，并显示出针对曲霉菌物种的抗真菌活性。索引项 - 根瘤菌，磷酸盐溶解，抗真菌活性。
使用机器学习预测非CG DNA甲基化
DNA甲基化可以在双溶液转化后使用测序仪器检测和测量，但是对于大型真核基因组而言，实验可能很昂贵。测序非表征和映射偏见可以使基因组的一部分具有低覆盖率或没有覆盖范围，从而阻碍了所有细胞固醇获得DNA甲基化水平的能力。为了解决这些局限性，已经提出了几种计算方法，可以预测胞质周围的DNA序列或附近细胞氨酸的甲基化水平的DNA甲基化。然而，大多数这些甲基元素完全集中在Humans和其他哺乳动物中的CG甲基化上。在这项工作中，我们第一次研究了六种植物物种的CG，CHG和CHH环境的胞嘧啶甲基化的问题，要么是从胞嘧啶周围的DNA主要序列或邻近细胞糖苷的甲基化水平来进行。在此框架中，我们还研究了跨物种的预测问题和跨境预测问题（在同一物种中）。最后，我们表明，提供基因和重复注释允许现有的分类器可以逐步提高其预测准确性。我们介绍了一种称为AMP的新分类器（基于注释的甲基化预测），它利用基因组注释来实现更高的精度。
杂交杨组织培养中芽器官发生过程中等位基因特异性DNA甲基化和基因表达
植物组织再生对于遗传转化和基因组编辑技术至关重要。在再生过程中，表观遗传修饰的变化伴随着细胞命运的转变。然而，两种单倍型中的等位基因特异性 DNA 甲基化如何影响再生过程中的转录动力学仍不清楚。在这里，我们应用跨物种杂交杨（Populus alba × P. glutumoosa cv. 84 K）作为一个系统，在等位基因水平上表征从头芽器官发生过程中的 DNA 甲基化景观。直接和间接芽器官发生均显示全基因组 DNA 甲基化的降低。在基因水平上，与表达基因相比，未表达基因的甲基化程度较高。在 DNA 甲基化水平与基因表达之间表现出显著相关性的基因中，75% 的基因的表达模式与 CG 环境中的 DNA 甲基化呈负相关，而 CHH 环境中的相关性模式则相反。等位基因偏向的DNA甲基化在芽器官发生过程中是一致的，等位基因特异性甲基化区域偏移的概率不到千分之一。等位基因特异性表达分析表明，在再生过程中只有1909个基因表现出相位依赖性的等位基因偏向表达，其中启动子区域转录因子结合位点差异较大的等位基因对表现出较大的等位基因表达差异。我们的研究结果表明，在芽器官发生过程中，两个亚基因组中的转录调控相对独立，这是由顺式作用基因组和表观基因组变异所致。
实验性种子去甲基化后的长期甲基化组变化及其与香叶草（Geraniaceae）中反复水分胁迫的相互作用
• 全球亚热带和温带地区干旱期的频率和长度正在增加。表观遗传对水分胁迫的反应可能是植物抵御这些难以预测的挑战的关键。实验性 DNA 去甲基化与应激因子的应用相结合是揭示表观遗传学对植物应激反应贡献的适当策略。• 在温室中，我们分析了用 5-氮杂胞苷对种子进行去甲基化和/或反复受水胁迫后，一年生地中海草本植物 Erodium cicutarium 成年植株叶片胞嘧啶甲基化的变化。我们使用亚硫酸盐 RADseq (BsRADseq) 和新报道的 E. cicutarium 参考基因组，以 2 9 2 因子设计表征甲基化变化，控制植物相关性。 • 从长期来看，仅用 5-氮杂胞苷处理会导致单个胞嘧啶的低甲基化和高甲基化，在 CG 环境中会出现显著的低甲基化。在对照条件下，干旱导致除 CHH 环境中所有环境中的甲基化减少。相反，经历反复水胁迫并用 5-氮杂胞苷处理的植物的基因组使 DNA 甲基化水平增加约 5%。• 种子去甲基化和反复干旱在整体和特定环境中的胞嘧啶甲基化方面产生了高度显著的相互作用。大多数甲基化变化发生在基因区域周围和转座因子内。这些与基因相关的差异甲基化区域的注释包括几个在应激反应中具有潜在作用的基因（例如 PAL、CDKC 和 ABCF），证实了表观遗传在分子水平上应对应激的贡献。
文章 久坐行为与超重或肥胖儿童的大脑结构和智力之间的关联：ActiveBrains 项目
1 PROFITH“通过体育活动促进身体健康”研究小组，体育与健康大学研究所（iMUDS），体育与运动教育系，体育科学学院，格拉纳达大学，18071格拉纳达，西班牙；ireneesteban@ugr.es（IE-C.）；patricio.solis.u@gmail.com（PS-U.）；jmorag@ugr.es（JM-G.）；cristina.cadenas.sanchez@gmail.com（CC-S.）；maria_92_rg@hotmail.es（MR-A.）；jairohm@ugr.es（JHM）；pablomolinag5@gmail.com（PM-G.）； ortegaf@ugr.es (FBO) 2 安德烈斯贝洛大学教育与社会科学学院，比尼亚德尔马 2531015，智利 3 瓦尔帕莱索天主教大学体育学院 IRyS 研究小组，2374631 瓦尔帕莱索，智利 4 北卡罗来纳大学夏洛特分校健康与人类服务学院，夏洛特，北卡罗来纳州28262，美国 5 加的斯大学教育科学学院 MOVE-IT 研究组和体育系，11519 加的斯，西班牙 6 加的斯生物医学研究与创新研究所 (INiBICA) 研究部，波多黎各德尔马大学医院 加的斯大学，11009 加的斯，西班牙 7 鲁汶大学康复科学系鲁汶, 3000 鲁汶, 比利时8 心智、大脑和行为研究中心（CIMCYC），格拉纳达大学，18071 格拉纳达，西班牙；j.verdejo@gmail.com 9 认知和计算神经科学实验室（UCM-UPM），生物医学技术中心（CTB），波苏埃洛德阿拉尔孔，28223 马德里，西班牙 10 东北大学心理学系，波士顿，马萨诸塞州 02115，美国；a.kramer@northeastern.edu（AFK）； c.hillman@northeastern.edu (CHH) 11 伊利诺伊大学香槟分校贝克曼研究所，伊利诺伊州香槟市 61821，美国 12 东北大学物理治疗、运动与康复科学系，马萨诸塞州波士顿 02115，美国 13 匹兹堡大学心理学系大脑老化与认知健康实验室，宾夕法尼亚州匹兹堡 Sennott Square 3601 号，15218，美国；kiericks@pitt.edu 14 格拉纳达大学实验心理学系、心智、大脑与行为研究中心 (CIMCYC)，西班牙格拉纳达 18011；acatenam@gmail.com * 通信地址：jzavala@unab.cl