隶属关系:美国华盛顿特区乔治华盛顿大学生物科学系1。2史密森尼国家动物园和保护生物学研究所,美国华盛顿特区,史密森尼国家动物园和保护生物学研究所。3美国华盛顿特区乔治敦大学伦巴第综合癌症中心肿瘤学系。 4病理学,微生物学和免疫学部门以及儿科,范德比尔特大学医学院,美国田纳西州纳什维尔。 5生物科学系,美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学 *通讯作者:Suite 6000,800 22 ND ST NW,华盛顿特区,20052年,美国。 电话:202-994-8076电子邮件:leon_grayfer@gwu.edu。3美国华盛顿特区乔治敦大学伦巴第综合癌症中心肿瘤学系。4病理学,微生物学和免疫学部门以及儿科,范德比尔特大学医学院,美国田纳西州纳什维尔。 5生物科学系,美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学 *通讯作者:Suite 6000,800 22 ND ST NW,华盛顿特区,20052年,美国。 电话:202-994-8076电子邮件:leon_grayfer@gwu.edu。4病理学,微生物学和免疫学部门以及儿科,范德比尔特大学医学院,美国田纳西州纳什维尔。5生物科学系,美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学 *通讯作者:Suite 6000,800 22 ND ST NW,华盛顿特区,20052年,美国。 电话:202-994-8076电子邮件:leon_grayfer@gwu.edu。5生物科学系,美国田纳西州纳什维尔市范德比尔特大学 *通讯作者:Suite 6000,800 22 ND ST NW,华盛顿特区,20052年,美国。电话:202-994-8076电子邮件:leon_grayfer@gwu.edu。
蛙壶菌 ( Bd ) 是壶菌病的病原体,正在毁灭世界各地的两栖动物种群。Bd 属于壶菌谱系,这是一类早期分化的真菌,被广泛用于研究真菌进化。与所有壶菌一样,Bd 会从运动形态发展为固着生长形态,这一转变会导致其细胞骨架结构发生剧烈变化。由于缺乏用于检验有关潜在分子机制的假设的遗传工具,研究 Bd 细胞生物学、发育和致病性的努力受到限制。在此,我们报告了一种 Bd 瞬时遗传转化系统的开发。我们使用电穿孔将外源 DNA 递送到 Bd 细胞中,并在异源和天然启动子下检测到长达三代的转基因表达。我们还调整了转化方案以使用抗生素抗性标记进行选择。最后,我们使用该系统表达荧光蛋白融合,并作为概念验证,表达了肌动蛋白细胞骨架的遗传编码探针。利用活细胞成像,我们可视化了 Bd 生命周期每个阶段以及关键发育转变期间聚合肌动蛋白的分布和动态。该转化系统可以直接测试有关 Bd 发病机制的关键假设。该技术还为解答壶菌细胞、发育和进化生物学的基本问题铺平了道路。
1 德克萨斯大学奥斯汀分校综合生物学系,美国德克萨斯州奥斯汀 2 康奈尔大学生态与进化生物学系,美国纽约州伊萨卡 3 加利福尼亚州鱼类和野生动物部,美国加利福尼亚州西萨克拉门托 4 地球研究所和 5 加利福尼亚大学生态、进化和海洋生物学系,美国加利福尼亚州圣巴巴拉 6 加利福尼亚大学基因组中心,美国加利福尼亚州戴维斯 7 美国地质调查局,森林和牧场生态系统科学中心,美国俄勒冈州科瓦利斯 8 六河国家森林,下三一护林区,美国农业部森林服务局,邮政信箱 68,美国加利福尼亚州威洛溪 9 Spring Rivers 生态科学有限责任公司,美国加利福尼亚州卡塞尔 10 佛罗里达国际大学生物科学系,美国佛罗里达州迈阿密 11 普卢默斯国家森林,美国农业部森林服务局,美国加利福尼亚州昆西 12 美国地质调查局,国家野生动物健康中心,美国威斯康星州麦迪逊 13 Point雷耶斯野外站,美国地质调查局,西部生态研究中心,美国加利福尼亚州雷斯角站 14 尖峰国家公园,美国国家公园管理局,美国加利福尼亚州派辛斯 15 加州大学脊椎动物学博物馆,美国加利福尼亚州伯克利市 16 加州大学综合生物学系,美国加利福尼亚州伯克利市 17 塞拉利昂溪流研究所,美国加利福尼亚州内华达城 18 HELIX 环境规划公司,美国加利福尼亚州罗斯维尔 19 华盛顿州立大学生物科学学院,美国华盛顿州温哥华 20 美国农业部林务局太平洋西南研究站,美国加利福尼亚州阿克塔 21 旧金山州立大学生物系,美国加利福尼亚州旧金山 22 美国土地管理局中央海岸实地办事处,美国加利福尼亚州马里纳市 23 加州科学院爬虫学系,美国加利福尼亚州旧金山市
两栖动物在生态系统中非常重要,因为它可以在水和土地上生存。它们是高度进化的,并且在不同动物门中具有显着的再生能力。不同的两栖动物属在能量流中从小动物到大动物群的能量和营养物质的转移中起着重要作用。青蛙认为是自然的害虫控制器,而不会伤害生态系统中的任何人,维持生态平衡。有大量的青蛙物种在过去二十年(10 - 20年)中消失,而国际自然保护联盟(IUCN)则记录了许多威胁类别的物种。研究人员在过去几十年中确定的一个明显的原因是,由chytridiycomisosis感染性疾病是由chytrid真菌(batrachochochytrium dendrobatidis)引起的,负责全球两栖动物的人口下降。当不利的状况(冬季,干旱等)来了,两栖动物将它们自我视为在进化过程中在基因中编码的保护机制。在休眠期间,chytrid真菌在青蛙皮肤上生长并形成一件外套,并影响皮肤呼吸过程,因此供水切断并使其难以呼吸。一段时间后,青蛙面临脱水问题,然后死亡。在真菌感染之外,还有许多其他因素会导致青蛙种群下降,包括细菌和病毒疾病,栖息地破坏,污染和农药使用等。
入侵物种是现在发生在其自然范围之外并威胁着有价值的环境,农业,海洋和社会资源的物种。入侵物种包括杂草,陆地和海洋脊椎动物和无脊椎动物,以及引起疾病的生物。澳大利亚入侵物种的例子包括野猫,欧洲红狐狸,甘蔗蟾蜍,兔子,欧洲鲤鱼,chytrid真菌,默特尔锈病,默特尔锈,布法尔草和甘巴草。本地物种有时对我们的本地生物多样性也可能是有问题的 - 例如,嘈杂的矿工对其他林地鸟类社区的影响,袋鼠和袋鼠等本地过多的宏观动物的影响,以及长刺海盘对本地kelp森林的影响。侵入性和有问题的本地物种通过捕食来减少生物多样性,与本地物种竞争食物和栖息地的竞争,带来疾病以及以排除本地物种的方式改变物理环境。污染
范围非常限制。范围和数量都严重下降,并有望在持续的威胁(威胁物种科学委员会(TSSC)2013a)下继续下降。在2017年1月,野外的成年人口估计少于50个人,占用面积(AOO)估计为1 km 2(Hunter等人。2018),代表过去三代人(21岁)的地理分布减少99%。数量和地理分布的严重下降是由Batrachochytrium dendrobatidis真菌(以下简称“ Chytrid Fungus”)引起的。在没有目标干预的情况下,预计下降将继续下降。该物种具有高度的栖息地特异性,发生在七个位置,估计发生的(EOO)为60 km 2,AOO为1 km 2(Hunter未发表的数据,2012年在TSSC 2013a中引用)。现在在野外发生SCF的大多数区域都是重新引入地点(Hunter等人2018)。
Chytrid真菌胚层艾美艾尔(Emersonii)产生带有游泳尾巴的孢子(Zoospores);这些细胞可以感知并朝光线游动。对该物种的兴趣源于持续开发艾默生芽孢杆菌的努力,作为理解相关光遗传电路的光持续演变和分子细胞生物学的模型。在这里,我们报告了B. emersonii美国型培养物收藏品22665菌株的高度结合基因组组装和基因注释。我们在一个带有Illumina配对的基因组序列调查的PACBIO长阅读库中,导致组装21个重叠群,总计34.27 MB。使用这些数据,我们评估了编码基因的感觉系统的多样性。这些分析确定了G蛋白偶联受体,离子转运蛋白和核苷酸循环酶的丰富补体,所有这些都通过域重组和串联重复而多样化。在许多情况下,这些结构域的组合导致蛋白质结构域与跨膜结构域融合,将推定的信号传导与细胞膜绑定在一起。这种模式与B. emersonii感觉信号系统的多元化一致,后者可能在这种真菌的复杂生命周期中起着各种作用。