随着公共数据库中核基因组的增加,比较基因组学方法现在使用数百种基因组来分析物种多样性。许多研究着重于整个物种基因含量,即pangenome,以了解其在流行病学或环境数据方面的共同和可变基因方面的进化。在这种情况下,我们一直在研究基因组数据表示作为pangenome图。我们开发了用于重建和分配的pangenome重建和分区(Ppanggolin 1),基因组可塑性鉴定区域(PANRGP 2)和模块检测(PanModule 3)的方法。与Panorama一起,我们将实现新的方法论发展,以进行pangemenomes的比较研究。 将有助于研究细菌的适应潜力,并更好地了解微生物代谢多样性背后的进化动力学。与Panorama一起,我们将实现新的方法论发展,以进行pangemenomes的比较研究。将有助于研究细菌的适应潜力,并更好地了解微生物代谢多样性背后的进化动力学。
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在各种天然生态系统中,细菌最常生活在梗塞的状态下,该状态在自我生产的细胞外基质中形成生物膜。由于它们对我们日常生活的不同方面的负面影响或积极影响,专门研究生物膜的研究数量正在增加。大多数研究是基于单个细菌物种形成的生物膜。这些简单的模型允许理解涉及的生物膜的机制。这同样有助于开发几种控制生物膜形成的方法。然而,这些模型并未密切模仿自然生物膜,称为生化和微生物学上异质和动态结构。出于这个原因,当前的研究更多地集中于使用复杂模型的多物种生物膜,以最好地近似自然环境。在这篇综述中,我们介绍了不同领域中多物种生物膜的可用样本,以说明财团内生活的复杂性和组织。最后,我们回顾了研究多物种生物膜的最常用的分析技术,强调了需要多尺度策略以更好地破译这种复杂的生活方式。
tick传播的立克斯曲霉是由立克属的革兰氏阴性细菌引起的,构成了日益增长的全球威胁,各种节肢动物载体为它们的传播做出了贡献。了解壁虱微生物群中的复杂相互作用,包括立克氏症的作用,对于阐明立克疾病的动力学至关重要。在这里,我们研究了RH的Rickettsia的分类学概况和共发生网络。sanguineus sensus lato(s.l.)和RH。turanicus tick虫,揭示了立克群体的社区组成和局部连通性的显着差异。虽然这两个壁虱物种的微生物群都有共同的分类单元,但相对丰度和网络拓扑的明显差异表明了独特的生态壁ches。此外,鲁棒性分析表明对扰动的韧性有所不同,这表明网络组织的策略不同。我们的发现还强调了tick物种之间的代谢差异,这表明对立克相互作用的潜在影响。总体而言,这项研究提供了有关壁虱中复杂的微生物景观的见解,从而阐明了与立克相关的功能冗余和代谢途径,从而促进了我们对tick传播疾病的理解。
河流生态系统中的生物多样性丧失速度要比限制系统更快,更严重,并且需要空间保护和恢复计划来停止这种侵蚀。关于生物多样性和物种分布的状态和变化的可靠且高度解决的数据对于有效措施至关重要。的高分辨率图仍然有限。与全球卫星传感器的耦合数据具有广泛的环境DNA(EDNA)和机器学习可以实现河流生物分布的快速而精确的映射。在这里,我们研究了使用沿瑞士和法国Rhone River的110个地点的埃德纳数据集组合这些方法的潜力。使用Sentinel 2和Landsat 8图像,我们产生了一组生态变量,描述了河走廊周围的水生栖息地和陆地栖息地。我们将这些变量与基于EDNA的存在和29种鱼类的不存在数据相结合,并使用了三种机器学习模型来评估这些物种的环境适用性。大多数模型表现出良好的性能,表明从遥感中得出的生态变量可以近似鱼类分布的生态决定因素,但是水衍生的变量比河流周围的陆地变量具有更强的关联。物种范围的映射表明该物种沿着瑞士的物种占用物的显着转移,从其瑞士阿尔卑斯山的来源到法国南部的地中海出口。我们的研究消除了将遥感和EDNA结合到大河中物种分布的可行性。该方法可以扩展到任何大河以支持保护方案。
密歇根州的州长和立法机关每年从2015财政年度开始指定500万美元,并从2024年开始将其增加到700万美元,作为管理入侵物种影响的持续资金。最初的支持大大增强了密歇根州的侵入性物种计划,用于水生生物(水基)生物,并启动了针对陆地(陆基)物种的正式计划。2024年的资金增加了在460万英亩国家管理土地上管理入侵物种的能力。2015年的资金还启动了密歇根州入侵物种赠款计划,每年向机构,大学和非营利组织提供360万美元的奖励,以帮助预防,检测,消除和控制水生和地面入侵物种。MISGP的一部分专门用于为22个合作入侵物种管理领域或CISMAS的年度资金,以支持密歇根州83个县的当地领导的入侵物种计划。
•国防部(DOD)致力于改善对其不动产数据的监控。在2018年11月,我们发现DOD没有有效录制和报告数据,这导致不准确和不完整的房地产信息。10随后,国防部已定义并记录了对决策最重要的数据元素,并采用了部门范围的方法来改善其数据质量。此外,海军,空军和陆军改进了对各自的过程记录所有必需的房地产信息的监控。但是,国防部尚未优先考虑和协调军事服务,以确定填补空置不动产职位的机会。这有助于工作负载积压,并阻止了他们足够维护其不动产数据。
•专业知识:审稿人应了解北方公园法西里亚,法西里亚属或类似物种或生态系统的知识或经验。•独立性:审阅者不应雇用该服务。学术,咨询或政府科学家应具有足够的独立性。•客观性:审稿人应被其同龄人认可为客观,开放和周到。此外,审稿人应该愿意分享他或她的知识和观点,并公开识别他或她的知识差距。•利益冲突:审稿人不应有冲突或可能损害其客观性或创造不公平竞争优势的任何财务或其他利益。如果其他合格的审查员有不可避免的利益冲突,则该服务可能会公开披露冲突。虽然专业知识是主要的考虑因素,但该服务将选择同行评审者(但不限于这些选择),这些选择增加了与北公园Phacelia的物种状态评估报告相关的多样性科学观点。我们将不会为同行评审者提供经济补偿。我们将征求至少三位合格专家的评论。
∗作者感谢在2014年在Ascona举行的SURED会议,2014年在图卢兹举行的EEA-ESEM和2014年在西雅图的公共经济理论的参与者;巴黎大学奥斯特尔大学的研讨会2014年和美国国家环境研究研究所2018; Toyo University的2019年宏观综合研讨会;和国际公共财政研究所2020(实际上)。这项工作得到了Asahi Glass Foundation,JSPS Kakenhi Grant(JP15H05728,JP20H01477,JP20H05631)和社会和经济研究所的联合使用/研究中心(ISER),OSERSA,OSERSA的联合使用/研究中心的计划。电子邮件地址:ikefuji.masako.gn@u.tsukuba.ac.jp(ikefuji),ono@iser.osaka-u.osaka-u.ac.ac.jp(ono)。对应的auth:masako ikefuji。人文与社会科学学院,杜斯库巴大学,托努迪1-1-1,伊巴拉基,日本305-8571;大阪大学的伊萨(Iser),6-1 Mihogaoka,Ibaraki,大阪567-0047,日本