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在番茄植物中对葡萄球菌的抗性抗氯酸酯的抗性背后的分子事件
植物防御肽是挑战后分泌的最重要的内源性危险信号，增强了植物免疫反应。肽激素系统蛋白（SYS）显示出在几个植物病态的抗药性中参与抗药性，尽管当外源应用时，SYS诱导的抗性背后的机制仍然难以捉摸。，我们进行了蛋白质组学，代谢组和酶学研究，以破译在不存在或存在辣椒粉感染的情况下SYS诱导的番茄植物变化。系统处理触发了直接蛋白质组学重排，主要参与碳代谢和光合作用。但是，防御蛋白的最终诱导需要并发挑战，从而触发了靶向病原体的蛋白质。相反，在代谢水平上，经SYS处理的植物在一般启动曲线后显示出另一种行为。的液根代谢产物，类黄酮鲁丁和异戊烯素和两种生物碱与4-甲酸盐酸酯酶和Chalcone-Flavanone-异酮酶相关。 此外，蛋白质组学和酶促分析表明，SYS将主要代谢降低了可用的糖的生产，这可能会促进经SYS处理的植物中callo糖沉积的启动。此外，PR1在系统诱导的电阻中是关键元素。 总的来说，蛋白质的直接诱导和在经SYS处理的植物中的特定二级代谢产物的启动表明，翻译后蛋白质调节是针对坏死性真菌的启动的另一个组成部分。的液根代谢产物，类黄酮鲁丁和异戊烯素和两种生物碱与4-甲酸盐酸酯酶和Chalcone-Flavanone-异酮酶相关。此外，蛋白质组学和酶促分析表明，SYS将主要代谢降低了可用的糖的生产，这可能会促进经SYS处理的植物中callo糖沉积的启动。此外，PR1在系统诱导的电阻中是关键元素。总的来说，蛋白质的直接诱导和在经SYS处理的植物中的特定二级代谢产物的启动表明，翻译后蛋白质调节是针对坏死性真菌的启动的另一个组成部分。
使用
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在开发coprinoppis cinerea
摘要：confinopsis cinerea是真菌发育研究中使用的模型物种之一。这种形成蘑菇的基本菌真菌具有多个发展命运，以响应于改变的环境，并具有动态的生物体发展法规。尽管灰叶梭菌发育中的基因表达已经广泛地领导，但先前的研究仅集中在特定的阶段或真菌发育过程上。缺乏跨不同发育道路的全面观点，并且对生命周期中动态转录调节的全球观点和发展路径远非完整。此外，这种真菌中有关转录和后转录后修饰的知识仍然很少见。在这项研究中，我们在孢子发芽，营养生长，卵巢菌，硬化性菌根形成和成熟身体形成过程中调查了灰曲霉的转录变化和修饰，通过诱导有机体的不同发育路径，并使用高发射式序列序列序列序列序列方法来诱导转录组。在表达基因的身份和丰度中的过渡推动了生物体的生理和形态学改变，包括代谢和多细胞性构建。此外，进行了替代剪接和RNA编辑，并在C. c. c. c. c. c. c.这些修饰与基因的保护特征呈负相关，并且在真菌发育过程中可以为转录组提供额外的可塑性。我们建议C. cinerea在其发育调控中采用不同的分子策略，包括表达基因集的变化，遗传信息的多样化以及RNA分子的可逆差异。这种特征将在迅速变化的环境中提高真菌的适应性，尤其是在发展计划的过渡以及遗传和转录组差异的维持和平衡中。基因表达的多层调节网络是发育调控功能的分子基础。
CRISPR/Cas9 介导的 SlATG5 诱变降低番茄果实对灰葡萄孢的抗性
摘要：番茄果实在贮藏期间极易受到主要病原菌灰葡萄孢（B. cinerea）的侵染。最近的研究表明，自噬在植物防御生物和非生物胁迫中至关重要。自噬相关基因5（ATG5）在自噬体的完成和成熟中起关键作用，并被灰葡萄孢菌快速诱导，但ATG5在番茄采后果实抗灰葡萄孢菌中的潜在机制尚不清楚。为了阐明SlATG5在番茄果实抗灰葡萄孢菌中的作用，本研究采用CRISPR/Cas9介导的SlATG5敲除技术。结果表明，slatg5突变体对灰葡萄孢菌的感染更加敏感，病害症状更加严重，抗病酶几丁质酶（CHI）、β-1,3-葡聚糖酶（GLU）、苯丙氨酸解氨酶（PAL）、多酚氧化酶（PPO）等活性降低。此外，研究还观察到接种灰葡萄孢菌后，slatg5突变体中水杨酸（SA）信号相关基因SlPR1、SlEDS1、SlPAD4、SlNPR1的相对表达量高于WT，而茉莉酸（JA）信号相关基因SlLoxD和SlMYC2的相对表达量低于WT。这些结果表明，SlATG5 通过抑制 SA 信号通路和激活 JA 信号通路正向调控番茄果实对灰霉病菌的抗性反应。
预组装 Cas9 核糖核蛋白介导的基因缺失鉴定了灰盖菇中的碳分解代谢阻遏物及其靶基因
摘要 Cre1 是一种重要的转录因子，可调节碳分解代谢抑制 (CCR)，在真菌中广泛保守。cre1 基因已在几种子囊菌中得到广泛研究，而其在担子菌物种中基因表达调控的作用仍不太清楚。在这里，我们鉴定了 Coprinopsis cinerea 并研究了 cre1 的作用，Coprinopsis cinerea 是一种可以有效降解木质纤维素植物废物的担子菌模型蘑菇。我们使用一种基于 PCR 扩增的分裂标记 DNA 盒以及体外组装的 Cas9 引导 RNA 核糖核蛋白 (Cas9 RNPs) 的快速有效的基因缺失方法来生成 C. cinerea cre1 基因缺失菌株。两个独立的 C. cinerea cre1 突变体的基因表达谱显示碳水化合物代谢、植物细胞壁降解酶 (PCWDE)、质膜转运蛋白相关基因和几种转录因子编码基因等显著失调。我们的研究结果支持以下观点：与子囊菌中的报告一样，C. cinerea 的 Cre1 通过多种基因的联合调节来协调 CCR，包括 PCWDE、正向调节 PCWDE 的转录因子和可以导入可诱导 PWCDE 表达的单糖的膜转运蛋白。有些矛盾的是，虽然与其他伞菌一致，但与木质素降解相关的基因在 cre1 突变体中大多下调，表明它们受到的调节与其他 PCWDE 不同。基因缺失方法和此处提供的数据将扩展我们对担子菌中 CCR 的了解，并为与植物生物质降解相关的基因提供功能假设。