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在开发coprinoppis cinerea
摘要：confinopsis cinerea是真菌发育研究中使用的模型物种之一。这种形成蘑菇的基本菌真菌具有多个发展命运，以响应于改变的环境，并具有动态的生物体发展法规。尽管灰叶梭菌发育中的基因表达已经广泛地领导，但先前的研究仅集中在特定的阶段或真菌发育过程上。缺乏跨不同发育道路的全面观点，并且对生命周期中动态转录调节的全球观点和发展路径远非完整。此外，这种真菌中有关转录和后转录后修饰的知识仍然很少见。在这项研究中，我们在孢子发芽，营养生长，卵巢菌，硬化性菌根形成和成熟身体形成过程中调查了灰曲霉的转录变化和修饰，通过诱导有机体的不同发育路径，并使用高发射式序列序列序列序列序列方法来诱导转录组。在表达基因的身份和丰度中的过渡推动了生物体的生理和形态学改变，包括代谢和多细胞性构建。此外，进行了替代剪接和RNA编辑，并在C. c. c. c. c. c. c.这些修饰与基因的保护特征呈负相关，并且在真菌发育过程中可以为转录组提供额外的可塑性。我们建议C. cinerea在其发育调控中采用不同的分子策略，包括表达基因集的变化，遗传信息的多样化以及RNA分子的可逆差异。这种特征将在迅速变化的环境中提高真菌的适应性，尤其是在发展计划的过渡以及遗传和转录组差异的维持和平衡中。基因表达的多层调节网络是发育调控功能的分子基础。
使用
5。referênciasbibliográficasDean，R。等。分子植物病理学中的十大真菌病原体：前10个真菌病原体。分子植物病理学，第13卷，n。 4，第4页。 414–430，Maio 2012。Doyle，J.J。； Doyle，J。L.从新鲜组织中分离植物DNA。 重点，第12卷，第13-15页，1990年。 Fillinger，S。; Elad，Y。 （eds。）。 葡萄干 - 农业系统中的真菌，病原体及其管理。 CHAM：Springer International Publishing，2016年。 Garfinkel，A。R.葡萄干分类法的历史，系统发育学的兴起及其对物种识别的影响。 Phytopathology®，第111页，n。 3，第3页。 437–454，3月。 2021。 Giampieri，F。等。 草莓作为健康促进者：基于证据的审查。 食品与功能，第6卷，n。 5，p。 1386–1398，2015。 Kumari，S。等。 对肉豆蔻酸分离株中遗传和致病性变异性的分析。 微生物研究，第169页，n。 11，第1页。 862–872，11月。 2014。 Leroux，P。等。 氯蒂斯灰质性田间抗杀菌剂抗性的机制。 害虫管理科学，第58页，n。 9，第9页。 876–888，设置。 2002。 Messias，R。D。S.等。 与不同玉米品种的晶粒中高品质RNA分离。 制备生物化学和生物技术，第44页，n。 7，第7页。 697–707，3淘汰。 2014。 Wang，M。等。 双向交叉kingdom RNAi和外部RNA的真菌吸收植物保护。 自然植物，第2卷，n。 10，p。 16151，19集。Doyle，J.J。； Doyle，J。L.从新鲜组织中分离植物DNA。重点，第12卷，第13-15页，1990年。Fillinger，S。; Elad，Y。 （eds。）。 葡萄干 - 农业系统中的真菌，病原体及其管理。 CHAM：Springer International Publishing，2016年。 Garfinkel，A。R.葡萄干分类法的历史，系统发育学的兴起及其对物种识别的影响。 Phytopathology®，第111页，n。 3，第3页。 437–454，3月。 2021。 Giampieri，F。等。 草莓作为健康促进者：基于证据的审查。 食品与功能，第6卷，n。 5，p。 1386–1398，2015。 Kumari，S。等。 对肉豆蔻酸分离株中遗传和致病性变异性的分析。 微生物研究，第169页，n。 11，第1页。 862–872，11月。 2014。 Leroux，P。等。 氯蒂斯灰质性田间抗杀菌剂抗性的机制。 害虫管理科学，第58页，n。 9，第9页。 876–888，设置。 2002。 Messias，R。D。S.等。 与不同玉米品种的晶粒中高品质RNA分离。 制备生物化学和生物技术，第44页，n。 7，第7页。 697–707，3淘汰。 2014。 Wang，M。等。 双向交叉kingdom RNAi和外部RNA的真菌吸收植物保护。 自然植物，第2卷，n。 10，p。 16151，19集。Fillinger，S。; Elad，Y。（eds。）。葡萄干 - 农业系统中的真菌，病原体及其管理。CHAM：Springer International Publishing，2016年。 Garfinkel，A。R.葡萄干分类法的历史，系统发育学的兴起及其对物种识别的影响。 Phytopathology®，第111页，n。 3，第3页。 437–454，3月。 2021。 Giampieri，F。等。 草莓作为健康促进者：基于证据的审查。 食品与功能，第6卷，n。 5，p。 1386–1398，2015。 Kumari，S。等。 对肉豆蔻酸分离株中遗传和致病性变异性的分析。 微生物研究，第169页，n。 11，第1页。 862–872，11月。 2014。 Leroux，P。等。 氯蒂斯灰质性田间抗杀菌剂抗性的机制。 害虫管理科学，第58页，n。 9，第9页。 876–888，设置。 2002。 Messias，R。D。S.等。 与不同玉米品种的晶粒中高品质RNA分离。 制备生物化学和生物技术，第44页，n。 7，第7页。 697–707，3淘汰。 2014。 Wang，M。等。 双向交叉kingdom RNAi和外部RNA的真菌吸收植物保护。 自然植物，第2卷，n。 10，p。 16151，19集。CHAM：Springer International Publishing，2016年。Garfinkel，A。R.葡萄干分类法的历史，系统发育学的兴起及其对物种识别的影响。Phytopathology®，第111页，n。 3，第3页。 437–454，3月。2021。Giampieri，F。等。草莓作为健康促进者：基于证据的审查。食品与功能，第6卷，n。 5，p。 1386–1398，2015。Kumari，S。等。 对肉豆蔻酸分离株中遗传和致病性变异性的分析。 微生物研究，第169页，n。 11，第1页。 862–872，11月。 2014。 Leroux，P。等。 氯蒂斯灰质性田间抗杀菌剂抗性的机制。 害虫管理科学，第58页，n。 9，第9页。 876–888，设置。 2002。 Messias，R。D。S.等。 与不同玉米品种的晶粒中高品质RNA分离。 制备生物化学和生物技术，第44页，n。 7，第7页。 697–707，3淘汰。 2014。 Wang，M。等。 双向交叉kingdom RNAi和外部RNA的真菌吸收植物保护。 自然植物，第2卷，n。 10，p。 16151，19集。Kumari，S。等。对肉豆蔻酸分离株中遗传和致病性变异性的分析。微生物研究，第169页，n。 11，第1页。 862–872，11月。 2014。Leroux，P。等。氯蒂斯灰质性田间抗杀菌剂抗性的机制。害虫管理科学，第58页，n。 9，第9页。 876–888，设置。2002。Messias，R。D。S.等。与不同玉米品种的晶粒中高品质RNA分离。制备生物化学和生物技术，第44页，n。 7，第7页。 697–707，3淘汰。2014。Wang，M。等。 双向交叉kingdom RNAi和外部RNA的真菌吸收植物保护。 自然植物，第2卷，n。 10，p。 16151，19集。Wang，M。等。双向交叉kingdom RNAi和外部RNA的真菌吸收植物保护。自然植物，第2卷，n。 10，p。 16151，19集。2016。Wang，L。等。 在绿辣椒后果实中的辣椒粉的隔离和控制。 Scientia Horticulturae，第302页，第1页。 111159，以前。 2022。 Watanabe，M。等。 用珠磨削的快速有效的DNA提取方法可用于大量真菌DNA。 食品保护杂志，第73页，n。 6，第6页。 1077–1084，6月。 2010。 Weiberg，A。等。 真菌小RNA通过劫持宿主RNA干扰途径抑制植物免疫。 Science，第342节，n。 6154，p。 118–123，4淘汰。 2013。 Schenk，J。J.等。 “修改”的CTAB协议是什么？ 表征对CTAB DNA提取方案的修改。 植物科学中的应用，第11卷，n。 3，第3页。 E11517，Maio2023。 Silva，M。N. D.fretrçãodednagenômicode tecidos foliares maduros deespéciesnativas do cerrado。 Revistaárvore，第34页，n。 6，第6页。 973–978，Dez。 2010。Wang，L。等。在绿辣椒后果实中的辣椒粉的隔离和控制。Scientia Horticulturae，第302页，第1页。 111159，以前。2022。Watanabe，M。等。 用珠磨削的快速有效的DNA提取方法可用于大量真菌DNA。 食品保护杂志，第73页，n。 6，第6页。 1077–1084，6月。 2010。 Weiberg，A。等。 真菌小RNA通过劫持宿主RNA干扰途径抑制植物免疫。 Science，第342节，n。 6154，p。 118–123，4淘汰。 2013。 Schenk，J。J.等。 “修改”的CTAB协议是什么？ 表征对CTAB DNA提取方案的修改。 植物科学中的应用，第11卷，n。 3，第3页。 E11517，Maio2023。 Silva，M。N. D.fretrçãodednagenômicode tecidos foliares maduros deespéciesnativas do cerrado。 Revistaárvore，第34页，n。 6，第6页。 973–978，Dez。 2010。Watanabe，M。等。用珠磨削的快速有效的DNA提取方法可用于大量真菌DNA。食品保护杂志，第73页，n。 6，第6页。 1077–1084，6月。2010。Weiberg，A。等。真菌小RNA通过劫持宿主RNA干扰途径抑制植物免疫。Science，第342节，n。 6154，p。 118–123，4淘汰。 2013。 Schenk，J。J.等。 “修改”的CTAB协议是什么？ 表征对CTAB DNA提取方案的修改。 植物科学中的应用，第11卷，n。 3，第3页。 E11517，Maio2023。 Silva，M。N. D.fretrçãodednagenômicode tecidos foliares maduros deespéciesnativas do cerrado。 Revistaárvore，第34页，n。 6，第6页。 973–978，Dez。 2010。Science，第342节，n。 6154，p。 118–123，4淘汰。2013。Schenk，J。J.等。 “修改”的CTAB协议是什么？ 表征对CTAB DNA提取方案的修改。 植物科学中的应用，第11卷，n。 3，第3页。 E11517，Maio2023。 Silva，M。N. D.fretrçãodednagenômicode tecidos foliares maduros deespéciesnativas do cerrado。 Revistaárvore，第34页，n。 6，第6页。 973–978，Dez。 2010。Schenk，J。J.等。“修改”的CTAB协议是什么？表征对CTAB DNA提取方案的修改。植物科学中的应用，第11卷，n。 3，第3页。 E11517，Maio2023。Silva，M。N. D.fretrçãodednagenômicode tecidos foliares maduros deespéciesnativas do cerrado。Revistaárvore，第34页，n。 6，第6页。 973–978，Dez。2010。
CRISPR/Cas9 介导的 SlATG5 诱变降低番茄果实对灰葡萄孢的抗性
摘要：番茄果实在贮藏期间极易受到主要病原菌灰葡萄孢（B. cinerea）的侵染。最近的研究表明，自噬在植物防御生物和非生物胁迫中至关重要。自噬相关基因5（ATG5）在自噬体的完成和成熟中起关键作用，并被灰葡萄孢菌快速诱导，但ATG5在番茄采后果实抗灰葡萄孢菌中的潜在机制尚不清楚。为了阐明SlATG5在番茄果实抗灰葡萄孢菌中的作用，本研究采用CRISPR/Cas9介导的SlATG5敲除技术。结果表明，slatg5突变体对灰葡萄孢菌的感染更加敏感，病害症状更加严重，抗病酶几丁质酶（CHI）、β-1,3-葡聚糖酶（GLU）、苯丙氨酸解氨酶（PAL）、多酚氧化酶（PPO）等活性降低。此外，研究还观察到接种灰葡萄孢菌后，slatg5突变体中水杨酸（SA）信号相关基因SlPR1、SlEDS1、SlPAD4、SlNPR1的相对表达量高于WT，而茉莉酸（JA）信号相关基因SlLoxD和SlMYC2的相对表达量低于WT。这些结果表明，SlATG5 通过抑制 SA 信号通路和激活 JA 信号通路正向调控番茄果实对灰霉病菌的抗性反应。
在番茄植物中对葡萄球菌的抗性抗氯酸酯的抗性背后的分子事件
植物防御肽是挑战后分泌的最重要的内源性危险信号，增强了植物免疫反应。肽激素系统蛋白（SYS）显示出在几个植物病态的抗药性中参与抗药性，尽管当外源应用时，SYS诱导的抗性背后的机制仍然难以捉摸。，我们进行了蛋白质组学，代谢组和酶学研究，以破译在不存在或存在辣椒粉感染的情况下SYS诱导的番茄植物变化。系统处理触发了直接蛋白质组学重排，主要参与碳代谢和光合作用。但是，防御蛋白的最终诱导需要并发挑战，从而触发了靶向病原体的蛋白质。相反，在代谢水平上，经SYS处理的植物在一般启动曲线后显示出另一种行为。的液根代谢产物，类黄酮鲁丁和异戊烯素和两种生物碱与4-甲酸盐酸酯酶和Chalcone-Flavanone-异酮酶相关。 此外，蛋白质组学和酶促分析表明，SYS将主要代谢降低了可用的糖的生产，这可能会促进经SYS处理的植物中callo糖沉积的启动。此外，PR1在系统诱导的电阻中是关键元素。 总的来说，蛋白质的直接诱导和在经SYS处理的植物中的特定二级代谢产物的启动表明，翻译后蛋白质调节是针对坏死性真菌的启动的另一个组成部分。的液根代谢产物，类黄酮鲁丁和异戊烯素和两种生物碱与4-甲酸盐酸酯酶和Chalcone-Flavanone-异酮酶相关。此外，蛋白质组学和酶促分析表明，SYS将主要代谢降低了可用的糖的生产，这可能会促进经SYS处理的植物中callo糖沉积的启动。此外，PR1在系统诱导的电阻中是关键元素。总的来说，蛋白质的直接诱导和在经SYS处理的植物中的特定二级代谢产物的启动表明，翻译后蛋白质调节是针对坏死性真菌的启动的另一个组成部分。
预组装 Cas9 核糖核蛋白介导的基因缺失鉴定了灰盖菇中的碳分解代谢阻遏物及其靶基因
摘要 Cre1 是一种重要的转录因子，可调节碳分解代谢抑制 (CCR)，在真菌中广泛保守。cre1 基因已在几种子囊菌中得到广泛研究，而其在担子菌物种中基因表达调控的作用仍不太清楚。在这里，我们鉴定了 Coprinopsis cinerea 并研究了 cre1 的作用，Coprinopsis cinerea 是一种可以有效降解木质纤维素植物废物的担子菌模型蘑菇。我们使用一种基于 PCR 扩增的分裂标记 DNA 盒以及体外组装的 Cas9 引导 RNA 核糖核蛋白 (Cas9 RNPs) 的快速有效的基因缺失方法来生成 C. cinerea cre1 基因缺失菌株。两个独立的 C. cinerea cre1 突变体的基因表达谱显示碳水化合物代谢、植物细胞壁降解酶 (PCWDE)、质膜转运蛋白相关基因和几种转录因子编码基因等显著失调。我们的研究结果支持以下观点：与子囊菌中的报告一样，C. cinerea 的 Cre1 通过多种基因的联合调节来协调 CCR，包括 PCWDE、正向调节 PCWDE 的转录因子和可以导入可诱导 PWCDE 表达的单糖的膜转运蛋白。有些矛盾的是，虽然与其他伞菌一致，但与木质素降解相关的基因在 cre1 突变体中大多下调，表明它们受到的调节与其他 PCWDE 不同。基因缺失方法和此处提供的数据将扩展我们对担子菌中 CCR 的了解，并为与植物生物质降解相关的基因提供功能假设。
植物
摘要：研究表观遗传调控与抗生物胁迫之间的关系为植物保护和作物改良提供了替代方法。为了阐明番茄对灰葡萄孢菌的反应机制，我们进行了染色质免疫沉淀 (ChIP) 分析，结果显示沿着早期诱导基因 SlyDES、SlyDOX1 和 SlyLoxD（编码氧化脂质途径酶）以及 SlyWRKY75（编码激素信号转录调节剂）的 H3K9ac 标记增加。这种组蛋白标记比之前研究的 H3K4me3 分布更为明显。RNAPol-ChIP 分析反映了与组蛋白修饰增加相关的实际基因转录。抗 P. syringae 的氧化脂质相关基因中标记的不同模式支持病原体特异性谱，而 SlyWRKY75 中没有出现显著差异。内含子结合 miR1127-3p 对 SlyWRKY75 的表观遗传调控得到了对照植物中 SlyWRKY75 前 mRNA 存在的支持。有趣的是，研究发现，在 B. cinerea 和 P. syringae 的响应下，mRNA 会积累，而 miRNA 的减少只发生在 B. cinerea 上。内含子区域呈现出与两种致病系统中的基因其余部分相似的标记模式，B. cinerea 上的 miRNA 结合位点的 H3K4me3 除外。我们定位了编码 Sly-miR1127-3p 的基因，该基因在 B. cinerea 的启动子上呈现出降低的 H3K4me3。
葡萄灰霉病
葡萄（Vitis vinifera L.）是世界主要水果作物之一。葡萄的生产受到许多疾病的严重影响，包括由死体真菌灰葡萄孢引起的灰霉病。虽然所有葡萄属物种都可以成为灰葡萄孢的宿主，但葡萄属葡萄孢特别容易感染。因此，这种疾病对葡萄产业构成了重大威胁，并造成了巨大的经济损失。抗性葡萄属葡萄品种的开发已经从农民的偶然选择发展到通过使用统计和实验设计的有针对性的选择，再到使用遗传和基因组数据。标记辅助选择和基因工程等新兴技术促进了对灰葡萄孢具有抗性的品种的开发。一种有前途的方法是使用 CRISPR/Cas9 系统诱导定向诱变并开发转基因非转基因作物。因此，科学家现在正积极寻求识别与易感性和抗性相关的基因。本综述重点介绍 B. cinerea 病原体与其葡萄寄主之间的已知相互作用机制。它还探讨了 V. vinifera 中进化的先天免疫系统，目的是促进抗性葡萄品种的快速发展。
使用单层和双层琼脂生物测定
幼虫菌来自昆虫的幼虫，包括幼虫粪便，外骨骼和未消化的饮食，是有机物质和微生物的丰富来源。 尽管具有潜在的价值，但对农业中的弗拉和价值研究是有限的。 In this study, single-layer agar (SLA) and double-layer agar (DLA) in vitro bioassays were conducted to evaluate the effect of water-based black soldier fly larvae (BSFL) frass extracts from two different diets on the growth of six plant pathogens: Alternaria solani , Botrytis cinerea , Fusarium oxysporum , Phytophthora capsici , Rhizoctonia solani和Sclerotinia sclerotiorum。 The results showed that frass extract from Gainesville house fly diet strongly or completely inhibited the growth of all tested plant pathogens in both SLA and DLA bioassays, while frass extract from fruit/vegetable/bakery/brewery diet strongly inhibited the mycelial growth of A. solani , B. cinerea , and S. sclerotiorum , and moderately inhibited the mycelial growth of P. capsici in both生物测定。 在饮食和生物测定中，不含微生物的0.22μm微过滤器提取物通常对病原体的生长没有影响，表明生长抑制是由Frass植入的微生物引起的。 SLA和DLA生物测定都揭示了居住在BSFL FRASS对植物病原体的微生物的强烈拮抗作用。 此外，该研究表明了BSFL饮食对FRASS提取物的拮抗作用的影响。 在未来的工作中，将在体内测试FRASS提取物对上述病原体的拮抗作用。幼虫菌来自昆虫的幼虫，包括幼虫粪便，外骨骼和未消化的饮食，是有机物质和微生物的丰富来源。尽管具有潜在的价值，但对农业中的弗拉和价值研究是有限的。In this study, single-layer agar (SLA) and double-layer agar (DLA) in vitro bioassays were conducted to evaluate the effect of water-based black soldier fly larvae (BSFL) frass extracts from two different diets on the growth of six plant pathogens: Alternaria solani , Botrytis cinerea , Fusarium oxysporum , Phytophthora capsici , Rhizoctonia solani和Sclerotinia sclerotiorum。The results showed that frass extract from Gainesville house fly diet strongly or completely inhibited the growth of all tested plant pathogens in both SLA and DLA bioassays, while frass extract from fruit/vegetable/bakery/brewery diet strongly inhibited the mycelial growth of A. solani , B. cinerea , and S. sclerotiorum , and moderately inhibited the mycelial growth of P. capsici in both生物测定。在饮食和生物测定中，不含微生物的0.22μm微过滤器提取物通常对病原体的生长没有影响，表明生长抑制是由Frass植入的微生物引起的。SLA和DLA生物测定都揭示了居住在BSFL FRASS对植物病原体的微生物的强烈拮抗作用。此外，该研究表明了BSFL饮食对FRASS提取物的拮抗作用的影响。在未来的工作中，将在体内测试FRASS提取物对上述病原体的拮抗作用。BSFL Frass最终可以找到控制植物疾病的应用。
海藻糖和味精对冻干过程中酵母活力的保护作用及拮抗作用
摘要 在当今生态意识强烈的时代，消费者选择的食物反映了道德和环境问题，这增加了对有机产品的需求。生物防治是有机农业中可行的植物保护方法。冷冻干燥是一种长期保存微生物的技术，可确保其遗传稳定性和生存能力。为了减少冷冻干燥对细胞的损害，使用海藻糖和味精等冷冻保护剂。本研究评估了在冷冻干燥过程中添加这些物质对所选酵母分离物的生存能力、它们在番茄叶片上存活的能力以及保持对抗灰葡萄孢菌的拮抗特性的影响。在温室条件下，在冷冻干燥过程之前和之后，对酵母分离物 114/73（Wickerhamomyces anomalus EC Hansen）和 117/10（Naga nishia albidosimilis Vishniac & Kurtzman）在番茄植株上进行了测试，以了解其在叶片上定植的能力以及作为 B. cinerea 的预防和干预治疗。在体外评估了冷冻干燥后的酵母活力。海藻糖和谷氨酸钠均在冷冻干燥过程中提高了酵母活力。活力不是很高（117/10 从 30.33% 到 36.17%，114/73 从 10.67% 到 16.5%）。冷冻干燥后脱水的酵母用海藻糖和谷氨酸钠保护，在番茄叶片上显示的菌落数与冷冻干燥前相同。保护性治疗的效果取决于酵母分离物、冻干过程中使用的保护性物质、治疗时机（预防与干预）以及这些因素之间的相互作用。冷冻保存的分离物 117/10 的效果优于添加海藻糖或谷氨酸钠的 114/73，将疾病严重程度指数从 88.3%（对照）降低至 18.75 - 55.33%。预防性治疗比干预更有效。酵母分离物在冻干后对灰葡萄孢菌的叶片定殖能力和生物防治效果为可持续农业提供了有希望的解决方案。然而，可能需要进一步研究，以分析各种因素之间的相互作用并优化策略。
在选定的高架城市...
在许多城市城市中，低层和高层城市居住建筑中的屋顶花园在许多城市城市中很常见，因为它们的美学价值和对建筑物居民的健康益处。这些花园中植物群落的叶子垃圾提供合适的微气候条件和底物，可以支持粘霉菌的生长和发育。粘菌丝，也称为粘液模具，在维持土壤微生物组中发挥作用，并可能影响这些住宅花园中的微生物群落。在这项研究中，从八座低至高层建筑物的高架花园中收集了观赏木灌木和草本开花植物的204个地面叶子垃圾样品，以制备湿室（MC）。在这项研究中记录并鉴定了总共14种属于9属属的粘菌素：Arcyria cinerea，collaria arcyrionema，diachea leucopodia，diderma fefusum，diderma hemisphaericum，didemamium nigripes，didymium nigripes，didymium sp。，didymium squamulosum，ophiotheca chrysperma，perichaena cf。Corticalis，Perichaena DePressa，Physarum Album，Physarum Cinereum和Stememonitis cf。pallida。总体MC生产率为43％至45％。在物种丰度方面，灰烬和佩里奇纳（Perichaena）depressa是最记录的粘菌菌之一。这项研究提供了屋顶花园作为粘霉菌的合适栖息地的证据。