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液相色谱 - 潮流质谱测定法，用于在药物相互作用的临床背景下，人血浆中CDK4/6抑制剂定量
Fanny Leenhardt，Matthieu Gracia，Catherine Perrin，Claudia Muracciole-Bich，BénédicteMarion等。液相色谱 - 潮流质谱测定法，用于在药物相互作用的临床背景下人类血浆中CDK4/6抑制剂定量。药物和生物医学分析杂志，2020，188，pp.113438。10.1016/j.jpba.2020.113438。HAL-03003807V2
关于建立因果关系，治疗应用和在微生物组研究中使用临床前模型的共识陈述
肠道微生物组包括数万亿微生物，并通过调节代谢，免疫反应和神经元功能来深刻影响人类健康。肠道微生物组组成中的破坏与各种炎症状况，代谢性疾病和神经退行性疾病有关。但是，确定基本机制和建立原因和效力非常困难。临床前模型为肠道微生物组在疾病中的作用提供了重要的见解，并有助于鉴定潜在的治疗干预措施。人类微生物组的行动联盟启动了Delphi调查，以评估包括动物和基于细胞模型在内的临床前模型的实用性，以阐明肠道微生物组在这些疾病中的因果作用。Delphi调查旨在解决选择适当的临床前模型以有效研究疾病因果关系并有效研究宿主 - 微生物组相互作用的复杂性。我们采用了一种结构化方法，其中包括文献综述，专家研讨会和德尔福问卷，以收集来自各种利益相关者的见解。要求专家评估这些模型在解决肠道微生物组与疾病发病机理之间因果关系方面的优势，局限性和适用性。由此产生的共识陈述和建议为在肠道微生物组相关疾病的未来研究中选择临床前模型提供了宝贵的见解。
解密温度与免疫之间的关系法国临床宏基因组学的性能
Methods In this observational study, we prospectively performed short-read shotgun metagenomics analysis as a second-line test (in cases of negative first-line test or when the symptoms were not fully explained by initial positive results) or as a first-line test in life-threatening situations requiring urgent non-targeted pathogen identification at the Necker-Enfants Malades Hospital (Paris, France).包括所有样本类型，临床适应症和患者人群。样品伴随着由高级临床医生或病理学家填写的强制性表格，该临床临床水平的可疑感染（定义为高或低）。我们使用多元逻辑回归中的优势比（ORS）评估了与MNGS病原体检测相关的变量（性别，年龄，免疫状态，感染的初始怀疑，指示和样本类型）。使用特定的PCR或培养技术进行了其他研究，以确认MNGS的阳性结果，或者尽管MNG造成阴性，但传染性怀疑何时特别高。
临床数据仓库的大脑T1加权磁共振图像的自动质量控制
图1：来自临床数据仓库和Correponding标签的T1W脑图像的示例。a1：质量高的图像（第1层），没有gadolinium； A2：质量高（第1层），带有Gadolinium； B1：中等质量（第2层），没有Gadolinium（噪声1级）； B2：中等质量（第2层），带有Gadolinium（对比1级）； C1：不良质量（第3层），没有gadolinium（对比2级，运动2级）； C2：不良质量（第3层），gadolinium（对比2级，运动级1级）； D1：笔直排斥（分段）； D2：直接拒绝（裁剪）。
CD44，MMP-2和MMP-9表达在透明细胞肾细胞癌中的预后和临床病理学意义
认为，在包括RCC在内的几种人类恶性肿瘤中，一个被称为癌细胞细胞（CSC）的子集具有自我更新和保留肿瘤生长的能力[3，4，9]。CSC已知与癌症的初始进展，转移和最终复发密切相关[3,4,10,11]。此外，CSC对许多化学治疗剂具有抗药性，因此，消除CSC在癌症治疗中至关重要[3,9,9,12,13]。最近的研究表明，在几种恶性肿瘤中，CD44可以用作CSC标记[3，4]。CD44是一种多功能的I类跨膜蛋白，充当透明质酸的特定受体。它在各种细胞过程中起作用，包括聚集，增殖，迁移和激活以及生长因子的呈现[9，14]。较高水平的CD44表达与多种类型的癌症中的肿瘤浸润，进展和转移有关。在肾脏癌中，CD44表达也被修饰，并已被认为是潜在的预后标记，尽管它在肾细胞癌（RCC）中的预后意义仍在争论中[1，6]。基质金属蛋白酶（MMP）是25个以上超过25个内肽酶降解细胞外基质和基底膜的集合，裂解生长因子，细胞酮以及与细胞表面相关的粘附和信号受体。特别是MMP-2和MMP-9具有降解IV型胶原蛋白的能力，这是基底膜的主要成分。这两个MMP也与肿瘤细胞的恶性表型有关[15，16]。除了它们的侵入性功能外，MMP在细胞增殖和血管生成中也有所影响[17]。因此，MMPS增强了肿瘤的生长和肿瘤性。基于这些特征，越来越多的研究考虑了MMP在各种恶性肿瘤中的病理意义，并表明MMP-2和MMP-9对于评估CCRCC的预后可能很有价值[15，16，18，19]。这项研究旨在分析CCRCC中CD44，MMP-2和MMP-9的免疫组织化表达，并检查与临床病理学参数的关联，并对患者的存活产生影响。这可能有助于阐明与CCRCC的细胞性质有关的可能机制，并确定将来这些标记物在靶向疗法中的潜在效用。
在临床试验中对不良事件报告的系统审查，导致批准有针对性的治疗和免疫疗法
对抗癌治疗的管理风险的详细知识对于多个利益相关者，包括监管机构，临床研究人员，医师，当然 - 患者1。大约二十年前，美国临床肿瘤学会健康研究委员会的成果工作组将毒性定义为非常重要的结果，其中包括用于技术评估和开发癌症治疗指南2。实际上，与抗癌药物给药相关的频率，持续时间和严重程度（AE）的完整准确描述对于对其风险 /福利概况的知情评估至关重要。根据现代的基于证据的临床实践的概念，患者与医生在与治疗相关的福利和风险之间进行详尽的沟通可确保在决策中充分考虑患者的偏好，并且对于最佳护理至关重要。在新批准的治疗情况下，有关不良事件的信息基本上是基于关键临床试验的报告。出版物中可用的毒性的次优报告和描述可能会大大影响其负担的绝对估计，这对于适用试验的高度相关信息在临床实践中的适用性高度相关，尤其是对于新药。近年来，研究人员的AE报告通过常见的不良事件术语标准（CTCAE）对AE进行了编码和分级，一直是对患者的治疗危害的最常用方法4。毫无疑问，CTCAE的广泛采用代表了毒性报告的标准化和协调5。但是，需要大大改善几个方面。首先，众所周知，当报告专门根据医师的记录1,6时，许多主观毒性的风险有低于报告的风险。为了减少这种不足的报道，将患者报告结果整合到AES描述中的科学兴趣正在增长1。一种综合方法，患者直接报告有症状的毒性信息，可以真正提高报告的效率7。第二，与传统化学疗法的不同，这种疗法通常是针对有限数量的周期进行的，许多新批准的肿瘤学（包括靶向疗法和免疫疗法）的许多药物经常进行直到疾病进展，通常数月，有时也持续了多年。使用这些药物，根据对每个患者经历的最差毒性等级的描述，通常的报告不适合完全捕获耐受性概况8。因此，随着时间的推移，毒性的完整描述应充分考虑到发生毒性，其持续时间和修饰（改善或恶化）的时间：即使是低度毒性影响，尤其是在长期持久的情况下，也会对生活质量质量产生相关的影响9。第三，与数据收集质量无关，毒性报告在出版物10,11中提出的数据的完整性方面可以是最佳的。在试验期间，AES上的数据收集通常受到限制。部分由于大多数科学期刊施加的长度限制，摘要中包含的信息通常不完整。此外，即使在同一期刊中，在不同出版物之间，毒性数据的呈现方式也是高度异质的。这项系统评价的目的是描述AE在实体肿瘤中测试新药（分子靶向剂和免疫疗法）的关键临床试验出版物中的报告质量。
临床癌症管理中的免疫监视
f i g u r e 2化学疗法，放射治疗和靶向抗癌药的有益免疫作用。几种临床使用的抗癌治疗，包括经典化学治疗剂，至少在某些情况下，局灶性放射治疗和选择的靶向抗癌药可以通过三种一般机制来介导有益的免疫作用：（1）通过在癌细胞中诱导免疫细胞死亡（ICD），这与多种免疫剂的发射有关，这与癌细胞相关。 （2）通过抑制或耗尽免疫抑制细胞群体，包括调节性T（T Reg）细胞，很大一部分与肿瘤相关的巨噬细胞（TAM）和髓样衍生的抑制细胞（MDSC）；或（3）通过促进免疫效应细胞的激活，例如细胞毒性T淋巴细胞（CTL），这些细胞（CTL）识别出恶性细胞，这些细胞在MHC I类分子上呈现特定肿瘤相关的抗原（TAAS），并通过其T -Cell受体（TCR）（TCR）（TCR）对其进行反应，并通过产生效应效应分子，例如Inrolecules，例如Inrolegn，例如Interfeor，例如Inroven GAN，例如InroveNGAN，例如InroveNGAN，例如InroveNGAN，例如Inrofefors inserforefeanga。ATP，三磷酸腺苷； Calr，钙网蛋白； CXCL10，C -X -C基序趋化因子配体10; HMGB1，高移动性组框1； IFN，干扰素； MHC，主要的组织相容性复合物。ATP，三磷酸腺苷； Calr，钙网蛋白； CXCL10，C -X -C基序趋化因子配体10; HMGB1，高移动性组框1； IFN，干扰素； MHC，主要的组织相容性复合物。
促进临床文本的表型：Medkit库
摘要：表型包括应用算法来识别与特定，潜在复杂，性状或条件相关的个人，通常是从电子健康记录（EHRS）集合中的。由于EHR的许多临床信息都在文本中，因此文本的表型在依赖EHR的次要使用的研究中起着重要作用。但是，临床文本的内容和形式的异质性和高度专业化的方面使这项任务特别繁琐，并且是观察研究中时间和成本限制的来源。为了促进表型管道的开发，评估和可重复性，我们开发了一个名为MED KIT的开源Python库。它可以启用由易于重复使用软件砖制成的数据处理管道，名为MedKit Operations。除了图书馆的核心外，我们还共享我们已经开发的运营和管道，并邀请表型社区重新使用和丰富。
分析临床MRI研究中使用的样本量
尽管如此，临床MRI研究的计划面临着几个挑战，最值得注意的是样本量计划，必须在研究开始之前进行。必须在道德委员会和资金机构面前捍卫这项前研究计划。因此，这对于研究的成功至关重要。太小的样本量可能无法达到统计确定性。也应避免样本量，尤其是出于道德原因，因为MRI研究给经常患有严重疾病的患者增加了扫描时间的负担。此外，花费超过必要的资源在环境和经济上是有问题的[3]，可能会耗尽医疗专业人员的工作时间。这可能是尤其具有挑战性的，因为“医疗保健劳动力短缺是许多国家的医疗保健系统面临的最大，最紧迫的挑战” [4]。
plasmamatch：旨在评估
次要结果度量1。临床利益率和无进展生存率（PFS），定义为完全/部分反应或稳定疾病，由recist v1.1至少持续24周定义。PFS将从进入治疗队列的日期到第一次根据RECIST标准或死亡确认进行性疾病的日期。2。使用NCI CTCAE v4.0 3。响应持续时间是从第一个记录恢复完整 /部分响应（以第一个状态记录为准）到第一次复发或进行性疾病的第一个日期，从而衡量的持续时间。4。< /div>在CTDNA筛查中鉴定出的突变频率以及进入治疗成分的可靶向突变患者的比例5。ctDNA突变状态与进入治疗成分的患者的组织突变状态之间的一致性6。在第2-4天和队列B评估的队列中的药代动力学评估1-4天1