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使用原代人
由KatharinaGötze教授领导的研究小组在TechnischeUniversitätmünchen的肿瘤学/血液学系目前正在寻找实习的硕士学生（3月至4月），然后是我们实验室的硕士学位论文（May-Nov）。背景：造血干/祖细胞（HSPC）位于骨髓中，并通过称为造血的过程负责血细胞的产生。在一生中，这些细胞积累了突变，其中大多数是乘客，没有任何功能后果。然而，某些突变会触发克隆扩张，这是一个逐渐发展的过程，随着时间的流逝而发展，导致血液学疾病，例如骨髓增生性综合征（MDS）和急性髓性白血病（AML）。我们专注于称为不确定电势克隆造血症（CHIP）的克隆造血的前阶段。CHIP的特征是在没有血液学疾病迹象的个体中，具有变异等位基因频率大于2％的HSPC中存在体细胞突变，但进展到髓样恶性肿瘤的风险增加。MDS和AML的病理生理受到来自BM微环境的细胞中性（HSPC）和外在信号的影响，该信号提供了支持突变克隆扩展的各种细胞类型的网络。芯片中是否也是这种情况。
克隆造血作为2型糖尿病的新风险因素，患有高胆固醇血症患者
结果：在总受试者中，有635（15.7％）有芯片。在5。1年的中位随访期间，芯片携带者的新发病率的发生率明显高于没有芯片的受试者（11.8％vs. 9.1％，p = 0.039）。在单变量分析中，CHIP显着增加了新发糖尿病的风险（HR 1.32，95％CI 1.02-1.70，p = 0.034），但在多变量分析中，这并不明显。根据LDL胆固醇水平差异的新发作糖尿病风险。在高LDL胆固醇血症组中，CHIP显着增加了糖尿病的风险（HR 1.64，95％CI CI 1.09–2.47，p = 0.018），但并没有增加非Hyper-LLDL胆固醇血症组的风险。具有CHIP和高LDL-胆固醇血症的受试者的糖尿病风险大约是没有芯片和低LDL胆固醇的受试者的两倍（HR 2.05，95％CI 1.40-3.00，P <0.001）。
利用 CRISPR-Cas9 进行基因编辑的液滴和利用水凝胶进行克隆选择改进
1 阿根廷布宜诺斯艾利斯国立科技大学 IREN 中心，B1706EAH；camilo.bm91@gmail.com（CP-S.）；pvallejoj@gmail.com（APV-J.）2 布宜诺斯艾利斯大学（UBA）生物医学工程研究所，布宜诺斯艾利斯 C1063ACV，阿根廷 3 智能肿瘤学合作研究所（CRIION），Hermann-Herder-Straße 4，79104 弗莱堡，德国 4 佛罗里达国际大学电气与计算机工程系，佛罗里达州迈阿密 33174，美国； sbhansali@gmail.com 5 国家科学技术研究委员会——对抗儿童神经系统疾病基金会，(LIAN-CONICET-FLENI)，FLENI Sede Escobar, Ruta 9 Km 53, Belén de Escobar, Buenos Aires B1625XAF, 阿根廷； smiriuka@fleni.org.ar * 通讯：maxperez@fiu.edu (MSP)； belerner@fiu.edu (BL)
多能性景观的无偏分析揭示了克隆命运偏差的空间调节因素
尽管 Ptch1 编辑导致祖细胞重新偏向或由于 Hedgehog 通路的功能获得而导致谱系进展严重中断，但针对其他受体可能会导致以更微妙的方式调整克隆组成。我们专注于躯干神经嵴，它一直被热议为是受限制祖细胞的混合群体，还是高度多能干细胞的群体 [39-42]。野生型胚胎的克隆变异分析显示 375
克隆进化的数学模型为高风险神经母细胞瘤提出了个性化的多模式治疗
简单总结：神经母细胞瘤是一种罕见的癌症，通常影响儿童。高风险患者的预期生存率不到 50%。原因之一是标准治疗方案缺乏精确性：一刀切的多模式治疗。本文介绍的研究旨在通过优化诱导化疗期间两种化疗药物（长春新碱和环磷酰胺）的使用来解决这一缺陷。诱导化疗是方案的一部分，可在手术切除前缩小原发肿瘤。我们结合了数学模型和优化算法，为具有不同初始肿瘤组成的虚拟患者群体确定最佳化疗方案。我们的研究结果揭示了利用具有不同疗效水平的一对药物的新策略，为个性化诱导化疗提供了平台，并为利用靶向疗法、多区域测序、液体活检和现代计算方法来改善当今的多模式治疗的个性化治疗奠定了基础。
药物治疗同质癌细胞后出现不同的克隆命运
重印和许可信息可在 http://www.nature.com/reprints 上找到。通信和材料请求应发送至 Yogesh Goyal 或 Arjun Raj。yogesh.goyal@northwestern.edu；arjunrajlab@gmail.com。作者贡献 YG 和 AR 构思并设计了这个项目。YG 设计、执行和分析了所有实验，由 ARMP 监督，GTB 和 EIG 协助 YG 进行 FateMap 实验和分析。RHB、PTR、JL 和 MP 协助 YG 进行批量 RNA-seq 实验和分析。MP 根据 YG 和 ARIPD 的意见对修订进行了特定分析，GTB、SSA、EIG、MCD 和 CC 协助 YG 进行组织切片以及自动 RNA FISH 和 DAPI 扫描和分析。YG、BE 和 KK 设计并优化了 PCR“副反应”引物，以从 scRNA-seq 文库中恢复条形码。 RHB、GTB 和 JL 提取了 gDNA 用于 WGS 实验，NB 在 YG 的输入下进行了 WGS 分析，ARAK 协助 YG 设计和实施球体实验。GTB、NJ、JL、JB、MP 和 IAM 协助 YG 准备条形码库并完成计算流程。YG 设计了小鼠条形码实验，DF、HL、YC、GMA 和 MEF 在 YG、MH、AR 和 ATWYG 的输入下进行了小鼠实验，GTB 为小鼠实验准备了条形码库。MC、RHB、RGW、RL、DRI、SBJ、KW、MP、AJL 和 JAW 在 YG 和 ARYG 的输入下进行了人类患者实验和分析，GTB 和 EIG 准备了本研究中使用的所有插图。YG 和 AR 在所有作者的帮助下撰写了手稿。
人类胰腺导管腺癌中的克隆异质性及其对肿瘤进展的影响
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2025年2月15日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637729 doi：Biorxiv Preprint
克隆进化的数学模型提出了针对高危神经母细胞瘤的个性化多模式治疗
简单总结：神经母细胞瘤是一种罕见的癌症，通常影响儿童。高风险患者的预期生存率不到 50%。原因之一是标准治疗方案缺乏精确性：一刀切的多模式治疗。本文介绍的研究旨在通过优化诱导化疗期间两种化疗药物（长春新碱和环磷酰胺）的使用来解决这一缺陷。诱导化疗是方案的一部分，可在手术切除前缩小原发肿瘤。我们结合了数学模型和优化算法，为具有不同初始肿瘤组成的虚拟患者群体确定最佳化疗方案。我们的研究结果揭示了利用具有不同疗效水平的一对药物的新策略，为个性化诱导化疗提供了平台，并为利用靶向疗法、多区域测序、液体活检和现代计算方法来改善当今的多模式治疗的个性化治疗奠定了基础。
基因组学和人类遗传学年度评论克隆造血的临床和治疗意义
克隆性造血 (CH) 是一种与年龄相关的过程，在此过程中，造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 获得突变，从而获得增殖优势和克隆扩增。最常见的突变基因是表观遗传调节因子、DNA 损伤反应基因和剪接因子，这些基因对于维持功能性 HSPC 至关重要，并且经常参与血液系统恶性肿瘤的发展。已知的 CH 风险因素，包括年龄、之前的细胞毒性治疗和吸烟，会增加患 CH 的风险和/或可能增加 CH 适应性。CH 已成为许多与年龄相关的疾病的新风险因素，例如血液系统恶性肿瘤、心血管疾病、糖尿病和自身免疫性疾病等。未来表征驱动 CH 进化的机制对于开发预防和治疗方法至关重要。
在TP53-和BRCA1缺陷型细胞中获得的PARP抑制剂耐药性的异质性和克隆进化
摘要◥同源重组（HR） - 有效的癌症是对多ADP核糖聚合酶抑制剂（PARPI）的现象，它们在治疗高级浆液性癌症（HGSC）方面表现出临床效率。然而，大多数患者将复发，而获得的PARPI耐药性正在成为紧迫的临床问题。在这里，我们生成了七个单细胞克隆，具有源自PARPI敏感的TP53 /和BRCA1 /上皮细胞系的获得的PARPI电阻，该电阻使用CRISPR / CAS9产生。这些克隆显示出不同的电阻机械机械，并且有些克隆同时提出了多种电阻机制。与敏感细胞系相比，对克隆的基因组分析揭示了独特的转录和突变性方案，并增加了基因组不稳定性。克隆进化分析表明，获得的parpi抗性是通过从本质上不稳定和异源细胞种群中的克隆选择引起的