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单细胞 DNA 扩增子测序揭示克隆......
T 细胞急性淋巴细胞白血病 (T-ALL) 是一种侵袭性白血病，最常见于儿童，其特征是在诊断时存在少量染色体重排和蛋白质编码区 10 至 20 个体细胞突变。大多数 T-ALL 病例都含有 NOTCH1 中的激活突变以及与激酶信号传导、转录调控或蛋白质翻译有关的基因突变。为了更深入地了解诊断和治疗期间的克隆异质性水平，我们使用 Tapestri 平台进行单细胞靶向 DNA 测序。我们设计了一个定制的 ALL 面板，并获得了精确的单核苷酸变异和小插入-缺失突变，需要 305 个扩增子，覆盖每个样本和时间点约 4400 个细胞中的 110 个基因。对 8 名 T-ALL 患者的 25 个样本共分析了 108 188 个细胞。我们通常在诊断时观察到一个主要克隆（> 35% 的细胞），伴随几个次要克隆，其中一些克隆占细胞总数的不到 1%。四名患者有 > 2 个 NOTCH1 突变，其中一些存在于次要克隆中，表明在发育中的 T-ALL 细胞中获得 NOTCH1 突变的压力很大。通过分析纵向样本，我们检测到残留的白血病细胞和克隆的存在和克隆性质，这些细胞和克隆在诊断时存在较少，在疾病后期发展为临床相关的主要克隆。因此，单细胞 DNA 扩增子测序是一种灵敏的检测方法，可用于检测 T-ALL 中的克隆结构和进化。（Blood . 2021;137(6):801-811）
B细胞和抗病毒免疫反应中的抗体免疫官方。 寄生疾病中的抗菌抗性 讨论糖尿病性肾病诊断和治疗。 环境因素的影响 - 微生物学 - 食物腌制背后的科学：了解发酵过程。 免疫反应感染的机制 神经发育障碍中的神经免疫相互作用 中等医学的预期 - 智能治疗 - 革兰氏阳性细菌：探索一个非凡的群体的多样性和影响。 工业发酵：为可持续的未来革新生物加工。 工业生物技术在高级药物中的作用。 竞争性抑制：了解其在酶调节中的作用并探索生物系统中的缺陷。 部分控制科学：服务量如何影响饮食习惯。 解锁生命的蓝图：遗传研究和应用的进步。 感染中的免疫失调：从自身免疫到免疫缺陷的相关疾病。 进化和影响 - 现代 - ... 解锁酶抑制剂的秘密：揭示其在医学及其他方面的作用。 了解血糖水平：您的读数的真正含义。 可源性的和肿瘤 - 抑制剂基因 - 现代洞察食品保存技术
免疫系统是一个复杂的细胞和分子网络，它们共同捍卫人体免受病原体（包括病毒）的影响。免疫反应病毒感染的一个关键方面是B细胞产生抗体。这些专门的细胞在识别和中和病毒方面起着核心作用，从而防止了进一步的感染并促进从体内清除病毒。在本文中，我们将在抗病毒免疫反应的背景下探讨B细胞和抗体免疫降低的概念。b细胞是一种在骨髓中成熟并在适应性免疫中起关键作用的白细胞。当病毒进入人体时，B细胞会被激活并经历称为克隆扩张的过程。在克隆膨胀期间，B细胞分裂并分化为浆细胞，这些细胞是分泌抗体的工厂和可提供长期免疫力的记忆B细胞。浆细胞产生的抗体特异于触发其激活的病毒抗原[1]。
宇航员在太空中的DNA会发生什么？
J. Sebastian Garcia-Medina, Karolina Sienkiewicz, S. Anand Narayanan, Eliah G. Overbey, Kirill Grigorev, Krista A. Ryon, Marissa Burke, Jacqueline Proszynski, Braden Tierney, Caleb M. Schmidt, Nuria Mencia-Trinchant, Remi Klotz, Veronica Ortiz, Jonathan Foox, Christopher Chin, Deena Najjar, Irina Matei, Irenaeus Chan, Carlos Cruchaga, Ashley Kleinman, JangKeun Kim, Alexander Lucaci, Conor Loy, Omary Mzava, Iwijn De Vlaminck, Anvita Singaraju, Lynn E. Taylor, Julian C. Schmidt, Michael A. Schmidt, Kelly Blease, Juan Moreno, Andrew Boddicker, Junhua Zhao, Bryan Lajoie, Andrew Altomare, Semyon Kruglyak, Shawn Levy, Min Yu, Duane C. Hassane, Susan M. Bailey, Kelly Bolton, Jaime Mateus, and Christopher E. Mason (2024) Genome and clonal hematopoiesis stability contrasts with immune, cfDNA，线粒体和端粒长度在短时间太空飞行中变化。精确临床医学。https://academic.up.com/pcm/article/7/1/pbae007/7642247
1 单细胞转录组识别针对患者的...
肿瘤内异质性高和癌细胞群进化是血液系统恶性肿瘤和实体瘤治疗耐药性的主要驱动因素 1–5 。在急性髓系白血病 (AML) 中，大量单细胞基因组分析已在细胞亚群水平上绘制了疾病进展和治疗耐药性的克隆进化过程，并破译了与化疗耐药性、复发和临床结果有关的白血病细胞亚群中的细胞层次和重编程 6–9 。同样，在实体瘤中，高级别浆液性卵巢癌 (HGSC) 患者的克隆分析和纵向取样揭示了进化轨迹，具有与治疗反应相关的不同基因组和形态学特征 10 。尽管有如此丰富的信息，我们仍然缺乏针对化疗耐药亚群的方法，以提高复发患者的二线治疗效果，或通过同时抑制具有足够高效力的多个白血病细胞亚群来避免对一线疗法产生耐药性
Cellartis® iPSC CRISPR/Cas9 Gesicle 和单细胞克隆系统用户手册
一旦 Cas9/sgRNA RNP 复合物通过囊泡递送并恢复细胞，就必须分离单细胞并将其扩增成克隆细胞系，以便分离和筛选目标基因型（图 3）。传统上，从作为菌落生长和传代的 hiPS 细胞建立克隆群效率低、困难且耗时；通常会导致细胞死亡或过早分化。然而，Cellartis iPSC CRISPR/Cas9 囊泡和单细胞克隆系统的细胞培养组件包含一个确定的培养系统（Cellartis DEF-CS™ 培养系统，由基础培养基、涂层和添加剂组成），可有效进行单细胞克隆和扩增编辑的 hiPSC 克隆。 DEF-CS 培养系统是一种基于单层的培养系统，它通过允许单细胞传代、促进接种单细胞的存活和进一步扩增以及保留这些细胞的多能性，克服了基于菌落的培养所面临的挑战。
癌症的进化论：挑战和潜在解决方案
本文已发表在《自然评论癌症》中。这是作者版本。请注意，这些数字已由NRC编辑，并且在已发布的版本中有所不同。您可以在这里找到论文：https：//www.nature.com/articles/s41568-024- 00734-2您可以引用文章，如下：Laplane，L。，Maley，C.C.。癌症的进化论：挑战和潜在解决方案。NAT REV CANCER 24，718–733（2024）。癌症的进化理论：挑战和潜在解决方案Lucie Laplane 1,2和Carlo Maley 3,4,5,6，†1：CNRS，Paris I Pantheon-Sorbonne，UMR 8590 Institut d'Histoire d'Histoire et histoire et physimophie et physimophie et physepophie et persionophie et sciences et des desiques et eforce et teciques et des paris，paris 7 cancer 7衰老，壁画，法国3：美国亚利桑那州立大学亚利桑那州立大学亚利桑那州癌症进化中心，美国亚利桑那州85287，美国。4：美国亚利桑那州立大学生命科学学院，美国亚利桑那州85287，美国。5：美国亚利桑那州立大学生物陈述中心，安全与社会，美国亚利桑那州坦佩，亚利桑那州85287，美国。6：美国亚利桑那州立大学进化与医学中心，美国亚利桑那州85287，美国。†电子邮件：maley@asu.edu摘要癌症的克隆进化模型是在1950年代至1970年代开发的，在二十一世纪成为癌症生物学的核心，主要是通过对癌症遗传学的研究。尽管它已经证明了其价值，但其结构受到了表型可塑性，遗传性非遗传形式的观察，克隆健身的非遗传决定因素和基因的非树样传播的挑战。我们旨在解决克隆的定义甚至存在混乱。克隆进化模型的性能和价值取决于经验范围，进化过程与癌症有关，及其理论能力来说明这些进化过程。在这里，我们确定了克隆进化模型的理论性能中的限制，并提供解决方案以克服这些限制。尽管我们没有声称克隆进化可以解释有关癌症的所有内容，但我们显示了在癌症动力学中已经确定了多少复杂性可以集成到模型中，以提高我们对癌症的当前理解。引言癌症是整个空间和时间上异质性的细胞种群。这种多样性目前是一个主要的临床问题，限制了大多数癌症治疗的效率，因为通常有一部分细胞对使用任何治疗方法有抵抗力1，2。多样性还限制了预后的准确性和我们预测其对干预措施的反应的能力，因为活检可能无法代表整个肿瘤，并且对于它如何随时间变化而有很强的随机成分。迫切需要更好地理解这种多元化的机制才能更好地治疗癌症。在二十一世纪获得关注的细胞多样化的一种解释机制是克隆进化：癌细胞通过遗传和表观遗传改变的积累而多样化，这可以改变细胞的相对适应性，从而导致克隆膨胀或通过自然选择进行克隆扩张或收缩。给定进化原理和种群遗传学的工具可以成功地应用于癌细胞3、4。然而，癌症进展的进化观点受到挑战5，结果表明，癌症内表型异质性在很大程度上可以独立于克隆的遗传学6。
泰米尔纳德邦新闻纸和纸张有限公司 TNPL，...
截至 2025 年 1 月 1 日，至少拥有 29 年纸浆木种植园从业经验，其中 10 年应在知名纸浆和造纸厂或国家森林公司的种植园领域工作。 总经理（种植园）将带领一个大型团队实现战略目标，其中包括从植物生产到向我们的工厂供应产量的所有活动。以下是指示性行动清单。 1. 负责从所有种植园区域（包括外包种植园）按时供应和运往造纸和纸板厂的木材。 2. 监测和控制 a. 作物管理和现场活动（相对于外包种植园农场）。 b. 森林运营 c. 克隆生产和供应 d. 组织培养实验室运营 e. 针对林业和克隆的研发 f. 苗圃管理 g. 灌溉方法 3. 种植园预算的制定和执行。 4. 支持植物材料、投入、设备和基础设施的采购。
不匹配修复缺乏不足以引起肿瘤免疫原性
DNA不匹配修复缺乏（MMRD）与高肿瘤突变负担（TMB）以及对免疫检查点阻滞（ICB）治疗的敏感性有关。尽管如此，大多数MMRD肿瘤对ICB的反应不持久，并且有关这些肿瘤中免疫监视和TMB的关键问题仍然存在。在本研究中，我们开发了MMRD肺和结肠癌的自围小鼠模型。令人惊讶的是，这些模型没有显示出T细胞浸润或ICB响应增加，我们证明这是突变的大量肿瘤内异质性的结果。此外，我们发现免疫监视塑造了克隆建筑，而不是新抗原的整体负担，并且针对亚克隆新抗原的T细胞反应被钝化。最后，我们证明了克隆人但没有下克隆的新抗原负担预测了MMRD胃癌和结直肠癌的临床试验中的ICB反应。这些结果为理解高TMB的癌症的免疫逃避提供了重要背景，并对旨在增加TMB的疗法具有重大影响。
造血TET2失活增强了对检查点阻滞剂免疫疗法的反应
和DKFZ-ZMBH联盟，德国海德堡69120 *这些作者同样为这项工作做出了贡献。＃与robert.vanner@uhn.ca，john.dick@uhn.ca利益冲突的信件：RJV和JED是专利“克隆造血症作为生物标志物”的共同发明者。J.E.D. 从获得许可到Trillium Therapeutics Inc/Pfizer的专利获得收入，并获得了Celgene/BMS的商业研究赠款。 抽象的体细胞突变灭活TET2是克隆造血的最常见驱动因素之一。 虽然TET2失活与单核细胞衍生的炎症和改善的嵌合抗原受体-T细胞功能有关，但其对免疫疗法反应的影响尚不清楚。 在我们的小鼠模型中，造血TET2突变增强了免疫检查点阻滞（ICB）反应。 用TET2突变增强了ICB反应所需的吞噬细胞，CD4和CD8 T细胞。 从机械上讲，在TET2-突出肿瘤浸润的白细胞（TIL）中，ICB优先诱导抗肿瘤状态和与肿瘤进展相关的受限细胞态。 TET2-突变的单核细胞激活了共刺激程序，而TET2突变T细胞显示J.E.D.从获得许可到Trillium Therapeutics Inc/Pfizer的专利获得收入，并获得了Celgene/BMS的商业研究赠款。抽象的体细胞突变灭活TET2是克隆造血的最常见驱动因素之一。虽然TET2失活与单核细胞衍生的炎症和改善的嵌合抗原受体-T细胞功能有关，但其对免疫疗法反应的影响尚不清楚。在我们的小鼠模型中，造血TET2突变增强了免疫检查点阻滞（ICB）反应。用TET2突变增强了ICB反应所需的吞噬细胞，CD4和CD8 T细胞。从机械上讲，在TET2-突出肿瘤浸润的白细胞（TIL）中，ICB优先诱导抗肿瘤状态和与肿瘤进展相关的受限细胞态。TET2-突变的单核细胞激活了共刺激程序，而TET2突变T细胞显示
急性白血病单细胞分析在治疗策略中的贡献
几十年来，在急性骨髓细胞白血病的治疗中仅限于围绕细胞链球菌/蒽环类药物的骨骼周围的变化，出现了靶向疗法。这些疗法首先基于单克隆抗体，也依赖于各种分子异常的特定抑制剂。由于这些新疗法受到高度复发率的限制，由于白血病干细胞的内在化学疗法和免疫抵抗力，以及通过克隆进化获得这些耐药性，因此已经观察到了显着但适度的预后改善。复发也受到骨髓基质微环境和免疫效应子的pro或抗肿瘤信号之间平衡的影响。鉴于白血病固有的肿瘤异质性以及这种类型的肿瘤能够的克隆漂移，靶向治疗方案的位置应该是什么？通过单细胞分析和下一代测序的新方法精确定义了克隆异质性和进化，从而导致了个性化和时间变量的适应处理。的确，自发或在治疗选择压力下，白血病的进化是非常复杂的现象。线性进化的模型被遗忘了，因为诊断和复发时样品的单细胞分析表明，肿瘤逃避治疗是从祖先和末端克隆发生的。此外，单细胞技术还可以识别每个细胞的性质，并可以在同一样品上分析肿瘤细胞及其环境。单细胞技术对不同肿瘤亚群的轨迹的测定允许鉴定累积对化学/免疫疗法抗性因子（“泛抗克隆”）的克隆，从而可以选择最有可能消除这些细胞的组合剂。因此，可以评估白血病应力诱导其功能改变的免疫效应子（T淋巴细胞，天然杀伤细胞）的种群。最后，单细胞技术是评估可测量残留疾病的宝贵工具，因为不仅能够量化，而且还可以根据对剩余白血病细胞的免疫化学疗法的敏感性来确定最合适的治疗方法。