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稳健高斯和非线性混合不变聚类特征辅助方法加速脑肿瘤诊断
1 纳季兰大学医学院内科放射学系，纳季兰 61441，沙特阿拉伯；yealmalki@nu.edu.sa 2 世宗大学无人驾驶车辆工程系，首尔 05006，韩国；umair@sejong.ac.kr 3 Secret Minds，创业组织，伊斯兰堡 44000，巴基斯坦；engnr.waqasahmed@gmail.com 4 国立科技大学（NUST）机械与制造工程学院（SMME）机器人与智能机械工程系（RIME），H-12，伊斯兰堡 44000，巴基斯坦； karamdad.kallu@smme.nust.edu.pk 5 伊巴达特国际大学电气工程系，伊斯兰堡 54590，巴基斯坦 6 卡西姆大学医学院放射学系，沙特阿拉伯布赖代 52571；salduraibi@qu.edu.sa（SKA）；al.alderaibi@qu.edu.sa（AKA） 7 纳季兰大学工程学院电气工程系，沙特阿拉伯纳季兰 61441；miditta@nu.edu.sa 8 扎加齐格大学人类医学学院放射学系，埃及扎加齐格 44631；maatya@zu.edu.eg 9 纳季兰大学应用医学科学学院放射科学系，沙特阿拉伯纳季兰 61441； hamalshamrani@nu.edu.sa * 通信地址：amad.zafar@iiui.edu.pk † 这些作者作为第一作者对这项工作做出了同等贡献。
抑制拓扑异构酶2催化活性会影响异染色质和重复DNA的完整性，并导致聚类重复序列之间的链接
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未获得同行评审证书）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年8月3日。 https://doi.org/10.1101/2023.08.01.551420 doi：biorxiv Preprint
在原核生物中，CRISPR（成簇的规律间隔的短回文重复序列）最初是作为防御入侵的机制而开发的。
在原核生物中，CRISPR（成簇的规律间隔的短回文重复序列）最初是作为防御入侵质粒和病毒的机制而开发的。Ishino 于 1987 年首次发现 CRISPR 结构。1 在其他细菌和古细菌中发现许多类似结构后，Jansen 于 2002 年创造了 CRISPR 这个绰号。2-3 后来，Mojica 及其同事推测 CRISPR 模式及其相关蛋白质可以抵御遗传影响，并可能具有免疫防御活性。4 然而，这一领域的三位主要贡献者是 Charpentier、Doudna 和 Zhang。CRISPR Cas-9 的机制首先由 Charpentier 阐明。后来 Charpentier 和 Doudna 报道了 Cas-9 介导的生化表征和系统优化。5 张是第一个在多细胞生物中实现 CRISPR Cas-9 遗传修饰的人。6
文章 - 工程、技术和技巧基于卷积深度神经网络的脑肿瘤诊断，使用聚类图像和特征- Sup
摘要：识别和分类胶质瘤脑肿瘤是医学领域的一项艰巨任务，为了延长患者的寿命，尽早识别恶性肿瘤至关重要。已经进行了医学图像分析研究以帮助检测恶性脑肿瘤。为了实现高分类性能，提取的特征必须既具有描述性又具有判别性。机器学习在分类中至关重要，因为它具有灵活性和对不同问题的适应性。我们提出了一种聚类图像和特征支持分类器 (CIFC) 以及一个深度卷积神经网络框架来对脑肿瘤图像进行分类。所提出的模型由各种分类器组成，例如：(i) 原始和分段图像特征支持的分类器；(ii) 原始和分段图像支持的分类器和 (iii) 聚类图像和特征支持的分类器。免费和开放访问的图像数据集 BRATS 2021 用于训练和测试所提出的肿瘤检测系统框架。 CFIC 的表现优于迄今为止提出的几乎所有分类器。所提出的系统的性能指标结果为灵敏度 99.76%、特异性 98.04% 和准确度 99.87%。因此，与其他现有技术相比，所提出的系统结果在肿瘤检测方面表现良好。
系统评价 - 改善脚部自我保健实践...
基因操纵工具已经改变了生物医学研究，并改善了其用于治疗目的的可能性。这些工具在许多生物体中有助于有效的基因组修饰，并已成功应用于生物医学工程，生物技术和生物医学。他们还显示了减轻遗传和非遗传疾病的治疗应用的潜力。小型干扰RNA（siRNA）和定期间隔间的短上粒细胞重复/相关蛋白系统（CRISPR/CAS）是基因操作中应用的两种工具。本综述旨在评估siRNA和CRISPR/CAS作为遗传操作的新工具的分子影响。本综述讨论了siRNA和CRISPR/CAS的分子机制，以及siRNA和CRISPR/CAS的优点和缺点。本综述还将siRNA和CRISPR/CAS之间的比较作为基因治疗的潜在工具。siRNA治疗应用是通过蛋白质敲除发生的，导致细胞损害。siRNA在mRNA水平上敲低基因表达，而CRISPR/CAS在DNA水平上永久击倒基因。毫无结论，基因操纵工具具有改善治疗策略和植物衍生产品的应用的潜力，但是必须在基因编辑的临床应用之前建立道德标准。
成簇的规律间隔的短回文重复序列/相关蛋白 9 介导的抑制乙型肝炎病毒感染的体内递送工具：最新进展
尽管已有有效的预防性乙型肝炎病毒 (HBV) 疫苗，但慢性乙型肝炎病毒 (HBV) 感染仍然是全球主要的健康问题。目前的抗病毒疗法无法完全治愈慢性乙型肝炎 (CHB)，因为共价闭合环状 DNA (cccDNA)（HBV 的复制模板）具有持久性，因此需要开发替代治疗方法。CRISPR/Cas 系统是一种新兴的基因组编辑工具，在基因组编辑和基因治疗方面具有巨大的前景。多项体外和/或体内研究已证明 HBV 特异性成簇规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/相关蛋白 9 (CRISPR/Cas9) 系统在切割 HBV DNA 和 cccDNA 方面的有效性。尽管 CRISPR/Cas 技术的最新进展增强了其在临床应用抗 HBV 感染的前景，但将 CRISPR/Cas9 系统体内递送到目标部位仍然是一项重大挑战，需要在其临床应用于 CHB 基因治疗之前解决。在本综述中，我们讨论了用于靶向 HBV 感染的 CRISPR/Cas9 递送工具，重点介绍了腺相关病毒载体和基于脂质纳米颗粒 (LNP) 的 CRISPR/Cas 核糖核蛋白 (RNP) 递送治疗 CHB 的开发。此外，我们还讨论了递送工具在增强 CRISPR/Cas9 抗 HBV 感染的抗病毒功效方面的重要性。
基因编辑：成簇规律间隔短回文重复序列技术对当代社会的影响
分子，由圣保罗州梅斯基塔大学（UNESP）完成；德国明斯特大学法医学研究所（DAAD/CNPq 奖学金获得者）；临床分析硕士学位，重点领域：分子生物学，毕业于圣保罗大学。 2004 年获圣埃斯皮里图联邦大学药学-生物化学学位（学士学位）。她是圣埃斯皮里图联邦大学阿雷格里校区的副教授。从事遗传学和分子生物学领域的工作，具有人类和非人类法医遗传学、SNP分析、通过DNA条形码进行物种识别以及开发新DNA分析技术的经验。 ORCID：https://orcid.org/0000-0001-8035-4199。 CV Lattes：http://lattes.cnpq.br/8176374147579841。 ggpaneto@gmail.com
成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关 9 (CRISPR/Cas9) 酶的三种工程化 HNH 内切酶 Lys-to-Ala 突变体动力学降低的结构基础
许多细菌对入侵的噬菌体或质粒具有 II 型免疫力，称为成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关 9 (Cas9) 系统，用于检测和降解外来 DNA 序列。Cas9 蛋白有两个负责双链断裂的核酸内切酶（分别称为 HNH 结构域，用于切割 DNA 双链的靶链，RuvC 结构域用于切割非靶链）和一个单向导 RNA (sgRNA) 结合结构域，其中 RNA 和靶 DNA 链是碱基配对的。三种工程化的单 Lys-to-Ala HNH 突变体（K810A、K848A 和 K855A）表现出对靶 DNA 链切割的增强的底物特异性。我们在本研究中报告，在野生型酶中，在 1mM EDTA 存在下，与催化位点相邻的含 Y836 环（包括 E827-D837）内的 D835、Y836 和 D837 具有无法表征的加宽 1 H 15 N NMR 共振，而环中其余残基具有不同程度的加宽 NMR 光谱。我们发现，野生型酶中的该环在分子动力学 (MD) 模拟期间表现出三种不同的构象，而三个 Lys-to-Ala 突变体
CRISPR/Cas9 Selection 试剂盒产品说明书
CRISPR (clustered, regularly interspaced, short palindromic repeats) 是一种来自细菌降解入侵的病毒 DNA 或其 他外源 DNA 的免疫机制。在该机制中， Cas 蛋白（ CRISP‐associated protein ）含有两个核酸酶结构域，可以 分别切割两条 DNA 链。一旦与 crRNA （ CRISPR RNA ）和 tracrRNA 结合形成复合物， Cas 蛋白中的核酸酶即 可对与复合物结合的 DNA 进行切割。切割后 DNA 双链断裂从而使入侵的外源 DNA 降解。