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DNAA和DNA在大肠杆菌细胞中的相对分布是其表型变异性的一个因素
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2024年10月7日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.08.06.606784 doi：Biorxiv Preprint
摘要：基因组编辑，特别是使用 CRISPR-Cas9，是操纵基因组（包括大肠杆菌）的强大工具。本研究旨在
摘要：基因组编辑，特别是使用 CRISPR-Cas9，是操纵基因组（包括大肠杆菌）的有力工具。本研究旨在利用 CRISPR-Cas9 对大肠杆菌中的 lacZ 基因进行遗传工程改造，以评估其在红薯皮（Ipomoea batatas）深层发酵过程中在淀粉酶产生中的作用。在 37ºC、pH 6.2、7.0 和 8.4 条件下培养编辑型和野生型大肠杆菌，并使用硫酸铵纯化所得淀粉酶。使用淀粉作为葡萄糖源筛选淀粉酶的产生，并在不同温度和 pH 水平下进行酶表征。没有向导 RNA (gRNA) 和阿拉伯糖的 CRISPR-Cas9 编辑的大肠杆菌显示蓝色菌落，而有 gRNA、Cas9 但没有阿拉伯糖的 CRISPR-Cas9 编辑的大肠杆菌没有菌落。用 Cas9 和阿拉伯糖但不加 gRNA 编辑的大肠杆菌也产生了蓝色菌落。当暴露于 Cas9、gRNA 和阿拉伯糖时，菌落表现出白色表型。凝胶电泳显示，暴露于 Cas9 和阿拉伯糖的大肠杆菌在 650 bp 处有两条带，而暴露于不含 gRNA 和阿拉伯糖的 Cas9 的蓝色菌落则在 1,100 bp 处显示条带。阳性对照显示三条不同的条带，而阴性对照没有。淀粉酶筛选显示野生型大肠杆菌和 CRISPR 编辑的大肠杆菌有相似的透明区。在发酵 15 天期间，pH 8.4 为野生型大肠杆菌的生长提供了最有利条件，pH 7.0 为 CRISPR 编辑的大肠杆菌的生长提供了最有利条件。温度和 pH 值测定表明，野生型和 CRISPR 编辑的大肠杆菌在 45ºC 和 pH 7 下均表现出相似的最大淀粉酶活性，酶产量没有显着差异。这些结果表明 lacZ 基因对大肠杆菌中的淀粉酶产生没有显着影响。 DOI：https://dx.doi.org/10.4314/jasem.v28i10.5 许可证：CC-BY-4.0 开放获取政策：JASEM 发表的所有文章均为开放获取文章，任何人都可以免费下载、复制、重新分发、转发、翻译和阅读。版权政策：© 2024。作者保留版权并授予 JASEM 首次出版权。本文的任何部分均可未经许可重复使用，但必须引用原始文章。引用本文为：MINARI, J. B; NWOSU, GE; DADA, I. S; ABDULAZEEZ, DO (2024)。使用马铃薯皮（Ipomea batata）作为酶源，分离和表征由 CRISPR-Cas 9 编辑的 LacZ 基因和未编辑的大肠杆菌产生的淀粉酶。应用科学与环境管理杂志 28 (10) 2981-2989 日期：收到日期：2024 年 7 月 7 日；修订日期：2024 年 8 月 15 日；接受日期：2024 年 8 月 19 日出版日期：2024 年 10 月 5 日关键词：CRISPR Cas9 基因编辑、lacZ 基因、大肠杆菌、马铃薯皮发酵、淀粉酶理想的代谢催化剂是酶，它通过明确定义的途径提供各种内源性生化反应。（Singh 等人，2019 年）。由于酶存在于所有自然界物种中，包括植物、动物、和微观微生物，它们可用于工业用途。此外，在受控情况下，各种微生物酶被识别
阿卜杜拉（Abdullah），Osama调查了RNA解旋酶死亡与Escherichia Coli
hatzimanolis，精神分裂症患者衍生的嗅觉神经元干细胞中的橡木失调的循环RNA是与细胞迁移和亚细胞组织相关的疾病相关性状的基础
设计基于细胞内适体的荧光生物传感器，以跟踪大肠杆菌的负担
细胞负担会影响工程合成系统的性能。出于这个原因，人们对开发跟踪负担和改善生物技术应用的工具有很大的兴趣。荧光RNA适体是实时监测负担的极好候选者，因为他们的产量有望在转录资源上施加可忽略的负载。在这里，我们表征了从大肠杆菌中不同启动子表达的适体库的性能。我们发现适体相对性能取决于启动子和菌株，与期望相反，适体的表达会影响宿主的适应性。通过选择具有更明亮的输出且影响较低的两个适体，我们设计了一个细胞内生物传感器，能够报告工程细胞中负担响应的激活。此处开发的传感器增加了可用于减轻负担的工具的收集，并可能支持寻求改善主机性能的生物处理应用程序。
重新定义没有抗生素的家禽中的大肠杆菌控制
摘要家禽行业通过生产具有较高蛋白质和重要养分的鸡蛋和肉类产品，以较低的成本生产鸡蛋和肉类产品在弥合许多国家的营养差距中发挥了重要作用。自禁止抗生素启动子（AGP），天然抗生素替代品，包括益生元，有机酸，有机酸，共生剂，免疫刺激剂，酶，精油和植物生成剂，包括植物学，油脂素，精油，精油和herbs的造型性，包括杂种，包括普遍的范围。，由于其独特的特征和对家禽生产的良好影响，它们在世界范围内广泛使用。They are simple to combine with other feed ingredients, leave no tissue residue behind, enhance feed intake, feed gain, feed conversion rate, boost immunity in birds, enhance digestion, increase the availability and absorbability of nutrients, have anti-microbial properties, do not alter carcass characteristics, reduce the need for antibiotics, act as antioxidants and anti-inflammatory agents, compete for stressors,并生产营养有机产品，这些有机产品可安全。因此，当前的评论重点介绍了对不同自然抗生素增长者的替代方案的全面描述，其作用方式以及对家禽生产的影响。关键词大肠杆菌，抗生素，有机添加剂，家禽，AMR，健康
立体异构体同型和异核虹膜（III）配合物具有3-氧化剂桥桥配体及其在OLEDS
配体可以充当两个采用n ˆ o - 和o o o - 螯合模式的虹膜中心的辅助配体。为了调整这种双核复合物中激发态的能量，2-（2,4-二苯基）吡啶（HDFPPY）和2-苯基苯甲苯二唑（HPBTZ）（HPBTZ）用作环的配体，以分别与蓝色 - 或橙色的Homo-emissive yy-yy-emissive-yy-emissive yy-yy-emissive-yyy-yyy-yyy-yyy-yyy-yyys and yyys一起使用[ir（dfppy）2] 2（pico）和[ir（pbtz）2] 2（pico）。此外，在第一次，也获得了短桥的杂粒元素化的双核配合物（通过和yb，带有公式[ir（dfppy）2]（pico）[ir（pbtz）2]和[ir（pbtz）2]和[ir（pbtz）2] 2]（pico）2]（pico）[ir（pico）[ir（dfpppy）2]）。取决于在小脚桥桥的两侧的环数配体的相互排列，获得了两对非映异构体的夫妻并有效地分离，如NMR和DFT研究所证明的那样。报道的双核复合物具有高度发光量子产率（PLQY）高达67％的高度发射，与其单核类似物（B和Y）相当。由于其氧化还原过程的完全可逆性，所有复合物也在溶液处理的有机发光二极管中进行了测试，从而提供了基于异核 - 核环含量硫化锂（III）配合物的独特OLED。
肠道本能：利用益生菌的力量在溃疡性结肠炎中驯服致病信号通路
溃疡性结肠炎（UC）是一种慢性炎症性肠病（IBD），其特征是大肠的粘膜内膜持续炎症，导致症状令人衰弱和生活质量降低。新兴证据表明，肠道菌群的失衡在UC发病机理中起着至关重要的作用，并且各种信号通路与免疫反应失调有关。益生菌是给宿主带来健康益处的活微生物，引起了人们对恢复肠道微生物平衡和改善UC炎症的潜力的极大关注。最近的研究阐明了益生菌调节这些信号通路的机制，通常是通过产生抗炎分子并促进调节性免疫细胞功能。例如，益生菌可以通过稳定Kappa B alpha（IκBα）的抑制剂来抑制核因子-κB（NF-κB）途径，从而抑制促炎细胞因子的产生。同样，益生菌可以调节Janus激酶/信号转录器和转录激活因子（JAK/STAT）信号通路，从而抑制了STAT1和STAT3的激活，从而减少了炎症反应。在调节UC中调节致病信号通路时，更好地理解益生菌的潜在机制将为开发更有效的基于益生菌的疗法铺平道路。In this review, we explore the mechanistic role of probiotics in the attenuation of pathogenic signaling pathways, including NF- κ B, JAK/STAT, mitogen-activated protein kinases (MAPKs), Wnt/ β -catenin, the nucleotide-binding domain (NOD)-, leucine- rich repeat (LRR)- and pyrin domain-containing protein 3 （NLRP3）UC中的炎性体，Toll样受体（TLR），白介素23（IL-23）/IL-17信号通路。
嵌合抗原受体T细胞T细胞治疗多发性骨髓瘤
GSK，Janssen，Karyopharm，Pfizer，Ra Capital，Regeneron，Sanofi；科学顾问委员会：Caris Life Sciences；董事会：Antengene；毫米中某些鱼类测试的专利。 C. F.报告咨询：Janssen；研究：Regeneron，Janssen；股票所有权：辅助。 P.M.V. 报告咨询：Abbvie，Astra Zeneca，BMS，GSK，Janssen，Karyopharm，Karyopharm，Lava Therapeutics，Regeneron，Sanofi；研究：Abbvie，Janssen，Regeneron。 S.D.R. 报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。 J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。GSK，Janssen，Karyopharm，Pfizer，Ra Capital，Regeneron，Sanofi；科学顾问委员会：Caris Life Sciences；董事会：Antengene；毫米中某些鱼类测试的专利。C. F.报告咨询：Janssen；研究：Regeneron，Janssen；股票所有权：辅助。P.M.V. 报告咨询：Abbvie，Astra Zeneca，BMS，GSK，Janssen，Karyopharm，Karyopharm，Lava Therapeutics，Regeneron，Sanofi；研究：Abbvie，Janssen，Regeneron。 S.D.R. 报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。 J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。P.M.V.报告咨询：Abbvie，Astra Zeneca，BMS，GSK，Janssen，Karyopharm，Karyopharm，Lava Therapeutics，Regeneron，Sanofi；研究：Abbvie，Janssen，Regeneron。S.D.R. 报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。 J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。S.D.R.报告Honoraria：Janssen，BMS；指导委员会参与，Gracell Therapeutics，BMS；研究支持，Janssen，BMS，C4 Therapeutics，Gracell Therapeutics，Heidelberg Pharma；咨询：Genentech，Janssen，BMS。J.Y.S. 报告咨询：风筝，Immpact Bio。 L.L. 报告咨询：萨诺菲异元。 S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。J.Y.S.报告咨询：风筝，Immpact Bio。L.L.报告咨询：萨诺菲异元。S.F.P. 报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。 A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。S.F.P.报告咨询：制图生物科学；科学咨询委员会：利卡生物系统。A.J.C. 报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。 D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。A.J.C.报告咨询：BMS，自适应；研究：适应性生物技术，鱼叉，尼克塔尔，BMS，詹森，赛诺菲，abbvie。D.W.S. 报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。 D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。D.W.S.报告咨询：GlaxoSmithkline，Janssen，Sanofi，Abbvie，Bristol Myer Squibb，Pfizer，Bioline，Bioline，Arcellx，Astrazeneca，Genentech；研究：Gilead，Pfizer，Janssen，Bioline，Glaxosmithkline，Sanofi，Amgen，Cantex，Arcellx，Roche；指导委员会：Janssen；数据安全和监测：Karyopharm和独立审查委员会：Parexel。D.K.H. 报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。 其余的作者没有兴趣披露。D.K.H.报告咨询：BMS，Janssen，Legend Biotech，Pfizer，Karyopharm；研究：BMS，Karyopharm，自适应生物技术和五旬节骨髓瘤研究中心。其余的作者没有兴趣披露。
内吞镜检查具有自动多光谱肠屏障病理学成像，以评估深度愈合，以预测溃疡性结肠炎的结局
消息屏障愈合代表了溃疡性结肠炎（UC）的一种新型治疗靶标，尽管其评估仍然具有挑战性并且缺乏标准化。这项探索性研究评估了超高放大射击内吞镜检查引导组织采样并驱动紧密连接（TJ）蛋白质自动量化的能力，以评估静脉屏障完整性并预测主要的不良结果（MAOS）。34例临床缓解中的UC患者前瞻性地接受了内吞镜检查和机器学习支持的肠内屏障蛋白评估的评估。内尾镜检查与Claudin-2表达的组合在12个月内准确预测MAOS方面表现出了希望。这种综合方法有望确定UC中的深层康复和增强对待目标策略。
使用体外发酵模型
的目的：他的研究对三种不同的益生元，人乳寡糖2' - 纤维糖（2'-fl），一种寡糖 - 寡糖 - 纤维素hed inulin（fructo-oligosacc haride）和甲状腺酸果糖（fructo-Oligosacc haride）和falacto-OligosAcccariecccarios（fa fa）混合物（fa racto-OligososAccccaride）（fa ructo-Oligosacc haride）（fa ructo-Oligosacc haride）（fa con）和fa fa faracto-osobaccaride（fa fa），溃疡性结肠炎（UC）使用体外批处理培养发酵模型。比较细菌基团的变化和短链脂肪酸（SCFA）的产生。方法和结果：在三个健康对照组和三名活性UC患者的样品上进行48小时的体外pH控制批量培养发酵。运行四个容器，一个阴性对照，每种益生元底物。细菌枚举。SCFA定量。所有底物对肠道微生物群都有积极的影响，并在48小时时导致总SCFA和丙酸酯浓度显着增加。 2'-FL是唯一显着增加乙酸盐并导致SCFA浓度在48小时的最大增加的底物。 2'-fl最佳抑制的脱硫O Vibrio spp。，一种与UC相关的病原体。结论：2'FL，FOS和GOS在这项体外研究中都显着提高了肠道菌群，并导致SCFA增加。