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人类共同Segatella copri的RNA景观揭示了肠道定植必不可少的小RNA
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年4月5日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.04.05.588293 doi：Biorxiv Preprint
小非编码 RNA CjNC110 影响空肠弯曲菌的运动性、1 自凝集、AI-2 定位和鸡 2 定植 3
小的非编码RNA参与27种病原微生物的许多重要生理功能。先前的研究已经确定了主要人畜共患病原体空肠弯曲菌中存在非编码RNA 28 ，但迄今为止，很少有非编码RNA在功能上得到表征。CjNC110是空肠弯曲菌中保守的ncRNA，位于30 luxS基因下游，该基因负责产生群体感应分子自诱导物-2 31 (AI-2)。在本研究中，我们利用链特异性高通量RNA测序来识别空肠弯曲菌羊流产克隆中CjNC110的潜在32靶标或相互作用伙伴。这些数据被用于进一步表型评估 CjNC110 在空肠弯曲菌的生长、运动、34 自体凝集、群体感应和鸡定植中的作用。与野生型相比，35 CjNC110 ncRNA 的失活导致自体凝集能力显著下降，同时 36 运动能力增强。37 ∆CjNC110 中细胞外 AI-2 检测降低，然而，细胞内 AI-2 积累显著增加，同时 LuxS 表达增加，这表明 CjNC110 在调节 39 AI-2 运输方面发挥着关键作用。值得注意的是，∆CjNC110 还显示出定植鸡的能力存在显著缺陷。CjNC110 的补充将所有表型变化恢复到野生型 41 水平。我们数据中观察到的表型和转录组变化的总体结果 42 为 C. jejuni 羊流产克隆的病理生物学提供了宝贵的见解，并强烈 43 表明 CjNC110 在调节能量趋向性、鞭毛 44 糖基化、通过群体感应的细胞通讯和鸡定植中起着重要作用。 45 重要的人畜共患病原体。46
大麦二萜类植物抗毒素抑制禾谷镰刀菌感染但增强大麦根部根腐病菌定植
植物免疫是一个多层次的过程，包括识别病原体的模式或效应物以引发防御反应。这些包括诱导通常会限制病原体毒力的多种防御代谢物。在这里，我们在代谢物水平上研究了大麦根与真菌病原体根腐病菌 ( Bs ) 和禾谷镰刀菌 ( Fg ) 之间的相互作用。我们发现大麦烷是一组以前未描述过的具有抗菌特性的罗丹烷相关二萜类化合物，是这些相互作用中的关键参与者。Bs 和 Fg 感染大麦根会引发 600 kb 基因簇中的大麦烷合成。在酵母和本氏烟中异源重建生物合成途径产生了几种大麦烷，包括功能最丰富的产品之一 19-b-羟基大麦三烯酸 (19-OH-HTA)。该簇二萜合酶基因的大麦突变体无法产生大麦烷，但出乎意料的是，Bs 的定植率却降低了。相比之下，另一种大麦和小麦真菌病原体禾谷镰刀菌在完全缺乏大麦烷的突变体中的定植率要高 4 倍。因此，19-OH-HTA 可增强 Bs 的发芽和生长，而抑制其他致病真菌，包括 Fg。显微镜和转录组学数据分析表明，大麦烷可延缓 Bs 的坏死营养期。综上所述，这些结果表明，诸如 Bs 之类的适应性病原体可以破坏植物的代谢防御，以促进根部定植。
藻类伙伴的热应激阻碍了定植成功并改变了刺胞动物-藻类共生体中的藻类细胞表面糖基化
摘要 珊瑚的生态成功归功于它们与甲藻 (Symbiodiniaceae) 的共生关系。虽然人们对热应激对这种共生关系的负面影响进行了深入研究，但对热应激如何影响共生关系的开始和共生体特异性的研究较少。在这项工作中，我们使用模型海葵 Exaiptasia diaphana (通常称为 Aiptasia) 及其本地共生体 Breviolum minutum 来研究热应激对藻类对 Aiptasia 的定殖以及藻类细胞表面糖组的影响。热应激导致藻类对 Aiptasia 的定殖减少，这并不是由于藻类运动或氧化应激等混杂变量造成的。利用质谱分析和凝集素染色，我们鉴定出热诱导的聚糖富集（以前发现与自由生活的藻类菌株有关，高甘露糖苷聚糖），同时鉴定出与共生藻类菌株有关的聚糖（半乳糖基化聚糖）减少。我们还鉴定出特定唾液酸聚糖的差异富集，尽管它们在这种共生关系中的作用仍不清楚。我们还讨论了用于分析藻类细胞表面糖组的方法，评估了当前的局限性，并为藻类-珊瑚糖生物学的未来工作提供了建议。总体而言，这项研究深入了解了压力如何通过改变共生生物伙伴的糖组来影响刺胞动物与其藻类共生体之间的共生关系。
oxfam gb's decolonial partnerships strategy in summary
While formal colonization has mostly ended, its influence on how we think and act remains today. Colonization saw one group of people believing they were “better than” others. It provided them with the justification and authority to exploit, infantilize, and dictate to those they see as “lesser than”. This sense of superiority persists today, often unquestioned, and means that power is still skewed towards former colonial empires in the Global North. Within the aid sector, this manifests as:
在溃疡性结肠炎患者中，细菌伴侣与粪便微生物移植衰竭的持续粘膜定植和粪便代谢功能障碍
粪便微生物移植（FMT）为治疗溃疡性结肠炎（UC）提供了希望，尽管治疗失败的机制尚不清楚。这项研究利用了纵向收集的结肠活检（n = 38）和粪便样本（n = 179），来自19名患有轻度至中度UC的成年人接受串行FMT，其中抗菌预处理和递送模式（capsules versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus sorge均可评估临床响应（从临床上降低）。结肠活检进行了双RNA-Seq；粪便样品接受了平行的16S rRNA和shot弹枪元基因组测序以及未靶向的代谢组分分析。与反应性（R）患者相比，无反应性（NR）患者的结肠粘膜（NR）患者的结肠粘膜（NR）患者的结肠粘膜增加了细菌的负担，包括细菌的负担增加，这些细菌表达了更多的抗菌耐药性基因。NR患者还表现出先天免疫抗菌反应基因的粘膜表达。FMT，NR和R粪便微生物组和代谢组表现出明显的差异。NR代谢组具有升高的免疫刺激化合物，包括鞘磷脂，溶血磷脂和牛磺酸。nr粪便微生物组富含菌丝脆弱的菌丝和细菌剂盐菌株，这些菌株编码了能够生产牛磺酸的基因。这些发现表明，有效的粘膜微生物清除率和重新引入细菌，使腔内代谢与FMT成功相关，以及持续的粘膜粘膜和粪便抗菌细菌菌种物种可能会导致FMT失败。
抗生素治疗后的阴道微生物定植，早产膜的早产：一项观察性队列研究
1妇产科和妇科系妇产科，维也纳医科大学，沃林格·盖尔特尔（Waehringer Guertel）18-20，奥地利1090年维也纳； fanny.mikula@meduniwien.ac.at（F.M.）; Alex.farr@meduniwien.ac.at（A.F.）; harald.leitich@meduniwien.ac.at（H.L.）; sonja.granser@meduniwien.ac.at（S.G.）2感染控制与医院流行病学系，维也纳医科大学，奥地利维也纳1090； julia.ebner@meduniwien.ac.at 3新生儿学，小儿重症监护和神经科医生，儿科和青少年医学系，维也纳医科大学综合儿科中心，奥地利1090年，维也纳，奥地利维也纳； agnes.grill@meduniwien.ac.at *通信：philipp.foessleitner@meduniwien.ac.at;电话。： +43-1-40400-28220;传真： +43-1-40400-28620
使用实时细胞分析系统
结果：CDI组的RTCA测量功能和毒梭状芽胞杆菌毒素B（TCDB）浓度（302.58±119.15 ng/ml）明显高于CDC组（18.15±11.81 ng/ml）（P = 0.0008）的CDC组（18.15±11.81 ng）。相反，ELISA结果显示CDC（26.21±3.57 ng/ml）和CDI组（17.07±3.10 ng/ml）之间的TCDB浓度没有显着差异（P = 0.064）。PCR结果表明，CDC（774.54±357.89副本/μL）和CDI组（4,667.69±3,069.87副本/μL）之间的TCDB基因拷贝没有显着差异（p = 0.407）。另外，通过RTCA测量了从艰难梭菌分离株分泌的功能和毒性TCDB浓度。CDC（490.00±133.29 ng/ ml）和CDI组（439.82±114.66 ng/ ml）的结果没有显着差异（p = 0.448）。值得注意的是，当与合并的CDC样品上清液混合时，RTCA测量的功能和毒性TCDB浓度显着降低（P = 0.030）。
肠产毒性大肠杆菌的多表位融合抗原候选疫苗可在兔子模型中预防 B7A 菌株的定植
产肠毒素大肠杆菌 (ETEC) 菌株是导致儿童和旅行者腹泻的主要原因。由于决定其病理的毒素和粘附素的性质各异，开发针对这种异源菌群的有效疫苗已被证明非常困难。使用多表位融合抗原 (MEFA) 疫苗学平台开发了一种多价候选疫苗，并证明其可有效在小鼠和猪中引发广泛的保护性抗体反应。然而，在这些系统中并未测量到对小肠 ETEC 定植的直接保护。众所周知，ETEC 菌株的定植是疾病结果的决定性因素，并且依赖于粘附素。在这项研究中，我们开发了一种非手术兔定植模型来研究兔对 ETEC 定植的免疫保护。我们测试了基于 MEFA 的疫苗粘附素抗原与 dmLT 佐剂结合诱导广泛免疫反应和防止 ETEC 在兔小肠定植的能力。我们的结果表明，候选疫苗 MEFA 抗原在兔体内引发抗体，这些抗体与其结构中包含的七种粘附素发生反应，并可防止持续定植于幼兔体内的攻击菌株的定植。
引用本文：妮可·桑迪·格罗夫（2021）：《欢迎来到火星》：太空殖民、预期威权主义和希望的劳动，全球
摘要 2017 年，迪拜政府宣布计划在一百年内建立第一个火星人类定居点。本文探讨了“火星 2117”项目及其在地球上的 beta 测试如何代表一种日益全球化和先锋的与我们称之为自然的物质的关系，其中政治的目标是创造一种新的栖息地而不是建立一个城邦。火星 2117 揭示了阿联酋目前威权主义合法性的基础实际上是借来的，未来充当了其当前治理结构的一种抵押品，并且依赖于对未来的人民、地方和基础设施的精心设计预期。预期威权主义是一种正在创新的权威形式，旨在跳过石油峰值和不可逆转的气候变化之间的反馈所造成的政治矛盾和环境限制。