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共生真菌和草酸盐降解：是否有联系？
草酸是生物体生产的最常见的低分子有机酸之一，它在草酸盐使用和处置的策略中多样化（Smith 2002）。例如，植物可能会在细胞内积聚，以获得电荷平衡，钙调节和防御，而真菌的草酸盐分泌与致病性有关，如Palmieri等人所述。（2019）。相反，细菌可以使用草酸盐作为能量和碳源（Herve等人2016）。在这种情况下，人类落在灰色区域。的确，在人类以及许多非人类动物中，草酸盐是乙二醇代谢的最终产物（Ermer等人。2023），由于酶促库缺乏草酸盐降解酶及其生理功能尚不确定（Palmieri等人2019）。然而，在自然界中草酸盐的广泛存在和使用反对人类中草酸盐的这种还原性的视力。的确，除了微生物或微生物群的结构化群落外，不能认为人类会殖民到外部环境中暴露于外部环境的所有表面，包括肠道，这代表了来自饮食中草酸盐的附加来源。据估计，在健康的个体中，饮食和内源性合成也同样有助于草酸盐水平（Mitchell等人。2019）。微生物群包括细菌和真菌，它们可能整合了宿主代谢途径，从而为草酸盐的合成和降解提供了酶，从而总体上有助于维持其稳态水平。考虑到分别称为原发性（pH）和次级（SH）高氧化尿症的草酸盐积累的病理弊端，这一点尤其重要，这导致肾脏中草酸盐的形成
特刊 - 免疫系统和共生微生物群
“微生物”将非常小的思想与不断发展的生物体的思想融合在一起，是微生物学学科的统一原理。Our journal recognizes the broadly diverse yet connected nature of microorganisms and provides an advanced publishing forum for original articles from scientists involved in high-quality basic and applied research on any prokaryotic or eukaryotic microorganism, and for research on the ecology, genomics and evolution of microbial communities as well as that exploring cultured microorganisms in the laboratory.
来自共生根瘤菌的II型分泌sublase ...
植物的根在与微生物社区相关的群体中生长，称为根际微生物组。免疫Acɵvaɵ响应于诸如艾氏蛋白酶衍生的表位（G22）之类的引发剂限制了植物根部的细菌，但也抑制了植物的生长。一些共同的根部相关细菌能够抑制植物对引起剂的免疫反应。在这项研究中，我们提高了165种根相关细菌抑制含量G22诱导的免疫Acɵvaɵ和生长式restricɵon的能力。我们证明，来自Dyella Japonica菌株MF79的II型分泌的亚lase，我们称其为免疫抑制亚抑制作用A（ISSA）A（ISSA），使免疫Eliciɵngpepɵdepepɵdetof g22裂解并有助于免疫抑制。在其他与植物相关的共同体中发现了ISSA同源物，在xanthomonadales的顺序中具有高度高的保守。这代表了一种新型机制，通过该机制，共生微生物在根际微生物组中调节了抗G22诱导的免疫力。
胃肠道健康和疾病中的炎性体和共生微生物之间的相互作用
炎性体是一种胞质多蛋白复合物，在炎症和细胞死亡中起着至关重要的作用。炎性体复合物中的传感器蛋白检测到各种微生物和内部刺激，从而导致随后的caspase激活。胱天蛋白酶的激活导致促炎性细胞因子IL-1 B和IL-18或凋亡的成熟。炎性体功能障碍与包括自身免疫性疾病和癌症在内的各种疾病的发病机理有关。看来，肠道菌群和炎性体之间的相互作用在胃肠道中起着至关重要的作用。肠道菌群诱导炎性蛋白的表达和激活，这与肠道中的体内平衡和疾病有关。同样，尽管有争议，但越来越多的证据表明，炎性体激活可以调节肠道微生物群的组成，这反过来又影响了疾病进展。在这篇综述中，我们总结了当前的概念和最新的见解，这些概念和肠道共生微生物联系起来。我们描述了炎症体和共生微生物群之间的相互相互作用与宿主中的生理和病理生理后果有关。
基于共同人类1
Cato Prince 1，George Bounoutas 1，Bolu Zhou 1，Weseem Raja 1，Isabella Gold 1，Rianna 3 Pozsgai 1，Parmi Thakker 1，Nicole Bois 1，Christopher Reardon 1，Christopher Reardon 1，Stephanie 4 Thurmond。 Ozturk 1，Rajendra Boggavarapu 1，Simeon Springer 1，LovePreet 5 Chahal 1，Maciej Nogalski 1，Tuyen Ong 1，Dhananjay Nawandar 1，Christopher 1，6 Ashley Mackey 1，Ashley Mackey 1，Ashley Mackey 1，Geoffrey Parsons 1，Jose Parsons 1，Jose Cabraph Cabraph Cabraph Cabral 1 * 7 7
共生生物的代谢多样性调节肠道免疫和反式1
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2023年8月26日发布。 https://doi.org/10.1101/2022.08.26.505490 doi：Biorxiv Preprint
共生肠道微生物及其代谢物针对细菌病原体的保护作用
抽象的多药微生物已成为全球主要的公共卫生问题。肠道微生物组是用于保护人体免受病原体的生物活性化合物的金矿。我们使用了一种多摩学方法，该方法通过代谢组分析整合了74个共生肠道微生物组分离株的全基因组测序（WGS），以发现它们与沙门氏菌和其他抗生素耐药病原体的代谢相互作用。我们根据WGS注释曲线评估了这些选定分离株的功能潜力差异。此外，确定了选定的共生肠道微生物组分离株的共培养上清液中最大的代谢产物，包括一系列二肽，并检查了其防止各种抗生素抗性细菌生长的能力。我们的结果提供了令人信服的证据，表明肠道微生物组会产生代谢产物，包括可能应用于抗感染药物的二肽的化合物类别，尤其是针对抗生素耐药的病原体。我们既定的肠道微生物组生物活性代谢产物的发现和验证的管道是作为多种耐药感染的新候选者，这是发现抗菌铅结构的新途径。
揭示了来自单个人类皮肤部位的共生菌群的多样性
。CC-BY 4.0国际许可证。根据作者/资助人提供了预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月25日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2024.11.28.625817 doi：Biorxiv Preprint
代际保护性抗恒星共生免疫球蛋白G起源于早期
G类（IgG）的母体免疫球蛋白保护后代免受肠道感染的侵害，但是何时，何时何地以及这些抗体是生理产生的，并赋予保护仍然神秘。我们发现，成年小鼠中的循环IgG优先结合 - 生命肠道的共生细菌，而不是自己的成年肠道细菌。igG-分泌针对早期生命的肠道细菌的分泌浆细胞出现在断奶后的肠道中，在那里保持成年。操纵暴露于肠道细菌或浆细胞发育之前，但并非此后，断奶会减少IgG-分泌靶向早期生命肠道细菌的浆细胞。此外，这种抗肠道分子IgG反应的发展与早期生命区间一致，其中结肠中存在杯状细胞相关抗原通道（GAP）。在早期生命中被B细胞消融或细菌暴露减少的大坝的后代更容易受到肠道病原体挑战的影响。与当前的概念相反，保护性母体IgG针对后代中的肠道分子而不是肠病原体。这些早期的生活事件影响了反 - 共生IgG生产，具有保护后代的世代相传效应。