通过检测无细胞DNA(C Q Q QA)和非侵入性产前测试(NIPT)[1,2]的发育来彻底筛选染色体非整倍型的染色体。While over decades, the detection rate (DR) of trisomy 21 could be improved from only 30% to 90% at a false positive rate (FPR) of 5% by first trimester combined screening (FTCS), c ff DNA has a DR of Down syndrome of 99% at a very low FPR of 0.04% [3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12].三体三体第18和18的DRS与双胞胎妊娠中的C扰性[9、10、11、12]相似。尽管表现出色,但C效应仍然是筛查测试,并且通过侵入性测试确认了高风险C扰动的结果[13,14]。由于其高昂的成本,大多数医疗保健系统并未对所有孕妇进行DNA筛查。因此,已经提出了直接c或偶然筛选的不同模型[15,16,17]。在瑞士,所有孕妇的健康保险提供者都偿还了FTC,包括一名经过认证的超声检查员的详细超声检查,并测量了胎儿颈部半透明(NT)以及生化分析。在超声波中看到的胎儿异常,NT> 95%的胎儿疾病或FTCS≥1:380的任何三体造期风险。自2015年7月以来,作为全球最早的国家之一,斯威茨 - 以偶然的方式实施了常规筛查。如果在FTC上将孕妇年龄(MA)和NT与生化血清标记物β-人类绒毛膜促性腺激素
临床前扰动筛选,其中在疾病模型上系统地测试了遗传,化学或环境扰动的影响,由于其规模和因果性质,对机器学习增强的药物发现具有巨大的希望。预测模型可以根据分子特征来推断以前未经测试的疾病模型的扰动反应。这些在计算机标签中可以扩展数据库并指导实验优先级。但是,对扰动特异性效应进行建模并在各种生物环境中产生健壮的预测性能仍然难以捉摸。我们介绍了LEAP(自动编码器和预测变量的分层集合),这是一个新颖的集合框架,可改善稳健性和概括。LEAP利用多个Damae(数据增强蒙版的自动编码器)表示和套索回归器。通过结合从不同随机初始化中学到的多种基因表达表示模型,在预测未见细胞系,组织和疾病模型中基因本质或药物反应方面始终胜过最先进的方法。值得注意的是,我们的结果表明,结合表示模型而不是仅预测模型会产生出色的预测性能。超出其性能增长,LEAP在计算上是有效的,需要最小的高参数调整,因此很容易将其纳入药物发现管道中,以优先考虑有希望的目标并支持生物标志物驱动的分层。这项工作中使用的代码和数据集可公开使用。
3爱丁堡大学生物科学学院,Max Born Crescent,Edinburgh,EH9 3BF,英国。 *相应的作者:d.oyarzun@ed.ac.uk; n.carragher@ed.ac.uk摘要胶质母细胞瘤多形(GBM)是一种侵略性的原发性脑肿瘤,由于其复杂的病理和异质性,引起了重大治疗挑战。 缺乏经过验证的分子靶标是发现新的治疗候选者的主要障碍,在二十年中,没有向患者提供新的有效GBM疗法。 在这里,我们报告了针对GBM干细胞存活表型的化合物的鉴定。 我们的方法采用机器学习(ML)的预测指标的细胞存活率,这些细胞存活在高通量,基于图像的,基于图像的表型筛选数据中,用于3,561种化合物,以多个浓度,跨六个异质,患者衍生的GBM干细胞系进行多个浓度。 我们在计算上筛选了跨越各种化学类别的12,000多种化合物。 对GBM干细胞系中ML识别的候选物的实验验证,导致了三种化合物对GBM表型的活性。 值得注意的是,我们经过验证的HSP90抑制剂XL888之一,靶向消除所有六个GBM干细胞系,其IC50在纳莫尔范围内。 其他两种化合物在具有不同细胞系敏感性的多个GBM细胞系中展示了广泛的活动,为将来的个性化医学运动提供了途径。 患者的预后较差,治疗方案有限(通常是手术,然后进行化学放疗),导致抗药性的出现。3爱丁堡大学生物科学学院,Max Born Crescent,Edinburgh,EH9 3BF,英国。*相应的作者:d.oyarzun@ed.ac.uk; n.carragher@ed.ac.uk摘要胶质母细胞瘤多形(GBM)是一种侵略性的原发性脑肿瘤,由于其复杂的病理和异质性,引起了重大治疗挑战。缺乏经过验证的分子靶标是发现新的治疗候选者的主要障碍,在二十年中,没有向患者提供新的有效GBM疗法。在这里,我们报告了针对GBM干细胞存活表型的化合物的鉴定。我们的方法采用机器学习(ML)的预测指标的细胞存活率,这些细胞存活在高通量,基于图像的,基于图像的表型筛选数据中,用于3,561种化合物,以多个浓度,跨六个异质,患者衍生的GBM干细胞系进行多个浓度。我们在计算上筛选了跨越各种化学类别的12,000多种化合物。对GBM干细胞系中ML识别的候选物的实验验证,导致了三种化合物对GBM表型的活性。值得注意的是,我们经过验证的HSP90抑制剂XL888之一,靶向消除所有六个GBM干细胞系,其IC50在纳莫尔范围内。其他两种化合物在具有不同细胞系敏感性的多个GBM细胞系中展示了广泛的活动,为将来的个性化医学运动提供了途径。患者的预后较差,治疗方案有限(通常是手术,然后进行化学放疗),导致抗药性的出现。我们的工作证明了在与ML串联串联中使用表型筛选的使用可以有效地识别具有很少已知分子靶标的高度异质指示中个性化处理的治疗铅。关键字:胶质母细胞瘤,人工智能,药物发现,机器学习简介胶质母细胞瘤多形(GBM)是人类成年人中最常见和最具侵略性的原发性脑肿瘤,其特征是遗传驱动因素的实质异质性和肿瘤微环境1-3。在过去20年中,新诊断的GBM患者的护理标准包括手术,替莫唑胺(TMZ)和电离辐射(IR),延长了12个月至15个月患者的总体生存期4,5。大规模的基因组分析增强了我们对GBM分子生物学的理解,后者支持
最后,我要感谢我的家人,感谢你们一直以来的支持。我希望我让你们为我感到骄傲,并将继续这样做。爸爸,谢谢你们一直相信我。伊萨姆,我的哥哥,我希望我能成为你们的灵感源泉,正如你一直告诉我的那样。我最亲爱的妈妈和我的妹妹海法,这一成就,以及你们所说的成功,是对你们无尽的支持、爱和牺牲的证明。妈妈,你不懈的努力、对我的信任以及在所有挑战中陪伴着我,一直是我的力量源泉。海法,你的鼓励和陪伴让我脚踏实地,充满动力。我希望这一里程碑能带给你们和你带给我生命中的快乐和自豪一样多。我会一直努力让你们为我感到骄傲,因为你们塑造了今天的我。还有我的妹妹胡埃达,我为她感到无比自豪,你教会了我很多东西,我永远敬佩你。你的毅力、自信和取得更大成就的动力是我不断的灵感源泉。你每天都让我惊叹不已。Pitouti,我爱你。Wenti outi,wenti zeda,wenti zeda,wenti zeda……。
摘要目的:在现实世界中描述一种方法,以通过公共牙科服务与斯德哥尔摩地区的公共牙科服务与初级卫生保健之间的跨专业协作来识别患有未诊断前观和2型糖尿病的人。设计:描述性观察性研究。设置:该研究是在瑞典斯德哥尔摩地区的七个地点进行的。每个合作网站都由一家初级健康诊所和牙科诊所组成。主题:研究参与者包括18岁以上的成年人,他们访问了公共牙科服务,并且没有糖尿病前期或2型糖尿病的病史。主要结果指标:根据公共牙科服务的风险评估协议进行选择性筛查。在调查的方法(牙科和糖尿病)中,被诊断为龋齿和/或牙周炎的成年人被转介给初级卫生保健诊所,用于筛查糖尿病前期和2型糖尿病。结果:Dentdi在2017年至2020年之间在七个地点引入,所有这些都继续使用该方法。共有863名来自公共牙科服务的参与者转交给了初级卫生保健。中有396人接受了在初级卫生保健中心进行筛查的邀请。24个人不符合纳入标准,导致研究中总共包括372人。在372名参与者中,27%(101)的葡萄糖水平升高,其中12个被诊断为2型糖尿病,根据研究分类为89个糖尿病。结论:Dentdi是一种可行的跨专业协作方法,每个专业都会在日常临床实践中所包含的能力,以早日鉴定患有糖尿病前观察和2型糖尿病的人,并具有完整的护理链。目标是在斯德哥尔摩县甚至瑞典的其他地区传播这种方法。
计划要求接种三剂疫苗。您将在第一次预约时接种第一剂,一个月后接种第二剂,六个月后接种第三剂。根据实习日期,有些学生可能需要在第 0 天、第 7 天和第 21 天加快接种计划。第三次接种疫苗后至少四周,您需要进行血液检查,以确保您对疫苗接种有反应。在某些情况下,由于免疫水平不够,需要加强接种。有些人对疫苗接种没有反应,因此不会产生免疫力。识别这些人很重要,这样我们才能建议您在接触患者体液时该怎么做。暴露后治疗是可行的,可以帮助预防感染。
摘要 蛋白质是细胞中的关键分子,其丰度不仅在基因表达水平而且在转录后水平受到广泛调控。在这里,我们描述了一种酵母基因筛选方法,该方法能够系统地表征蛋白质丰度调控在基因组中的编码方式。该筛选方法结合了 CRISPR/Cas9 碱基编辑器来引入点突变,并对内源性蛋白质进行荧光标记以方便流式细胞仪读数。我们首先使用单个 gRNA 以及正向和负向选择筛选对酵母中的碱基编辑器性能进行了基准测试。然后,我们研究了 16,452 种基因扰动对代表各种细胞功能的 11 种蛋白质丰度的影响。我们发现了数百种调控关系,包括 GAPDH 同工酶 Tdh1/2/3 与 Ras/PKA 通路之间的新联系。许多已识别的调节因子特定于这 11 种蛋白质中的一种,但我们还发现了一些基因,这些基因在受到扰动时会影响大多数测试蛋白质的丰度。虽然更具体的调控因子通常作用于转录,但广泛的调控因子往往在蛋白质翻译中发挥作用。总的来说,我们的新筛选方法为蛋白质调控网络的组成部分、规模和连通性提供了前所未有的见解。