复杂性,遗传变异性以及伦理限制是对人类研究的固有的,这使得在基本和应用研究中不可避免地使用模型生物。至关重要的是,假定物种的基本生物过程非常相似,并且对一种物种的详细研究将提供有关(远)相关物种的生物学的宝贵信息。在本课程中,将提供最受欢迎的模型物种的概述,以及它们的历史和生物学。我们将强调每个模型对生物学的贡献。在模仿疾病时,动物模型有时不足。新技术 - 3D细胞培养,诱导多能干细胞,基因编辑和芯片中的器官 - 导致解决方案用于替代,炼油和减少动物模型。目标是为学生提供对这些概念的介绍。
胶质母细胞瘤(GBM)是一种恶性和侵略性脑肿瘤,由于结构和细胞态在结构和细胞状态下,由于内部和肿瘤间异质性而难以治疗。GBM肿瘤的一个特征是围绕坏死核的缺氧利基存在。传统的体外模型(如单层和肿瘤培养物)衍生自患者样品的培养物并未概括这些特征,这可能会导致评估新的治疗策略的困难。将GBM细胞培养为类器官,可能会提供更好的方法来保留父肿瘤的表型,这是由于3D器官结构内存在明显的低氧和非催眠区域。在这里,我们提出了一种基于Hubert等人发表的方案,使用Neurocult™NS-A增殖介质从肿瘤培养物中产生GBM器官的方案。(2016)。1
转化和基因组编辑技术是从基础研究到实用材料生产、植物育种等实际应用领域中不可或缺的技术。在植物研究中,遗传转化、基因组编辑技术、个体再生以及组织和细胞培养系统都是必不可少的。组织培养研究始于20世纪初。Haberlandt(1902)提出植物细胞具有全能性,这通过发现从生长中的愈伤组织中分化出的不定芽得到证实(White等人,1939)。随后,许多研究人员尝试诱导不定芽和根的分化。组织和细胞培养技术的突破是植物激素的发现,例如细胞分裂素和生长素。研究发现,控制细胞分裂素与生长素的比例可以调节烟草的不定芽和根的分化(Skoog和Miller,1957)。Steward等人(1958)和Reinert(1959)从胡萝卜愈伤组织诱导体细胞胚再生出完整的植物。该生长过程在形态上类似于受精卵的胚胎发育,因此再生被称为体细胞胚胎发生。这一认识为研究分化机制和应用遗传转化和基因组编辑提供了一种重要方法。同时,许多用于培养组织和细胞的基础培养基也被开发出来,其中一些至今仍在使用。Murashige 和 Skoog (1962) 报道了一种通过培养烟草髓细胞来优化营养浓度的培养基(MS 培养基)。Gamborg 等人 (1968) 报道了用于培养大豆根尖细胞的 B5 培养基。其他已建立的培养基包括 White 培养基(White 1963)、LS 培养基(Linsmaier 和 Skoog 1965)、NN 培养基(Nitsch 和 Nitsch 1969)、N6 培养基(Chu 1978)和 AA 培养基(Müller 和 Grafe 1978)。通过调节植物激素条件、改变碳源、改良无机盐等,可以开发出适合每种植物材料的培养基。
宏基因组测序是一种最近可行的方法,可以同时表征样品中的ARG,微生物组和病原体的数据,与分离和培养细菌相比,它是一种更有效,更全面的方法。对宏基因组数据的典型分析涉及一种基于组装的方法或基于读取的方法,每种方法都有其自身的好处和限制。宏基因组装配允许对ARGS进行上游或下游研究,并提供对其起源的准确识别。但是,这种方法可能导致信息丢失,因为低覆盖的基因组通常不会组装。相比之下,基于读取的方法可实现所有可用数据的映射,但缺乏探索周围基因组环境或提供准确分类分类的能力。为了应对这些挑战,我们开发了Balrog-mon,这是一种多功能且可重现的NextFlow管道,用于测量病原体和元基因组长阅读测序的ARG,提供“组装”和“无装配”工作流程选项。
多能干细胞 (PSC) 的分化及其向类器官的自组织受到细胞间相互作用的影响,这些相互作用由接触和分泌分子介导。由于限制和小的培养体积,这些相互作用在微流体液滴中得到增强。然而,尚未对液滴内 PSC 的培养及其微环境的影响进行全面研究。在本研究中,我们提出了一个液滴平台,用于在细胞定型的各个阶段对 PSC 进行 3D 培养。我们展示了 PSC 分化为三个胚层以及在液滴内形成类器官的可行性。我们的研究结果表明,在密闭空间中培养 PSC 可以调节细胞命运决定,通过依次诱导不同分化细胞群的生长和迁移来促进类原肠胚中的组织模式形成,并促进心脏类器官的自组织。这种技术方法为体外调节组织自模式形成的内在因素提供了独特的见解。
•样本收集:根据赫尔辛基宣布和机构审查委员会(IRB)批准,收集新鲜的组织样本。•器官推导条件:基于器官的血清培养培养基,低O 2孵育,超低附着板(ULA)和Matrigel底物,具体取决于肿瘤类型。•功能性药物筛查:在384个井板中播种器官,在37 o C下孵育6天•6天•读数:通过ATP(细胞滴度发光)的生存能力•分析(Sengine App):使用15至1的新颖分数(SPM)对响应的内部分析进行了分析,并在响应中进行了分析,并分析了绝对分析和分析的响应和分析。pDTO被归类为敏感与抗性,对响应进行了排名:异常/良好/中等/低。
传统的环境实验,包括PH,EC,TN,TOC,BOD 5和COD和腐殖质分析,IR,GC,HPLC,LC-MS和ICP-MS,以及使用斑马鱼模型等水生毒性实验等。传统的微生物学实验,包括使用Omnilog TM,AST,MIC测试和表型外源性质粒隔离的培养,电镀,生长曲线,使用滤波器交配测定流式细胞仪知识和用户经验;细胞染色,计数和排序等。分子微生物学实验,包括底漆设计,PCR,QPCR,多重PCR,质粒键入,质粒固化,CRISPR和TRADIS动手经验,克隆;基因组和质粒DNA分离和纯化(通过机器人和手动),Illumina和Nanobore测序文库的准备和装置上的负载;序列分析和数据库搜索个人技能
本文件为评估涉及毒性测试以及用于废水和地表水毒性测试的淡水和海洋鱼类、无脊椎动物和植物培养的生物实验室提供指导方针。涵盖的主题包括:评估标准、审计和评估准备、组织历史、实验室人员、设施、设备和用品、方法、样品收集、处理和保存、质量保证、记录和数据报告、安全和报告准备。执行水生生物实验室现场审计和评估的评估员必须具备 NPDES 计划的工作知识,并具备足够的生物监测和毒性测试方法知识和经验。本手册旨在帮助国家污染物排放消除系统 (NPDES) 评估员/检查员执行美国环境保护署 (1988a)《NPDES 合规性检查手册》中规定的合规性评估检查 (CEI) 和绩效审计检查 (PAI)。
(学分:理论3)(教学时间 - 4)课程目标:了解微生物学的基础知识并了解环境中的作用。提供对微生物世界,微生物的基本结构和功能,代谢,营养,其多样性,生理学以及与环境和人类健康的关系的基本理解。具有隔离和操纵条件的实用技能。确保学生了解微生物的结构和功能。单元 - I(10小时)微生物多样性:微生物学,历史和微生物学范围,一般特征和分类的古细菌,细菌,真菌,藻类,原生动物,病毒,病毒和王室的基础。原核生物和真核生物之间的差异。单位II(15小时)细菌的超微结构:细胞结构 - 细菌及其生物合成的细胞壁,细胞包膜 - 胶囊和粘液层,细胞附加物 - pili,鞭毛,鞭毛和脂肪,细胞膜,细胞膜,包含体,质粒DNA和质子DNA和染色体和染色体DNA。细菌遗传学 - 结合,转导(广义和专业化)和转化。单位-V(10小时)微生物控制:灭菌,消毒,反杂质,熏蒸。物理控制:温度(潮湿的热量,高压灭菌,干热,热空气烤箱和焚化炉),干燥,渗透压,辐射,紫外线,电力,超声波,超声波波,过滤。化学控制:防腐剂和消毒剂(卤素,酒精,气态灭菌)课程学习结果(CLO):学生将能够1。2。单元-III(15小时)显微镜:染色 - 染色(简单和微分)显微镜的原理和类型 - 光学显微镜(明亮场,暗场,相位对比,荧光显微镜)和电子显微镜的原理,原理和申请营养类型,培养基类型的制备,微生物的培养,微生物生长曲线,病毒复制:裂解和裂解性周期,微生物的隔离,保存和维持微生物,有氧和厌氧的细菌培养,生物效应以及生物因素的作用以及生物因素对生长的生长。定义了微生物学的科学,其发展和在人类福利中的重要性。描述自发产生的历史概念以及执行
(学分:理论3)(教学时间 - 4)课程目标:了解微生物学的基础知识并了解环境中的作用。提供对微生物世界,微生物的基本结构和功能,代谢,营养,其多样性,生理学以及与环境和人类健康的关系的基本理解。具有隔离和操纵条件的实用技能。确保学生了解微生物的结构和功能。单元 - I(10小时)微生物多样性:微生物学,历史和微生物学范围,一般特征和分类的古细菌,细菌,真菌,藻类,原生动物,病毒,病毒和王室的基础。原核生物和真核生物之间的差异。单位II(15小时)细菌的超微结构:细胞结构 - 细菌及其生物合成的细胞壁,细胞包膜 - 胶囊和粘液层,细胞附加物 - pili,鞭毛,鞭毛和脂肪,细胞膜,细胞膜,包含体,质粒DNA和质子DNA和染色体和染色体DNA。细菌遗传学 - 结合,转导(广义和专业化)和转化。单位-V(10小时)微生物控制:灭菌,消毒,反杂质,熏蒸。物理控制:温度(潮湿的热量,高压灭菌,干热,热空气烤箱和焚化炉),干燥,渗透压,辐射,紫外线,电力,超声波,超声波波,过滤。化学控制:防腐剂和消毒剂(卤素,酒精,气态灭菌)课程学习结果(CLO):学生将能够1。2。单元-III(15小时)显微镜:染色 - 染色(简单和微分)显微镜的原理和类型 - 光学显微镜(明亮场,暗场,相位对比,荧光显微镜)和电子显微镜的原理,原理和申请营养类型,培养基类型的制备,微生物的培养,微生物生长曲线,病毒复制:裂解和裂解性周期,微生物的隔离,保存和维持微生物,有氧和厌氧的细菌培养,生物效应以及生物因素的作用以及生物因素对生长的生长。定义了微生物学的科学,其发展和在人类福利中的重要性。描述自发产生的历史概念以及执行
