图2。集成的工作流解决方案,以支持过程开发和GMP环境。Resdnaseq DPCR大肠杆菌DNA试剂盒是生物药物制造过程中用于杂质测试的集成工作流程的一部分。使用Applied Biosystems™PrepSeq™残留DNA样品制备试剂盒的Thermo Scientific™Pharma Flex themo Scientific™Pharma Flex™Flex 96深孔磁性颗粒处理器可确保残留大肠杆菌DNA的高恢复,甚至减少劳动力减少,甚至来自最复杂的样品矩阵的误差较小。使用Applied Biosystems™QuantStudio™Absolute Q™软件简化了数据分析,该软件提供了准确的定量和安全性,审核和电子签名(SAE)功能,以启用21 CFR Part 11的合规性。
定量 PCR (qPCR) 和数字 PCR (dPCR) 用于定量生物样本中的特定核酸。这两种技术都适用于许多应用,但在从通量到灵敏度等许多方面存在差异。那么,哪种方法更适合您的实验室应用呢?
摘要。随着基因和细胞治疗产品数量的不断增加,分子技术在生物分析实验室中的应用也变得越来越普遍。目前,这些技术尚无生物分析监管指南,合同研究组织依赖科学判断和最佳实践来执行这项工作,以符合 GxP 要求,用于支持生物分布和载体脱落的临床前和临床研究。本文介绍了定量聚合酶链反应 (qPCR) 和数字 PCR (dPCR) 检测的开发和验证过程和原理,如 2021 年 AAPS 为期两天的 qPCR 协调研讨会上所述。本文的范围包括利用这些技术的生物分析验证参数和验收标准。此外,本文还将重点介绍这些分子技术的优缺点,并说明应避免的常见陷阱。本文旨在提供最佳实践、工作建议和促进未来的监管指导。
在欧洲市场上销售的基因编辑生物及其衍生食品和饲料产品属于 2001/18/EC 指令的范围。因此,专门检测和量化它们的可能性已成为优先事项。为此,基于 PCR 的方法(例如实时 PCR 和数字液滴 PCR)有望适用于基因编辑生物携带的单个变异点,即使在技术层面上可能具有挑战性。但是,还可能遇到与结果解释相关的其他问题。事实上,考虑到它可能通过自然或育种计划传播,这种单一变异的存在并不能自动证明基因编辑生物的存在。为了克服这一关键问题,我们提出了一个通用工作流程来开发和验证一种针对基因编辑生物的 PCR 方法,以针对其单个变异点。首先,基于计算机模拟分析,评估技术设计基于 PCR 的方法以及使用其单个变异点区分基因编辑生物的可能性。如果确认了这些参数,则将根据转基因检测的最低性能要求测试所开发的 PCR 方法的性能。通过开发一种专门针对携带单核苷酸插入的基因编辑大米的 2 重数字液滴 PCR 方法,成功地说明了所提出的一般工作流程的使用。因此,所提出的工作流程被视为支持主管部门进行食品和饲料可追溯性的关键工具。
重新混合或改编本材料用于任何目的,无需注明原作者。预印本(未经同行评审认证)在公共领域。它不再受版权限制。任何人都可以合法共享、重复使用,版权所有者已将此版本发布于 2020 年 4 月 14 日。;https://doi.org/10.1101/2020.04.13.039297 doi:bioRxiv 预印本