越来越多的研究报告说,细菌DNA甲基化具有重要的功能,超出了其在限制性修饰系统中的作用,包括影响临床相关的表型,例如毒力,宿主定殖,孢子孢子,生物膜形成等。尽管有洞察力,但此类研究在很大程度上具有临时的性质,并且将从系统的策略中受益,从而实现微生物学界对细菌甲基瘤的联合功能表征。在这种意见中,我们建议高度保守的DNA甲基转移酶(MTases)代表了细菌表观基因组学研究的独特机会。这些MTases在细菌中很常见,跨越各种分类法,并且存在于多种人类病原体中。除了具有良好特征的核心DNA MTase,例如来自Vibrio Cholera,Salmonella Enterica,梭状芽胞杆菌艰难梭菌或化脓性链球菌的核心MTase,在许多人类病原体中也发现了多个高度保守的DNA MTase,其中包括属于Burkholderia属的人和阿科氏菌。我们讨论了为什么以及如何优先考虑这些MTase,以使社区范围内的综合方法进行功能基氏症研究。最终,我们讨论了一些高度保守的DNA MTases如何成为开发新型表观遗传抑制剂以用于生物医学应用的有希望的靶标。
tardrade是微小无脊椎动物,能够承受极端的环境条件,包括高辐射水平。tardigrade蛋白DSUP(损伤抑制器)在严重的环境压力和X射线上保护Tardigrade的DNA。在癌细胞中表达时,DSUP可保护DNA免受辐射诱导的单链和双链断裂(DSB)的侵害,增加辐照细胞的存活,并保护DNA免受活性氧。DSUP的这些异常特性表明,了解蛋白质功能如何有助于设计可以在放疗或太空旅行期间保护人类的小分子的设计。在这里,我们研究了DSUP是否在大鼠胚胎培养的皮质神经元中具有保护性。我们发现,在皮质神经元中,密码子优化的DSUP定位于细胞核,令人惊讶地促进了神经毒性,导致神经变性。出乎意料的是,我们发现DSUP表达会导致培养的神经元中DNA DSB的形成。使用电子显微镜,我们发现DSUP促进了染色质凝结。与DSUP在癌细胞中的保护特性不同,神经元中DSUP促进神经毒性,诱导DNA损伤,并重新排列染色质。总的来说,神经元对DSUP敏感,DSUP是神经元细胞中DNA保护的替代替代物。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2025年3月5日。 https://doi.org/10.1101/2025.03.03.03.641186 doi:Biorxiv Preprint
第1,2节研究确定性计算。计算的非确定性方面(输入,互动,错误,随机化等)在高级理论和实践中至关重要且具有挑战性。将它们定义为确定性计算的扩展很简单。后者在概念上更简单,需要精心设计的模型才能进行定义。如果我们需要对所有必需的资源进行精确度量,那么这些模型可能会很复杂。但是,如果我们只需要定义可计算的内容并获得所需资源的非常粗糙的幅度,则所有合理的模型都相同,即使是最简单的模型。我们将非常关注这个令人惊讶和重要的事实。最简单的模型对于证明负面结果最有用,并且最有用的模型可用于积极结果。我们从所有模型共同的术语开始,逐渐使其更具体地针对我们实际研究的术语。我们表示计算为图:边缘反映了节点(事件)之间的各种关系。节点,边缘具有属性:标签,状态,颜色,参数等。(影响计算或其分析)。因果边缘从每个事件运行到其出现或属性所必需的所有事件。它们形成有向无环图(尽管可以人为地添加循环以标记计算的外部输入部分)。我们将仅研究同步计算。他们的节点具有时间参数。它反映了逻辑步骤,不一定是任何物理时钟的精确值。其他称为平行。因果边缘仅跨越短(通常为\ leq 3时刻)时间间隔。节点原因中的一个事件称为其父。指针边缘将每个事件的父级连接到其所有其他可能的原因,并反映允许同时事件相互作用并具有关节效应的连接。用相同来源的指针具有不同的标签。给定时间的事件/边缘的(标记)子图是模型的即时内存配置。每种非末端配置都有可能会更改的活动节点/边缘。在计算的任何步骤中只有一个小活动区域的模型都是顺序的。
abtract-由于石墨烯的独特特性,由于它的发现,因此已经提出了从化学传感器到晶体管的不同领域中的许多应用。石墨烯最重要的应用之一是在拉曼光谱法的增强中,最近引起了科学家的注意。本文研究了其作为拉曼增强的底物的潜力,称为石墨烯增强拉曼光谱(GERS)。我们使用若丹明6G(R6G)和晶体紫(CV)来说明氧化石墨烯对拉曼增强的影响。表明,与沉积在裸玻璃基板上的液溶液沉积在石墨烯基底物上沉积的若丹明6G和晶体紫溶液的拉曼峰显着增加。使用拉曼光谱仪,拍摄了这些材料的拉曼光谱,并比较了它们的图。表明,该方法可以增强若丹明6G和晶体紫的分子的拉曼信号。
上下文。自适应光学器件(AO)是一种允许地面望远镜的角度分辨率的技术。波前传感器(WFS)是此类系统的关键组成部分之一,驱动基本的性能限制。目标。在本文中,我们专注于特定类别的WFS:傅立叶过滤波前传感器(FFWFSS)。此类以其极高的灵敏度而闻名。然而,缺乏任何类型的FFWF的清晰而全面的噪声传播模型。方法。考虑到读出的噪声和光子噪声,我们得出了一个简单而全面的模型,使我们能够了解这些噪声如何在线性框架中的相重建中传播。结果。这种新的噪声传播模型适用于任何类型的FFWF,它允许人们重新审视这些传感器的基本灵敏度极限。此外,还进行了广泛使用的FFWFSS之间的新比较。我们专注于使用的两个主要FFWFS类:Zernike WFS(ZWFS)和金字塔WFS(PWFS),从而带来了对其行为的新理解。
1。对本文档中电路,软件和其他相关信息的描述仅供说明半导体产品和应用程序示例的操作。您对产品或系统设计中的电路,软件和信息的合并或任何其他用途完全负责。renesas电子设备对您或第三方造成的任何损失和损失均不承担任何责任,而这些损失和损失是由于使用这些电路,软件或信息而引起的。2。Renesas Electronics特此明确违反了对侵权或涉及第三方的专利,版权或其他知识产权的任何其他要求,或者是由于使用Renesas电子产品或本文档中描述的肾上腺电子产品或技术信息所产生的,包括但不限于产品,图形,图形,图表,图表,Algorith和Algorith和Algorith,以及不限于本文档中的技术或技术信息。3。在任何专利,版权或其他知识产权的权利下,没有明示,隐含或其他方式的许可证。4。您应负责确定任何第三方需要哪些许可证,并获得合法进出口,出口,制造,销售,利用,分销或其他任何产品(如果需要)的任何产品(如果需要)的任何产品。5。您不得更改,修改,复制或反向工程师,无论是全部还是部分。6。“高质量”:运输设备(汽车,火车,船舶等。7。renesas电子设备对您或第三方造成的任何损失或损害赔偿均不承担任何责任,这些损失或损失是由于这种更改,修改,复制或反向工程而引起的。Renesas电子产品根据以下两个质量等级进行分类:“标准”和“高质量”。每种Renesas电子产品的预期应用都取决于产品的质量等级,如下所示。“标准”:计算机;办公设备;通信设备;测试和测量设备;音频和视觉设备;家用电子电器;机床;个人电子设备;工业机器人;等。);交通控制(交通信号灯);大规模通信设备;关键财务终端系统;安全控制设备;等。除非在Renesas电子数据表或其他Renesas电子文档中明确指定为高可靠性产品或用于恶劣环境的产品,否则Renesas电子产品不打算或授权用于可能对人类生活或人身伤害构成直接威胁的产品或系统(人为生命或人工生命支持设备或系统; ),或可能造成严重的财产破坏(太空系统;海底中继器;核电控制系统;飞机控制系统;关键工厂系统;军事设备;等)。 renesas电子设备对您或任何第三方造成的任何损害或损失均不承担任何责任,这些损失或损失与使用任何Renesas电子数据表,用户手册或其他Renesas Electronics Electronics文档相抵触的任何Renesas Electronics产品产生的任何损失。 8。 9。 10。),或可能造成严重的财产破坏(太空系统;海底中继器;核电控制系统;飞机控制系统;关键工厂系统;军事设备;等)。renesas电子设备对您或任何第三方造成的任何损害或损失均不承担任何责任,这些损失或损失与使用任何Renesas电子数据表,用户手册或其他Renesas Electronics Electronics文档相抵触的任何Renesas Electronics产品产生的任何损失。8。9。10。没有绝对安全的半导体产品。尽管有任何安全措施或功能在Renesas电子硬件或软件产品中可能实现,但Renesas Electronics绝对不承担任何责任或安全漏洞的责任,包括但不限于对使用Renesas电子产品或使用Renesas电子产品的任何未经授权访问或使用任何未经授权的访问或使用。Renesas电子产品不保证或保证Renesas电子产品或使用Renesas电子产品创建的任何系统都将是无敌的,或者不受腐败,攻击,病毒,干扰,黑客攻击,数据丢失或盗窃或其他安全入侵(“脆弱性问题”)。renesas电子设备不承担与任何漏洞问题有关或相关的所有责任或责任。此外,在适用法律允许的范围内,Renesas Electronics在本文档以及任何相关或随附的软件或硬件(包括但不限于对特定目的的承包商或适合性的隐含保证)方面违反任何明示或暗示的保证。使用Renesas Electronics产品时,请参阅最新产品信息(数据表,用户手册,应用程序注释,“可靠性手册中的处理和使用半导体设备的一般说明”,等等。),并确保使用条件在Renesas电子设备指定的范围内,相对于最高评级,操作电源电源电压范围,散热特性,安装等。11。12。13。14。renesas电子设备因使用此类指定范围以外的Renesas电子产品而引起的任何故障,失败或事故均不承担任何责任。尽管Renesas Electronics努力提高了Renesas电子产品的质量和可靠性,但半导体产品具有特定的特征,例如以一定速率发生故障和在特定使用条件下发生故障。除非指定为高可靠性产品或Renesas电子数据表或其他Renesas电子文档中恶劣环境的产品,否则Renesas Electronics产品不会受到辐射抗性设计。,您有责任采取安全措施,以防止火灾受到人身伤害,伤害或损害以及/或在雷纳斯电子产品失败或故障的情况下对公众造成的危险,例如硬件和软件的安全设计,包括但不限于预防裁员,防火和不适用任何其他适当的治疗方法,包括但不限于裁员预防或其他任何适当的脱发度量。由于仅对微型计算机软件的评估非常困难和不切实际,因此您负责评估最终产品或系统的安全性。请联系Renesas电子销售办公室,了解有关环境问题的详细信息,例如每种Renesas电子产品的环境兼容性。renesas电子设备因不遵守适用法律和法规而导致的任何损害或损失承担任何责任。您有责任仔细,充分调查适用的法律和法规,这些法律和法规,这些法规和使用受控物质(包括不限于欧盟ROHS指令),并根据所有这些适用的法律和法规使用Renesas Electronics指令。Renesas电子产品和技术不得用于或纳入任何适用于国内或外国法律或法规的产品或系统中的任何产品或系统。您应遵守任何由任何国家的政府颁布和管理的任何适用的出口控制法律法规,主张对当事方或交易的管辖权。是Renesas电子产品的买方或分销商的责任,或任何其他分发,处置或以其他方式将产品分发,处置或以其他方式将产品转交给第三方的当事方,在本文档中规定的内容和条件之前通知该第三方。未经Renesas Electronics事先书面同意,不得以任何形式重印,复制或重复任何形式。如果您对本文档中包含的信息或Renesas电子产品有任何疑问,请联系Renesas电子销售办公室。
1。对本文档中电路,软件和其他相关信息的描述仅供说明半导体产品和应用程序示例的操作。您对产品或系统设计中的电路,软件和信息的合并或任何其他用途完全负责。renesas电子设备对您或第三方造成的任何损失和损失均不承担任何责任,而这些损失和损失是由于使用这些电路,软件或信息而引起的。2。Renesas Electronics特此明确违反了对侵权或涉及第三方的专利,版权或其他知识产权的任何其他要求,或者是由于使用Renesas电子产品或本文档中描述的肾上腺电子产品或技术信息所产生的,包括但不限于产品,图形,图形,图表,图表,Algorith和Algorith和Algorith,以及不限于本文档中的技术或技术信息。3。在任何专利,版权或其他知识产权的权利下,没有明示,隐含或其他方式的许可证。4。您应负责确定任何第三方需要哪些许可证,并获得合法进出口,出口,制造,销售,利用,分销或其他任何产品(如果需要)的任何产品(如果需要)的任何产品。5。您不得更改,修改,复制或反向工程师,无论是全部还是部分。6。“高质量”:运输设备(汽车,火车,船舶等。7。renesas电子设备对您或第三方造成的任何损失或损害赔偿均不承担任何责任,这些损失或损失是由于这种更改,修改,复制或反向工程而引起的。Renesas电子产品根据以下两个质量等级进行分类:“标准”和“高质量”。每种Renesas电子产品的预期应用都取决于产品的质量等级,如下所示。“标准”:计算机;办公设备;通信设备;测试和测量设备;音频和视觉设备;家用电子电器;机床;个人电子设备;工业机器人;等。);交通控制(交通信号灯);大规模通信设备;关键财务终端系统;安全控制设备;等。除非在Renesas电子数据表或其他Renesas电子文档中明确指定为高可靠性产品或用于恶劣环境的产品,否则Renesas电子产品不打算或授权用于可能对人类生活或人身伤害构成直接威胁的产品或系统(人为生命或人工生命支持设备或系统; ),或可能造成严重的财产破坏(太空系统;海底中继器;核电控制系统;飞机控制系统;关键工厂系统;军事设备;等)。 renesas电子设备对您或任何第三方造成的任何损害或损失均不承担任何责任,这些损失或损失与使用任何Renesas电子数据表,用户手册或其他Renesas Electronics Electronics文档相抵触的任何Renesas Electronics产品产生的任何损失。 8。 9。 10。),或可能造成严重的财产破坏(太空系统;海底中继器;核电控制系统;飞机控制系统;关键工厂系统;军事设备;等)。renesas电子设备对您或任何第三方造成的任何损害或损失均不承担任何责任,这些损失或损失与使用任何Renesas电子数据表,用户手册或其他Renesas Electronics Electronics文档相抵触的任何Renesas Electronics产品产生的任何损失。8。9。10。没有绝对安全的半导体产品。尽管有任何安全措施或功能在Renesas电子硬件或软件产品中可能实现的任何安全措施或功能,但Renesas Electronics绝对不承担任何责任,包括任何漏洞或安全漏洞,包括但不限于对使用Renesas Electronics或使用Renesas电子产品的任何未经授权访问或使用任何未经授权的访问或使用。Renesas电子产品不保证或保证Renesas电子产品或使用Renesas电子产品创建的任何系统都将是无敌的,或者不受腐败,攻击,病毒,干扰,黑客攻击,数据丢失或盗窃或其他安全入侵(“脆弱性问题”)。renesas电子设备不承担与任何漏洞问题有关或相关的所有责任或责任。此外,在适用法律允许的范围内,Renesas Electronics在本文档以及任何相关或随附的软件或硬件(包括但不限于对特定目的的承包商或适合性的隐含保证)方面违反任何明示或暗示的保证。使用Renesas Electronics产品时,请参阅最新产品信息(数据表,用户手册,应用程序注释,“可靠性手册中的处理和使用半导体设备的一般说明”,等等。),并确保使用条件在Renesas电子设备指定的范围内,相对于最高评级,操作电源电源电压范围,散热特性,安装等。11。12。13。14。renesas电子设备因使用此类指定范围以外的Renesas电子产品而引起的任何故障,失败或事故均不承担任何责任。尽管Renesas Electronics努力提高了Renesas电子产品的质量和可靠性,但半导体产品具有特定的特征,例如以一定速率发生故障和在特定使用条件下发生故障。除非指定为高可靠性产品或Renesas电子数据表或其他Renesas电子文档中恶劣环境的产品,否则Renesas Electronics产品不会受到辐射抗性设计。,您有责任采取安全措施,以防止火灾受到人身伤害,伤害或损害以及/或在雷纳斯电子产品失败或故障的情况下对公众造成的危险,例如硬件和软件的安全设计,包括但不限于预防裁员,防火和不适用任何其他适当的治疗方法,包括但不限于裁员预防或其他任何适当的脱发度量。由于仅对微型计算机软件的评估非常困难和不切实际,因此您负责评估最终产品或系统的安全性。请联系Renesas电子销售办公室,了解有关环境问题的详细信息,例如每种Renesas电子产品的环境兼容性。renesas电子设备因不遵守适用法律和法规而导致的任何损害或损失承担任何责任。您有责任仔细,充分调查适用的法律和法规,这些法律和法规,这些法规和使用受控物质(包括不限于欧盟ROHS指令),并根据所有这些适用的法律和法规使用Renesas Electronics指令。Renesas电子产品和技术不得用于或纳入任何适用于国内或外国法律或法规的产品或系统中的任何产品或系统。您应遵守任何由任何国家的政府颁布和管理的任何适用的出口控制法律法规,主张对当事方或交易的管辖权。是Renesas电子产品的买方或分销商的责任,或任何其他分发,处置或以其他方式将产品分发,处置或以其他方式将产品转交给第三方的当事方,在本文档中规定的内容和条件之前通知该第三方。未经Renesas Electronics事先书面同意,不得以任何形式重印,复制或重复任何形式。如果您对本文档中包含的信息或Renesas电子产品有任何疑问,请联系Renesas电子销售办公室。
。cc-by-nc 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本于2025年3月3日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.27.640170 doi:biorxiv preprint
细胞已经进化了分子机制的武器,以应对DNA的主要结构的连续改变。在细胞水平上,DNA损伤反应蛋白在DNA损伤部位积聚并组织成核灶。由Errol Friedberg所讲述的是,在1930年代,DNA修复的开创性工作受到物理学家与遗传学家之间的合作的刺激。近年来,物理学对自组织隔室的想法引入了风暴的细胞生物学领域。渗滤和相分离理论越来越多地用于模拟隔室的自组装,称为生物分子冷凝物,这些隔离式凝聚力有选择地浓缩没有周围膜的分子。在这篇评论中,我们在DNA损伤响应的背景下讨论了这些概念。我们讨论了将DNA修复灶作为cON致密的研究如何将分子机制与细胞生理功能联系起来,为调节机制提供新的见解,并为针对治疗目的的DNA损伤响应提供开放的新观点。