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使用真实世界医疗保健数据库识别糖尿病药物：丹麦和澳大利亚对称性分析
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TCMBank-最大的中医数据库，提供深度学习
亲爱的编辑： 在中药现代化中，确定草药中的有效成分和阐明有效成分与靶标之间的作用机制是两个关键方面。建立一个全面且高可靠性的中药数据库是非常可取的。我们的 TCM Database@Taiwan1 自 2011 年成立以来，已被广泛使用和大量引用，并且还被收录到 ZINC 数据库 2 中。我们使用自然语言处理，建立了知识图谱和分子信号传导通路来建立中药数据库 TCMBank ( https://TCMBank.cn/ )，它从 TCM Database@Taiwan 扩展而来，包括 9192 种草药、61,966 种成分、15,179 个靶标和 32,529 种疾病。更新后的中药库将中药成分数量由32,364种扩充至61,966种（非重复），并增加了靶点和疾病两个新数据字段。具有连接信息的中药数量为9010种，中药平均连接边数为16.05。具有连接信息的成分数量为54,676种，中药平均连接边数为5.26。TCMBank以mol2格式提供中药成分的三维结构，并提供与外部公共数据库的交叉引用链接，如CAS、DrugBank、PubChem、MeSH、OMIM、DO、ETCM、3 HERB、4等。目前，TCMBank是最全面、可下载、最大的非商业中药数据库，TCMBank与其他中药相关数据库的数据规模比较见图1 a。中西药库提供了一个方便的用户自由探索草药、成分、基因靶点与相关途径或疾病之间的关系的网站（图1b）。图1c展示了中西药库的建立流程，包括文本挖掘策略、智能文档识别模块等。所有与中药相关的信息必须经过志愿者至少两次的人工验证，以确保中西药库数据的可靠性。中西药之间的不良反应会导致医疗费用增加，甚至死亡。据估计，超过10%的患者需要同时服用五种药物，20%的老年患者需要同时服用至少十种药物，这大大增加了中西药互斥带来的医疗风险。中西药互斥反应的鉴别在临床上主要依靠生化分析。然而，这个过程非常耗费人力和物力。基于人工智能的中西药互斥预测需要大量带有不良反应标签的中西药配对。目前中西药互斥数据集尚不完善，而目前有两个现实世界的公共药物相互作用（DDI）数据集：DrugBank 和 TWOSIDES。在前期工作中，我们首先提出了两个模型，3DGT-DDI 5 和 SA-DDI, 6 在 DDI 数据集上预测两种化合物之间的相互作用。
AACR GENIE 数据库中软组织和骨肉瘤中组织学无关靶点的分析
肉瘤是一类异质性罕见癌症，具有共同的间叶来源。然而，特定亚型的肉瘤具有不同的临床、病理和分子特征，导致对目前批准的标准治疗方法的反应不同，总体预后也各异 ( 1 )。尽管肉瘤种类繁多（目前世界卫生组织 (WHO) 的分类将肉瘤分为约 100 种组织学亚型），但在过去 40 年中，一刀切的治疗方法一直主导着晚期软组织肉瘤 (STS) 的治疗。骨肉瘤的治疗方法类似。尽管化疗最初在总体生存率方面取得了显著进展，但目前仅有传闻中的靶向疗法或免疫疗法被批准用于治疗肉瘤。因此，临床上迫切需要从分子水平上了解这些肿瘤，以“打破天花板”并显著影响这些患者的预后（2、3）。在多样化和罕见的肉瘤群体中，开发个性化、分子信息疗法具有挑战性。因此，目前只有一小部分软组织或骨肉瘤患者能从基因组靶向治疗中受益（4-7）。目前，美国食品药品管理局 (FDA) 批准用于治疗肉瘤的生物标志物靶向疗法很少，包括针对胃肠道间质瘤 (GIST) 的 KIT 和 PDGFRA、腱鞘巨细胞瘤的 CSF1R、上皮样肉瘤的 EZH2、血管周上皮样细胞分化瘤 (PEComa) 的 mTOR 和炎性肌成纤维细胞瘤的 ALK（ 4 , 7 – 10 ）。在过去十年中，随着对多种肿瘤类型致癌分子改变的了解不断加深，以及高效靶向疗法的出现，开启了药物开发的新时代，其特点是与组织学无关、生物标志物驱动的疗法（ 11 ）。在这个新时代，正在开发用于治疗特定分子改变的疗法，无论肿瘤组织来源如何。迄今为止，FDA 已批准六种药物作为组织学不可知论疗法，针对四种不同的分子生物标志物（12-16）。组织学不可知论开发首次被认可为一种新的药物审批监管途径，是因为微卫星不稳定性高 (MSI-H) 表型被认定为抗 PD-1 免疫检查点抑制剂疗效的预测生物标志物。这引发了一系列试验，研究使用 pembrolizumab 治疗来自不同原发来源的 MSI-H 肿瘤患者。初始疗效结果显著；总体缓解率 (ORR) 为 39%，包括具有 15 种不同肿瘤组织学的患者。此外，这种反应的持久性令人印象深刻——78% 的反应在六个月后持续 (17)。这些结果是 FDA 历史上不分组织学批准派姆单抗用于 MSI-H 肿瘤患者的基础。从那时起，派姆单抗的疗效已在更多患者中得到证实。此外，另一种抗 PD-1 药物 dostarlimab-gxly 也已获批用于相同适应症 ( 12 , 14 )。随后，拉罗替尼和恩曲替尼获批用于治疗 NTRK 融合实体瘤，派姆单抗获批用于治疗高肿瘤突变负荷 (TMB-H) 实体瘤，最近，达拉非尼和曲美替尼联合用药获批用于治疗 BRAF V600E 突变实体瘤 ( 13 ,
Synecosys®-...
Synecosys®还是具有直观用户界面的一站式单细胞数据可视化和采矿平台，可访问单个单元格数据。Celeviz TM数据可视化模块嵌入到数据库中，以提供与主要科学期刊要求兼容的优雅图形数据可视化。Celelens TM模块通过可调分析参数和注释促进自动数据分析管道。
tallo：全球树的异构和皇冠架构数据库
Tommaso Jucker 1 | FabianJörgFischer1 | JérômeChave2.3 | David A. Coomes 4 |约翰·卡斯珀森（John Caspersen）5 | Arshad Ali 6 | Grace Jopaul Loubota Panzou 7.8 | Ted R. Feldpousch 9 |丹尼尔·福特（Daniel Falster）10 | Vladimir A. Usoltsev 11,12 | Stephen Adu-Bredu 13 | Luciana F. Alves 14 | Mohammad Aminpour 15 | Ilondoa B. Angoboy 16 | Niels P. R.天线17 | CécileAntin 18 | Yousef Askari 19 | RodrigoMuñoz20,21 | Narayanan Ayyappan 22 | Patricia Balvanera 23 | Lindsay Banin 24 | Nicolas Barbier 18 | John J.
搜索“主要” AWE 档案数据库和其他问题
'1.请搜索“主要”AWE 档案数据库（我指的是 AWE 提供视频信息帮助的最大单一档案，或由主题专家判断最有可能包含请求类型信息的档案）。请告知我此数据库在 AWE 内通常使用的名称。2.请根据可用的关键字和此索引的分类，根据需要搜索以下术语：a) 如果索引允许使用此术语进行搜索，则搜索“TCHD”，如果不使用此术语，则搜索“Transport”。b) 如果需要对武器类型进行搜索，则搜索“Trident”或（如果不使用此术语）“Holbrook”。请同时搜索这两个术语。3.请从最新可用记录开始搜索，并继续回溯，直到达到成本限制。4.请向我提供此搜索方法选择的每个条目的标题和日期，无论它们是否可能是不符合搜索条件的“误报”。如果任何标题由于被视为《信息自由法》豁免而无法透露，请提供删节的条目。5.我希望以列表的形式接收此信息，其中显示每个已识别项目的标题和生产日期，并建议这是 AWE / MoD 准备此信息的最简单和最具成本效益的方式。国防部已经能够根据先前的信息请求向我提供列表，但如果您认为您无法向我提供列表，请向我提供每个数据库条目的副本，如有必要，请以 pdf 文档格式提供屏幕截图。请确保屏幕截图清晰易读。6.请告知我您对此请求的回应中采用的提取所请求信息的方法。'
利用人工智能数据库减少欺诈 - 富士通
© Fujitsu 2022。保留所有权利。富士通和富士通徽标是富士通有限公司在全球许多司法管辖区注册的商标。本文提及的其他产品、服务和公司名称可能是富士通或其他公司的商标。本文件截至首次发布之日为最新，富士通可能会随时更改，恕不另行通知。本材料仅供参考，富士通不承担与其使用相关的任何责任。
美国接种 COVID-19 mRNA 疫苗后罹患心肌炎和心包炎的风险：索赔数据库中的一项队列研究
简介 在美国，BNT162b2（辉瑞 - BioNTech）COVID-19 疫苗适用于 5 岁及以上的人群，mRNA-1273（Moderna）COVID-19 mRNA 疫苗适用于 18 岁及以上的人群。2021 年春夏，欧洲 1 以色列 2 加拿大 3 和美国 4 的被动监测系统以及病例系列 5–9 和一些观察性研究（一些已发表 10–12 一些未发表 13,14 ）报告了心肌炎或心包炎（或两者兼有）与 COVID-19 mRNA 疫苗的潜在关联。美国食品药品管理局 (FDA) 于 2021 年 6 月更新了 BNT162b2 15 和 mRNA-1273 16 的紧急使用授权情况说明书，该说明书基于对美国疫苗不良事件报告系统报告的持续评估，表明风险增加
由专家精心策划的大型基准文档数据库...
用于查找相关文献的文档推荐系统大多依赖于十年前开发的方法。这主要是因为缺乏一个涵盖各种研究领域的大型离线黄金标准相关文献基准，以便可以比较、改进新开发的文献检索技术并将其转化为实践。为了克服这个瓶颈，我们成立了 RE 相关文献搜索联盟，该联盟由来自 84 个国家的 1500 多名科学家组成，他们共同注释了超过 180,000 篇 PubMed 收录文章与其各自的种子（输入）文章的相关性。大多数注释都是由经验丰富的种子文章原作者提供的。收集到的数据涵盖了 76% 的所有唯一 PubMed 医学主题词描述符。在不同经验水平、研究领域或注释时间所花费的人之间未观察到系统性偏差。更重要的是，不同科学家对相同文档对的注释高度一致。我们进一步表明，用于生成推荐文章以供评估的三种代表性基线方法（Okapi Best Matching 25、词频 - 逆文档频率和 PubMed 相关文章）具有相似的总体性能。此外，我们发现这些方法各自倾向于生成不同的推荐文章集合，这表明可能需要混合方法来进行比较
降钙素基因相关的肽靶向药物和雷诺现象：来自WHO PharmaCovigigilance Database
摘要背景：偏头痛负责严重的残疾和社会负担。最近，针对降钙素基因相关肽（CGRP）途径的药物引起了新的希望。CGRP是一种有效的血管扩张剂，在偏头痛攻击的发病机理中起关键作用。CGRP的缺乏涉及Raynaud的现象，该现象由数字的异常血管收缩组成。我们旨在评估Raynaud现象与CGRP靶向药物的潜在关联，分析来自世界卫生组织（Vigibase®）的现实世界数据。方法：我们询问了涉及CGRP靶向药物的Raynaud现象的所有报告。我们寻求使用这些药物对Raynaud现象的分区报告。为此，我们依靠信息组件（IC）的计算。IC的95％置信区间（CI）的正下端定义了统计学意义的关联。由于偏头痛患者容易发生Raynaud的现象，我们还计算了与5HT1 B/D激动剂（Triptans）相比，用CGRP靶向药物的IC和用于偏头痛治疗的Beta-Blockers的IC。结果：总体而言，在Vig-Ibase®中产生了涉及涉及CGRP靶向药物的Raynaud现象的99个报告。最报告的CGRP靶向药物是Erenumab，有56个报告（56.6％）。发作的中位时间为84天。未通知死亡，但一名患者患有坏疽和肢体坏死。总体而言，靶向CGRP的药物与Raynaud的现象显着相关，IC为3.3（95％CI：3.0–3.5）。与triptans（IC 0.4; 95％CI：0.1-0.6）和β受体阻滞剂（IC 0.5; 95％CI：0.2-0.7）相比，与CGRP靶向药物相比，雷诺与CGRP靶向药物的现象的报道不成比例。结论：Raynaud与CGRP靶向的现象存在明显的不成比例信号。将靶向CGRP靶向药物与偏头痛患者使用的其他药物进行比较时，该信号脱颖而出。这项研究受到药物戒备报告中缺少数据的限制。靶向CGRP的药物可能会受到Weber效应和报告偏见的影响。尽管如此，CGRP封锁可能是破坏血管生理平衡