Abbreviations ADC: Antibody-drug conjugate ADCP: Antibody-dependent cell phagocytosis ADCC: Antibody-dependent cellular cytotoxicity AI: Aromatase inhibitor AKT: Protein kinase B ASCO-CAP: American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists CAR-T cells: Chimeric antigen receptor T cells cTNM: Clinical肿瘤淋巴结 - 纳斯症CDK:依赖细胞周期蛋白的激酶CCL5:趋化因子(C-C基序)配体5 CHI3L1:几丁质酶-3样蛋白1 CHRM1:毒蕈碱乙酰胆碱受体受体M1 DCIS M1 DCIS M1 DCIS M1 DCIS M1 DCIS:DDPCR:DDDPCR:DDDPCR:ddplet DIDIDER DIMDASE CRASSENT CONSE RIDENCASE COSSERVER DILDATE CRASSISS COMENCASS COMASE DRFFS: Early Breast Cancer Trialists' Collaborative Group EC: Epirubicin and cyclophosphamide EGFR: Epidermal growth factor receptor ER: Estrogen receptor ERBB2: Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) ERK: Extracellular signal-regulated kinase FDR: False discovery rate FZD: Frizzled receptors GNRH: Gonadotropin-releasing hormone GPCR: G蛋白偶联受体GPRC5D:G蛋白偶联受体C类C组5成员D HER1:人表皮生长因子受体1(EGFR)HER2:人类表皮生长因子受体2
背景:线粒体DNA(mtDNA)是一种促炎性损伤相关的分子模式分子,可能是MS炎症和疾病活性的早期指标。自体造血干细胞移植(AHSCT)是MS的有效治疗方法,但其对脑脊液(CSF)的MTDNA水平的影响仍未开发。目标:验证MS患者中CSF MTDNA浓度升高并评估AHSCT对mtDNA浓度的影响。方法:多重液滴数字PCR(DDPCR)用于定量182 CSF样品中的mtDNA和核DNA。这些样品是从48名MS患者(在AHSCT前后的48例)中收集的,在年度随访中以及32个健康对照中收集。结果:MS患者的CSF CCF-MTDNA水平较高,与多个临床和分析因子相关,并在干预AHSCT后进行了归一化。在AHSCT前一年,观察到AHSCT之前的AHSCT之前的差异。结论:我们的发现表明,MS患者的CSF MTDNA水平升高,这与疾病活性相关并在AHSCT之后正常化。这些结果将mtDNA定位为监测炎症活性和对MS治疗的反应的潜在生物标志物。
IPO 的一个重要目标是对当地产生影响。LLNL 授权的技术已促成众多新企业的成立,这些企业正在帮助推动经济增长,并支持三谷地区和大旧金山湾地区的高科技商业机会。例如,LLNL 的 Droplet Digital™ 聚合物链反应 (ddPCR) 已授权给位于加利福尼亚州普莱森顿的 QuantaLife, Inc. 这项技术可快速筛查生物样本中的病原体。它目前正用于检测感染患者中是否存在 COVID-19。LLNL 先进的激光喷丸系统已授权给位于加利福尼亚州利弗莫尔的 Metal Improvement Co. Inc. 这项技术可显著增强金属部件的强度,并已在商用飞机上喷丸了 40,000 多个喷气发动机风扇叶片。激光喷丸还用于波音 787-8 的机翼成型,使该飞机成为世界上每乘客英里燃油效率最高的飞机。 LLNL 开发的 DYNA3D 是第一个精确模拟金属结构弯曲、折叠和塌陷的计算机代码。DYNA3D 已授权给位于加州利弗莫尔的利弗莫尔软件技术公司,是汽车行业用于车辆碰撞测试的基础技术。
BRAF抑制剂彻底改变了黑色素瘤患者的治疗,尽管发生了抵抗,但仍有一组维持耐用疾病的患者。对于那些具有持久完全反应的情况(CR),尚不清楚是否可以安全停止治疗。在这里,我们确定了13例接受BRAF +/- MEK抑制剂治疗的患者,他们在延长Cr后停止治疗(中位数= 34个月,范围为20-74)。复发。在其余10名接受CR持续治疗的患者中,中断后的随访时间为19个月(范围8-36)。我们在纵向血浆样品中使用液滴数字PCR(DDPCR)回顾性测量了CTDNA水平。ctDNA水平是无法检测的,在CR中的患者中仍无法检测到(10/13)。ctDNA最终在疾病复发的2/3例病例中被检测到,但在1例仅大脑进展的患者中仍无法检测到。我们的研究表明,可以考虑在长期治疗,持久反应和没有CTDNA测量的残留疾病的情况下停止靶向治疗。
背景:硬化菌核(SS)是一种广泛的宿主范围,可影响400多种植物物种。ss cys camelina sativa(CS)的茎腐病疾病是一种适用于低输入作物和工业油属性的Allohexaploid crucifer物种,适用于生物燃料和润滑剂。组织化学和分子研究已将C. sativa中的SS抗性与细胞壁木质化联系起来(Eynck等,2012),并报道了CSS抗性线CN114263中的Cinnamoyl-COA还原酶4(CSCCR4)基因的组成型表达。现代繁殖工作(例如基因编辑)需要改善商业线条,并限制农作物损失的风险,这对生产者来说是重要的。目的:为了研究单极生物合成的重要性以及CSCCR4在Camelina对SS耐药性中的作用,我们使用CRISPR/CAS9介导的基因编辑产生了CN114263 Camelina系的CSCCR4敲除突变体。材料和方法:三十T1植物是通过花卉浸入转化产生的,然后是草甘膦喷雾,该植物在筛选程序的第一步中使用,并通过PCR方法确认。使用数字液滴PCR(DDPCR)确定T1和T2祖细胞中T1和T2祖细胞中的T-DNA拷贝数变化T-DNA CNV,并且通过下降测定技术对T1和T2代的CSCCR4同源物的三个副本中的三个副本中的突变发生。为确保T2植物中的突变体是真实的,对其中三个的cas9/ grna特异性裂解点侧面进行了topo ta测序。在T2代生成中,筛选了CSCCR4基因中的潜在突变。结果:在T1代中,确认了25种植物,这些植物在相应的Camelina基因组中具有1至9个TNA拷贝。在CSCCR4的三个副本中证明了各种类型的突变,包括插入和缺失。实际上,CRISPR系统可以分别在编号T2-Plant 10,T2-Plant 15和T2-Plant 19的事件中删除一个,两或三个副本。T3-plant 19在上一代中所有版本的CSCCR4中表现出突变具有易感性的螺旋杆菌侵袭,并保留为实际CSCCR4突变体材料,以进一步研究骆驼 - 螺旋菌相互作用。CSCCR4中的突变是通过容易出错的非同源端连接(NHEJ)核DNA修复途径发生的。ss挑战早期开花的T3一代。与WildType对照母体CN114263相比,在CSCCR4位置217处的突变的T3植物在CSCCR4位置217处的过早停止密码子受到了损害。结论:使用DDPCR很容易识别T1和T2祖细胞中CSCCR4同源物中的T-DNA CNV和突变的发生。我们说明,CRISPR/CAS9介导的突变是一种体面的技术,可以用来加快突变线的发展,可以帮助您弄清CSCCR4基因在防御:sativa C. c. c. c.c。sativa中的活性,作为前瞻性石油种植作物的生物柴油生产。
目的:该标准参考材料 (SRM) 用于人类基因组脱氧核糖核酸 (DNA) 定量材料的值分配,主要用于定量聚合酶链式反应 (qPCR)。注意:有关可识别的私人信息,请参阅第 2 页的“使用和隐私协议”。描述:一个 SRM 2372a 单位包含三种特征明确的人类基因组 DNA 材料,溶于 pH 8.0 水性缓冲液中。这些成分来自人类白膜样本,标记为 A、B 和 C。成分 A 包含来自单个男性供体的基因组 DNA。成分 B 包含来自单个女性供体的基因组 DNA。成分 C 包含基因组 DNA 的重量混合物(1 份男性供体和 3 份女性供体)。一个 SRM 单位包含每个成分一个 0.5 mL 无菌小瓶,每瓶约含有 50 µL DNA 溶液。每个小瓶都贴有标签,并用彩色编码的螺帽密封。认证值:认证值列于下表。这些认证值是根据 8 条染色体上的 10 个独特靶标的液滴数字聚合酶链式反应 (ddPCR) 检测计数、稀释因子和液滴体积测量值确定的。NIST 认证值是 NIST 对其有最高信心的值,因为已考虑了所有已知或可疑的偏差来源 [1]。拷贝数值在计量学上可追溯到自然单位计数 1 和比率 1 以及国际单位制 (SI) 得出的体积单位。DNA 质量浓度值在计量学上可追溯到自然单位计数和比率 1 以及 SI 得出的质量和体积单位。
家族性高胆固醇血症 (FH) 是一种常见的常染色体显性遗传病,其特征是低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C) 终生升高,导致早发性动脉粥样硬化和冠状动脉事件。约 85% 至 90% 经基因确诊的 FH 是由 LDLR 基因致病突变引起的,该基因的单倍体不足会导致 LDL-C 摄取降低 1,2 。目前可以使用他汀类药物和依折麦布等终生降脂药物,但有些患者往往无法耐受这些药物,无法达到理想的 LDL-C 水平 3 。一种较新的治疗方法是基于皮下注射单克隆抗体,这种抗体可以暂时抑制前蛋白转化酶枯草溶菌素/kexin 9 型 (PCSK9),PCSK9 是一种促进 LDLR 溶酶体降解的蛋白质 4,5 。但这种方法作为单一疗法往往是不够的,因此需要与他汀类药物联合使用 6 。在这里,我们提出了一种新颖、直接且持久的治疗策略,通过基于 CRISPR 的基因编辑截断 LDLR 3' UTR 的一部分(其中包含负向调节 LDLR 表达的位点),以上调 LDLR 表达。在 HepG2 细胞系、FH 患者来源的淋巴母细胞系 (LCL) 和小鼠肝癌细胞系 Hepa1-6 中测试了编辑策略。通过 ddPCR 确认 3'UTR 的切除,并通过 qRT-PCR 量化 LDLR mRNA 水平。分别通过 Western Blot 和流式细胞术使用特异性抗体测定总 LDLR 水平和表面 LDLR 水平。最后,通过流式细胞术测量荧光标记的 LDL-C 的细胞摄入量来评估 3'UTR 切除对胆固醇摄取的影响。 HepG2 细胞中的切除效率约为 50%。与未经处理的细胞相比,切除的细胞显示 LDLR mRNA 水平上调 2 倍,表面 LDLR 增加 6 倍。3'UTR 切除导致 LDL-C 摄取增加 3 倍。患者来源的 LCL 显示出类似的结果,LDL-C 摄取增加 4 倍。此外,比较分析表明,我们的策略在增加 LDL-C 摄取方面优于 PCSK9 敲除 (KO) 和他汀类药物。这些发现支持我们基于 CRISPR 的基因编辑策略,即截断负责快速 LDLR mRNA 周转的区域以增强其表达并促进 LDL-C 摄取。这种独特的方法可能对多种高胆固醇血症相关疾病有用。
eo斑块是一种外部胰岛素注射装置,它会自动从体外注入胰岛素,以控制血糖水平以治疗糖尿病。斑块可以全天提供胰岛素的持续输注(基础)和/或在短时间内注入其他胰岛素(Bolus)。此补丁与EO Flow ADM(Advanced Diabetes Manager)(EO补丁可穿戴胰岛素泵的配件)连接,该补丁是一个遥控器,可控制和管理从EO补丁传递胰岛素
在人类诱导的多能干细胞(HIPSC)中,系统地对内源性蛋白进行了带有荧光标记的内源性蛋白,可以观察到不同细胞态中的活细胞动力学。然而,通过CRISPR/CAS9诱导的编辑将氟化蛋白的精确插入到活细胞中依赖于同源指导的修复(HDR)。非同源末端连接(NHEJ)DNA修复途径通常胜过HDR,导致不可逆的内部和缺失(Indels)和低敲门效率。识别成功的HDR介导的标记事件是当目标基因在干细胞中未表达并且成功的标记可能不会立即观察到的靶基因是一个额外的挑战。为了解决这些挑战,我们使用了:1)在优化的感染多重性(MOI)下,与腺相关的病毒血清型6(AAV6)介导的DNA供体以最大的效率提供标签有效载荷; 2)滴定的多重CAS9:GRNA核糖核蛋白(RNP)量确保条件之间的HDR/indel频率平衡; 3)长放大液滴数字PCR(DDPCR),以测量编辑池中HDR产生的等位基因的频率; 4)同时推断CRISPR编辑(ICE)以检测并避免与Indels明显饱和(> 50%)。这些方法使我们能够确定有效,准确的编辑条件并恢复带有标记的单元,包括在干细胞中未表达的位点标记的单元。这些步骤共同使我们能够开发出有效的方法和工作流程,直接从具有最佳HDR和最小化indel频率的理想细胞池的克隆分离。使用这种方法,我们同时实现了荧光标记物和双重插入到四个基因中的基因,这些基因在差异过程中被打开,但最初在HIPSC中未表达,在HIPSC中,基于荧光基于荧光的标记细胞的直接选择是不可能的:TBR2,TBR2,TBXT,CDH2,CDH2,CDH2,CDH2,CDH2,CDH2(PROFEFFEREDIATION和MEGREDIATION和MEGREGRIATION和MEGRGIAL egratiation and Moggratial Genes and Cdhees and Cdhh5)and Cdhh5(cdh5)和CDH5(cdh)5(cdh)5(cdh)5(cdh5)。通过对各种GRNA序列和RNP浓度的系统评估,我们确定了达到高HDR频率的每个基因的条件,以38.6%的峰值达到峰值,同时还避免了与Inderels相关的条件,在这种情况下,很难在带有统一的等位基因中具有标记等位基因的克隆的隔离。过度,该方法提高了在hipscs中未表达的基因的荧光敲击的效率,对细胞过程的基于可靠的基于图像的观察,并可以恢复精确编辑的单声道和双重标记的克隆。我们将这些方法标准化,以产生有效且一般的工作流程,以将大型HDR介导的敲入引入HIPSC中。
冠状病毒疾病2019年(Covid-19)是一种由严重的急性呼吸综合症冠状病毒2(SARS-COV-2)病毒引起的威胁生命的疾病,该病毒于2019年底在中国首次在中国报道,然后在世界范围内遍及全球[1]。根据世界卫生组织(WHO)的最新数据,自19次大流行以来,全球范围内有761,402,282例确定的病例,而据报道,由于SARS-COV-2-2],据报道,据报道了6,887,000例死亡。自大流行以来,尤其是在第一波和第二波期间,本期特刊的目标是鉴于出现的新知识,突出了SARS-COV-2的关键方面。在本期特刊中总共发表了15份手稿。这些论文提供了有关流行病学,发病机理,表观遗传学的见解[3,4] Covid-19 Covid-19在医院环境中的紧急情况[5,6],晚期诊断[6-8],疫苗接种[9,10]和SARS-COV-COV-2在实验环境中感染[11]。高度的严格性,独创性,对于其中一些人来说,获得的引文数量很高,这是很明显的。特别有趣的是,其中一个关注的问题是某些细胞内细菌的作用,例如肺炎氯化炎和肺炎支原体,在影响两种临床(呼吸道)的范围(呼吸量)上的范围(均具有cyviential tige)的预后和预后,促进了对临床(呼吸)的范围(dive)的预后(dive)(呼吸)(呼吸症)的预后(dive)(呼吸)。与对照组相比,不是显着的[12]。此类共感染也已证明会导致d-二聚体和纤维纤维的增加。这增加了血栓形成引起的血栓形成的风险[13,14]。另一项原始研究,包括致病性和临床性的,旨在测试睾丸激素水平是否与胶质纤维酸蛋白(GFAP)和泛素羧酸羧酸携带末端水解酶L1(UCH-L1),脑损伤的生物标志物,严重形式的covid-199;该研究表明,创伤性脑损伤生物标志物UCH-L1可能与严重的Covid-19病例中观察到的神经系统损害有关[7]。此外,UCH-L1与血清睾丸激素浓度之间的负相关性意味着睾丸激素可能在严重病重的COVID-19患者中在神经后遗症的发展中起作用。有关SARS-COV-2感染诊断的相当数量的手稿一直是本期特刊的出版物。在检测病毒RNA的呼吸道分泌物上进行的基于PCR的实时测定法被认为是SARS-COV-2诊断的金标准方法。,例如液滴 - 数字PCR(DDPCR),簇状的定期间隔短的短膜重复序列(CRISPR)和下一代测序(NGS),目前正在开发中,以检测临床标本中的SARS-COV-2 RNA [8,15]。但是,在分子的靶区域中发现的单匹和多个不匹配的速率