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马尔贝克葡萄品种的二倍体基因组组装使得能够对克隆表型变异背后的转录组差异进行单倍型感知分析
为了保留其品种属性，已建立的葡萄品种（Vitis vinifera L. ssp. vinifera）必须进行克隆繁殖，因为它们的基因组是高度杂合的。马尔贝克是一种源自法国的品种，因生产高品质的葡萄酒而受到赞赏，是品种 Prunelard 和 Magdeleine Noire des Charentes 的后代。在这里，我们将 PacBio 长读段三重合并到从父母遗传的两个单倍体补体中，构建了马尔贝克的二倍体基因组组装。经过单倍型感知的重复数据删除和校正后，获得了两个单倍相的完整组装，且单倍型转换错误率非常低（< 0.025）。单倍相比对确定了 > 25% 的多态性区域。基因注释（包括 RNA-seq 转录组组装和从头算预测证据）导致两个单倍相的基因模型数量相似。利用注释的二倍体组装体对四个表现出浆果组成特征差异的马尔贝克克隆种质进行转录组比较。使用任一单倍体作为参考对成熟果皮转录组进行分析，得到了相似的结果，尽管观察到了一些差异。特别是，在仅以 Magdeleine 遗传单倍型为参考鉴定的差异表达基因中，我们观察到假设的半合子基因的过度表达。克隆种质 595 的浆果花青素含量较高，与脱落酸反应增加有关，可能导致观察到的苯丙烷代谢基因的过度表达和与非生物应激反应相关的基因的失调。总体而言，结果强调了生产二倍体组装体的重要性，以充分代表高度杂合的木本作物品种的基因组多样性并揭示克隆表型变异的分子基础。
DNA甲基化雌性和男性X染色体之间的DNA甲基化差异
图3。DNA甲基化和雌性X染色体链接基因之间的基因表达差异。a）基因表达log 2（折叠变化）（在y轴上）的散点图对X轴上基因启动子甲基化差异（f expr =女性表达； m expr =雄性表达； f m =雌性甲基化； m m m =雄性甲基化）。每个点表示蛋白质编码基因。红色x表示Xist lncRNA，该lncRNA高度雄性甲基化和雌性过表达。在log 2（折叠）= 1处的红色虚线，表明该线上上方的基因（红色为红色）在女性中比男性更高，我们称为“ Escapers”。蓝色的三角形点是PAR1连接的基因，与男性相比，它们在男性中的表达更高，与先前的研究一致（37）。b）对比数量的女性低甲基化区域。
性别和性别差异和药物宣传
迄今为止，在科学界，“性别”和“性别”术语之间的混乱似乎不那么频繁。但是，在医学研究中，仍然很难确定男女之间的差异是否取决于性别，性别或两者的影响（Lapeyre-Mestre，2019年）。此外，性别和性别相互作用。世界卫生组织（WHO）将性别医学定义为对生物学的影响（由性别定义）以及社会经济，环境和文化（由性别差异定义）对人民健康或疾病状况的差异（世界卫生组织，世界卫生组织，2024年）。在过去的几十年中，性别医学的研究显着增加。特别是，药理学研究领域对性别的关注可以允许开发个性化疗法，该疗法旨在患者的中心性。这种方法代表了当今生物医学研究重点的创新视野之一。从这个角度来看，性别药理学研究了有效性和安全性药理学治疗的性别差异。它仔细考虑了可能影响药物反应的所有生理和非生理变量，以促进治疗的公平性和适当性。男女在药物反应上可能因性别相关的关键变量而有所不同，包括体重，身高，身体表面积，脂肪质量和等离子体体积，这又取决于其他相关因素，例如基因，激素和年龄（Mauvais-Jarvis等人，2021年）。这些参数会影响药代动力学和药效过程（Spoletini等，2012）。药效参数的分析比药代动力学参数更为复杂，因为它应该基于以下证明，即药物在两性中产生不同的药理作用。虽然性别是静态因素，但性别是与其他特征永久相互作用的动态和可修改过程。因此，对性别差异的研究更加困难（Lapeyre-Mestre，2019年）。因此，将女性视为男人的“变体”是一个遥远根源的文化问题，只有在近年来，全球意识才出现。尽管如此，在医疗保健管理和治疗疗法方面，男人和女人仍然被认为是独一无二的（极少数例外）。鉴于这些简短的考虑，我们需要一个新的策略大纲，以更好地研究两性药物的效率和安全性。因此，本文的目的是讨论应改进临床研究的关键要点，以提出性别和性别差异。
审查宿主定向的免疫疗法和针对利什曼病的候选药物
神经认知能力下降是当今医学中最重要的可怕问题之一。痴呆发病机理的机制是复杂且多因素的，尤其是在阿尔茨海默氏病（AD）的情况下。一个无可辩驳的但无法解释的因素是AD的性别差异，其中妇女受到疾病的速度和严重程度的AD影响不成比例的影响。检查多方面的促成原因以及可改变的危险因素（例如饮食）中的独特性别动态，可能会深入了解这种差异的存在和前进的潜在路径。这篇简短的叙述性综述的目的是总结当前饮食习惯中性别差异的文献，以及它们如何与有助于AD发病机理的神经炎症状态有关。因此，将讨论饮食，荷尔蒙和炎症之间的相互作用，以及潜在的干预措施以提供护理实践。
糖尿病肾脏病的性别差异解释了
糖尿病性肾脏疾病（DKD）是糖尿病的常见并发症，可导致慢性肾衰竭。但是，预防和治疗方案相当有限。此外，已知DKD的发生率和进展率在男性和女性患者之间有所不同。迄今为止，这些性别差异的原因尚不清楚。一项发表在《科学转化医学》上的新研究已开始确定DKD性别差异的潜在机制的过程。“患有糖尿病的男性往往表现出比女性更快，更严重的表现，”作者塞尔吉·克洛特·弗里瓦斯（Sergi Clotet-Freixas）解释说。“但是，我们仍然不知道雄性肾脏内会发生什么，以使它们更容易出现DKD，我们也不知道哪些因素可能是保护雌性肾脏。”在先前的一项研究中，作者发现，从男性供体到男性荷尔蒙，暴露于人类近端管状上皮细胞（PTEC）导致葡萄糖和谷氨酰胺水平的变化，这是肾脏代谢的关键因素。“这一观察结果表明，我们必须开始研究肾细胞如何在男性和女性中特别是男性和女性中的谷氨酰胺，这是一种新的科学策略，以了解糖尿病男性和女性肾脏中不同损伤反应的新策略，” Clotet-Freixas说。作者首先检查了三个男性和三个女性捐助者的人类PTEC的性别差异。在基线和代谢应激之后，雄性PTEC的细胞表面较大，线粒体面积较大，氧气消耗率更高，糖酵解高于雌性PTEC。
梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染与转录活性微生物群落的差异有关
梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染（CDI）每年在美国约30万住院，相关的货币成本为数十亿美元。肠道微生物组营养不良对CDI很重要。据我们所知，元文字组合（MT）仅用于表征肠道微生物组组成和功能，在一项涉及CDI患者的先前研究中。因此，我们利用MT研究了CDI+（n = 20）和CDI-（n = 19）样品在微生物类群和表达基因方面的活性群落多样性和组成的差异。根据CDI状态，未检测到有关丰富性或偶数的显着（Kruskal-Wallis，p> 0.05）的显着差异。但是，基于CDI状态的聚类对于活性微生物分类群和表达的基因数据集都很重要（Permanova，P≤0.05）。此外，与CDI-样品相比，CDI+中的差异特征分析表明，机会性病原体的肠球菌病原体和Ruminococcus gnavus的表达更大。仅考虑真菌序列时，糖霉菌科在CDI-中表达了更多的基因，而其他31种真菌分类群则被确定为显着（Kruskal-Wallisp≤0.05，log（LDA）≥2）与CDI+相关。我们还检测到基于CDI状态的各种基因和途径（Kruskal-Wallisp≤0.05，log（LDA）≥2）显着差异。值得注意的是，与生物膜形成相关的差异基因通过艰难梭菌表达。这为艰难梭菌对抗生素的抵抗和体内频繁复发提供了另一个可能的贡献。此外，更多的CDI+相关真菌分类群构成了额外的证据，表明该分枝杆菌对CDI发病机理很重要。未来的工作将集中于确定艰难梭菌在感染过程中是否积极产生生物膜，以及任何特定的真菌分类群在CDI中是否特别有影响力。
孟加拉国2型糖尿病患病率和决定因素的农村和城市差异
在城市地区，T2D的患病率为10.8％，农村地区为7.4％，而在这些环境中，前居民影响了31.4％和27％的人口。这项研究发现了影响城市和农村地区糖尿病的重要因素，特别是在55-64岁年龄段（Urban：AOR = 1.88，95％CI [1.46，2.42]；乡村：AOR = 1.87，95％CI [1.54，2.27]）。受过良好教育的人的T2D几率较低，而富裕和超重的参与者在这两个领域的几率都更高。在农村地区，T2D的风险在咖啡馆的消费者和未参与占领有关的体育锻炼的饮料消费者中较高，而这些因素在城市地区没有显示出重大影响。此外，城市参与者在T2D和高血压之间表现出显着关联。
大规模的多组分干预措施的影响减少质子泵抑制剂在综合医疗系统中过度使用：差异研究
方法设计，数据源和研究人群我们在美国退伍军人事务医疗系统中进行了差异分析，这是美国最大的综合医疗保健系统，拥有1255个医疗保健设施和1074个门诊站点。它包含18个区域卫生系统，称为退伍军人综合服务网络（VISNS），每个服务网络都有自己的卧床药房系统。退伍军人事务临床医生规定的药物几乎总是由退伍军人事务药店填写。VISN 17中的医疗和药房领导者，其中包括德克萨斯州的大多数退伍军人事务设施以及新墨西哥州和俄克拉荷马州的部分地区，开发了一项基于多组分药房的倡议，旨在减少PPI的过度使用，并于2013年8月至2013年8月将其推出Visn Wide。研究期跨越2009年2月至2019年1月，以捕捉实施前后4。5年的趋势。我们将研究期分为连续的六个月间隔。在每个间隔中，我们包括所有在前两年中至少与初级保健提供者进行两次访问的患者。我们使用退伍军人事务的公司数据仓库来获取人口统计，医疗，药房，实验室和住院/门诊遭遇数据。
定性而不是定量的HLA -DQ等位基因之间的差异会影响器官移植中HLA -DQ免疫原性
转移后移植抗体（HLA-DNDSA）的DE-NOVO HLA-DONOR特异性抗体的发展与抗体介导的排斥反应（ABMR）的风险增加和同种异体移植效果不佳有关。1 - 5虽然ABMR的发展可能是由于药物不合规引起的，但尚不清楚为什么有些接受者尽管有足够的槽级免疫抑制，但为什么有些接受者会向其HLA不匹配的捐助者开发DNDSA，而另一些则没有。这表明某些HLA不匹配比其他不匹配更具有免疫原性。旨在破译这种免疫晶状体的变异性，近年来引入了几种分子不匹配载荷（MML）肛门方法。6 - 9，如名称所建议的，所有MML方法都需要在（分子）氨基酸水平上键入的供体和受体HLA等位基因的知识。最受使用的软件程序Hlamatchmaker，10 - 12个假设，假定小的多态氨基酸片段称为Eplet，称为EPLET，具有免疫原性的意义。hlamatchmaker-从两个供体等位基因到“ eplet Universe”中的eplets将其与接收的eplet宇宙进行了比较，并输出仅作为不匹配负载中的供体抗原中存在的eplets数量。hlamatch-Maker进一步将这些EPLET视为“功能表位”，13,14与“结构表位”不同，这是指抗体认可的该区域的全部占地面积。
化学粘合决定了两个看似相同的超导体的急剧临界温度差
尽管YB 6和实验室6具有相同的晶体结构，原子价电子的形象和声子模式，但它们表现出截然不同的声子介导的超导性。yb 6低于8.4 K的超导导，使其成为已知硼化物的第二个最高临界温度，仅次于MGB 2。实验室6直到接近 - 绝对零温度（低于0.45 K）才能超导。尽管以前的研究已经量化了Yb 6的更高费米 - 水平（E F）状态和较高的电子 - Phonon耦合（EPC）的规范超导性描述（EF），但尚未全面评估该差异的根源。通过化学键合，我们确定灯笼中的低谎言，未占用的4F原子轨道是这些超导体之间的关键区别。这些轨道在YB 6中无法访问，与πB– B键杂交，并使能量的能量低于σB-B键，否则在E f时。这种频段的反转至关重要：我们显示的光学声子模式负责超导性，导致Yb 6的σ-轨道在重叠中发生巨大变化，但彼此弱于实验室6的π轨道。yb 6中的这些声子甚至访问电子状态的交叉，表明EPC强。在实验室6中未观察到这种交叉。最后，显示了一个超级电池（m k-点）会发生PEIERL-喜欢YB 6中的效果，从柔软的声音子和相同的电子 - 耦合的光学模式中引入了其他EPC。总体而言，我们发现实验室6和YB 6具有从根本上不同的超导性机制，尽管它们差不多 - 身份差。