<根特大学,技术帕克71,9052,根特,比利时B比利时B植物系统生物学中心,Technologiepark 71,9052,Ghent,Belgium C Ghent C Ghent C Ghent C ghent University for Bioassay Development of Bioassay Development and Specant(C-Bios),9052,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VENT,VENT,VENT,VIB,VIB,VIB 9052,根特,比利时E植物生物学与生态学系,巴斯克大学Universe of apdo。 644, Bilbao, E-48080, Spain f Laboratory of Applied Physical Chemistry (ISOFYS), Ghent University, Coupure Links 653, 9000, Ghent, Belgium g Department of Microbiology, RIBES, Radboud University, Heyendaalseweg 135, 6525, AJ, Nijmegen, the Netherlands h VIB Metabolomics Core, Technologiepark 71,9052,根特,比利时I合成,生物库和生物有机化学研究小组(Synbioc),绿色化学技术系,根特大学,政变链接653,9000,比利时根特,<根特大学,技术帕克71,9052,根特,比利时B比利时B植物系统生物学中心,Technologiepark 71,9052,Ghent,Belgium C Ghent C Ghent C Ghent C ghent University for Bioassay Development of Bioassay Development and Specant(C-Bios),9052,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VENT,VENT,VENT,VIB,VIB,VIB 9052,根特,比利时E植物生物学与生态学系,巴斯克大学Universe of apdo。 644, Bilbao, E-48080, Spain f Laboratory of Applied Physical Chemistry (ISOFYS), Ghent University, Coupure Links 653, 9000, Ghent, Belgium g Department of Microbiology, RIBES, Radboud University, Heyendaalseweg 135, 6525, AJ, Nijmegen, the Netherlands h VIB Metabolomics Core, Technologiepark 71,9052,根特,比利时I合成,生物库和生物有机化学研究小组(Synbioc),绿色化学技术系,根特大学,政变链接653,9000,比利时根特,<根特大学,技术帕克71,9052,根特,比利时B比利时B植物系统生物学中心,Technologiepark 71,9052,Ghent,Belgium C Ghent C Ghent C Ghent C ghent University for Bioassay Development of Bioassay Development and Specant(C-Bios),9052,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VENT,VENT,VENT,VIB,VIB,VIB 9052,根特,比利时E植物生物学与生态学系,巴斯克大学Universe of apdo。 644, Bilbao, E-48080, Spain f Laboratory of Applied Physical Chemistry (ISOFYS), Ghent University, Coupure Links 653, 9000, Ghent, Belgium g Department of Microbiology, RIBES, Radboud University, Heyendaalseweg 135, 6525, AJ, Nijmegen, the Netherlands h VIB Metabolomics Core, Technologiepark 71,9052,根特,比利时I合成,生物库和生物有机化学研究小组(Synbioc),绿色化学技术系,根特大学,政变链接653,9000,比利时根特,<根特大学,技术帕克71,9052,根特,比利时B比利时B植物系统生物学中心,Technologiepark 71,9052,Ghent,Belgium C Ghent C Ghent C Ghent C ghent University for Bioassay Development of Bioassay Development and Specant(C-Bios),9052,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VIB,VENT,VENT,VENT,VIB,VIB,VIB 9052,根特,比利时E植物生物学与生态学系,巴斯克大学Universe of apdo。644, Bilbao, E-48080, Spain f Laboratory of Applied Physical Chemistry (ISOFYS), Ghent University, Coupure Links 653, 9000, Ghent, Belgium g Department of Microbiology, RIBES, Radboud University, Heyendaalseweg 135, 6525, AJ, Nijmegen, the Netherlands h VIB Metabolomics Core, Technologiepark 71,9052,根特,比利时I合成,生物库和生物有机化学研究小组(Synbioc),绿色化学技术系,根特大学,政变链接653,9000,比利时根特,
监督的机器学习模型依赖于具有正面(目标类)和负面示例的培训数据集。因此,培训数据集的组成对模型性能有直接影响。具体来说,关于不代表目标类别的样品的负样本选择偏见,在诸如文本分类和蛋白质 - 蛋白质相互作用预测等范围内提出了挑战。基于机器学习的免疫治疗设计是一个越来越重要的研究领域,重点是设计抗体或T细胞受体(TCR),可以与其具有高特异性和亲和力的靶标分子结合。鉴于免疫治疗药物的生物医学重要性,有必要解决负面训练集成分如何影响模型概括和生物学规则发现以实现合理和安全的药物设计的尚未解决的问题。我们着手在抗体 - 抗原结合预测问题的背景下通过改变负面类别,包括结合亲和力梯度来研究这个问题。我们的研究基于提供基于地面真理结构抗体 - 抗原结合数据的大型合成数据集,从而使结合界面上的残基结合能访问了残基的结合能。我们发现,分布式概括和绑定规则发现都取决于所使用的负数据集的类型。重要的是,我们发现模型学习正数据集的绑定规则的能力并不是其分类精度的微不足道相关性。我们通过现实世界中相关的实验数据确认了我们的发现。我们的工作强调了考虑培训数据集组成在基于机器学习的研究中实现最佳分布性能和规则学习的重要性。
发现治疗牛皮癣的新方法 该研究增进了对慢性炎症性皮肤病的理解 牛皮癣是最常见的慢性炎症性皮肤病之一,在奥地利约有25万人受其影响。此前的治疗方法主要集中在抑制促炎性免疫细胞,而由维也纳医科大学皮肤病学教授、维也纳医学中心(CeMM)兼职主任医师(Adjunct PI)乔治·斯塔里(Georg Stary)领导的一项研究表明,可以有针对性地恢复某些抗炎性免疫细胞的功能。该研究结果发表在《免疫》(Immunity)杂志上,为开发一种不仅作用更精准,而且副作用更少的疗法铺平了道路。乔治·斯塔里领导的研究团队重点研究了调节性T细胞(Treg细胞)在牛皮癣等慢性炎症性皮肤病中的作用。Treg细胞是人体免疫系统的重要组成部分,专门负责预防过度免疫反应,从而防止炎症。已知这些细胞在慢性皮肤炎症中会失去调节功能,导致免疫反应失控,病情进展。研究人员如今首次揭示了背后的确切机制:“我们能够证明,调节性T细胞抗炎功能的丧失是由细胞代谢功能障碍引起的,”研究负责人Georg Stary总结这项研究工作时说道。正如研究人员的分析所揭示的,SSAT酶在Treg细胞功能丧失中起着关键作用。SSAT参与调节某些分子(多胺),这些分子对于抗炎和促炎免疫细胞之间的平衡至关重要。如果Treg细胞中SSAT的产生量过高,它们就会失去调节功能,并开始自行产生促炎信使物质。这会加剧银屑病典型的过度免疫反应。靶向阻断炎症循环 鉴于SSAT在炎症过程中的关键作用,研究人员同时发现了新的治疗切入点:在银屑病样皮肤炎症的小鼠模型中,抑制SSAT可以恢复Treg细胞的调节功能,从而打破炎症循环。因此,开发特异性抑制SSAT的特效药物,有望成为现有治疗方法的一种有希望的替代方案,因为现有治疗方法通常伴有免疫抑制和炎症增加。
在杂志杂志的出版物中,由弗朗索瓦·福克斯(FrançoisFuks),癌症表观遗传学实验室,ULB医学学院,ULB-癌症研究中心和H.U.B. Jules Bordet Institute领导的研究人员。表明,实际上,DNA和RNA表观遗传学可能比以前想象的更相互联系。研究人员发现他们形成了互补的调节系统,其中DNA表观遗传学组织可用的基因和RNA表观遗传学会动态调节其使用。
异常检测(AD)代表了一种从根本上进行数据驱动发现的新工具。最初的努力集中在将强大的离线算法调整到这些高通量流系统中,但这种算法应如何适应不断发展的检测器条件的问题仍然是一个重大挑战。在这项工作中,我们引入了一个模块化生态系统,以制定和评估自主发现的策略,其中包含了不同的组件,包括:具有时间依赖性效果的数据集,复杂的触发菜单,实时控制机制和成本感知的优化标准。我们通过使用公共CMS数据集的AD触发器进行了基于强化学习的新基准来说明这一框架,旨在鼓励以社区为导向的发展发展新一代智能和适应性触发器。
埃克塞特大学和瓦格宁根大学的这项新研究研究了腺菌细菌如何影响蚊子幼虫的发展。结果表明,Asaia一天将开发时间加速了,这可能会促进需要生产数百万成人的质量养育方案。
体细胞变体检测是癌症基因组学分析的组成部分。尽管大多数方法都集中在短阅读测序上,但长阅读技术现在在重复映射和变体相位方面具有潜在的优势。我们提出了一种深度学习方法,一种深度学习方法,用于从短读和长阅读数据中检测体细胞SNV,插入和缺失(indels),具有用于全基因组和外显子组测序的模式,并且能够以肿瘤正常,唯一的肿瘤正常,ffpe pppe的样本进行运行。为了帮助解决公共可用培训的缺乏和基准测试数据以进行体细胞变体检测,我们生成并公开提供了一个与Illumina,Pacbio Hifi和Oxford Nanopore Technologies的五个匹配的肿瘤正常细胞线对的数据集,以及基准的变体。在样本和技术(短读和长阅读)中,深度态度始终优于现有呼叫者,特别是对于Indels而言。
Kranzler博士是Altimmune和Clearmind Medicine的咨询委员会成员; Sobrera Pharmaceuticals和Altimmune的顾问;来自Alkermes的研究人员提出的研究的研究资金和药物供应的接受者;美国临床心理药理学学会的酒精临床试验计划的成员,在过去三年中得到了Alkermes,Dicerna,Dicerna,Ethypharm,Imbrium,Indivior,Kinnov,Kinnov,Lilly,Otsuka和Pear的支持;以及美国临时专利的发明者“丁丙诺啡治疗反应的多功能基因组协会荟萃分析”。
MSU密西西比州农业和林业实验站的助理教授 Hill说,这个蚱hopper属可能在更新世时期(也称为冰河时代)中有多元化。 他指出,在洛矶山脉中,随着冰川后退,其栖息地转移到更高的海拔时,在高山草原的这种亚科种类可能被隔离。 希尔怀疑他的团队发现的沙漠物种发生了类似的孤立和物种形成过程。Hill说,这个蚱hopper属可能在更新世时期(也称为冰河时代)中有多元化。他指出,在洛矶山脉中,随着冰川后退,其栖息地转移到更高的海拔时,在高山草原的这种亚科种类可能被隔离。希尔怀疑他的团队发现的沙漠物种发生了类似的孤立和物种形成过程。