XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemdoty
慢病毒载体假型：改善造血细胞基因修饰的珍贵工具用于研究和基因治疗
摘要：通过将病毒转化为病毒载体，已将病毒重新用于用于基因递送的工具。最常用的载体是慢病毒载体（LVS），这些载体源自人类免疫缺陷病毒，允许哺乳动物细胞中有效基因转移。它们代表了影响造血系统的最安全，最有效的治疗方法之一。LV通过不同的病毒信封（假型）进行修饰，以改变和改善其对不同原发性细胞类型的端主。囊泡口腔炎病毒糖蛋白（VSV-G）通常用于假型，因为它增强了基因转移到多种造血细胞类型中。然而，VSV-G假型LV无法在静态血细胞（例如造血干细胞（HSC），B和T细胞）中赋予有效的转导。为解决此问题，可以将VSV-G交换为其他异源病毒包膜糖蛋白，例如麻疹病毒，狒狒内源性逆转录病毒，Cocal病毒，Nipah病毒或仙境病毒的糖蛋白。在这里，我们提供了这些LV伪型如何改善HSC，B，T，T和自然杀伤（NK）细胞的转导效率，并通过多个体外和体内研究强调了拟型LV提供治疗基因或基因编辑工具的概括性遗传和癌细胞的概述。
我们可以检测到弱重力场的量子性质吗？
图2 PSEN1 A246E神经元中的RNA-SEQ鉴定了疾病内型。（a）PSEN1 A246E IPSC衍生的神经元相对于NDC的差异表达基因（DEG）的RNA-seq火山图，具有错误的发现率（FDR）调整后的P值<.05。（B-C）通过（b）ISMARA基序分析（基于Z得分，TF-GENE PEARSON相关性和平均基因目标表达变化）和（C）Dorothea TF-GENE目标分析（基于标准化的富集量），通过（c）基因目标表达变化）（基于Z得分，平均基因目标表达变化），通过（B）ISMARA基序分析（基于Z得分，TF-GENE PEARSON相关性）预测具有显着活性变化的转录因子（TFS）。ISMARA平均靶基因表达变化由UP（相对于NDC的增加）或向下（相对于NDC）箭头指示。（D-E）使用（d）CODODE-CHEA共识TF数据库或（e）通过FGSEA多层次富集测试（e）定义的神经元相关TF-GENE目标列表的PSEN1 A246E神经元中排名的TF-TARGET富集。（F-G）使用（F）标志性数据库和（G）基因本体生物学过程（GOBP）对PSEN1 A246E神经元基因表达签名进行排名的富集分析。
肺功能、气道和外周嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞与重度哮喘类固醇反应的分子药物基因组内型相关
摘要 简介 哮喘是一种复杂的疾病，其表现/严重程度各不相同。人们对定义与不同治疗反应始终相关的哮喘内型的兴趣日益浓厚，重点关注 2 型炎症 (Th2) 作为一种关键病理机制。当前哮喘内型主要通过临床/实验室标准来定义。每种内型可能都具有独特的分子机制，从而确定最佳治疗方法。方法 我们对来自重度哮喘研究计划的 19 名哮喘患者在基线和 40 毫克剂量肌肉注射皮质类固醇后 6-8 周的痰液气道细胞 RNA 测序转录组数据进行了无监督（无先验临床标准）主成分分析。我们研究了主成分 PC1、PC3 与 55 个临床变量的关联。结果 PC3 与基线 Th2 临床特征相关，包括血液（秩和 p=0.0082）和气道（秩和 p=0.0024）嗜酸性粒细胞增多症、FEV 1 变化（Kendall tau-b R=−0.333（−0.592 至 −0.012））和后续 FEV 1 沙丁胺醇反应（Kendall tau-b R=0.392（0.079 至 0.634））。PC1 与血液嗜碱性粒细胞增多症相关（秩和 p=0.0191）。对 PC1、PC3 贡献最大的 5% 基因在不同的免疫系统/炎症本体中富集，表明对皮质类固醇的转录组反应存在不同的受试者特异性簇。 PC3 与 FEV 1 变化的关联在可比的独立 14 名受试者（基线，每日吸入皮质类固醇 (ICS) 后 8 周）气道上皮细胞 microRNAome 数据集中以计算机模拟方式再现。结论这种无监督方法的转录组 PC 定义了分子药物基因组内型，可能产生新的生物学基础，为哮喘中皮质类固醇治疗的不同受试者特定反应和最佳个性化哮喘护理提供基础。这些 PC 的主要贡献基因可能表明新的治疗靶点。
中度和重度创伤性脑损伤的内型和精准治疗之路
摘要 异质性被认为是改善创伤性脑损伤 (TBI) 患者护理和预后的主要障碍。即使在较窄的中度和重度 TBI 层面，目前的管理方法也无法捕捉到这种以多种临床、解剖和病理生理特征为特征的疾病的复杂性。解决异质性的一种方法可能是将未分化的 TBI 群体分解为内型，即通过共同的生物学特征区分的亚类。内型范式已在一系列医学领域得到探索，包括精神病学、肿瘤学、免疫学和肺病学。在重症监护中，正在研究脓毒症和急性呼吸窘迫综合征等综合征的内型。本综述概述了内型范式以及它的一些方法和用例。提出了中度和重度 TBI 内型研究的概念框架，以及在该人群中发现和验证内型的科学路线图。关键词：创伤性脑损伤，表型，内型，机器学习，富集，精准医疗，治疗效果异质性
基于嗅觉裂口生物标志物的慢性鼻孔炎
潜在的利益冲突披露：以下咨询职位或赠款支持均隶属于此调查或手稿：Z.M.S：Olympus Medical Systems的顾问，Optinose US Inc.，Genentech，Genentech，Lyra Therapeutics和Sinusonic。R.J.S. ：ENT Stryker，Medtronic Systems Inc.的顾问，Healthy Humming，GlaxoSmithkline，Sanofi和Optinose US Inc. 从：ENT Stryker，Healthy Humming，Glaxosmithkline，Sanofi和Optinose US Inc. T.E.B的赠款中获得支持：没有潜在的利益冲突可以披露。 J.A.A. ：Optinose US Inc.，Medtronic Inc.和Glycomira Therapeutics，Inc。的顾问 V.R.R. ：Optinose US Inc.和Medtronic Systems Inc.的顾问 Genentech，Novartis和Glaxosmithkline的顾问委员会成员。 J.L.M：没有潜在的利益冲突来披露。 J.K.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 J.C.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 t.l.s：没有潜在的利益冲突可以披露。R.J.S.：ENT Stryker，Medtronic Systems Inc.的顾问，Healthy Humming，GlaxoSmithkline，Sanofi和Optinose US Inc.从：ENT Stryker，Healthy Humming，Glaxosmithkline，Sanofi和Optinose US Inc. T.E.B的赠款中获得支持：没有潜在的利益冲突可以披露。J.A.A. ：Optinose US Inc.，Medtronic Inc.和Glycomira Therapeutics，Inc。的顾问 V.R.R. ：Optinose US Inc.和Medtronic Systems Inc.的顾问 Genentech，Novartis和Glaxosmithkline的顾问委员会成员。 J.L.M：没有潜在的利益冲突来披露。 J.K.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 J.C.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 t.l.s：没有潜在的利益冲突可以披露。J.A.A.：Optinose US Inc.，Medtronic Inc.和Glycomira Therapeutics，Inc。的顾问V.R.R. ：Optinose US Inc.和Medtronic Systems Inc.的顾问 Genentech，Novartis和Glaxosmithkline的顾问委员会成员。 J.L.M：没有潜在的利益冲突来披露。 J.K.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 J.C.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 t.l.s：没有潜在的利益冲突可以披露。V.R.R.：Optinose US Inc.和Medtronic Systems Inc.的顾问Genentech，Novartis和Glaxosmithkline的顾问委员会成员。J.L.M：没有潜在的利益冲突来披露。 J.K.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 J.C.M：没有潜在的利益冲突可以披露。 t.l.s：没有潜在的利益冲突可以披露。J.L.M：没有潜在的利益冲突来披露。J.K.M：没有潜在的利益冲突可以披露。J.C.M：没有潜在的利益冲突可以披露。t.l.s：没有潜在的利益冲突可以披露。
神经系统中的慢病毒载体的转导模式
，我们基于马传染性贫血病毒（EIAV）开发了一种非青春期的慢病毒载体，以有效地转移到中枢和周围神经系统。以前，我们已经证明，用狂犬病病毒糖蛋白赋予慢病毒载体的伪型载体会赋予这些载体逆行轴突转运。在本研究中，我们成功地生产了用纹状病毒囊炎病毒（VSV）血清型（Indiana和Chandipura菌株）中的膜糖蛋白伪型的高素质EIAV载体；狂犬病病毒[各种Evelyn – rokitnicki – Abelseth时代菌株和挑战病毒标准（CVS）]； Lyssavirus Mokola病毒，一种与狂犬病有关的病毒；和铁纳病毒淋巴细胞性绒毛膜炎病毒（LCMV）。通过直接注射将这些载体传递到成年大鼠或新生小鼠的肌肉的纹状体或脊髓上。我们报告说，慢病毒载体被VSV印第安纳菌株，野生型ERA和CVS菌株的信封进行拟型型，导致纹状体的强大转导，而Mokola和LCMV-Pseudotyped载体则分别表现出中度和弱的转导。此外，ERA-和CVS-PESEUDYTY型慢病毒载体在脑，脊髓和肌肉中注射后远端神经元表现出逆行的运输和表达。这些包膜糖蛋白赋予的转导效率和逆行运输的差异在设计不同神经系统疾病的治疗策略方面提供了新的机会。